BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-290N15
Chromosome18 (Build37)
Map Location 57,418,947 - 57,562,942
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMegf10, LOC672445, Prrc1
Upstream geneLOC676543, LOC667432, Gramd3, LOC667458, Aldh7a1, Rnuxa, 1700065I17Rik, LOC675171, Lmnb1, March3, C330018D20Rik
Downstream gene1700011I03Rik, 4930511M06Rik, 2210409D07Rik, Slc12a2, 9330166H04Rik, Fbn2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-290N15.bB6Ng01-290N15.g
ACCGA087889GA087890
length1,1281,083
definitionB6Ng01-290N15.b B6Ng01-290N15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,561,818 - 57,562,942)(57,418,947 - 57,420,041)
sequence
gaattcagacaggatttaggcagaataatgtaaaagataggcagggtata
ttacagagaagggggggcaccctggaggggtaattgtggcaatggccgag
gggatcagtacaaaggaaagtactctgacatgacaagacttgacaacggc
cagagaaagcactgcacagggtactgtcttaagaggtaagaatggataat
ggccaaagaaaccattgtgccaactcacatgccttggtaggctttttact
atctcttaaagtcctggaacggacagccttcctggggagtgttttcctgt
ctaggtagtagacaggctcatttgaatgaactcttatgtgaggggacata
aaaggctttatcagccagaaagcttcctgctaaatagtaatcctatgttc
tttgtgggtgcagtttaatatgtcctgtctctaccctaggccaaagacat
ggctcagacactattcttttgaccttagtcaagattcctgaaggttcagt
tcctgggtttgcaatatgctgattatgaaggggggtgtcctcccccgagt
ctcttccttctagacaacagtatctggatagttccctggcaactatagct
gaggaattaagtaaggaagtgtcctctcactgctcagtatttttctaagg
acggcatagctccttccatttaaacatctgtagaatgagacagccactcc
aatgcaaacaggtcagatttatttagaagatgcagtggttcatcttggtg
gtcaatttaacacacctgggaagaagaagcctcaactgaagaattgcttc
aatcagactggcccgtagacaggtctatgggacatattcttgatggctaa
ttgacgtaggagagagcagcccactgtgggtgactctgtccccagatagt
cagggcttgggctggataagaacacgagcctgagagtgaacctgtgagca
atgtgcttcaagttcctgccttggcccttcctcaacgatagacataaccc
ataggtaaaaataagtcctttcctcctccaagtgttttgggtcacggaca
tttgtcatagtgataggaaacagacctgtgaacataagctaatgagcata
gaagaactcctcttgtggaaccatttcc
gaattccttggatatcacacaagtgcgtttggcattgaatggagctggtc
agtgtgcctcatggtgctgccttcttattgagttagtgctttcaatgtaa
gacatgactacaaagaattttaggcaaaaggataaagttattgtagtcac
tcgagtagggcatgaatgctgatttcattcatcgtttctgcaattaatag
tcaagtgtcagccaattaattaagtcacaccacccacaggaattaggtct
aaaccgtgtttgtggaattaccagcaacattcgtgcctattgaggaagca
gcatttgcacatgcttcaagtgtcatgtctaccccagaatgacgtattcg
ttttcatctctgtctctcagctgtcatcccatgtctggagagtgtggctg
caagccgggttggtcgggactgtactgtaatgaaacatgctcccctggat
tctacggggaggcttgccaacagatctgcagctgccagaacggggcggac
tgcgacagtgtgactggaaggtgtgcctgcgctccaggattcaaagtgag
taacctgggctctggaggcaggagagggatacaagatggagaatagcaac
agcacgttttacgtgagctattgtgaactagagtaaatgtgatcaaacca
ttctcagcattcatgggaagggagctgtttgagataagtaactctaacat
tctactgatggctgagaacactgatgaaactgtcaaggcatcattgatgt
tcaatattaggacacatcaggaagtatgacccattatagctattccatat
atactggttttattctgacctgttggcaacaaagaaatagctcttcacat
gattattagttattattttcaacagtttctgtttgaattccacaaattta
aagacacaacatgcgtcaggttagcattataaggtgttcacactctgcgc
atggttttgagccctttgggagttagatcctacaaatgtacctgtactac
agaacacaactctgcttgtggtcctatgactcttggctatggggaaggaa
tgttcaactgtgaatttctttctttcattgtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_57561818_57562942
seq2: B6Ng01-290N15.b_49_1176 (reverse)

seq1  GGAAATGGGTCCCACAAGA-GATGTCTCCTATTGCTCATAAGCTTATG-T  48
      |||||| ||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||| |||||||| |
seq2  GGAAAT-GGTTCCACAAGAGGAGTTCTTCTA-TGCTCATTAGCTTATGTT  48

seq1  CACA-GTCTGTTTCCTATCACTATGACAAATGTCGTTGACCCAAAACAAC  97
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||
seq2  CACAGGTCTGTTTCCTATCACTATGACAAATGTCCGTGACCCAAAAC-AC  97

seq1  TTGG-GGAGGAAAGGACTTA-TTTTACTTATGGGTTATTGTCTATCGTTG  145
      |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  TTGGAGGAGGAAAGGACTTATTTTTACCTATGGGTTA-TGTCTATCGTTG  146

seq1  AGGAA-GGCCAAGGCAGGAACTTGAAGCACATTGCTCACAGGTTCACTCT  194
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGGCCAAGGCAGGAACTTGAAGCACATTGCTCACAGGTTCACTCT  196

seq1  CAGGCTCGTGTTCTTATCCAGCCCAAG-CCTGACTATCTGGGGACAGAGT  243
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTCGTGTTCTTATCCAGCCCAAGCCCTGACTATCTGGGGACAGAGT  246

seq1  CACCCACAGTGGGCTGCTCTCTCCTACGTCAATTAGCCATCAAGAATATG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACAGTGGGCTGCTCTCTCCTACGTCAATTAGCCATCAAGAATATG  296

seq1  TCCCATAGACCTGTCTACGGGCCAGTCTGATTGAAGCAATTCTTCAGTTG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATAGACCTGTCTACGGGCCAGTCTGATTGAAGCAATTCTTCAGTTG  346

seq1  AGGCTTCTTCTTCCCAGGTGTGTTAAATTGACCACCAAGATGAACCACTG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCTTCTTCCCAGGTGTGTTAAATTGACCACCAAGATGAACCACTG  396

seq1  CATCTTCTAAATAAATCTGACCTGTTTGCATTGGAGTGGCTGTCTCATTC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCTAAATAAATCTGACCTGTTTGCATTGGAGTGGCTGTCTCATTC  446

seq1  TACAGATGTTTAAATGGAAGGAGCTATGCCGTCCTTAGAAAAATACTGAG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATGTTTAAATGGAAGGAGCTATGCCGTCCTTAGAAAAATACTGAG  496

seq1  CAGTGAGAGGACACTTCCTTACTTAATTCCTCAGCTATAGTTGCCAGGGA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGAGGACACTTCCTTACTTAATTCCTCAGCTATAGTTGCCAGGGA  546

seq1  ACTATCCAGATACTGTTGTCTAGAAGGAAGAGACTCGGGGGAGGACACCC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCCAGATACTGTTGTCTAGAAGGAAGAGACTCGGGGGAGGACACCC  596

seq1  CCCTTCATAATCAGCATATTGCAAACCCAGGAACTGAACCTTCAGGAATC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCATAATCAGCATATTGCAAACCCAGGAACTGAACCTTCAGGAATC  646

seq1  TTGACTAAGGTCAAAAGAATAGTGTCTGAGCCATGTCTTTGGCCTAGGGT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTAAGGTCAAAAGAATAGTGTCTGAGCCATGTCTTTGGCCTAGGGT  696

seq1  AGAGACAGGACATATTAAACTGCACCCACAAAGAACATAGGATTACTATT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGGACATATTAAACTGCACCCACAAAGAACATAGGATTACTATT  746

seq1  TAGCAGGAAGCTTTCTGGCTGATAAAGCCTTTTATGTCCCCTCACATAAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGGAAGCTTTCTGGCTGATAAAGCCTTTTATGTCCCCTCACATAAG  796

seq1  AGTTCATTCAAATGAGCCTGTCTACTACCTAGACAGGAAAACACTCCCCA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATTCAAATGAGCCTGTCTACTACCTAGACAGGAAAACACTCCCCA  846

seq1  GGAAGGCTGTCCGTTCCAGGACTTTAAGAGATAGTAAAAAGCCTACCAAG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGCTGTCCGTTCCAGGACTTTAAGAGATAGTAAAAAGCCTACCAAG  896

seq1  GCATGTGAGTTGGCACAATGGTTTCTTTGGCCATTATCCATTCTTACCTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGAGTTGGCACAATGGTTTCTTTGGCCATTATCCATTCTTACCTC  946

seq1  TTAAGACAGTACCCTGTGCAGTGCTTTCTCTGGCCGTTGTCAAGTCTTGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGACAGTACCCTGTGCAGTGCTTTCTCTGGCCGTTGTCAAGTCTTGT  996

seq1  CATGTCAGAGTACTTTCCTTTGTACTGATCCCCTCGGCCATTGCCACAAT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCAGAGTACTTTCCTTTGTACTGATCCCCTCGGCCATTGCCACAAT  1046

seq1  TACCCCTCCAGGGTGCCCCCCCTTCTCTGTAATATACCCTGCCTATCTTT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCTCCAGGGTGCCCCCCCTTCTCTGTAATATACCCTGCCTATCTTT  1096

seq1  TACATTATTCTGCCTAAATCCTGTCTGAATTC  1125
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTATTCTGCCTAAATCCTGTCTGAATTC  1128

seq1: chr18_57418947_57420041
seq2: B6Ng01-290N15.g_69_1151

seq1  GAATTCCTTGGATATCACACAAGTGCGTTTGGCATTGAATGGAGCTGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGGATATCACACAAGTGCGTTTGGCATTGAATGGAGCTGGTC  50

seq1  AGTGTGCCTCATGGTGCTGCCTTCTTATTGAGTTAGTGCTTTCAATGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGCCTCATGGTGCTGCCTTCTTATTGAGTTAGTGCTTTCAATGTAA  100

seq1  GACATGACTACAAAGAATTTTAGGCAAAAGGATAAAGTTATTGTAGTCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGACTACAAAGAATTTTAGGCAAAAGGATAAAGTTATTGTAGTCAC  150

seq1  TCGAGTAGGGCATGAATGCTGATTTCATTCATCGTTTCTGCAATTAATAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGTAGGGCATGAATGCTGATTTCATTCATCGTTTCTGCAATTAATAG  200

seq1  TCAAGTGTCAGCCAATTAATTAAGTCACACCACCCACAGGAATTAGGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTGTCAGCCAATTAATTAAGTCACACCACCCACAGGAATTAGGTCT  250

seq1  AAACCGTGTTTGTGGAATTACCAGCAACATTCGTGCCTATTGAGGAAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCGTGTTTGTGGAATTACCAGCAACATTCGTGCCTATTGAGGAAGCA  300

seq1  GCATTTGCACATGCTTCAAGTGTCATGTCTACCCCAGAATGACGTATTCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTGCACATGCTTCAAGTGTCATGTCTACCCCAGAATGACGTATTCG  350

seq1  TTTTCATCTCTGTCTCTCAGCTGTCATCCCATGTCTGGAGAGTGTGGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATCTCTGTCTCTCAGCTGTCATCCCATGTCTGGAGAGTGTGGCTG  400

seq1  CAAGCCGGGTTGGTCGGGACTGTACTGTAATGAAACATGCTCCCCTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCGGGTTGGTCGGGACTGTACTGTAATGAAACATGCTCCCCTGGAT  450

seq1  TCTACGGGGAGGCTTGCCAACAGATCTGCAGCTGCCAGAACGGGGCGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACGGGGAGGCTTGCCAACAGATCTGCAGCTGCCAGAACGGGGCGGAC  500

seq1  TGCGACAGTGTGACTGGAAGGTGTGCCTGCGCTCCAGGATTCAAAGTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGACAGTGTGACTGGAAGGTGTGCCTGCGCTCCAGGATTCAAAGTGAG  550

seq1  TAACCTGGGCTCTGGAGGCAGGAGAGGGATACAAGATGGAGAATAGCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTGGGCTCTGGAGGCAGGAGAGGGATACAAGATGGAGAATAGCAAC  600

seq1  AGCACGTTTTACGTGAGCTATTGTGAACTAGAGTAAATGTGATCAAACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACGTTTTACGTGAGCTATTGTGAACTAGAGTAAATGTGATCAAACCA  650

seq1  TTCTCAGCATTCATGGGAAGGGAGCTGTTTGAGATAAGTAACTCTAACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGCATTCATGGGAAGGGAGCTGTTTGAGATAAGTAACTCTAACAT  700

seq1  TCTACTGATGGCTGAGAACACTGATGAAACTGTCAAGGCATCATTGATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTGATGGCTGAGAACACTGATGAAACTGTCAAGGCATCATTGATGT  750

seq1  TCAATATTAGGACACATCAGGAAGTATGACCCATTATAGCTATTCCATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATTAGGACACATCAGGAAGTATGACCCATTATAGCTATTCCATAT  800

seq1  ATACTGGTTTTATTCTGACCTGTTGGCAACAAAGAAATAGCTCTTCACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGTTTTATTCTGACCTGTTGGCAACAAAGAAATAGCTCTTCACAT  850

seq1  GATTATTAGTTATTATTTTCAACAGTTTCTGTTTGAATTCCACAAAATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GATTATTAGTTATTATTTTCAACAGTTTCTGTTTGAATTCCAC-AAATTT  899

seq1  AAAGACACAACATGCGTCAGGTTAGCATTATAAGGTGTTCACACTCTGCG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACACAACATGCGTCAGGTTAGCATTATAAGGTGTTCACACTCTGCG  949

seq1  CATGGTTTTGAGGCCCTTTTGGGAGTTTAGATCCTACAAATGTACCTGTA  1000
      ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTTTGAG--CCCTTTGGGAG-TTAGATCCTACAAATGTACCTGTA  996

seq1  CTACAGGAACACCAAACTCTGCCTGTGGTCCCTATGACTTCTTGGCTATT  1050
      ||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| 
seq2  CTACA-GAACAC--AACTCTGCTTGTGGT-CCTATGAC-TCTTGGCTATG  1041

seq1  GGGAAGGGGAAATGGTCAACTGTG-ATTTCTTTCTTTCCATTGTAA  1095
      |||||||   |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  GGGAAGG---AATGTTCAACTGTGAATTTCTTTCTTT-CATTGTAA  1083