BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-133B06.T7 (MSMg01no133_b06.b1) | MSMg01-133B06.TJ (MSMg01no133_b06.g1) |
ACC | AG340151 | AG340152 |
length | 704 | 707 |
length of high quality (start - end) | 530 (131 - 660) | 81 (179 - 259) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no133_b06.b1 PHD_FILE: MSMg01no133_b06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:47:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no133_b06.g1 PHD_FILE: MSMg01no133_b06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:47:47 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGAGAATCCGCGG
AATTCTCCAGATTTCCTAAAACAGGCGGGCTGGTTTAAATGATGAAGTCC
AGGTTCAGTTAGAATACTTTGTCTAAAAAAAGGAGAGAAATGGAAAAGAC
TGGGTCAGCCCCAGTCCACAATTCACAAACAGAACACCAAAGTATAGAAC
AATGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTCTGTGTCTGTGTGTGTTGTAAATAT
GGGGAGAATAATACTCATTTGTCTTTACATGCAGATACTCTCGAAGGATA
ATGAGAAACCAAAGCAAGTGGTTATGGGGTGGGTAGAGTGCCAGACTTTA
CACTGGCTGTTTCTCTCCTCTTCCTGTATAAACTCCAGGTCATTGACTGT
CACTTTGCTCTCTGTTTGTATCCCAAGTACCCACAACAATGCAAGCCATA
TAAATAATAATTTTAGAGAAAGTGTTTGCCCCAAGCTAGCAGTTCACAGA
TGTCAAAACCATATATGCATATTGCAGAAAACATAGACAAGCTGGAAGCT
CTCCATGATGCCAACTTCCAAAGCGTCCTCACTGCAGTCCCTTTGTCTCC
TGTGCTGGGATTGAATCCAGCATCCAGCTCCTCTCTGTGCTAGGCAAGTG
CTTTGCCACTGAACGCTGCTCCCAATTCCCACAAGTAGTTAAGCTAATAT
CATG
| CCGATGCTGTGAGTAGCCTGGCGGCCGCCTGGCCATCGTAATGCGCTGAC
CTATAGAAGGTCCTTCTTAATCCTGTTTACTTAAAGTACTTATTCATCTT
GTGTATAATGGTGTTTTGCATGCACTCATGCACGCATGTGCACCATGAGC
GTGCCTGATGCTTGCAGAGACCAGCAGAGGGTGTCGAGTCCCCTGGAATG
TAGGTAAAAATGGTGATGAGCTGCCATGTGAGTGGGGAATCACACTTGGG
TCCTCTGTAACAGTAGCCAGCGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTCCTGC
CTCTACCTTTATTCTTGGCATATCTTTGTTATCTCACTATGTTTTTCAGG
CTAGCCTCACATACTTGCCGTTTCCCCTCTTGTATACCTGAGGCCCTATG
TTCACGTGCTTGATCGAGCCCCATTACATCCCGTCCCCTCCTGCTACGAC
TTGCCTTCGTCATCTCTCCGCCGTTGTGTTAAACCCCTGCGACTGCTTTT
TTCCCCTTTTTTACCCCTTGTCTCCATTTCCCCCCGTCTTTCCACCATCG
TTACTCCCTGTTTTGTTTTTCCATACTACTGTTCTTCTTACCCTTCCACT
GCTCTTTTCTCCTCTCCCATCGCCTATCTTTTTTTTCCTCCTTCCCCTTG
TCCTGCTCTTCTGCCTTCCTTCTCTTTCTCCCCTACTCCTTCTCCTTCTT
CCTTCCT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 8 6 6 10 7 15 24 26 23 23 28 22 15 17 13 9 9 9 13 23 25 39 23 20 18 14 11 11 13 11 12 12 10 10 9 6 6 6 6 8 10 12 24 21 28 30 33
33 33 44 42 42 31 23 19 12 9 9 8 8 6 6 6 6 6 8 12 14 12 15 12 14 11 16 25 27 41 41 41 48 50 50 53 57 50 50 36 36 37 42 42 42 37 39 39 34 38
42 38 38 36 36 33 33 33 33 37 37 25 19 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 12 16 11 11 11 11 14 18 30 32 28 28 37 37 33 35 35 35 35 36 53 59 59 57 57 42 47
43 44 43 43 35 42 29 43 30 31 37 33 33 43 37 39 39 43 46 46 46 46 46 37 37 46 46 48 41 41 39 57 57 43 43 43 43 39 37 47 42 48 48 42 42 37 42 44 42 42
54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 46 46 52 52 52 57 59 59 52 43 43 50 59 57 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57
57 54 57 52 52 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 57 50 57 57 57 57 57 59 54 59 44 44 38 50 43 43 43 33 33 44 44 57 48 57 57 57
57 57 57 44 59 57 41 34 42 35 35 59 59 54 54 48 59 34 32 17 12 12 16 16 15 12 9 15 19 41 44 54 54 54 57 57 57 59 59 59 43 43 43 43 43 54 54 59 57 57
57 57 57 57 59 44 43 36 43 24 30 17 17 17 24 24 37 32 39 35 35 32 32 19 19 12 12 12 24 28 34 43 46 41 41 48 48 48 50 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 48 48 48 59 59 47 47 43 43 43 40 40 43 47 57 57 57 46 46 42 42 48 46 42 39 35 35 32 42 39 43 43 43 42 59 42 47 44 59 43 39 37 42 42 42 43 43 44 57
47 57 57 57 68 68 68 57 57 47 47 50 44 44 42 43 43 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 52 54 52 57 52 52 52 52 52 52 52 43 43 52 43 43 38 38 39 50 50 52 52
52 52 52 52 57 57 57 59 57 57 57 54 57 54 57 57 48 48 48 57 57 44 44 28 28 20 32 28 41 40 47 47 36 44 40 47 37 42 37 41 41 47 54 57 57 57 57 42 42 36
40 37 37 30 37 37 42 47 44 32 20 20 20 31 32 39 42 36 33 42 43 48 57 43 43 43 43 43 47 43 43 57 57 43 43 35 35 35 37 43 39 48 43 43 43 48 48 48 48 39
33 31 30 27 27 24 24 22 24 18 24 24 33 37 41 28 20 15 18 18 22 30 32 24 19 16 26 26 20 30 30 35 35 35 28 18 18 19 22 18 21 15 9 9 9 9 15 14 39 47
47 34 59 39 30 28 23 20 20 20 27 27 20 20 20 30 30 20 17 16 16 11 11 15 9 9 12 21 21 34 28 28 28 28 26 24 22 18 14 15 10 9 8 8 9 15 26 33 37 32
18 20 11 11 | Open.Hide. 6 6 6 6 10 10 8 8 8 11 8 11 11 10 9 9 10 24 21 37 33 22 22 12 12 13 15 28 25 27 16 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 7 10 10
12 22 21 41 41 41 41 23 23 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 14 26 30 33 33 48 48 50 57 57 39 36 28 29 29 33 37 47 57 57 42 42 32 32 32 42 47 47
37 39 35 35 35 47 39 39 34 32 33 36 36 33 41 39 33 33 33 30 25 21 13 13 14 22 17 30 26 37 37 41 43 47 48 48 48 57 43 43 39 39 35 39 39 37 40 39 39 39
43 32 32 28 28 37 43 44 57 57 48 46 33 24 21 13 14 14 24 15 24 19 22 19 27 22 17 17 27 21 22 30 32 32 30 30 37 37 35 35 37 42 36 36 36 25 28 37 42 36
32 20 15 18 24 34 44 47 41 37 37 35 35 37 37 47 42 42 37 43 33 40 29 37 37 37 35 35 28 37 23 23 20 28 23 28 25 28 40 42 39 43 34 34 25 25 24 18 13 14
18 24 25 32 28 29 18 15 15 15 14 14 15 15 12 11 11 13 12 12 12 12 12 16 23 20 19 19 12 13 13 13 21 23 28 13 12 12 12 12 14 28 18 25 25 40 40 48 48 48
43 39 39 20 19 10 10 10 12 15 13 13 11 11 11 20 12 11 11 12 16 10 6 6 6 10 8 10 11 16 16 28 28 28 30 30 30 32 39 39 28 28 20 24 24 24 25 18 20 15
19 18 12 12 28 25 15 9 9 9 9 10 24 24 30 25 18 16 15 16 10 10 10 10 10 10 12 15 12 12 12 15 11 11 11 12 12 12 12 12 10 17 14 12 16 10 15 10 8 8
8 11 12 10 9 9 9 11 11 12 16 13 10 10 9 8 8 10 10 10 9 18 18 10 9 9 9 9 12 22 11 11 11 15 15 11 9 8 10 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8
21 19 28 31 23 23 23 18 10 10 8 8 8 12 13 13 12 18 11 8 8 8 8 8 10 15 12 11 11 11 13 12 12 13 14 22 12 10 10 10 10 10 11 9 8 8 8 8 8 13
11 14 14 13 17 15 15 11 11 12 15 10 10 10 13 13 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 13 13 13 13 17 13 15 9 9 9 9 10 15 15 9 10 8 6 8 8 8 8
8 10 12 10 11 10 10 12 10 14 14 13 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 9 9 16 10 10 10 10 10 10 10 13 15 18 18 16 12 10 6 6 8 8 8 12 19 12 15 15 24
24 30 34 22 17 8 8 10 10 12 13 19 19 9 12 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 9 8 8 11 9 8 10 11 15 15 18 17 16 17 10 11 20 18 17 13 11 11 11 11 11
12 14 10 8 8 8 8 10 18 19 27 14 14 14 13 12 10 10 10 15 28 15 13 10 10 12 14 15 14 13 13 8 8 9 8 10 8 9 9 10 10 14 14 12 11 11 14 12 11 11
9 9 10 10 12 10 10 |