BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321C11
Chromosome18 (Build37)
Map Location 63,682,735 - 63,790,135
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC627792
Upstream geneFbxo38, Spink10, EG408198, 2700046A07Rik, Apcdd1, Napg, 9430028L06Rik, 9030411M15Rik
Downstream geneTxnl1, Wdr7, LOC629436, LOC667773, St8sia3, LOC433193, Onecut2, LOC667783, LOC100043304, Fech, Nars, Atp8b1, LOC629480
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321C11.bB6Ng01-321C11.g
ACCGA110339GA110340
length1,1191,046
definitionB6Ng01-321C11.b B6Ng01-321C11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,682,735 - 63,683,856)(63,789,536 - 63,790,135)
sequence
gaattcaaagggtattactgctcactgagagcgttctggttccagaagta
agagcctgagacagctctgctgggtttggtgatcagtgggaaatctccct
ctccattttagtttggtttgaacaaaaatggtcacagttcttcaaggata
atctttgcagcggtattattatctgttgaggcacttcacctatttgtctt
gtgcaatcctatgagaatgtcccaacactgtataggtaagtgaagggcac
ggatggtttcctagttgcaggatatataaagatgtcagctgatttgttta
ggctagtcatagatgctcattgtgtctgtccattagaagttgaggatgaa
atgttggagatcaataaattccatcagctttcctcgggcagcctgaaaga
aacagtattctttaccaaaaatctcaaggagcaaattgtcttttgcagga
aatgtgtggttgacacagaaccaagtaagtgacctccatttttttgttgt
taattttatggcgagctagggtgcagattatttatgctgctttcatagaa
tgagcaataatttggccttgacagattcaaacccaagctctggatttaat
aaaataggagaggacataagatgtttctttccctgctgctgtgatagaat
atgctaacaaagcaacttggggaaggaagggttaattttggctgacagtt
ccaggatctacaatccatcatggcagggaactggtgctgcgggagcttga
ggcagcgaatcatatttatagtcgggaagcagagggacatgaatgttggc
actcaactagctttgtcccttatatacactccaggatccccaaccagaga
aaggtcctgcccagagtgaagacaggacttcccacattagttaaccccat
caagataatcctttgtaggtatccccagagacccatatctctcagtaatt
ctaagatttattttgattgatatgtatgtatatgtgtgattgtataaatt
tatgtgcactgaatgagccaggacggtgtcagattgcctggaactggtgt
tataggcaactgtgagccacatgtaatgtgctgagactggtgatacgaac
gttgtgagccaccaggtgt
gaattctttgtctggaattttatgtagtcattctcactgagaggcattgt
tactctaggattgctagatttttagctgatatatgttgcctcaaaagtgt
taaggagtatatttaaccttggaggtaaaatcttgtataagggaaaactt
taagacaccaaaagaagaaattgaagaagacattagatgatgaaaagact
atctatgctcctgactgcagatgctcctgatcagatttaatgcaatcacc
atcaaattccaaatatatttttcacaaaactagaaaaaaaaagtatgtaa
tttaaaaagactgtgattatccaatattaattaatactgactaagcagaa
agaacaaggctggaggcatcacattacctgacctcaagttatgtaacaga
ggcccagtgataaagaaagcatggcagcagcacaaagacagacatgtaga
catggcaatggcacaaagacagacatgcagacatggcaatggcacaagga
cagacatgtagacatggcaatggcacaagaacaggcatgaagatctatga
aatggattaaaaaaaccaaagataaatcaacacatttatgggcctttaat
ctttaataaagatgccaaaatattcactggaaaatcatagctttttcaat
aaatggctatgtcaaaaatgaatctccaactgcaaaagaataaaattaaa
tctatatccatcatcatgtacaaaaattgattcaaactatatcaaaggtc
ttactttgaaatggtatgtgctgtatctgctttaaaaatatgggggaaac
cactttaggatgtgggtataggcaacacatttccaaatagaacaccacta
gcacaggaaatagcccaaattagcaaatataatattaaattaaaaagact
ctacataccaaaaatgtttcaacaagatgaatagaaaatgttcataaaag
gagaaattattttctagttaaacctcagatagagtctatataaaaatatc
taaagaactacaaaaattgaacactcaaaatacaaaacgatcagtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_63682735_63683856
seq2: B6Ng01-321C11.b_46_1164

seq1  GAATTCAAAGGGTATTACTGCTCACTGAGAGCGTTCTGGTTCCAGAAGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGGGTATTACTGCTCACTGAGAGCGTTCTGGTTCCAGAAGTA  50

seq1  AGAGCCTGAGACAGCTCTGCTGGGTTTGGTGATCAGTGGGAAATCTCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTGAGACAGCTCTGCTGGGTTTGGTGATCAGTGGGAAATCTCCCT  100

seq1  CTCCATTTTAGTTTGGTTTGAACAAAAATGGTCACAGTTCTTCAAGGATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATTTTAGTTTGGTTTGAACAAAAATGGTCACAGTTCTTCAAGGATA  150

seq1  ATCTTTGCAGCGGTATTATTATCTGTTGAGGCACTTCACCTATTTGTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTGCAGCGGTATTATTATCTGTTGAGGCACTTCACCTATTTGTCTT  200

seq1  GTGCAATCCTATGAGAATGTCCCAACACTGTATAGGTAAGTGAAGGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATCCTATGAGAATGTCCCAACACTGTATAGGTAAGTGAAGGGCAC  250

seq1  GGATGGTTTCCTAGTTGCAGGATATATAAAGATGTCAGCTGATTTGTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGTTTCCTAGTTGCAGGATATATAAAGATGTCAGCTGATTTGTTTA  300

seq1  GGCTAGTCATAGATGCTCATTGTGTCTGTCCATTAGAAGTTGAGGATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGTCATAGATGCTCATTGTGTCTGTCCATTAGAAGTTGAGGATGAA  350

seq1  ATGTTGGAGATCAATAAATTCCATCAGCTTTCCTCGGGCAGCCTGAAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGGAGATCAATAAATTCCATCAGCTTTCCTCGGGCAGCCTGAAAGA  400

seq1  AACAGTATTCTTTACCAAAAATCTCAAGGAGCAAATTGTCTTTTGCAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTATTCTTTACCAAAAATCTCAAGGAGCAAATTGTCTTTTGCAGGA  450

seq1  AATGTGTGGTTGACACAGAACCAAGTAAGTGACCTCCATTTTTTTGTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGGTTGACACAGAACCAAGTAAGTGACCTCCATTTTTTTGTTGT  500

seq1  TAATTTTATGGCGAGCTAGGGTGCAGATTATTTATGCTGCTTTCATAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTATGGCGAGCTAGGGTGCAGATTATTTATGCTGCTTTCATAGAA  550

seq1  TGAGCAATAATTTGGCCTTGACAGATTCAAACCCAAGCTCTGGATTTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAATAATTTGGCCTTGACAGATTCAAACCCAAGCTCTGGATTTAAT  600

seq1  AAAATAGGAGAGGACATAAGATGTTTCTTTCCCTGCTGCTGTGATAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAGGAGAGGACATAAGATGTTTCTTTCCCTGCTGCTGTGATAGAAT  650

seq1  ATGCTAACAAAGCAACTTGGGGAAGGAAGGGTTAATTTTGGCTGACAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAACAAAGCAACTTGGGGAAGGAAGGGTTAATTTTGGCTGACAGTT  700

seq1  CCAGGATCTACAATCCATCATGGCAGGGAACTGGTGCTGCGGGAGCTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATCTACAATCCATCATGGCAGGGAACTGGTGCTGCGGGAGCTTGA  750

seq1  GGCAGCGAATCATATTTATAGTCGGGAAGCAGAGGGACATGAATGTTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCGAATCATATTTATAGTCGGGAAGCAGAGGGACATGAATGTTGGC  800

seq1  ACTCAACTAGCTTTGTCCCTTATATACACTCCAGGATCCCCAACCAGAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAACTAGCTTTGTCCCTTATATACACTCCAGGATCCCCAACCAGAGA  850

seq1  AAGGTCCTGCCCAGAGTGAAGACAGGACTTCCCACATTAGTTAACCCCAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCCTGCCCAGAGTGAAGACAGGACTTCCCACATTAGTTAACCCCAT  900

seq1  CAAGATAATCCTTTGTAGGTATCCCCAGAGACCCATATCTCTCAGGTAAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CAAGATAATCCTTTGTAGGTATCCCCAGAGACCCATATCTCTCA-GTAAT  949

seq1  TCTAAGATTTATTTTGATTGATATGTATGTATATGTGTGATTGTATAAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGATTTATTTTGATTGATATGTATGTATATGTGTGATTGTATAAAT  999

seq1  TTATGTGCACTGAATGAGGCCAGAGGGTGTCAGATTGCCTGGAACTGGTG  1050
      |||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTGCACTGAATGAGCCAGGACGGTGTCAGATTGCCTGGAACTGGTG  1049

seq1  TTATAGGCAACTGTGAGCCACCATGT-ATGTGCTGAGAACTGGTGATACA  1099
      |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| 
seq2  TTATAGGCAACTGTGAGCCA-CATGTAATGTGCTGAG-ACTGGTGATAC-  1096

seq1  GACAGTTGTGAGCCACCATGTGT  1122
      ||  |||||||||||||| ||||
seq2  GAACGTTGTGAGCCACCAGGTGT  1119

seq1: chr18_63789536_63790135
seq2: B6Ng01-321C11.g_66_665 (reverse)

seq1  ATTAAAGGCCCATAAATGTGTTGATTTATCTTTGGTTTTTTTAATCCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGGCCCATAAATGTGTTGATTTATCTTTGGTTTTTTTAATCCATT  50

seq1  TCATAGATCTTCATGCCTGTTCTTGTGCCATTGCCATGTCTACATGTCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGATCTTCATGCCTGTTCTTGTGCCATTGCCATGTCTACATGTCTG  100

seq1  TCCTTGTGCCATTGCCATGTCTGCATGTCTGTCTTTGTGCCATTGCCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTGCCATTGCCATGTCTGCATGTCTGTCTTTGTGCCATTGCCATG  150

seq1  TCTACATGTCTGTCTTTGTGCTGCTGCCATGCTTTCTTTATCACTGGGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACATGTCTGTCTTTGTGCTGCTGCCATGCTTTCTTTATCACTGGGCC  200

seq1  TCTGTTACATAACTTGAGGTCAGGTAATGTGATGCCTCCAGCCTTGTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTACATAACTTGAGGTCAGGTAATGTGATGCCTCCAGCCTTGTTCT  250

seq1  TTCTGCTTAGTCAGTATTAATTAATATTGGATAATCACAGTCTTTTTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTTAGTCAGTATTAATTAATATTGGATAATCACAGTCTTTTTAAA  300

seq1  TTACATACTTTTTTTTTCTAGTTTTGTGAAAAATATATTTGGAATTTGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATACTTTTTTTTTCTAGTTTTGTGAAAAATATATTTGGAATTTGAT  350

seq1  GGTGATTGCATTAAATCTGATCAGGAGCATCTGCAGTCAGGAGCATAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTGCATTAAATCTGATCAGGAGCATCTGCAGTCAGGAGCATAGAT  400

seq1  AGTCTTTTCATCATCTAATGTCTTCTTCAATTTCTTCTTTTGGTGTCTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTTCATCATCTAATGTCTTCTTCAATTTCTTCTTTTGGTGTCTTA  450

seq1  AAGTTTTCCCTTATACAAGATTTTACCTCCAAGGTTAAATATACTCCTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTCCCTTATACAAGATTTTACCTCCAAGGTTAAATATACTCCTTA  500

seq1  ACACTTTTGAGGCAACATATATCAGCTAAAAATCTAGCAATCCTAGAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTTTGAGGCAACATATATCAGCTAAAAATCTAGCAATCCTAGAGTA  550

seq1  ACAATGCCTCTCAGTGAGAATGACTACATAAAATTCCAGACAAAGAATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGCCTCTCAGTGAGAATGACTACATAAAATTCCAGACAAAGAATTC  600