BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124K11.T7 (MSMg01no124_k11.b1) | MSMg01-124K11.TJ (MSMg01no124_k11.g1) |
ACC | AG333952 | AG333953 |
length | 1,336 | 1,290 |
length of high quality (start - end) | 481 (126 - 606) | 471 (128 - 598) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k11.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_k11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k11.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_k11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTATACATTGGGCGCTATAGACTCATATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CAAGCATACTCACATACACCCATAAAGGCCCCCACACACACACACACACA
CACACACACACCACTACACACACCGACACACACACTCACACACACACTCA
CACACGCACACTCCCACACACAGACACACACACAGACACACAGACACAGA
CACAGACACACAGACACAGACACAGACACACACACAGACACAGACACAGA
CACACACACACACACACACACACACACACACTTTGGCTGGGCCGGACCAC
CTGTCTCAACAATTCCACAAGTGTTCATGCATACGTATGTACATACACAT
ATACCTACACACATATGTATGCACATACATATAGACAAACAGACATACGC
ATATATACTTTGGTAGATGGGGCTGAGCCTCAAATGTCACTCTTTATTTT
TTCTCTCAGCTCCCTTTATACTTTCTCAGACAAAAGTTCTCCATGAAATT
ACCTTATAGATGAAATGTTACACAAAGGGGGATTTATAGAAGGATGTTGA
TATTACCTTCGAAGCAGAGTTTCTATTCTACAAGCTCATTATAAGTTCAC
AGCAACAGTTTGATATGGCCCTTGCTTTATCCTAGTGCACACCAATGGCT
TGCTTTATCCTAGTGCACACCAATGGCTTTCTCTTTGGAGTGACCTATAA
CGAATCTTTTTTCTTGATTACAAATTTGTTTCAAGCCTTCAAGCTTCTTA
TCCCACGGCAGTTAGCCCGTGATGTGCCAAGGTTTACGGAGCTCTATTTG
CCGCTTTAATTCTATAGGGAGCCTGCGATTACGTATATCCCTTTAAGCGT
TCCATAAAATCCTTATCCAGAATTGGTGCAATCTCCTACTCACCCATCCT
GCCATTATCACCTGAACAACACATCTTTATTGTTACCTCTACACAACCAC
CTGCCCAACATCGCCGGGCCCAATGGTCCCCAAGGTTACGGCATTTATCG
CCCGGGAAAGGGAAACTTCTCCAACTCCACCCTTAATAACGAAGCCCTCC
GCTGAACCTTGCTTTCTCAAAACTTCCTCCCATCAACGAGCCACAGCCAA
AATGGGGTGGGCCTCTTTGACTGTGCACCTCCCTTTGGCAGGCCCTAAAA
CCTTCCCCTATAAGCGTCCTTCCGAACATCTGCAGAAACACCCTCCCTAA
ACTGCCTTCACTCCTTTATGTCCTCGNGCCCTTGTAGAAACAGCACTCTC
TCTAATATATATGCTCCCGACACTCTTATAACGCCTCTCCCTCGTGTGGG
ATCATACTGTAATAACCAGCAGACGCCGTCTCTCCG
| TTTTTCGAAGATAGTGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTCAGACATCTGTATAAGACATCACA
ACAAACAAACAACACCTACAACAAACCGGAACTGGCAAAATAAAAGTCTC
CTCACCATTGTTAGTCAGTGATGAGACAATCATGATGAGATTGATATCTA
ACTAATGGCTTGAGCCCCATAAATAATATGGAAGTCATGTGAATAATTCA
TGCCATGTGTCCTGTTGACCTTGATACTTTCCACAACAGTTTAAATTTGC
TTAAAGTTCCAGGAAAACATCTCATTTAAAGCCATGCTGGTTCAGCAATA
TCTGAAGCTACCCAATCTTCAACTGCCAAAGGACCCTGGTATAGCTGTCT
CGTGTGATTCTATGCCAGTGCCTGGCAAACACAGGAGTGGATGTTCACAG
TCATCTATAGGATGGAACACAAGGCCCCCAATGGAGAAGCTAGAGAAAGC
ACCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTGCAAACCCTATAGGTGGAACAACAATAT
GAACTAACCAGTACCCCCAGAGCTCGTGTCTCTAGATGCATATGTAGCAG
AAGATAGCCTAGTCAATCATCATTGGCAAGAGAGGCCCCTTGGTCTTGCA
AACCTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCCAGGGCCAAGAATTGAGAA
TGGGTGGTTAGGGGAGTAGGTCGGTGAGAGGCTACAGGTAACATTTGGCA
CAGCATTTGACATGTATATGAACAAAAACCTATTAAAAAATTACGGGAAA
AAAAAGAATAGTCTATTCTTCGTATTCAATATAAGATAAACTTCTTGATC
TGTGTCCTATGCTCCCACAGCATTTGAACATTTATATTTTTAAAGAAATT
TTGTCCTGCTGACCTTCCTTGTCTTTATTTTCCCCCTAATAGTCTTTGTA
TAATGAATCCCATGACCAATAATCCCTGCTTACAAAAGTTTTTTATACGC
CCCTATTTCTTCATAGGTTAAACACAAAACATCTTTCCTCTGGATTGTAA
TCACTCTTCAATCTATTCTGAATACACTTCCCGTTATTTTCCAATTGTTT
TCTAATTATCTGCTAATTCTCACTTTGCTCTTGTAACTTTTTCAGATTTC
TAAATCCCCTAAACTTCCTTTCCGTCTTTTGGTTGCCCTATTTTGAATGT
GTTACACCTCCTCTTCTCTCTAGCTAATCTCTAACTTGTTACTCCCGGAT
TTACAGATCAATTCAGTAATACTTCCTATATCTTCTTCTC
|
quality values | Open.Hide.10 10 9 9 13 8 6 7 7 12 12 12 15 15 28 21 11 9 9 9 9 11 11 13 8 8 8 13 13 19 29 30 28 28 28 28 28 28 23 36 36 39 39 39 39 34 37 34 33 34
34 28 28 35 35 36 36 36 31 31 33 33 37 33 19 19 9 9 9 10 10 11 11 15 11 8 8 8 8 13 10 15 12 20 20 34 41 59 59 59 59 53 53 57 57 44 57 59 57 48
59 59 59 59 59 47 27 25 9 8 6 7 6 6 8 11 11 12 13 13 13 13 12 15 15 12 23 27 41 42 48 48 36 36 53 50 47 39 43 40 40 43 47 47 42 42 42 48 48 48
48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 28 32 14 15 14 32 34 54 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 47 47 43 47 43 44 37 37 39 47 44 57 57 57 43 43 43 44 44 47
47 47 47 57 50 50 47 50 50 54 57 57 57 57 43 43 43 50 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 39 39 39 43 43 52 52 52 43 43 43 43 43 57 57 52 52 52 57 57 57 57
52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 39 43 43 57 57 57 57 57 39 42 35 47 43 52 52 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 39 39 43 39 43 43 62 62 43 52 52
43 43 35 38 20 35 35 43 43 52 62 62 62 62 62 39 39 39 44 44 62 62 62 62 52 62 62 43 52 45 45 62 52 52 52 62 43 43 35 35 35 44 44 62 62 62 52 52 62 52
52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 43 43 39 43 43 41 39 39 39 39 43 62 44 43 39 39 39 62 43 62 62 43 43
43 43 52 38 38 13 12 12 17 15 21 13 17 24 38 43 52 52 43 43 43 45 45 43 43 35 35 35 43 43 39 35 35 43 44 45 45 43 43 43 43 35 43 43 52 62 62 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 39 39 57 43 43 43 57 47 57 52 52 52 57 57 43 43 30 18 14 14 21 32 38 33 33 33 35 38 38 43 43 35
42 43 57 44 57 43 43 38 38 43 38 38 38 38 38 43 37 37 43 43 43 43 32 32 32 32 33 33 33 32 32 35 35 43 43 35 33 33 28 28 23 19 19 19 10 10 10 10 10 12
13 21 18 18 23 37 36 32 32 20 20 20 31 32 40 30 30 24 25 18 20 28 24 24 30 36 36 37 35 35 35 39 42 39 39 39 39 35 35 29 30 19 19 18 25 29 40 39 29 29
29 23 23 28 24 15 18 14 18 23 26 28 14 14 14 26 26 21 21 15 19 18 28 22 22 17 24 17 22 24 34 30 39 39 28 28 18 24 21 28 32 37 32 32 23 23 23 28 28 37
28 32 32 39 34 18 17 10 10 10 13 18 20 18 15 21 21 28 37 32 28 28 28 22 15 10 10 8 8 6 6 11 8 9 11 18 21 24 23 18 18 11 14 11 12 13 16 14 24 19
14 12 10 10 10 10 15 19 14 12 10 10 10 14 23 23 14 14 15 24 24 19 16 14 11 11 13 17 10 9 9 11 11 12 14 11 10 10 10 10 10 10 6 6 8 8 10 12 10 9
8 15 13 12 10 12 16 16 11 11 12 20 13 10 10 8 8 10 10 12 12 10 10 10 13 18 12 10 8 8 8 8 10 6 6 6 10 10 12 12 12 13 11 10 12 10 10 9 10 15
9 9 9 13 13 18 28 24 12 10 10 8 8 8 8 8 8 18 13 15 16 10 10 8 8 8 8 8 10 10 13 10 13 10 13 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8
10 10 8 8 8 8 10 10 11 13 8 8 8 8 10 11 11 8 8 9 10 8 9 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 10 10 10 8 8 6 6 6 10 10 10 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 11 11 10 10 10 11 13 9 10 10 10 14 10 13 11 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 12 12 12 11 12 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 7 6 6 6 8 8 8 8 10 14 19 15 19 19 14 15 13 11 11 11 9 9 9 8 8 10 10 6
6 8 8 8 8 8 12 10 10 11 11 11 12 9 9 9 10 8 8 9 10 9 10 15 12 12 11 12 9 9 9 9 10 9 19 11 9 9 8 10 10 8 9 9 9 10 10 14 19 12
10 9 9 9 9 12 11 13 12 10 11 11 14 9 11 8 8 6 6 8 12 21 12 8 8 8 7 7 11 9 9 8 8 8 10 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10
10 11 14 12 13 11 11 11 11 8 8 10 10 10 13 18 22 15 12 12 12 11 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 12 12 11 9 9 8 8 8 8 11 11 18 19 11 10 10
7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 10 8 9 8 8 6 7 7 9 10 10 10 9 6 10 6 6 8 13 6 6 8 8
10 10 9 9 9 11 8 6 6 6 8 8 10 7 7 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 3 0 3 8 8 10 11 11 8 8 8 9 9 8 8 9 8 8 6 6 8 11 8 8 8
8 9 9 9 12 10 10 10 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 13 9 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 6 6 6 7 9 6 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 7 7 7 | Open.Hide.10 10 10 19 9 9 9 9 6 6 6 7 7 7 7 8 6 6 6 8 9 10 9 10 10 13 19 19 15 8 6 8 19 13 16 13 10 9 9 10 13 19 19 12 12 9 11 10 18 19
20 22 24 20 20 18 21 28 44 37 47 44 44 39 47 46 23 23 10 9 10 10 12 12 12 9 9 9 10 10 10 10 10 11 15 11 19 23 31 53 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57
48 48 48 48 48 47 59 47 47 37 21 21 9 9 9 10 10 10 10 16 25 13 17 12 16 11 11 11 23 23 43 36 32 33 32 37 47 59 47 48 48 48 48 48 54 42 42 32 39 39
42 42 48 48 48 48 47 46 46 37 37 42 42 50 50 47 47 47 57 57 57 57 57 42 42 28 42 42 57 46 48 48 57 57 57 44 44 39 39 39 59 59 57 57 57 57 57 47 44 43
57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 52 52 38 38 14 14 14 38 38 52 52 62 62 62 62 62
62 62 52 45 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 43 43 52 62 62 62 39 39 43 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 52 44 59 43 43 41 43 43 43 43 41 41 27 43 43 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 43 43 45 43 43 43 43 45 52 62 45 45 45 43 43 52 52 62
38 38 13 12 12 11 8 8 8 10 10 36 38 52 62 43 62 52 52 52 62 62 62 43 43 39 39 43 43 45 45 43 43 35 35 31 43 43 62 52 52 62 62 57 57 57 57 52 52 52
52 52 43 43 43 41 38 35 20 20 24 24 36 35 20 20 35 35 33 27 38 28 43 33 33 27 43 43 34 34 15 15 11 24 19 27 23 24 19 23 28 32 32 27 27 20 38 32 43 43
35 43 43 37 37 32 43 28 22 23 32 43 43 42 35 32 28 24 18 13 24 27 32 23 23 32 32 32 29 33 33 32 30 33 33 33 36 33 33 32 37 37 37 42 37 37 37 42 42 42
30 24 17 17 27 32 24 28 24 21 20 26 28 36 37 43 40 39 39 39 43 43 32 28 28 23 28 31 34 39 43 37 42 37 36 36 32 32 23 23 23 34 32 24 23 10 10 10 10 10
11 13 18 20 30 24 14 14 19 24 15 15 21 18 15 12 12 12 18 12 14 14 21 19 13 13 10 16 10 14 19 12 11 10 10 10 10 15 24 25 34 23 18 18 21 24 25 25 17 19
17 15 8 8 8 10 10 23 32 25 30 30 33 26 19 14 16 19 18 13 12 19 12 12 11 11 17 22 24 28 19 19 19 12 10 15 24 18 16 11 11 11 18 16 15 15 12 12 12 22
22 15 10 11 11 11 11 18 14 15 13 12 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 9 10 10 14 10 13 15 10 9 9 8 11 12 21 18 18 18 16 16 13 13 10 12 11 12 12 14 15
19 14 13 13 15 15 24 12 8 8 8 8 8 13 11 10 8 10 8 15 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 15 18 19 21 18 15 11 11 12 8 8 8 8 11
11 9 9 9 9 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 13 22 22 29 24 24 15 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 12 15 12 12 10 9 9 8 12 8 8 8 8 8
10 10 10 10 10 10 10 9 9 10 10 10 10 11 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 10 20 13 12 10 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 12 13 15 13 13 15 10 12 12 14 18 11 10 8 8 8 10 9 9 12 9 11 11 15 11 10 10 8 8 6 6 8 10 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 13 10 10 10 10 9 9 10 8 9 8 8 8 8 10 9 10 10 12 12 18 18 18 10 10 10 11 11 11
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 15 11 11 10 10 11 17 13 10 9 9 11 11 9 17 13 8 10 6 7 10 6 9 8 10 8 8 8 8 10
10 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 9 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 17 13 8 8 8 8 13 15 10 10 10 10 9
9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 17 14 10 10 10 8 8 8 8 8 13 10 10 9 9 6 10 7 6 8 8 9 7 8 8 10 9 12 11 8 6 6 8 8 10 8 8 8
10 11 8 8 8 12 12 10 15 15 10 10 10 8 8 8 6 7 6 8 8 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 6
6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 13 14 11 10 8 7 6 8 8 9 12 10 10 10 9 7 10 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 7 12 8 10 9 8 8 8 8
8 8 9 10 9 9 8 11 7 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 13 13 17 13 12 7 7 8 7 |