| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-118O08.T7 (MSMg01no118_o08.b1) | MSMg01-118O08.TJ (MSMg01no118_o08.g1) |
|---|
| ACC | AG329650 | AG329651 |
|---|
| length | 660 | 1,311 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 297 (44 - 340) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no118_o08.b1 PHD_FILE: MSMg01no118_o08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:25:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no118_o08.g1 PHD_FILE: MSMg01no118_o08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:25:53 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CTCCTATATCCAGAGGATCCGCGGAATTCTCTTCTCCCTCGTCCATTTTT
GCCTTACTTTCTTTTTATAGCTCTTCCCCTCCTGCCCCCATTCTTTATAT
CAGTTTGACTAGATTTTTCAGTTTCAACCTGTCACTAAACTTGACTTTGC
TCTTTTCTTTCTCCCACATTGTCCTGACTGCAGTGAGCAGACCCCTCCCC
CCACCACATGCACCTATGAAGGTGCTATAGGTGCTGAGGAAGTTTCTCTG
TTTAGTTACCACATTTGCCTTGAAGCAAACTGCATTTTTATATCAACCCA
GTGGCGTGTCAGTTTTCAGAATCCTTCCTGGTACCTAGGCTGCTGATCGC
CCTTGAAGAATTTCTTCTACCTCAACCTACACTTCTACATCACAAGGTGT
CTTGTGCACAGCAAATTTAGAGACCCCTATTCTCAGGGCTCTGGAGGAAG
GTGTCATCTGGGCAGAGATGAGAATTGCCTTCTCCAGCCTGTGGCTTGCT
TCCCTTTCCCTTTCTTTCCATGTGAATGTCTCCCTTGTCCTTCCCAAGTT
TGACACTCCACTCCGTCAGAAGCAACCATATCCCCTTCTATAGTTTAAGG
CCCTGAAGAATAGTCCCAGGCTGAAAGTGTTCTCCAAATGGGCCTAGCCC
AATTTATAAA
| TTTATAATTNATTTANNNNNTNNNNNCNNTTTANAATTTAATTCCATNNT
TTTCTTTTTCAAATCATATTTNTAATATTTTTTTAAATTATTTTTCAATA
AAACAATAAANACAAAATAATAATAATTATCTATACTTAATAATNCACAT
ATATATTCACTATTCATCTATTAATATAATACTCATTTAACACTCTCTAC
TTCTCCATTACTCTANCTTATCTCTTACTCATATCTTTCATTACTACTCT
TCTCTCTTCATACTTAACCTTGCTCTCCAACATTCACCCTAACTCATCTC
CTTCTTATTCATTCGTTACATCATAACAATTACTGCCCCACCGATATTAC
CATACAACACAACCTCAACAAATATACACACACCATTACACAATACTATT
ACTATATAAACTACTACAATATACACCTTACGATTTATCACCCTCTCTCC
TCTTACCGATCTCCACCTTCTTATTTGCCGTTACGTGTGCCTGTACGTTG
CTTTCGTGCATTCGGTCCTGATTGCAATTTTTCACACGAGTTGTAGATCT
CAATATGTGGTGTAGCTAGACAAGATACACGATATAGTAGAGCAAGAAGC
AGGATTAGTAGCAAGACTGTGGCAGATTATAATATAAGTATACTCTGAAA
ACGAGCGAGTATAAGTTCGAAGAGAGATGTTGCTTGTACGAGTGTTTCCT
GGACCAGTATGTTTTTCTCACCGCTCAGAGTACGTGCGATAGTTGTGAGA
TTTGTCACTTGCATCTGCGTGGGTCCTTACGGTGCGTGCGTGACGAGATT
GGAGTATCGCACCTGGTAGTGCGTGCGTGAGTGCGTGTAGTGAGTCGCGT
ACAGCTGTGCGATATTGAGCGAGTAGCCAACCGATGTCGTTCGGGATGGG
ACGGAGCATGGAGTGAGTGGTGCGATNTAAGGGTGCGTGTGTGACGGAGT
GATGCAGATGACGGTGCGTGTGTGGATGGTGTGACGTGTGAGAGAAGAGT
GGGTGTAGGGCGAGGCGGGCGCGTAGTTAGTATGCGTTGGATGGATGCTA
TAAGTGCAATCTCACGCGCTTGAGAGCTATAGTCAATGGTGGGGCCGCAG
GGTTGTGGGTGTATATGTGCCGTGGACGGAGGCGGTGCTGAGCCTGTATC
ATCTCGAGGACAGATTAGGCAAGTAGTAGTGGTTATAGTATAAATTTGAT
CGAGCGGGGCGTGGTGAGCGACCTGAAAAGTGCGNTAGATTGTATGCGCG
GCATGGAAGAATATGGCGGCGAGTATGTNGAGACTCTGTTGCGATGTGAC
GTGATGGCAGG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 8 8 8 6 7 6 6 6 8 10 9 9 9 12 12 16 20 24 28 29 32 33 36 36 36 33 33 33 41 42 41 27 27 11 9 9 9 7 7 7 8 8 15 22 28 28 59 31 31
36 36 36 50 57 57 57 57 59 59 59 59 59 50 50 50 42 42 42 47 47 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 48 48 48 48 57 42
42 47 42 42 37 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 42 41 41 41 48 48 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 50 50 50 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 59 59 59 59 59 57
57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 52 57 57 57 57 45 45 45 52 52 57 43 43 23 23 27 34 34 39 57 57 57 59 59 59 57 52
52 52 57 52 54 43 43 43 43 52 57 57 57 54 57 57 59 57 54 57 57 57 57 52 52 52 52 52 48 50 57 57 54 50 50 50 50 50 43 27 24 11 11 11 15 15 18 24 32 30
32 37 42 42 43 44 44 47 57 57 47 47 47 47 47 57 57 54 47 47 44 44 48 48 48 54 57 57 47 37 36 30 28 36 36 34 26 18 25 12 21 21 23 20 12 10 8 8 8 15
19 39 48 48 43 37 28 28 28 37 37 47 47 48 48 43 40 40 39 39 34 34 28 24 30 34 34 34 28 28 28 28 37 37 39 32 24 15 12 12 15 28 32 28 28 28 32 28 28 22
26 24 33 36 29 39 33 43 28 30 28 28 23 23 32 32 28 28 14 23 18 34 34 43 43 43 43 43 41 43 47 39 32 24 23 11 11 11 12 25 30 37 24 24 17 17 17 19 16 19
22 28 22 22 22 22 22 24 26 19 14 13 14 21 18 16 15 15 22 22 12 10 9 16 17 22 21 30 35 37 37 37 37 39 39 35 35 35 28 24 19 17 14 12 12 9 9 8 12 12
19 15 22 39 39 20 20 11 12 12 14 12 14 14 15 15 10 9 9 9 10 11 13 13 12 11 15 15 13 11 12 9 9 9 12 15 14 11 12 11 12 12 15 18 15 13 11 11 14 14
23 27 24 21 21 21 21 25 23 20 13 13 10 10 10 16 13 18 10 10 10 10 9 10 10 9 8 8 9 9 9 10 14 28 28 13 12 12 22 19 15 10 8 10 10 10 12 9 8 8
8 8 8 12 14 16 16 10 10 9 10 9 10 11 17 11 12 10 10 8 6 6 8 10 10 15 10 14 9 9 9 10 11 10 10 11 9 9 10 10 10 11 11 11 13 11 13 10 10 9
10 10 10 10 15 10 8 8 9 9 | Open.Hide. 8 8 6 6 6 8 7 7 3 0 3 7 7 6 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 3 0 0 3 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 7 7 7 10 3 0 0 3
11 11 17 17 21 39 21 16 9 8 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 3 0 3 12 9 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 11 8 8 10 13 13
6 6 6 6 6 8 6 6 8 3 0 3 6 6 6 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 6 6 6 3 0 3 10 10 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 7 9 12 12 12 12 8 6 6 6 8
8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 6 3 0 3 8 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 6 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 10 8
10 11 10 10 9 8 8 11 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 11 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 12 11 6 6 6 6 7 12 9 10 12 13 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 9 10 10 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 9 9 8 9 11 10
7 6 8 6 6 6 6 6 8 8 13 10 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 6 10 6
6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 8 12 12 12 10 8 8 8 8 8 10 13
15 15 10 8 6 6 9 9 9 6 8 8 10 10 8 8 10 8 8 6 6 10 8 12 10 10 10 15 12 19 15 10 7 6 8 8 8 8 9 9 9 12 12 8 10 6 6 8 7 8
8 9 9 6 8 6 6 6 6 8 6 8 6 6 7 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 6 8 8 8 8 7 6 8 8 10 8 11 11 12 15 9 8 6 6 6 6 8 8
8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 6 8 10 10 10 10 10 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 11 9 9 9 12 11 11
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 9 9 8 8 6 6 6 7 8 8 6 6 6 8 8
6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 9 13 11 9 10 9 9 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8
8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 10 8 8 12 8 9 10 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8
8 10 11 11 7 7 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 7 8 10 9 9 9 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 7 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 11
8 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 10 3 0 3 8 8 8 10 11 10 10 11 11 11 10 9 8 10 6 6 6 6 8 8 8 9
9 9 9 9 9 8 8 8 11 17 11 11 11 11 11 9 8 10 8 8 8 10 8 8 9 10 10 12 10 10 8 10 10 8 8 8 11 12 10 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 6
8 8 9 9 9 8 8 10 10 10 10 10 6 8 6 6 8 7 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 10
11 6 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 13 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 7 8 9 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 17 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 10 8 8 6 7 8 8 11 16
12 12 11 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 10 10 6 7 8 7 6 8 6 6 8 8 10 9 6 7 7 8 10 8 11 12 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8
10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 11 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 11 11 12 11 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 10 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8
6 8 8 8 8 10 8 8 10 13 11 |
|---|
