BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-134J19.T7 (MSMg01no134_j19.b1) | MSMg01-134J19.TJ (MSMg01no134_j19.g1) |
ACC | AG341284 | AG341285 |
length | 1,195 | 1,204 |
length of high quality (start - end) | 330 (500 - 829) | 638 (87 - 724) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j19.b1 PHD_FILE: MSMg01no134_j19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j19.g1 PHD_FILE: MSMg01no134_j19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNGGCAGCTATGGGCGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTCATCATTTAAACTGGAATGAGGTTTTCATATCAAGTGACTAAAA
TACTTTTAAAATGATTTTAACAGGTTGAGGACACAACATGATAAAGTATT
TGTCTAGCGTGTATAAGGCTATAGGTTCAATACCCTACTCTACAACAGAA
AAAACAAAAAAAACAAAAACCTCCCAGCATTTTTTGTTGTTGTTAAGAAA
CATATAATGTGTGACTTTAGAAATTTGTAAACAGTTTTAATATATTTATA
CCTTTTGCATAATTGTCTAGTTGTTAGTACTTAAAATGGGAAGGGAACCA
CGTTGTTTGCTTTTCTTCACAATCGTACATCACAAGTTTTTGTTACAAGT
AATTTTCCCAAACATAGTGTCTTAGGGTTTTACTGCCGTGAAGAGCTATT
ATTTTTTCCCCCCCCCTTATAAAGGCAAATATTTAATAAAAAAATGGCTT
ACAATTTTAGAGGTTCAGTCTGTTATCAGTATGGCAGGAAGCATGGCAGC
ATGCAGGTAGACAAAGTGCTGGAGAAGGAACTGAGAGTTCTACATCTTGA
TCCTCAGGCAGCCAGGAGGGGACTGGATTTTTCACAATGGGTAGAACTTG
AGTATAGGAGACCTCAAAGCCCACCCCCACAGTGACACACTTCCTTCAAC
ATGGCCACAATTCCTAGTAGGGCCCCTCCTTATGGGCCAAGCATTCAAAC
ACATGAGTCTGTGGGGGCCAAACCTATTCAAACCAGCACACATAATAAAT
CAATCTGGCTATGTTGGTTCATACATCCAATCCAGTCCTTGAAGGATGAA
ACAAGAAGATTGCTATAAGTTTCAAGCCTGTATTGAGCACATGATGAGTT
AAGACCAGGCCTGAGTTATATAATGAAACCCTGTGTATCTGAAAAAAAAT
TAATCTCCCCATCAACACAAACCCCCCAAAGTAAACAAACATATATCTGT
TTAATTTTAACAAAAAATGGCTTAGGCCGTTTAAAGCTTTCAGGAATTCC
TTACCTGTTATATCAAAAAAAACCCCTTTCTAACCTTTAAAAAAAAATTT
GGTCTCTTTTTTCAAAAGGGCCCCAACAAGGAGGTTTATAAAAAAAAACA
AAAATTTTTTTAATAACCTGGTAATTGCAGCCCGAAATAAAGAGG
| NCCCAACTCTTNNNNACTCAAGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAATCCTGCTCTGTTAGTCA
TGAATTAGAGCTGCCTCCCTATGATGGCAATATTAAACAAGTCCATCCCC
AAGAGAAATGCAGAGGGGAACAAAACCTGCTGCAAAGTATACCCCTCCTC
TCAGGCACTCCAAATACACACCCAGCCCCGGCCACAGAGCACTTAACTCC
GTCCAGCAGCAAGGCTAAGCAACCGAACAACTGAGAGCAACCTGGGAAGA
CCAGGGTGAAATTTATGGAAACCCGCAGTAGAACCTCCAAGCCATGAAGC
CCGAATCTAAAAACAAAGCTGGACCTATCAAAATGAAGGATGAGAAGCAG
ATAAGAAAATAACGAGAAGCAGATGGCAAAGGTATTTTCCATTGATGCCA
TGCCCTTCTGAATAAAAGGCTTGAGTTTTTATGTTCTGAAAACGCTTGTA
TGCAGAGACCTATGAACATTTCACTATGCATTATTCTCTGTCTCTTTCTA
TCTCTGCCTCTCTCTACCTCTGTCTCTCTGTCTGTCTGTCTATCTGTCTC
TGTCTTTCTGTCTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTACAG
CTTAACCATTGTTTGTGACATCCTGAGGGGAACGGTCGGCTAAGTTGTGT
TTGTGGAGCACTCCGTTATCTTGAAGGCTACTATGGTATATCAATTCCCG
ACACTGTACTCGGGCAGGCACAGAAAGACCCAAGAGAAGCCCTGATCCTC
ACTCTGTTAGAAGGTGAAATTTGGTGGTCCTGGAACCCCTTGCCTAAAAA
TCTTTTTTTTTCTCTCAATTTTTTTTTTGGAATTGGTCCTCATTTTCTTG
TTTACATTATAACAATTTTTATCTCTCCTATCGTAATCTGTACTTCTTTC
TCTTATTTTAAATTTATTATGTCTATTTTTTAATACTTTTTTTTTTTTTG
TCTCTTTTTTTCCTTTCTTTTTCTTCTTTTCTTTTCTCAATCTTTGTATC
CTCTTTTATTCTATTTTCTTTTCTTTTCTCTCTTCTCTTATAACGTTAAT
TTTGCTTTTTATGATACTTCTCTTCTTATTTCTCTTAATCTTTCTTCTTT
CGTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 9 9 9 9 11 20 21 18 15 13 14 13 12 9 9 15 19 24 28 24 17 17 20 24 24 30 42 37 36 42 42 42 42 42 42 42 50 50 50 53 47
47 51 51 68 51 51 50 50 50 50 50 50 51 51 51 51 51 57 57 57 48 47 47 48 57 48 54 54 54 57 57 57 68 50 50 51 51 51 68 48 48 48 48 48 47 47 50 47 47 57
57 57 68 68 50 50 68 68 57 57 52 52 52 52 52 50 50 50 50 50 50 68 68 50 50 50 51 68 68 50 27 24 11 11 11 24 27 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 44 38 26 22 22 14 24 38 43 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 36 30 21
23 23 28 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 50 50 50 59 59 59 59 59 25 21 10 8
8 8 13 16 14 10 9 9 9 11 12 29 29 22 24 23 28 25 32 41 59 59 59 59 48 48 43 43 43 47 47 47 47 30 25 15 11 9 9 9 11 14 10 13 11 13 11 11 11 24
25 28 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57
57 57 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57
54 57 54 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 59 54 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 50 50 50 47 47 47
44 43 37 37 43 41 43 41 41 36 43 37 41 39 43 37 39 39 36 36 36 39 31 31 39 39 39 39 46 46 46 46 37 37 43 39 37 37 41 41 41 43 47 47 59 47 47 48 48 48
48 59 57 43 43 37 37 35 39 39 40 39 40 41 39 39 39 36 32 39 37 32 29 29 32 39 39 39 35 32 37 37 39 39 59 59 47 41 41 48 43 44 37 43 43 46 46 50 48 47
47 47 47 44 39 30 27 14 14 14 25 22 28 24 28 22 31 31 20 28 28 34 34 32 32 14 9 9 15 11 16 17 27 19 17 18 14 17 19 37 28 22 15 15 10 13 13 21 16 10
10 10 19 23 32 29 12 15 10 10 10 18 22 19 19 10 10 13 18 13 9 8 8 8 8 15 10 12 16 12 12 12 26 26 30 24 24 19 19 19 20 21 24 18 14 14 12 13 14 21
19 8 8 8 8 8 8 10 12 15 10 11 12 12 12 12 11 9 8 7 7 7 8 8 9 13 11 12 19 19 18 18 11 8 8 8 8 8 8 8 8 12 18 15 19 23 15 11 8 8
8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 12 12 12 10 13 9 8 8 9 14 19 21 25 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 10 10
10 12 11 11 10 13 10 9 9 9 9 9 17 19 26 24 12 10 10 8 6 6 7 7 7 7 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 6 7 6 6 10 7 6 6 6 7 8 8 8
10 10 13 13 8 11 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 11 17 10 12 10 10 12 8 11 9 10 10 10 10 9 8 8 8 8 10 9 9 24 20 20 9 8 8 8 8 10
10 8 6 6 6 6 8 8 11 12 12 13 15 16 16 11 12 12 11 10 11 8 8 6 6 6 8 10 10 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 19 26 30 35 18 13 9 8 8 8
14 15 10 6 6 8 8 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 7 8 9 13 10 10 10 6 6 6 6 13 6 11 8 8 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 6 6 8 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 8 12 11 8 7 9 8 8 9 16 15 19 9 10 10 23 22 28
22 22 25 28 30 32 32 33 42 37 35 35 35 36 36 36 36 44 44 50 50 47 39 27 18 9 9 12 10 8 8 8 8 10 12 16 19 28 28 30 30 35 35 35 35 38 38 38 50 50
53 53 53 42 38 53 47 47 31 33 33 33 33 33 25 25 10 9 6 6 6 6 8 10 14 24 34 32 40 43 40 41 42 41 22 15 8 8 8 8 10 31 32 37 37 39 44 44 53 50
57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 68 68 68 35 35 15 22 12 17 15 32 34 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 32 24 12 15 12 13 18 13 13 15 30 32 44 48 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 50 50 50 53 53 57 59 59
59 59 59 59 47 47 47 47 30 26 15 12 12 12 16 21 30 23 23 30 28 23 25 24 28 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 47 41 41 20 20 20
28 24 30 36 39 43 46 48 54 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 50 59 48 50 50 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 59 57 43 43 43 44 43 48 48 59 59 59 59 59 48 34 31 18 21 21 21 21 28
33 37 41 34 34 25 25 15 15 15 19 19 33 33 33 39 32 34 18 18 15 19 10 10 10 21 23 17 15 15 19 21 18 14 14 16 12 11 10 10 10 14 10 11 11 16 8 8 7 7
10 19 17 28 23 23 16 18 16 21 19 13 10 10 10 16 16 10 10 10 11 11 12 9 9 10 10 9 9 9 16 22 18 18 13 16 16 28 29 24 17 12 12 12 10 15 8 8 8 15
18 16 13 10 8 10 10 15 13 10 10 11 9 9 9 10 15 13 10 10 10 10 10 10 13 13 14 10 15 12 11 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 10
10 10 10 10 12 15 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 10 10 15 10 12 9 7 7 8 8 9 9 10 13 10 11 10 8 8 6 6 8 10 10 8 8 9 17 10 13 6
6 8 8 13 15 12 10 11 8 10 10 8 8 8 9 9 10 10 11 11 11 11 12 12 12 14 15 8 8 8 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 8 7 8 11 12 12 8 8 6 6 6 6 13 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 12
11 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 10 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 15 10 10 9 10 10 8 8 6 6
8 10 8 8 11 20 14 9 9 8 8 8 9 8 10 9 9 9 12 11 10 9 8 10 10 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 8 10 11 11 8 8 9 9 9 8 11 11 8
8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 9 9 10 8 8 8 6 6 11 8 10 10 10 10 12 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 16 9 9 7
8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 12 11 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 11 11 8 10
9 9 9 9 |