BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321D15
Chromosome18 (Build37)
Map Location 73,485,254 - 73,594,490
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDcc, LOC629684, LOC100043411, LOC100042955
Downstream geneRkhd2, Smad4, Elac1, Me2, Mro, Mapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321D15.bB6Ng01-321D15.g
ACCGA110391GA110392
length1,1631,089
definitionB6Ng01-321D15.b B6Ng01-321D15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,593,322 - 73,594,490)(73,485,254 - 73,486,351)
sequence
gaattcatgggtgaggagagatcatacattggctaccgtgtttcccacag
ttaagccccaggggagaaccgacgactatcttactaaatgaaccgtcttc
taaatacctatctttatacctaaacttggtccaattctcaaccctcatag
gagaaacttctctttgcagtggacggcagttaactctgagactcatactg
agcttgtcagagtgcagagagtaagcacctgtgggctgctcagtctgttg
tgacttctgtatcatatccctatccctcaagacacagtgtagaagcagga
agagaaggattgttagagctagggtttgggaaagactgttgtagaacagt
gtctttcggatatgatagaatttccaagccatctctgatatagcaacact
caaatcccccgatttgttcatatttctgggtaattctgggtctgttattc
ttggttagagaagagttatctaacttacacagtctctttgttgttggact
ttaaaaatagtctttctgtataacattgtcaacttattaacctctagacc
tggaaaaaattggaatatccaggcagtcatatttttagctgttttcctct
gaaggcaacatcaatcatacaaatgtctttgactcctgtttggttactgc
accaacaattgagtctaactttctaagttagaaggagataatggtttctt
ggggtaataaagctgtcaggaggagggagcctttcatctaactcagtaag
aaatgtgtatgcatcgggttgtagcacaaggacacggaggagagagcaac
atctggagaatctagagacttcaacagctctataatttacagtcctcaga
aagacgcctagagtcagtggcctggaaacctggcttcttcctcattccca
ggacagactgactgaatggccctgggcaacttgcctgacctttccttgtt
acttgtattcattctatagacaaagattctaatattcatctatctcttca
tttataccccaagaagtcctcatatctctctctctctctctctctctctc
tctctctctcccttcactctgttctgtctctgtcactctcagtggagaga
tgtgagacatcatgaaaatgctgagttcaatcgaagctctgattaataac
acatattactggc
gaattcaatgaaagctgtccttgaaatacttaggaattatagctgcttat
ggaataacacatgacataggctaacaacatcaaaaagaaggttcaaaaca
caagtcatttgaagttaactagtatttgtatggaaagagaggtgagagaa
aggctggcatcttaggttcagagcttagaaacagatcccgagaggaaaat
gtgatatggttcagtaatagaatgtttgcttagcgttcacaaggttcaaa
gttctaggttctctattacaacaagaaaggtcagaaaagaaagaatgaaa
agaaaaaaggagggaggaaaacatagagggacagaaggaaaaaggaaaaa
aacaaaatttattttttaaaaaaatgtaagaaaatagttcccagagcagg
caatgacagcctcacatttaagcgaaattgtcatcaaccctaatagcctg
tataagtctaaattcatagacaagacataggacaggagagacttgatact
ccacaagttgttcactcacctaccacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacactgatgatagtatccttaattaagctttttaac
tttatgaaaatatcatacattcatacaataaatcttgcttgtgctcattt
tctccttcagttcagcttccctgtctatctgtctttccaattttatgttt
tttttaatcccactaagtcaaattatcgctgtccatatgtgcatgtgtat
catgcatggacaacctaataatatccattggttactcctctatttatgta
aagagatgccatgacagagacaaattttataatagaaagtttaattgaag
gattggttacagtataaaggttggtccatagtcatcatggcagaaagaag
acatgctaagagatttattatagccccaaaaggagagagagagagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagataacagag
agacgctatgtcatgttcagaggcctgttctcccagtattctttctctca
tctctccatctcatctcatcttaatgatgcctccttggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_73593322_73594490
seq2: B6Ng01-321D15.b_46_1208 (reverse)

seq1  GCCAGTAAATATGTGTATAATAAAAACAAGAGCTTCGATTG-ACTCAGCA  49
      |||||| |||||||||    ||  ||  ||||||||||||| ||||||||
seq2  GCCAGT-AATATGTGT----TATTAATCAGAGCTTCGATTGAACTCAGCA  45

seq1  TCTCAATGATGTCTCACATCTCTCCACTGAGAGTGACAGAGACAGAAACA  99
      | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTTTCATGATGTCTCACATCTCTCCACTGAGAGTGACAGAGACAG-AACA  94

seq1  GAGTGAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGA  149
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATATGA  144

seq1  GGACTTCCTTGGGGTATAAATGAAGAGATAGATGAATATTAGAATCTTTG  199
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTT-CTTGGGGTATAAATGAAGAGATAGATGAATATTAGAATCTTTG  193

seq1  TCTATAGAATGAATACAAGTAACAAGGAAAGGTCAGGCAAGTTGCCCAGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGAATGAATACAAGTAACAAGGAAAGGTCAGGCAAGTTGCCCAGG  243

seq1  GCCATTCAGTCAGTCTGTCCTGGGAATGAGGAAGAAGCCAGGTTTCCAGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTCAGTCAGTCTGTCCTGGGAATGAGGAAGAAGCCAGGTTTCCAGG  293

seq1  CCACTGACTCTAGGCGTCTTTCTGAGGACTGTAAATTATAGAGCTGTTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGACTCTAGGCGTCTTTCTGAGGACTGTAAATTATAGAGCTGTTGA  343

seq1  AGTCTCTAGATTCTCCAGATGTTGCTCTCTCCTCCGTGTCCTTGTGCTAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTAGATTCTCCAGATGTTGCTCTCTCCTCCGTGTCCTTGTGCTAC  393

seq1  AACCCGATGCATACACATTTCTTACTGAGTTAGATGAAAGGCTCCCTCCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCGATGCATACACATTTCTTACTGAGTTAGATGAAAGGCTCCCTCCT  443

seq1  CCTGACAGCTTTATTACCCCAAGAAACCATTATCTCCTTCTAACTTAGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACAGCTTTATTACCCCAAGAAACCATTATCTCCTTCTAACTTAGAA  493

seq1  AGTTAGACTCAATTGTTGGTGCAGTAACCAAACAGGAGTCAAAGACATTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGACTCAATTGTTGGTGCAGTAACCAAACAGGAGTCAAAGACATTT  543

seq1  GTATGATTGATGTTGCCTTCAGAGGAAAACAGCTAAAAATATGACTGCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGATTGATGTTGCCTTCAGAGGAAAACAGCTAAAAATATGACTGCCT  593

seq1  GGATATTCCAATTTTTTCCAGGTCTAGAGGTTAATAAGTTGACAATGTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTCCAATTTTTTCCAGGTCTAGAGGTTAATAAGTTGACAATGTTA  643

seq1  TACAGAAAGACTATTTTTAAAGTCCAACAACAAAGAGACTGTGTAAGTTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAAGACTATTTTTAAAGTCCAACAACAAAGAGACTGTGTAAGTTA  693

seq1  GATAACTCTTCTCTAACCAAGAATAACAGACCCAGAATTACCCAGAAATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACTCTTCTCTAACCAAGAATAACAGACCCAGAATTACCCAGAAATA  743

seq1  TGAACAAATCGGGGGATTTGAGTGTTGCTATATCAGAGATGGCTTGGAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAAATCGGGGGATTTGAGTGTTGCTATATCAGAGATGGCTTGGAAA  793

seq1  TTCTATCATATCCGAAAGACACTGTTCTACAACAGTCTTTCCCAAACCCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATCATATCCGAAAGACACTGTTCTACAACAGTCTTTCCCAAACCCT  843

seq1  AGCTCTAACAATCCTTCTCTTCCTGCTTCTACACTGTGTCTTGAGGGATA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTAACAATCCTTCTCTTCCTGCTTCTACACTGTGTCTTGAGGGATA  893

seq1  GGGATATGATACAGAAGTCACAACAGACTGAGCAGCCCACAGGTGCTTAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATATGATACAGAAGTCACAACAGACTGAGCAGCCCACAGGTGCTTAC  943

seq1  TCTCTGCACTCTGACAAGCTCAGTATGAGTCTCAGAGTTAACTGCCGTCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCACTCTGACAAGCTCAGTATGAGTCTCAGAGTTAACTGCCGTCC  993

seq1  ACTGCAAAGAGAAGTTTCTCCTATGAGGGTTGAGAATTGGACCAAGTTTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAAAGAGAAGTTTCTCCTATGAGGGTTGAGAATTGGACCAAGTTTA  1043

seq1  GGTATAAAGATAGGTATTTAGAAGACGGTTCATTTAGTAAGATAGTCGTC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAAAGATAGGTATTTAGAAGACGGTTCATTTAGTAAGATAGTCGTC  1093

seq1  GGTTCTCCCCTGGGGCTTAACTGTGGGAAACACGGTAGCCAATGTATGAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTCCCCTGGGGCTTAACTGTGGGAAACACGGTAGCCAATGTATGAT  1143

seq1  CTCTCCTCACCCATGAATTC  1169
      ||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCTCACCCATGAATTC  1163

seq1: chr18_73485254_73486351
seq2: B6Ng01-321D15.g_67_1155

seq1  GAATTCAATGAAAGCTGTCCTTGAAATACTTAGGAATTATAGCTGCTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGAAAGCTGTCCTTGAAATACTTAGGAATTATAGCTGCTTAT  50

seq1  GGAATAACACATGACATAGGCTAACAACATCAAAAAGAAGGTTCAAAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAACACATGACATAGGCTAACAACATCAAAAAGAAGGTTCAAAACA  100

seq1  CAAGTCATTTGAAGTTAACTAGTATTTGTATGGAAAGAGAGGTGAGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCATTTGAAGTTAACTAGTATTTGTATGGAAAGAGAGGTGAGAGAA  150

seq1  AGGCTGGCATCTTAGGTTCAGAGCTTAGAAACAGATCCCGAGAGGAAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGCATCTTAGGTTCAGAGCTTAGAAACAGATCCCGAGAGGAAAAT  200

seq1  GTGATATGGTTCAGTAATAGAATGTTTGCTTAGCGTTCACAAGGTTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATATGGTTCAGTAATAGAATGTTTGCTTAGCGTTCACAAGGTTCAAA  250

seq1  GTTCTAGGTTCTCTATTACAACAAGAAAGGTCAGAAAAGAAAGAATGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAGGTTCTCTATTACAACAAGAAAGGTCAGAAAAGAAAGAATGAAA  300

seq1  AGAAAAAAGGAGGGAGGAAAACATAGAGGGACAGAAGGAAAAAGGAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAAAGGAGGGAGGAAAACATAGAGGGACAGAAGGAAAAAGGAAAAA  350

seq1  AACAAAATTTATTTTTTAAAAAAATGTAAGAAAATAGTTCCCAGAGCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAATTTATTTTTTAAAAAAATGTAAGAAAATAGTTCCCAGAGCAGG  400

seq1  CAATGACAGCCTCACATTTAAGCGAAATTGTCATCAACCCTAATAGCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACAGCCTCACATTTAAGCGAAATTGTCATCAACCCTAATAGCCTG  450

seq1  TATAAGTCTAAATTCATAGACAAGACATAGGACAGGAGAGACTTGATACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTCTAAATTCATAGACAAGACATAGGACAGGAGAGACTTGATACT  500

seq1  CCACAAGTTGTTCACTCACCTACCACACACACACACACACACACACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAGTTGTTCACTCACCTACCACACACACACACACACACACACACAC  550

seq1  ACACACACACACACACACTGATGATAGTATCCTTAATTAAGCTTTTTAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACTGATGATAGTATCCTTAATTAAGCTTTTTAAC  600

seq1  TTTATGAAAATATCATACATTCATACAATAAATCTTGCTTGTGCTCATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGAAAATATCATACATTCATACAATAAATCTTGCTTGTGCTCATTT  650

seq1  TCTCCTTCAGTTCAGCTTCCCTGTCTATCTGTCTTTCCAATTTTATGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTCAGTTCAGCTTCCCTGTCTATCTGTCTTTCCAATTTTATGTTT  700

seq1  TTTTTAATCCCACTAAGTCAAATTATCGCTGTCCATATGTGCATGTGTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAATCCCACTAAGTCAAATTATCGCTGTCCATATGTGCATGTGTAT  750

seq1  CATGCATGGACAACCTAATAATATCCATTGGTTACTCCTCTATTTATGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCATGGACAACCTAATAATATCCATTGGTTACTCCTCTATTTATGTA  800

seq1  AAGAGATGCCATGACAGAGACAAATTTTATAATAGAAAGTTTAATTGAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATGCCATGACAGAGACAAATTTTATAATAGAAAGTTTAATTGAAG  850

seq1  GATTGGTTACAGTAT-AAGGTTGGTCCATAGTCATCATGGCAGAAAGAAG  899
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGGTTACAGTATAAAGGTTGGTCCATAGTCATCATGGCAGAAAGAAG  900

seq1  ACATGCTAAGAGATTTATTATAGGCCCCAAAAGGGAGAGAGAGAGAGAGA  949
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACATGCTAAGAGATTTATTATA-GCCCCAAAA-GGAGAGAGAGAGAGAGA  948

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATA-ACA  997

seq1  GA-AGACAGCTATGTCATGTCCAGAGGCTGGTCCTTCCCAGTATTCCTTT  1048
      || |||| |||||||||||| |||||||  || | |||||||||| ||||
seq2  GAGAGAC-GCTATGTCATGTTCAGAGGCCTGTTC-TCCCAGTATT-CTTT  1044

seq1  CTCTCTTTCTCTTCCATTCTTCCTTCTCCTTCTTATTGATG-CTCCTTGG  1097
      |||||  |||| |||| |||  | ||| | ||||| ||||| ||||||||
seq2  CTCTC-ATCTC-TCCA-TCT--CATCT-CATCTTAATGATGCCTCCTTGG  1088

seq1  G  1098
      |
seq2  G  1089