BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-325K22
Chromosome18 (Build37)
Map Location 26,874,730 - 27,020,945
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBrunol4, LOC665916, LOC100041263, LOC100041274
Downstream geneEG665977, EG665646
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-325K22.bB6Ng01-325K22.g
ACCGA113678GA113679
length1,151973
definitionB6Ng01-325K22.b B6Ng01-325K22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,019,787 - 27,020,945)(26,874,730 - 26,875,705)
sequence
gaattcttcaatggaattttgtctcagccatagtctcagaatgagacttc
aggaaaacttgcttggaattacacattatttttaaagatagctttaaaat
atagactattgggattttacagtgagtgtgcacgtggtagtgatttgttg
gaaggttgtgaactgtggagtggagaccatggctagaatatgaagattat
tgaaggcagataactgagagttatagctcagagttgttccctgcagcaac
tcttcttgatcacttctgatgtaagaattcctagaacacaagtattggta
ccatagataagtctggcttagcttccacacatatcctaacttgacatgct
ctgttccatgaaactgtgaaccaaaataatcatcttcttaactaaataaa
ataaaaaaaaatagtatctttcagatatttcctcttagcttcaggaaaag
tagctaatacatcattccatgttctctaaaaattaaataagtaaataaat
aataaataatgtgcaaaatacctgaaaaatgttcctttgtcactatttca
gtggagttctgacccatcttctgataacagtcagctgagcaggctgtatt
tcatgaattcctgctacctcccatacctcaacagttacacaatgccaaca
ccctatagttctctaagcaaaagcaacttctttaagagtctgtcttatgc
ccatggcaccatgtccaacaattccatcactaaaagtcttggcattcaat
tgagtacataagatattgtcatatgcagaatccactcacctagatatcat
taatgatgataataaaatgacaaaatattttactgattgtgtagttgtgg
tcagtgaagccataggtttaagattgctagttcatctatggtacctagga
gaagaaatacatagacaagaggaacaatgtcattctcattacagttgctt
gggcatgagaatgcacacatgattttccaaaccctgaaagtcagtgaaag
tagctattgtctggaagtgggcatattcatatgcttcccaaatctatgaa
gcttgtcagtagagagcaataaatcactaaggtgatgatctagatgaaat
tgttacgaggaatgtttagcatagtattaacaggtaaaaaatttaccttg
t
gaattccatgacagcatggagtacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacaatcttgttgagaaaagaaacacaaaataatcataaaaac
aataataataatacttatgattgctaataataatggcatcaagctaattg
ttaaaataatatatatgtaaaaattataatatatgaagtatgttatatga
tatatgactcatgacacatgacacgtgttatgatatatgatgtaaaacta
atatatggtatgtgatatgtggcgtgttatgatatatgatgtaaaactaa
tatatggtatgtgatatgtggtacatgaaacatgatatgatatacaatat
atgattgatattgatgtttatgatatatgattgacatatgatatgtgatt
gatacatgatgatacatgttatatgatatatgatataagttaaatgacat
ataatatatgatatattatatgtgatgcatgacaaatgatacatagtaca
cgatatatgatatgagatatatacatgatacatgatacaaaaaataacaa
taatgtaatacaatataatgtaataatataaacaataatagttttatgat
ggagattctcatttaagaataattggcagtcatagcttcccatatattct
tctagattctgcctttaatcaatgtagaacaagtatctctttaatgtaat
caatgtagaacaagtatctcttttaatgatgtaattgtactattgcagtg
gtgctatattaccactgaaattttcacagatgaggatactaggactagag
aagtgaataacatatcctaacagccttatcagtgatcaaaaaattcatct
tcttgagcttcagctgagaccaaataatcaataatcaaattgaccctcta
ctatgattctagcagagcttccatcctcatttgtggtgaataagatgatt
tctctcatgactgtacaagccta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_27019787_27020945
seq2: B6Ng01-325K22.b_43_1193 (reverse)

seq1  ACAAGATAAATTTTTTACCTGTAGATTACTATGCT-AACATTCTCTGTAA  49
      ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||   ||||
seq2  ACAAGGTAAATTTTTTACCTGT-TAATACTATGCTAAACATTCCTCGTAA  49

seq1  CAAATTTCCATCTAGATTCATCCACTTAGTGATTTATTGCTTCTCTACTT  99
      |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| 
seq2  CAA--TTTCATCTAGA-TCATCACCTTAGTGATTTATTGC-TCTCTACT-  94

seq1  CCACAAGCTTCATAGATTTGGGGAAAGCATATGAATATGCCCACTTCCAG  149
        ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GACAAGCTTCATAGATTTGGG--AAGCATATGAATATGCCCACTTCCAG  141

seq1  ACAATAGCTACTTTCACTGACTTTCAGGGTTTGGAAAATCATGTGTGCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAGCTACTTTCACTGACTTTCAGGGTTTGGAAAATCATGTGTGCAT  191

seq1  TCTCATGCCCAAGCAACTGTAATGAGAATGACATTGTTCCTCTTGTCTAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATGCCCAAGCAACTGTAATGAGAATGACATTGTTCCTCTTGTCTAT  241

seq1  GTATTTCTTCTCCTAGGTACCATAGATGAACTAGCAATCTTAAACCTATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTCTTCTCCTAGGTACCATAGATGAACTAGCAATCTTAAACCTATG  291

seq1  GCTTCACTGACCACAACTACACAATCAGTAAAATATTTTGTCATTTTATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACTGACCACAACTACACAATCAGTAAAATATTTTGTCATTTTATT  341

seq1  ATCATCATTAATGATATCTAGGTGAGTGGATTCTGCATATGACAATATCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCATTAATGATATCTAGGTGAGTGGATTCTGCATATGACAATATCT  391

seq1  TATGTACTCAATTGAATGCCAAGACTTTTAGTGATGGAATTGTTGGACAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACTCAATTGAATGCCAAGACTTTTAGTGATGGAATTGTTGGACAT  441

seq1  GGTGCCATGGGCATAAGACAGACTCTTAAAGAAGTTGCTTTTGCTTAGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCATGGGCATAAGACAGACTCTTAAAGAAGTTGCTTTTGCTTAGAG  491

seq1  AACTATAGGGTGTTGGCATTGTGTAACTGTTGAGGTATGGGAGGTAGCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATAGGGTGTTGGCATTGTGTAACTGTTGAGGTATGGGAGGTAGCAG  541

seq1  GAATTCATGAAATACAGCCTGCTCAGCTGACTGTTATCAGAAGATGGGTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGAAATACAGCCTGCTCAGCTGACTGTTATCAGAAGATGGGTC  591

seq1  AGAACTCCACTGAAATAGTGACAAAGGAACATTTTTCAGGTATTTTGCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCCACTGAAATAGTGACAAAGGAACATTTTTCAGGTATTTTGCAC  641

seq1  ATTATTTATTATTTATTTACTTATTTAATTTTTAGAGAACATGGAATGAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTATTATTTATTTACTTATTTAATTTTTAGAGAACATGGAATGAT  691

seq1  GTATTAGCTACTTTTCCTGAAGCTAAGAGGAAATATCTGAAAGATACTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAGCTACTTTTCCTGAAGCTAAGAGGAAATATCTGAAAGATACTAT  741

seq1  TTTTTTTTATTTTATTTAGTTAAGAAGATGATTATTTTGGTTCACAGTTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTATTTTATTTAGTTAAGAAGATGATTATTTTGGTTCACAGTTT  791

seq1  CATGGAACAGAGCATGTCAAGTTAGGATATGTGTGGAAGCTAAGCCAGAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAACAGAGCATGTCAAGTTAGGATATGTGTGGAAGCTAAGCCAGAC  841

seq1  TTATCTATGGTACCAATACTTGTGTTCTAGGAATTCTTACATCAGAAGTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTATGGTACCAATACTTGTGTTCTAGGAATTCTTACATCAGAAGTG  891

seq1  ATCAAGAAGAGTTGCTGCAGGGAACAACTCTGAGCTATAACTCTCAGTTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGAAGAGTTGCTGCAGGGAACAACTCTGAGCTATAACTCTCAGTTA  941

seq1  TCTGCCTTCAATAATCTTCATATTCTAGCCATGGTCTCCACTCCACAGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTTCAATAATCTTCATATTCTAGCCATGGTCTCCACTCCACAGTT  991

seq1  CACAACCTTCCAACAAATCACTACCACGTGCACACTCACTGTAAAATCCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACCTTCCAACAAATCACTACCACGTGCACACTCACTGTAAAATCCC  1041

seq1  AATAGTCTATATTTTAAAGCTATCTTTAAAAATAATGTGTAATTCCAAGC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTCTATATTTTAAAGCTATCTTTAAAAATAATGTGTAATTCCAAGC  1091

seq1  AAGTTTTCCTGAAGTCTCATTCTGAGACTATGGCTGAGACAAAATTCCAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTCCTGAAGTCTCATTCTGAGACTATGGCTGAGACAAAATTCCAT  1141

seq1  TGAAGAATTC  1159
      ||||||||||
seq2  TGAAGAATTC  1151

seq1: chr18_26874730_26875705
seq2: B6Ng01-325K22.g_67_1039

seq1  GAATTCCATGACAGCATGGAGTACACACACACACACACACACACACACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGACAGCATGGAGTACACACACACACACACACACACACACAC  50

seq1  ACACACACACAATCTTGTTGAGAAAAGAAACACAAAATAATCATAAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACAATCTTGTTGAGAAAAGAAACACAAAATAATCATAAAAAC  100

seq1  AATAATAATAATACTTATGATTGCTAATAATAATGGCATCAAGCTAATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATAATAATACTTATGATTGCTAATAATAATGGCATCAAGCTAATTG  150

seq1  TTAAAATAATATATATGTAAAAATTATAATATATGAAGTATGTTATATGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATAATATATATGTAAAAATTATAATATATGAAGTATGTTATATGA  200

seq1  TATATGACTCATGACACATGACACGTGTTATGATATATGATGTAAAACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGACTCATGACACATGACACGTGTTATGATATATGATGTAAAACTA  250

seq1  ATATATGGTATGTGATATGTGGCGTGTTATGATATATGATGTAAAACTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGGTATGTGATATGTGGCGTGTTATGATATATGATGTAAAACTAA  300

seq1  TATATGGTATGTGATATGTGGTACATGAAACATGATATGATATACAATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGGTATGTGATATGTGGTACATGAAACATGATATGATATACAATAT  350

seq1  ATGATTGATATTGATGTTTATGATATATGATTGACATATGATATGTGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTGATATTGATGTTTATGATATATGATTGACATATGATATGTGATT  400

seq1  GATACATGATGATACATGTTATATGATATATGATATAAGTTAAATGACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATGATGATACATGTTATATGATATATGATATAAGTTAAATGACAT  450

seq1  ATAATATATGATATATTATATGTGATGCATGACAAATGATACATAGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATATGATATATTATATGTGATGCATGACAAATGATACATAGTACA  500

seq1  CGATATATGATATGAGATATATACATGATACATGATACAAAAAATAACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATATATGATATGAGATATATACATGATACATGATACAAAAAATAACAA  550

seq1  TAATGTAATACAATATAATGTAATAATAT-AACAATAATAGTTTCATGAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
seq2  TAATGTAATACAATATAATGTAATAATATAAACAATAATAGTTTTATGAT  600

seq1  GGAGATTCTCATTTAAGAATAATTGGCAGTCATAGCTTCCCATATATTCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATTCTCATTTAAGAATAATTGGCAGTCATAGCTTCCCATATATTCT  650

seq1  TCTAGATTCTG-CTTTAATCAATGTAGAACAAGTATCTCTTTAATGTAAT  698
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGATTCTGCCTTTAATCAATGTAGAACAAGTATCTCTTTAATGTAAT  700

seq1  CAATGTAGAACAAGTATCTC-TTTAATGTTGTAATTGTACTATTGAAGTG  747
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  CAATGTAGAACAAGTATCTCTTTTAATGATGTAATTGTACTATTGCAGTG  750

seq1  GTGCTATATTACCACTGAAATTTTCACAGATGAGGATACTAGGACATAGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GTGCTATATTACCACTGAAATTTTCACAGATGAGGATACTAGGAC-TAGA  799

seq1  GAGGTGAATAACATAGCCTAACAGTCTTACAGGTGTCAAAAAAATTCCAT  847
      || |||||||||||| |||||||| ||||   |||   |||||||| |||
seq2  GAAGTGAATAACATATCCTAACAGCCTTATCAGTGATCAAAAAATT-CAT  848

seq1  CTTCTTGAGCTTCAGCCTGAGACCAAAATAATCAATAATCAAATTGAACC  897
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTTCTTGAGCTTCAG-CTGAGACC-AAATAATCAATAATCAAATTG-ACC  895

seq1  TTTTATTACTGATTCTAACAGAGCTTCCATACTCATTTGTGGTGAACAAG  947
       | || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  CTCTACTA-TGATTCTAGCAGAGCTTCCATCCTCATTTGTGGTGAATAAG  944

seq1  ATGATTTCTCTCATTACTGTACAAGGCTA  976
      |||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  ATGATTTCTCTCATGACTGTACAAGCCTA  973