| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-049D06.T7 (MSMg01no049_d06.b1) | MSMg01-049D06.TJ (MSMg01no049_d06.g1) |
|---|
| ACC | AG278745 | AG278746 |
|---|
| length | 1,259 | 1,295 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 321 (71 - 391) | 322 (82 - 403) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_d06.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_d06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_d06.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_d06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:10:58 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TATGGGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCATAGTTA
ACTAATTTCCCTTAAATACCCATATGGCAACCCCTCTTCCTAAGCCTCCC
GAGTGCTAAGACTACAAGCATGCACCATCATGCCTAGCTTTCAAAAAACA
ATCATCTTTATGGCAGGGTCTCACATAGCCCAAGCTGGCCTTAAACCTGC
TATGGAGCCAAGGGTGGCCTTGAACTTCTGATCCTTCTGACTCAACCTCT
CAAGTGCTGGGATGACAGGCTTGTGCCACCATACCCATGCTATAAAGCCC
TAGTGACAGAATCTAGCACCGCCTGGATGCTAGGCAAGCACTGTACCAAC
ACTACATCCCCAACTCCTAGGGATGCATCTCAAACTTCCAAAAATGTGGA
GAAACGTCTTCTCTCTTATTATAGTCCCTTCCAAACACTAAAATATTTAT
AATCCGGCCCCTTCTTCAACATTCCTACCACTCCTTGGTCTTCAACAAAA
AATTCAATCTCCCTAAAATTACAGAACCATAAAGCATCACGGTAGATGTC
AAACAAACCCAAGCACGTAACGCGCAAAACCGCGTTCTCTTACCCCCCAC
AGCCCTCACACTGTAGCATCCTCCTACACCCACACCCATCACACTATAGC
ATTCTCTCATCCCCCCACCGCCATCACACTGTCAGTACAACACACTGGCT
CATGAACCAAGAACAGGATAGCATCCAAAATGACAACATTCCGTAGCTAC
GAAAGATGGCTCGGCCAGCAAAGCGCTTGTCATGAAAGAAGTAAGACCCG
AGTTCACACTCCTCCTCCCTGTGTGAAAACCCAACGGCAAGCAAGCGTGG
TCATTTCCAAAACCAGTGTTGGGGAAAACAACAGGTGCTCCCTGCAACAT
AAAAATTCCCCTTTATCAAGCCCCTTGCTAATCAGAAAACAAACCCAAAA
TCTCATAGTAACCCTTCTTATTAAAAGCTTAAACCAAAATAGTCGGTTTT
TGAATCCTACACCTTGTAAGCCAAAGTCCGGCTAAAGCCCCAAATTCTGT
AAGTTGGCTCCAGGAAACTTTAAGGCACCCCGACCAGAAAATAACACCTA
AGGTCTTATATTCCAAATTCTAAGTAAATATAATTAACAACATCAATCCT
TCTCAATCTTTTTAAAAAATAAGACAATCCCATGGTGAACTCCCTAATAT
CACAAATAATAGCTTCTCAACACAAGTATGTACTATCGTCATAATTATCC
CCAGCTTTT
| NNNNGAGATGCGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTTTCTTTAGGATTACCCACCAGCGGCAAT
CTTCTTTGCCTTGGCCTTTGCAGATGTTCCCCCTGACATCCCATGATCAT
AGAGAAACCTGGAGTGACCAGGCAGTCCCGGGAAGCTAGCCTGTACCAGT
GTAGGGGTACTACTGAGTACCCAGGGCCCTTCCCTTGTCCTCTTTGACCC
AACTGTGATAATAGACTCTGCTCACGTGAGGCTTCCATTTCCTGACAATG
GGCAAAGTAGTCGATAAAGGCTGGGAGCAATGGGATTCAAGAGGGACCAG
CAGAAGTGTGTCTTCATCACAGGGCACTCGTAGAACATAGACAATAGAGC
TACTAAATACAGATGAAGGAGGCTGGATCTATCTAAGGAAAGTTGGGGAC
AGAGTGCCTTACCCCAAGGCTCCATCCAAACCCCAGGCAAAAAGGAGGAA
CGATAAAATCGGGAGAAGAACGAAATTGGCCATAGATGGTCCACGAGGGG
CTTACTAGCACAGGTCTTATCTTCAGACTGACCAAAGCGGAGGGAGACGT
TAAGAAGACTCAAAAGACCAAGAAGATCCACAGGAGACAAGGCAGGCAAG
ATAGACAATTTGAAAAGCAAGCTCGAAGTCTGAATTTTTCACGCACGAAG
TCAGGGGCCAGTGTGAGAACGTATAATCTGTCCCCCCGACCTCTGTGTCC
TAGGTTCAGGAACAAGTCTGGAACCAGTTCCCGTCAGGGAGCTGCCTGTG
CACTGTGCTAAGCTTCCAAAAAGGCCCCTTTGTCCCCTCTTGCACCCCAC
ATCCTCGTTGTTGGGAACGAAAGCCTTCCAACTTACGTAATCCAAATTGC
TGTGTATCTTCCACGGGGAACGTACCAGGACCCCCCAAACCGTCATTGTC
CTAAGGCTTTTTATCTACATCTGGACCCCCCGGTTGATCTGAGTTTTAAT
GGGTGCTGAAGGCATCCCATGGTCTTTCTGAAAACTTCCAGGAATTCCCA
CTTCTGGTAATTCCCTCTAAAAATTGTTCCACATTTGTTTTTCTCTGCCT
TACATCCAGGACAATCCCACAGTAACAATGGTCTAGCCTCCAAAATTTTT
TTTTCCCCCCCCCTTCCGATAGTCTTAAGTCCTATATATCCGCTATCCCT
CTATCTGTGTCTAATATTTCCACTCCCCTGGTCCTTTATAAATAATATAC
CCCTCACTCTTCTCTATTAGCTAATCCACCNCAACCCCTTTTCTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 11 15 15 17 10 10 10 8 8 10 13 16 24 17 15 8 10 8 21 21 36 36 36 36 33 33 28 33 33 37 33 39 37 24 22 19 19 8 8 10 20 21 47 50 50 50
33 33 33 33 21 21 9 9 9 11 13 13 11 11 10 10 10 10 10 10 12 28 28 37 32 36 36 36 38 47 53 57 53 53 53 43 43 47 47 47 47 42 42 42 54 57 27 25 15 15
15 11 15 15 16 21 22 24 14 18 22 36 27 32 19 19 20 28 32 48 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 47 47 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 52 52 57 52 37 37 50 50 50 50 52 57 57 57 57 57 57 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 52 59 59 57 57
57 50 47 47 50 57 57 57 57 57 32 32 12 12 11 24 24 26 32 20 20 20 15 24 18 36 36 48 48 59 41 41 18 18 18 41 34 54 54 54 47 57 57 57 40 46 47 48 48 48
48 59 59 59 54 54 57 57 48 54 54 57 57 57 59 59 48 47 43 43 39 39 37 40 37 39 43 43 43 43 43 37 43 39 47 29 27 19 14 14 26 17 13 9 9 9 10 15 20 20
23 11 12 12 22 16 34 34 43 43 57 57 48 57 57 57 59 48 48 48 59 59 59 34 23 11 19 16 32 28 59 57 59 54 48 48 54 54 48 47 47 47 47 47 32 34 15 18 15 12
12 11 21 12 20 14 27 23 28 15 15 14 34 34 47 47 29 29 11 11 12 34 34 57 59 59 57 57 54 54 57 59 57 57 57 44 43 28 20 18 13 10 11 11 12 12 24 38 43 52
57 59 59 59 52 27 27 11 11 12 27 32 57 43 42 35 43 43 43 36 43 28 36 36 37 43 43 52 57 52 52 45 57 52 57 57 38 38 14 12 16 24 11 11 11 11 24 28 32 39
39 43 43 39 39 43 43 33 34 23 33 33 24 16 12 12 14 19 19 10 10 10 22 19 32 35 24 19 19 9 9 9 27 27 52 43 44 43 52 52 52 52 52 37 43 43 43 37 44 44
44 21 19 14 24 24 43 43 43 43 43 43 32 43 27 31 18 24 16 18 19 32 13 12 12 24 18 19 19 24 15 15 19 18 13 14 21 16 17 19 19 28 37 47 48 47 44 37 35 32
32 39 39 43 24 24 12 12 11 19 19 41 37 42 42 24 17 10 10 10 17 20 39 29 19 8 8 8 8 10 16 13 12 12 12 16 19 19 20 15 15 10 9 11 13 12 10 10 10 13
14 16 20 20 28 31 22 20 20 20 20 18 19 25 25 15 20 13 15 8 8 8 10 10 9 8 12 12 14 20 16 17 10 8 8 13 9 10 10 15 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11
11 11 20 16 14 9 9 9 9 9 10 10 10 8 10 10 8 9 10 10 10 11 16 15 19 19 25 29 19 15 15 13 16 20 13 11 8 12 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 8
8 8 10 13 12 8 8 6 6 8 8 9 11 12 16 18 16 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 15 13 18 9 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8
8 8 8 9 9 10 10 10 10 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 9 9 9 11 11 12 8 9 8 11 8 9 10 10 10 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 6 6 6 8 8 10 11 8 8 8 8 10 8 8 8 9 19 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 6 6 8 9 9 9 8 8 9 8
8 6 6 8 8 11 11 12 11 11 10 8 10 10 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 9 9 11 15 15 15 15 10 13 14 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 10 10
8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 12 15 11 10 8 8 6 6 7 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 11 11 13 22 15 15 11 8 8 6 6
10 8 8 13 13 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 12 10 6 6 6 6 8 8 10 9 9 12 12
12 9 9 8 10 8 12 7 6 8 8 9 10 11 12 18 13 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 10 10 9 9 9 11 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 12 14 16 14 14 8 8 13 10 10 6 6 6 6 7 11 10 10 9 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 8
8 10 10 8 8 8 8 8 10 12 9 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 10 11 11 12
12 9 9 7 7 8 8 7 7 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 7 6 8 8 6 6 6 6 6 11 8 6 6 10 7 9 12 19 19 8 8 6 8 19 19 25 19 19 10 10 10 22 21 31 19 19 29 29 37 37 37 36 36 37 37
36 36 39 39 39 37 48 48 48 47 50 47 39 27 18 11 12 12 11 11 11 15 12 13 24 19 18 15 10 10 10 19 27 33 33 33 33 59 59 59 50 57 57 57 57 57 57 53 53 44
44 39 37 42 41 39 34 33 24 22 19 25 22 22 28 35 33 33 33 37 26 26 20 20 20 20 32 43 48 57 40 47 47 42 42 40 43 47 47 48 48 48 48 48 50 48 68 68 54 54
54 54 54 57 59 59 48 43 43 44 47 47 54 57 57 57 57 57 46 44 37 44 44 57 57 48 48 57 57 59 47 47 43 57 47 47 47 47 47 57 48 57 50 47 47 50 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 57 57 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 35 43 43 62 62 62 45 43 43 41 39 38 43 23 23 23 44 43 52 52 43 43 39 43 43 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 43 43 52 52 62
62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 39 26 12 12 13 39 39 62 62 43 39 39 39 33 11 11 11 33 33 31 31 43 43 43 44 43 31 31 43 44 44 62 43 39 27 24 24
23 23 23 23 12 11 18 14 8 8 8 19 21 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 38 38 16 19 19 38 34 26 19 19 34 23 34
24 43 43 62 62 62 62 62 62 62 44 43 18 15 11 24 24 39 31 31 43 44 62 62 43 43 35 35 43 43 43 43 43 39 35 43 21 21 9 9 9 21 21 43 43 52 52 36 38 23
31 39 44 24 35 23 33 33 33 34 22 14 14 17 23 23 38 20 20 32 38 43 43 33 33 32 44 38 35 17 17 18 27 11 15 15 36 38 43 31 33 35 42 36 43 43 43 37 38 41
43 27 33 30 24 14 14 10 13 15 15 15 32 13 13 13 38 38 50 35 35 27 32 12 13 15 15 32 32 47 39 37 37 28 31 31 32 36 35 35 35 36 33 28 21 21 11 11 11 15
23 11 9 9 20 18 23 23 30 28 14 14 14 14 21 19 21 24 15 15 19 19 17 13 13 9 12 11 15 18 24 32 24 24 13 13 10 10 10 24 28 30 30 32 24 19 13 11 11 11
15 26 28 31 24 28 11 8 8 8 8 15 17 33 33 25 24 23 18 15 11 13 13 16 16 26 18 12 8 8 8 12 12 22 22 24 29 30 17 12 12 12 14 16 13 12 11 15 13 11
11 11 12 12 15 12 12 11 12 8 8 9 9 13 11 16 10 10 11 14 10 9 8 8 8 8 8 13 17 19 21 15 15 8 10 9 9 9 22 23 34 31 28 28 28 14 14 13 13 8
8 8 13 10 22 16 19 17 17 11 9 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 12 12 12 13 9 9 10 13 12 10
10 10 13 9 12 12 9 9 10 13 13 14 14 14 21 24 14 14 13 15 15 10 8 8 10 8 9 12 12 20 21 15 12 11 12 10 19 19 19 13 15 10 10 10 13 15 19 15 10 10
10 9 8 8 8 8 8 12 15 17 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 9 9 9 9 8 8 6 7 8 8 11 9 9 10 12 10 10 10 15 12 12 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 14 11 11 12 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8
8 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 12 21 12 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 9 9 9 10
10 10 8 8 6 6 10 10 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 11 12 12 8 8 6 6 10 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 11 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 9 8 8 6 6 8 12 10 10 10 10 9 14 10 10 10 10 10 10 11 11 11
9 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 10 6 8 8 8 13 10 8 8 8 11 10 7 7 8 6 6 6 8 8 10 13 17 10 10 8 11 11
13 10 14 17 23 16 19 13 14 13 10 14 11 10 10 8 8 6 6 8 8 11 12 11 11 11 11 11 11 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 13
9 9 10 10 10 10 10 9 7 8 8 9 8 10 9 9 9 8 6 8 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 11 7 6 8 8 8 6 6 10 6 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 8 6 7 6 6 8 8 8 8 8 |
|---|
