BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347M23
Chromosome18 (Build37)
Map Location 74,708,741 - 74,833,355
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo5b
Upstream geneRkhd2, Smad4, Elac1, Me2, Mro, Mapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126
Downstream geneAcaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7, Gm672
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347M23.bB6Ng01-347M23.g
ACCGA129300GA129301
length1,014205
definitionB6Ng01-347M23.b B6Ng01-347M23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,832,344 - 74,833,355)(74,708,741 - 74,708,920)
sequence
gaattctcctttctattcagtccaggatccaagcgtagagagcataggtc
cccaccccaatgaacccaacctcgatcatccctttgccagcatccccaga
ggctaacttaatctagatcatcccttgccagcatccccagaggctaacta
aatctagatcatccctttgccagcatccccagaggctaacttaatctaga
tcatcccttgccagcatccccagaggctaacttaatctagatcatccctt
gccagcatccccagaggataacttaatctagatcatctcttgccagcatc
cccagaggataacttaatctagatcatctcttgccagcatccccagaggc
taacttaatctagatcatcccttgccagcatccctagaggctaacttaat
ctagatcatctcttgccagcatgcaagagcttgcctgcttggtaattcta
gatcctgtcaagttgagaatcaaaattaaccacaacacagttctagaagc
ctgtgggaattaggcaacatccttagacttttcattagcatttcaatctg
caggaggccctggatcatctccactcctggttgtcacagacacctggcaa
ttcagccataccatgacaccccaacgtgaattgggaatgttttgctcatg
aatttgatcacatcctctagtgttttattgttaccaggccggtacagcca
cgaagcagccagaagcctgttctttagctactcacaagacaaggtcttta
attttaatgtgagtagcgtaggcagcatccaaataaatcagcaagtgaca
cactagagctgttctctgaacttggatgtcggaatcaggtggcagagctc
atttaaaaggggctctccagccctgattggcaggagcatacagccaagcc
attgaccatcccatccccttagggcttcttacaactcaggctacactcag
agtcacataagcctggctggaagttgatgtacgtcaactggaactgggag
gatcatgcactgct
tagagcagctgtaatgaagcttggtatttgcacagtgcttgctccttcta
agcatgtgccaattcctccctttactggtcacccagctactcaggagatt
cctctggtttctcttgaataaagagaataaataaatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatgtatatatatatatatatatatatatat
atata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_74832344_74833355
seq2: B6Ng01-347M23.b_55_1068 (reverse)

seq1  AGCAGTGCATGATCCTCCCAG-TCCAGTGGACGTACATCAACTTCCAGCC  49
      ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTGCATGATCCTCCCAGTTCCAGTTGACGTACATCAACTTCCAGCC  50

seq1  AGGGCTTATGTGACTCTGAGTGT-GGCTGAGTTGTAAGAAGCCCTAAGGG  98
      | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GGCTTATGTGACTCTGAGTGTAGCCTGAGTTGTAAGAAGCCCTAAGGG  99

seq1  GATGGGATGGTCAATGGCTTGGGCTGTATGCTCCTGCCAATCAGGGCTGG  148
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGATGGTCAATGGCTT-GGCTGTATGCTCCTGCCAATCAGGGCTGG  148

seq1  AGAGCCCCTTTTAAATGAGCTCTGCCACCTGATTCCGACATCCAAGTTCA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCCCTTTTAAATGAGCTCTGCCACCTGATTCCGACATCCAAGTTCA  198

seq1  GAGAACAGCTCTAGTGTGTCACTTGCTGATTTATTTGGATGCTGCCTAC-  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GAGAACAGCTCTAGTGTGTCACTTGCTGATTTATTTGGATGCTGCCTACG  248

seq1  CTACTCACATTAAAATTAAAGACCTTGTCTTGTGAGTAGCTAAAGAACAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCACATTAAAATTAAAGACCTTGTCTTGTGAGTAGCTAAAGAACAG  298

seq1  GCTTCTGGCTGCTTCGTGGCTGTACCGGCCTGGTAACAAT-AAACACTAG  346
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTTCTGGCTGCTTCGTGGCTGTACCGGCCTGGTAACAATAAAACACTAG  348

seq1  AGGATGTGATCAAATTCATGAGCAAAACATTCCCAATTCACGTTGGGGTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGTGATCAAATTCATGAGCAAAACATTCCCAATTCACGTTGGGGTG  398

seq1  TCATGGTATGGCTGAATTGCCAGGTGTCTGTGACAACCAGGAGTGGAGAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGTATGGCTGAATTGCCAGGTGTCTGTGACAACCAGGAGTGGAGAT  448

seq1  GATCCAGGGCCTCCTGCAGATTGAAATGCTAATGAAAAGTCTAAGGATGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCAGGGCCTCCTGCAGATTGAAATGCTAATGAAAAGTCTAAGGATGT  498

seq1  TGCCTAATTCCCACAGGCTTCTAGAACTGTGTTGTGGTTAATTTTGATTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAATTCCCACAGGCTTCTAGAACTGTGTTGTGGTTAATTTTGATTC  548

seq1  TCAACTTGACAGGATCTAGAATTACCAAGCAGGCAAGCTCTTGCATGCTG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTGACAGGATCTAGAATTACCAAGCAGGCAAGCTCTTGCATGCTG  598

seq1  GCAAGAGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTAGGGATGCTGGCAAGGGAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTAGGGATGCTGGCAAGGGAT  648

seq1  GATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAGAGATGATCTAGAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAGAGATGATCTAGAT  698

seq1  TAAGTTATCCTCTGGGGATGCTGGCAAGAGATGATCTAGATTAAGTTATC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTATCCTCTGGGGATGCTGGCAAGAGATGATCTAGATTAAGTTATC  748

seq1  CTCTGGGGATGCTGGCAAGGGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGGATGCTGGCAAGGGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGA  798

seq1  TGCTGGCAAGGGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCAAGGGATGATCTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAA  848

seq1  AGGGATGATCTAGATTTAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAGGGATGAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGATCTAGATTTAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAGGGATGAT  898

seq1  CTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAAGGGATGATCGAGGTTG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTAAGTTAGCCTCTGGGGATGCTGGCAAAGGGATGATCGAGGTTG  948

seq1  GGTTCATTGGGGTGGGGACCTATGCTCTCTACGCTTGGATCCTGGACTGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCATTGGGGTGGGGACCTATGCTCTCTACGCTTGGATCCTGGACTGA  998

seq1  ATAGAAAGGAGAATTC  1012
      ||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAGGAGAATTC  1014

seq1: chr18_74708741_74708920
seq2: B6Ng01-347M23.g_71_250

seq1  GAATTCTAGAGCAGCTGTAATGAAGCTTGGTATTTGCACAGTGCTTGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGAGCAGCTGTAATGAAGCTTGGTATTTGCACAGTGCTTGCTC  50

seq1  CTTCTAAGCATGTGCCAATTCCTCCCTTTACTGGTCACCCAGCTACTCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAAGCATGTGCCAATTCCTCCCTTTACTGGTCACCCAGCTACTCAG  100

seq1  GAGATTCCTCTGGTTTCTCTTGAATAAAGAGAATAAATAAATATATATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTCCTCTGGTTTCTCTTGAATAAAGAGAATAAATAAATATATATAT  150

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATGT  180
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATGT  180