seq1: chr18_43565096_43566274
seq2: B6Ng01-292I10.b_44_1213
seq1 GAATTCCAGCCCCAGGATCCACAGAGTGGGAGGAGGGAACAGATCCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCAGCCCCAGGATCCACAGAGTGGGAGGAGGGAACAGATCCCTTC 50
seq1 AAGTCACTATATGGCTGCCAGACTACTTTTAATCTAGCAGCCTGTGGTTC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGTCACTATATGGCTGCCAGACTACTTTTAATCTAGCAGCCTGTGGTTC 100
seq1 AGCCTTACGGTCCAGACTCTGGGTCTGTCTGTCCAGTGCCAAAAATCATC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCCTTACGGTCCAGACTCTGGGTCTGTCTGTCCAGTGCCAAAAATCATC 150
seq1 TTTCCCAGCAACATACTACATCACTAAAAGATGTCATGGGATGGTTTCAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTCCCAGCAACATACTACATCACTAAAAGATGTCATGGGATGGTTTCAA 200
seq1 TAAAGTCCCTGGACAGAGCCTCTTTGTGTTCCTCCCTTCTTGGCAAGAAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAGTCCCTGGACAGAGCCTCTTTGTGTTCCTCCCTTCTTGGCAAGAAG 250
seq1 CCATTTATGAGCCATCATTATGGGGACACATGGTTCCCACCATGGAGCTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATTTATGAGCCATCATTATGGGGACACATGGTTCCCACCATGGAGCTC 300
seq1 AGACATGAACTTTAACTCCGCTAATCACACAGATCACTGCTTAATTTCTA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGACATGAACTTTAACTCCGCTAATCACACAGATCACTGCTTAATTTCTA 350
seq1 CCCTTGCCTTGTAGTGACTGTGGTAGGAACCCAGATAATCTTTTTAAAGA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCTTGCCTTGTAGTGACTGTGGTAGGAACCCAGATAATCTTTTTAAAGA 400
seq1 ACTCTTCTGTAAAATGATGATAACGTGGTTCGATGAATCAGTGGTGTAAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTCTTCTGTAAAATGATGATAACGTGGTTCGATGAATCAGTGGTGTAAA 450
seq1 TGTAGATAAATTAAAGGATAGGTCCTGACATCTTGTGGATGCTTCCAGGA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTAGATAAATTAAAGGATAGGTCCTGACATCTTGTGGATGCTTCCAGGA 500
seq1 ACTAACTAATTAGTTTAAATAATGAAAGCATTGCATGATGTTGTTCAGTG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTAACTAATTAGTTTAAATAATGAAAGCATTGCATGATGTTGTTCAGTG 550
seq1 AGTGATCTCAAATAAAAGACAGCAAATACCCAGAAATTCCATGGGTATTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGATCTCAAATAAAAGACAGCAAATACCCAGAAATTCCATGGGTATTT 600
seq1 ATTTCAGCCCCATTTAGGAGACAGGGAAGCCTCTGCTTTTTATTTAGATC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTTCAGCCCCATTTAGGAGACAGGGAAGCCTCTGCTTTTTATTTAGATC 650
seq1 TTCAAAGGATACAAGAACCCCAAAAGGCCACACAGTCTCTCATCACTGAT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCAAAGGATACAAGAACCCCAAAAGGCCACACAGTCTCTCATCACTGAT 700
seq1 ATTATATTCAGAACATCCCTCTGCCCTGAGCTTCAGGCTGATTCATGTAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTATATTCAGAACATCCCTCTGCCCTGAGCTTCAGGCTGATTCATGTAA 750
seq1 CTACCTATGAAGTGGGTCCACCAAAATGAATATATGGACCCTAATTCCAT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTACCTATGAAGTGGGTCCACCAAAATGAATATATGGACCCTAATTCCAT 800
seq1 ATATCTGGTGAGCCTCATGGTCCAGTGCTCAGATCTTTCTTGGAGAATGA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATATCTGGTGAGCCTCATGGTCCAGTGCTCAGATCTTTCTTGGAGAATGA 850
seq1 AGGGCTAGCTTTTGACTAC-AAGGCTCTCCTCTTTCCTTAATCCCCTGCA 899
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGGCTAGCTTTTGACTACAAAGGCTCTCCTCTTTCCTTAATCCCCTGCA 900
seq1 GGACCAGACGAGGCTCCATTCTACCC-TTATATAATTCTGCCCTCATCTT 948
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2 GGACCAGACGAGGCTCCATTCTACCCTTTATATAATTCTGCCCTCATCTT 950
seq1 TTTTCTTTCATTTCCTTACATTGATGTCAACTTTAAAGCACTCTCAAGTA 998
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 TTTTCTTTCATTTCCTTACATTGATGTCAAC-TTAAAGCACTCTCAAGTA 999
seq1 GTGCCTTATGCTTCCAAAAGAACTTGGAACACCCAACAAGTCTATGATAA 1048
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
seq2 GTGCCTTATGCTTCCAAAAGAACTT-GAACACCCAACAAGTCTATGAT-A 1047
seq1 ATTCCAGAACTTTTCCTTGCATCTCCTTCCTGGAAAAATTCAGCTGGTGA 1098
||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||
seq2 ATTCCAG-ACTTT---CTGCATCTCTCT----GAAAAATTCAGCTGGTGA 1089
seq1 CATCT-CCTCTCACTTGGCT-CAATCAACTCAGAGGAAATCACTATACAA 1146
||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2 CATCTCCCTCTCACTTGCCTCCAATC-ACTCAGAGGAATTCACTATACAA 1138
seq1 GAT--CTCATCATAAACGCCTCATCCCAACTCACT 1179
||| || ||||| |||||||||||| |||||||
seq2 GATTCCTAATCAT-AACGCCTCATCC--ACTCACT 1170
| seq1: chr18_43702731_43702813
seq2: B6Ng01-292I10.g_69_151 (reverse)
seq1 TCTCCCCCTCTCTCCCACCCCTCTCTCACTATCATGAACATGGTGCATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTCCCCCTCTCTCCCACCCCTCTCTCACTATCATGAACATGGTGCATGA 50
seq1 GCTCAACATCAACCCTTATTGGGGCTGATGAGA 83
|||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTCAACATCAACCCTTATTGGGGCTGATGAGA 83
|