BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176P13.T7 (MSMg01no176_p13.b1) | MSMg01-176P13.TJ (MSMg01no176_p13.g1) |
ACC | AG371506 | AG371507 |
length | 1,490 | 1,325 |
length of high quality (start - end) | --- | 274 (118 - 391) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p13.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_p13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p13.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_p13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:24 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATGCGGCGCTAACATCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCCTGTGCAT
TAATTTCCCTTTAAGCCCCCTAATATTCTTCCCCCGCTCTTCAGAGCCCT
TTAAATCCCCGCCCCACCAAGCTTGTTATCCATGAAGGGAGTGTATTGTG
ATGGAAAAAGGACCAGCCTCACTATCCTAACCACCATGGTGACCCACGCT
CTGAACCTTGACCAAGACAACTCTTCCCTCCAATACTCCACTTCATTTTA
CTCTGTAAACGCTACCTCTTACACCACAGCTCATTATAATACCCTCTATA
CTACCACTGACACTCTCCTTTCTCAATGCAACAACCAATAACATGATCCT
CCTCCTTCTTAACTTACTCCCATTCTCCCCCCCTCTCCTTTTTTTTTTTT
CTTACCCCCTTCCCTCCCCACTTCTCTTACACACTCATCCCCCCCCTCTT
TTTTTCCCCCCCCCCCTCTAGCTTTCTCATTTCTTTCCTACAACAATTAC
TTCCTATCTACTTCTCTCCTTCATCAATCTCCTACTTTCTCACTCCCTCC
TCACCCTCTCAATATTTTCTACCCACTTCTCCTATATTTCCACTCTTTAA
CATTATCCTCCTTTATTTCCACCTCCCACTCTCCCTCCTTCACCCTTATC
CTCCTTTTCTCCCCTCCTCCCTCTCTTTCCAACCTACTCTCTCTTCATTC
TCTTTCACTCTCCTCTCCCCACCACCCTCCCTTACCCCTCCCATTACCTA
TCTCTCCATTAACTCCTCACCTACCTCCTTCCTTACTCACTCTCCCCTAC
CATCAAATTCCTTCCTCTCATTCCCCACCCTATTCCCCCTACCTCCCTCT
TCTTCCACCCTATCCCTCTTACCCGTCTCCCTTCCACTACTTCCTTCTCT
CACCTACTCTCCCCCTCTCTCACCCCAACCTACCCTCTCTATTATACTAT
TCATTTCCCCATACTCATCAATCTTCATCATCTCAACTCTCACACAATTA
CTACCCTCATCCACAACTGCATCACTCACTCTCCATCTCCATCTACCTTC
TTACTCACTCATCCCTAACCCTTTCATATCTATTAGCTCTCTATCTCTCC
TTACACCCTACCTCCTTTAAACTCCACCTTTCCTCACACTCCTCACAATC
CTATCTCCTCAACTTATCATCTATCTTCTACCCTATTCTCAATCGCATTC
AATATATTGTCCACTATATTATCATTTTCTCTCTCTCTCCTACTCCTCAA
CTATTTCTCCTTTCTTATAGTCTCACTCCTCCTATTCTTAACCTCTTCTA
GTCATACCCTCATCTTCATCTCACTCTAGACTGACATTCCCTTCATTATC
TATCCCTCTCTACCTCATCCCTCCCTCTACCATGTCTGCATTCCCACTCA
TTTACACTCCCTACCTTCCCTTCCTGTCACTCTCGCTCTAACTTTTCTCT
CTCTTACAATACTGTATTCCTCACACCTATCCACCCCTTC
| NNCCGAGCTAGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCTCTATATCCCATAAGCTGTAAAATACAAATTCAT
GAGTAACGTTGAACTCACACTTACTCTCTTCTTCTTTCTAGTCATGGTTT
TGCTACTGAGATACACCTCAGCCTTTCTCTTTGTTCTTTTGAACACATCT
TAAAAGATGTTCTTCATCTGGATTAACATTTAGGGAAAGCACCAATGTGA
ATTTCACAATGTGGTAAACCTCCACTATTTTTCTCATTTCTTTGTAATGA
AGAAAATCATTACGAAAGGACACAGTGCAATCATGTAGTTTTTCTTTCCA
GCTTTGCTTGTTTTGCAATGCATTTATCCTTACTGTCAGTAGCTCTTTTT
TGTTAACCTGCCTTGTCTGGTTAGTGTATTAAAGATGCACTGTCCTATTT
TTTTTCCCCCCCCCCAAGTTTTTCTTCTCCTCCCCAAAAAAAAGGGTGAT
TTTTTTTTTTTATTTTTTTTCATCTTTTCTTTTTTATTTTCTTCCTCTAT
CTTACTCTCTTTATTTTTTTTTCTATACTTTTCCTTCTCTCACTTTATCT
TCTTATTCTCTCTTTTATTCTATCCTCTTTTTCTATATCATTCACATTAT
ATTCATTCTTCCTTTTCATTTCTCCTATTCTTTTATTCTCTTCTTTTTTT
TACTTTCTTACCTCCATATTCTCTCTTTCTTTACTTTTTACTCCTTTTCT
TATTTTCTTCCTCATCTCTTCATTTTATTTAATCTCATCTTCTATCTTTT
TCTCTTACTACTTCTCCTTATTTTATTCTTTTCTCTTTTATTCTTATTTT
CTCATTCTCTCCTTCCCACTCTTTTTTATCTCTCTTTTTCCTTTCTCTTC
TCTTTTATTCTTCATCCTTAATTTTATTCCTATTTTCCCTATTCTTCTCT
CTCTATTTCTTTTATCTCCTTTTCTACTCTTTCTTTTTTCTTTCTCTCTT
CCATCCCTCATCTCACTCACCTATCTTCTATTCTAATCCTTCTCTTTTCT
CCGTTCTTTTCTTAACCTTTTACTTCTTCTCCTTTTCTTTTTCCATCTTA
AGGTCCTCTTCTCACTTTCCTTTCTTCCTACTCTTTTCTTATCTATTTTT
CTCCTATCTNTTTTATTTTTCCTATACCTTATCTTGTTTCTTTCCTTATC
TTCTCTCTTTTTTCATCACTTTCTTCCTCTTTTCTTTCCTGTTTCCTCTC
GTTTCTACTCTCCATCACTTTCGTCAATCAACCTCTTTCGTTTCTACTCA
TATTCCGTTCTTCACATTTCTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 8 20 24 13 12 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 22 22 28 17 20 20 28 33 33 33 33 37 26 31 32 24 26 15 15 9 9 10 19 19 33 33 33 37 30
28 25 22 19 14 13 10 12 11 10 10 10 10 10 10 10 11 15 13 9 9 9 9 21 21 31 31 33 33 28 33 37 57 44 39 33 33 33 31 31 29 29 30 21 18 18 11 14 12 10
9 10 12 14 9 11 10 13 12 8 8 8 11 6 6 6 6 6 8 19 16 27 30 30 21 24 24 24 31 28 32 32 31 23 22 14 18 15 15 12 13 13 19 12 15 21 26 17 17 20
21 21 14 18 14 24 24 23 14 14 14 14 19 21 16 15 15 15 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 17 21 15 15 17 21 20 12 11 11 11 15 19 12 18 14 10 10 8 9
9 10 10 14 10 10 8 8 10 13 13 13 13 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 12 10 10 10 10 10 10 11 23 10 10 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 10 13 13 11 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 12 12 16 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 12 11 11 10 10 10 8 8
9 9 8 8 9 9 9 10 12 9 8 8 8 8 8 10 12 12 8 13 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 7 6
8 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 20 23 29 27 15 8 8 7 10
8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 10 11 8 8 8 11 11 11 14 13 13 11 8 10 8 8 9 9 13 16 15 13 8 8 8 8 10
14 24 17 14 12 10 9 8 8 9 10 10 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 16 15 14 9 10 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 11 11 13 10 11 11 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 7 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8
8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 7 6 8 8 8 8 8 10 10 13 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 8 8 10 6 7 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8
8 8 10 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 11 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 12 12 9 11 11 10 10 10 12 12 15 9 9 9 10 8 8 8 8 8 12 15 16 10 10 8 8 6 7 10 8 9 9
10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 9 12 11 12 10 10 8
8 8 8 9 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 9 9 9 9 9 12 16 11 11 11 12 11 8 8 8 8 8 8
10 11 11 11 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 10 9 9 8 8 10 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 12 10 9 9
10 6 7 8 8 8 8 9 11 10 9 9 9 8 8 7 7 8 8 9 10 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 7 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 11 12 11 9 6
6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 9 6 8 10 8 8 8 11 9 11 9 9 10 10 10 13 8 8 7 7 10 8 8 8 8 8 10 10
9 9 8 8 8 8 7 7 10 8 6 6 7 10 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 11
11 10 11 11 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 6 6 8 8 9 11 9 8 8 7 8 6 6 6 6 8
8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 10 10 10 10 10 8
8 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10 8 8
7 7 9 9 10 10 10 11 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 17 15 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 10 9 12 9 9 8 8 6 6 10 8 9 8 6 6 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 10 10
8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 8 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10
8 8 9 12 10 8 8 6 6 8 8 8 6 7 10 8 8 8 9 9 15 12 8 8 7 7 7 9 9 9 9 8 8 7 7 8 10 8 8 10 10 10 10 10 8 6 7 7 8 8
8 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 7 7 8 10 9 9 13 10 8 8 8 8 8 10 13 13 13 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 7 7 11 12 17 7 7 9 9 16 12 21 19 19 10 10 10 21 21 33 36 36 36 21 21 10 10 10 23 21 43 43
42 50 53 53 53 53 53 50 50 50 41 27 18 11 12 12 12 8 8 8 8 14 17 21 14 12 12 15 19 26 31 36 50 38 50 53 53 53 53 53 53 50 50 50 53 53 53 50 50 68
51 42 21 17 9 10 10 10 10 18 18 24 25 24 24 15 15 15 20 20 36 36 48 48 48 48 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 51 51 51 51 57 57 57 57 57 68 68 68
68 51 51 51 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 50 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 59 59 59 50 50 39 38 43 32 32 28 38
38 41 27 43 43 59 59 54 50 50 44 43 29 29 33 42 42 46 57 46 36 36 25 28 28 35 31 33 25 25 36 40 46 54 47 47 37 37 37 47 44 57 57 54 57 48 46 46 43 43
39 43 43 46 46 46 46 43 43 43 43 43 43 39 35 35 35 32 34 30 28 23 31 23 23 15 15 15 15 30 32 43 32 31 20 20 24 21 16 16 10 10 11 11 16 11 14 18 21 10
9 7 7 8 12 12 24 28 32 32 37 37 32 28 18 18 15 21 11 11 11 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 12 21 12 11 11 12 8 8 8 8 8 8 9 8 10 13 6 8 8
19 18 15 12 12 10 10 10 16 18 18 15 15 10 11 9 6 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 14 14 14 15 14 9 10 15 15 16 11 11 11 9 11 11 11 12 12
10 10 10 10 10 15 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 12 14 16 12 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 10 12 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 6 6 8 10 8 9 9 12 10 8 8 6 6 6 6 6 6 7 10 10 10 8 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6 12 8 10 10 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 12 8 8 8 11 11 11 11 13 15 10 12 10 10 10 10 12 15 12 12 12 13 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 6 6 8
8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 6 7 6 6 8 8 10 9 9 9 11 9 10 8 8 8 8 6 7 8 6 8 8 10 10 11 9 9 8 8
8 10 8 8 8 7 6 8 6 8 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 9 10 9 8 8 10 10 13 8 8 8 10 8
8 8 8 8 10 11 7 7 8 6 10 8 11 7 7 7 7 8 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 10 9
8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 7 8 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 10 10 8 6 8 8 8 8 8 9 8 8 12 13
13 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 13 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 13 11 11 11 18 15 14 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 12 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 7 6 6 8 8 8 8 10 19 18 8 8 8 7 6 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 10 10 10 10 11 9 9 13 15 14 11 9 13 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 12 10 8 8 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 14 9 9 10 12 12 10 10 8
8 6 6 6 8 8 8 11 9 11 11 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 9 11 10 10 11 11 11 11 11 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 10 11 10 8 8
8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 7 13 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 10 13 10 8 8 8 10 9 9 10 10 11 11 9
10 12 12 11 6 6 6 6 3 0 3 10 8 13 8 8 8 8 9 11 11 11 11 11 13 8 8 7 7 8 6 9 9 9 9 9 9 8 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 11 13 19 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 12 8 10 8 11 10 12 15 11 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 15 14 9 9
9 9 9 9 9 9 8 8 8 7 10 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 6 6 6 7 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 10 8 6 6 6 8 8 12 9 7 11 8 8 6 |