BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313H07.T7 (MSMg01no313_h07.b1) | MSMg01-313H07.TJ (MSMg01no313_h07.g1) |
ACC | AG435377 | AG435378 |
length | 1,335 | 1,301 |
length of high quality (start - end) | 714 (135 - 848) | 299 (506 - 804) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h07.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_h07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h07.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_h07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCAATAAANNNNNNNNCCACTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTCAATTCTGAATATCTCTTTTTAAAATACAAGGGCAGC
CACATTCATTAAAGAAACTCTTTAAAAGCTCAAAGCACACATTGAACCTC
ACACAATAATAGTGGGTGACTTCAACACACCACTTTCACCAATGGACAGA
TCATGGAAAAAGAAACTAAACAGGGACACAGTGAAACTAACAGAAGTTGT
GAAACAAATGGATCTAACAGATATCTACAGAACATTTTATCCTAAAACAA
AAGGATATACCTTCTTGTCATCACCTCATGATACTTTCTCCAAAATTGAC
CACATAATTGGTCACAAAACAAGCCTCAACATATACAAAAATATTGAAAT
TGTCCCATGCATCCTATCAGATCACCATGGACTAAGGCTTATATTCAATA
ACAAAATAAATGATATAAAGCCAACATTCATGTGGAAACTGAACAACACT
CTTCTCAATGATACCTTGGTCAAGGAAGGAATAAAGAAAGAAATTAAGGA
CTTTTTGGAGTTTAATGAAAATGAAGGCACAACATACCCAAACTTATGGG
ACACAATGAAAGCATTTCTACGAGGAAAACTCATAGCTCTGAGTGCCTCC
AAAAAGAAACTGGAGAGAGCACACATTAGCAGCTTGACAACACACCTAAA
AGCTCTAGAACAAAAGGAAGCAAATTCACCCAAGAGGAGTAGATCCCAGG
AAATAATCAAACTCAGGGATGAAATCAACCAAGTGGAAACAAGAAGAACT
ATTCAAAGAATCAACCGAACGAGGAGCTGGTTCTTTGAGAAAATCAACTA
GATAAACACTTAGCCAGACTCACTAGAGGGCACAGGGAAAGCATCCTAAT
TAACAAAATAAGAAATGAAAAGGGAGACATAACCACAGATCCTGAAGAAA
TCCAAACACAATCAGATCCTTCTACAAAAGGCTATACTCAACAAAACTGG
AAAACCTGGATGAAATGGACCAGTTTCTAGACAGAAACCAGGTACCAAAG
TTAAATCAAGATCAGGTTAATGATCTAAACAGTCCTATATCTCCTAAAAA
AAATAAAACCGCCTTAATAGCCTCCCACCCCAAAAATCCCCGAAACAAAT
GGTTTAAGGCCAAAATTCTTCAAACATTCAAGAAGAAATTAACCCAGTTT
TCTCAAAATATTCACAAAAATAAAACAAAAGATTCCTCCCCCCTCTTTTA
TAAGCCCCTTATTCTTGTATCCTACTCCAAAGAACCCCCAAGAAGAAACT
CCCACACTTCTCTTATATTGTGGCGAAACCTCTCA
| NATTTATNNNNAAATGACGAGAGCTGGGGCGCCTGTXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATTGTGTTTTTTCTTCATTCTC
CAGTACTCACATTCTTTCTGCCCTCCTCTCCCAAGGCTTTTATGAACCTT
GGATGGAAGCTGACTCGAGAGATGACTCCATCTGCCCCTGAGCACTCAGT
CACTGATGCTAAGCACTTTGATGGGTATCTATTTTTAAAAGAATGAAAGA
AGTATGAGAAAATATTTTAAGACTTTGAAATTTCATAAACATAAGAATCA
AGATTTTCTAAAAGAAAACGAAATGCTGCTTTAGACATTCTTGCATTTAT
AGTCTAGTTTGGGTAAGTTTAAGAATTTATTATTTATTGTATTTAAGAAT
ACTATAGATAAAAGCAACTATTTTGTGATGTGATAGCCATTATGTTAATA
TTAAGATTATTATTTACCTCCCATATCCTTCACACAGATAGACATAACAA
AGGTGTCAAATTAAATGAGCGTATGAAACAGTAAGGATATTAACAGATTG
CCAAGTAAAATGGGAGTAACCTTAAACCTTGATAAAATTCCCATCTCGTC
TGAATATTCAGAACATTGAAAGATAAAGCATTTGTTAACCATGAATAGCT
ATGGGATTGCAGTACTTTGTTAATTTTTTTTTATATTTTATATGAAGAAT
GTTTCACTATTATTATAATACCCAAAAGTCATATTTTGGTTTTAAAAATG
TAAATTCCTAGCAATCAGTGTTTTCTCTATAACTTTGCAACTCAATCTCC
TGGGAAAGAACACTAACAAAAAAGTGTTGTGTTTGTAATAATTTGAAGAT
AAATTATGTTGGAAGGTATGAAATGGGATAAATCTTATAACATTTATAAA
TGCATTTTCTGTCTCCTGCAGAACATCAGTGAACATATGTATTCCTATGA
GAGAAGTGGAATTCATAAGGAACTAAATTACTGAAAGATCTGTATTTTTA
ATTTTGAAATTGTTTTGTCCTGCAAAAGCACCTTACCCTGAAGAACCGAC
CTCAAGTAACTTTCTTTTATTTTTAGGAACTTAATGTTTCTCGAAAAAAT
TATAAGGATTTAAAAATTTTGTTTGGTTAAGAAAGGGGAACACGGGCCCC
CCTGCTCCTCACAAAAAGGGAAATTTTTGTTGTGTGTGTCTCGTTCTGTC
TTTAACAAGAATTTTTTCTTATACTCCCGGTGCTTTCTACACTCTTTGTC
ACATACTGGCCTTCTCACTAATAATTCCCCCTTCCCCTTCTCCTTCATAG
C
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 9 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 9 9 8 8 9 10 10 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 13 13 17 20 24 17 19 14 14 15 16
22 22 30 26 27 24 21 21 13 13 22 29 33 35 36 47 37 43 43 43 40 33 33 30 19 15 10 10 9 10 10 12 8 8 9 11 14 14 18 18 11 12 13 28 30 41 41 28 28 30
39 37 43 48 47 42 42 36 29 29 28 30 37 59 39 28 23 12 11 12 11 11 10 16 16 30 30 22 22 17 22 16 12 12 18 19 30 30 37 37 48 48 57 43 44 36 36 36 42 39
48 57 57 54 48 48 46 46 46 42 37 34 31 33 24 24 24 43 40 42 43 44 43 43 43 47 44 48 48 48 57 48 54 54 57 57 54 54 37 32 18 13 13 13 13 24 32 42 44 46
57 57 44 43 37 37 43 50 50 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 32 32 32 44 44 57 52 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 45 45 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 31 43 43 52 44 39 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 39 39 13 13 13 39 39 43 43 62 62 62 52 52 52 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 52 52 45 43 43 43 44 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 52 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 54
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 57 54 54 54 54 54 68 57 54 54 54 54 54 57 59 59 54 48 48 43 39 36 36 43 43 43 43 39 43 35 39 39 43 34 43 39 37 28 37 34 40 41 39 41 39
37 37 44 44 37 36 37 35 31 31 39 41 37 27 22 20 20 22 32 41 41 37 37 39 27 16 11 11 11 10 15 14 27 27 37 34 31 35 41 39 39 37 32 29 24 17 8 10 13 22
23 40 37 32 29 29 32 37 37 36 30 25 15 15 14 14 19 19 26 27 39 39 34 34 28 28 30 37 29 26 32 20 32 25 31 20 28 14 14 14 30 28 28 28 14 13 13 21 23 16
16 17 30 15 17 9 9 9 14 12 14 9 9 9 12 11 11 11 19 19 20 20 23 18 9 9 9 11 11 19 25 10 11 11 15 16 19 26 23 28 37 37 37 30 33 28 24 12 12 14
19 19 22 27 22 21 12 11 12 11 10 21 16 16 18 27 32 31 31 41 41 22 12 16 10 9 10 9 8 8 8 8 9 8 10 10 19 19 19 25 19 21 25 19 19 10 10 9 8 8
8 10 10 10 11 12 10 14 10 8 8 12 15 10 10 13 23 16 28 28 25 24 12 10 9 12 12 19 21 22 18 12 10 8 8 8 10 10 10 11 19 21 24 28 37 37 37 33 28 14
11 10 11 10 10 12 12 10 9 9 9 9 14 21 18 14 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 10 8 11 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 11 14 12 9
9 9 9 15 15 11 11 11 11 11 11 14 12 14 14 20 14 16 17 12 16 16 16 10 10 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 9 10 16 16
9 9 8 8 8 10 14 10 10 9 9 9 12 8 9 9 8 8 8 9 9 9 11 11 9 6 6 6 8 10 13 22 22 9 6 6 6 8 6 9 9 9 6 6 6 6 8 8 6 6
6 6 12 12 12 16 11 16 12 12 12 10 10 10 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 11 10
10 9 9 9 8 8 10 6 6 6 6 8 6 6 6 10 10 13 8 6 6 6 8 8 11 11 14 10 6 6 6 8 8 10 11 8 8 8 9 8 10 8 7 6 8 9 8 8 8 8
10 9 10 10 8 9 9 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 11 8 8 11 18 13 13 12 9 9 9 9 9 9 10 11 11 8 6 6 6 6 10 12 10 10 9
9 9 11 11 9 9 9 6 8 8 8 8 8 9 10 11 13 15 8 8 8 8 10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 10 7 9 12 15 9 9 9 6 8 8 13 15 19 24 18 20 19 25 19 17 8 8 8
15 21 11 10 10 22 21 28 20 21 21 31 31 39 39 43 48 48 37 40 40 33 33 27 27 32 28 28 28 19 24 11 11 11 22 22 48 57 50 50 50 50 50 47 47 47 48 47 47 47
36 36 28 24 28 36 36 35 35 35 37 37 42 46 41 41 41 41 41 41 47 47 57 48 41 41 19 15 8 8 8 8 17 14 29 20 32 41 33 30 47 47 42 42 48 57 47 46 42 42
30 30 37 40 37 32 32 30 30 31 37 43 43 43 43 36 36 36 43 59 43 39 43 43 37 37 37 39 39 31 29 22 22 11 11 11 9 12 20 24 37 30 32 30 30 30 22 19 17 20
23 19 28 37 43 47 47 47 48 40 42 42 37 43 43 43 48 57 57 54 47 42 39 30 30 32 37 43 48 59 48 48 48 48 43 46 46 43 43 43 59 59 59 59 59 54 59 59 42 42
43 43 43 44 47 44 33 33 33 42 44 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 50 57 48 48 48 50 57 57 52 54 52 57 52 52 52 52 52 52 59 52 43 44 43 41 33
38 43 43 59 59 59 57 57 57 52 52 43 52 52 52 52 52 43 52 52 57 57 57 57 57 59 52 52 52 59 47 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 52 59 59 59 59
59 59 57 57 59 59 59 59 52 50 43 43 35 35 35 50 50 50 50 50 50 47 47 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 47 57 59 59 59 43 43 43 34 27
19 13 12 10 15 18 18 36 44 48 48 48 48 48 59 59 59 54 57 59 57 57 47 47 43 43 43 43 43 43 48 43 48 48 59 59 59 59 59 59 59 34 28 25 25 41 41 59 59 41
39 25 22 11 9 9 12 11 11 11 11 11 12 16 10 10 10 10 10 12 12 27 27 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 30 30 37 37 39 41 24 27 11 12 12 13 13 13 15
12 12 12 12 11 18 18 34 36 59 59 59 59 59 48 48 57 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48 39 42 35 39 43 46 48 57 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59
59 42 32 30 32 32 42 42 57 59 59 46 43 43 43 46 46 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59
57 57 54 57 57 57 57 57 57 54 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 54 44 44 41 41 44 57 57 57 68 57 57 54 54 54 59
59 59 59 43 43 43 48 48 57 59 59 47 47 47 57 57 57 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 48 48 48 48 43 59 59 47 41 41 41 41
37 37 37 37 39 39 47 41 41 37 39 41 44 48 48 48 59 59 59 59 41 41 35 35 31 24 24 15 15 15 25 27 41 41 59 43 43 28 28 32 39 40 47 59 59 47 48 47 47 43
43 43 47 47 47 59 39 32 32 20 20 34 36 37 41 43 59 35 36 36 34 23 25 19 30 30 34 30 21 14 9 9 9 18 16 18 25 31 31 59 47 43 41 31 31 37 37 37 32 31
34 25 22 25 18 19 19 22 19 19 21 19 18 28 20 25 32 37 32 32 28 26 29 22 28 28 27 27 14 14 12 16 16 18 28 28 25 19 22 14 17 18 22 20 18 14 15 18 22 23
20 17 17 12 16 10 19 22 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 17 19 17 8 8 8 8 9 9 8 8 10 13 13 15 15 12 20 23 22 18 24 28 16 11 14 19 18 16 17 9 8
8 8 11 11 12 19 14 18 16 16 10 10 8 10 8 10 13 10 10 8 8 8 8 10 10 13 15 18 15 10 8 9 8 8 10 9 13 13 22 15 16 15 24 17 24 23 22 17 17 12
12 9 9 9 10 10 10 10 17 8 8 8 8 15 17 24 12 11 11 10 9 9 10 10 14 10 13 13 22 19 19 19 21 19 15 8 8 8 8 8 10 8 9 9 21 22 28 26 11 11
10 10 13 13 18 23 18 19 10 16 11 11 13 14 31 17 16 10 10 8 13 8 8 8 8 9 8 8 9 8 8 8 9 9 9 14 16 19 16 13 8 8 8 8 7 10 7 6 8 8
6 6 6 8 8 12 12 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 17 14 10 10 11 11 9 8 8 8 8 8 11 12 7 9 6 6 8 6 7 8 7 6 6 7 7
8 6 6 6 6 7 9 10 20 23 14 19 19 17 9 10 13 15 15 11 11 15 13 7 6 8 8 10 12 11 10 8 6 6 6 6 7 10 10 8 8 8 8 6 7 6 8 6 12 19
22 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 10 9 14 11 11 12 18 17 18 17 15 15 18 14 13 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 9 9 11 12 9 9 12 12 21
16 15 13 9 9 9 8 8 8 8 8 10 14 16 11 11 11 8 8 8 10 10 10 11 11 12 8 6 6 6 6 7 8 8 11 10 10 10 10 8 8 8 9 9 9 12 15 8 8 8
6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 10 8 8 11 11 10 12 10 12 15 12 12 11 8 6 6 10 8 6 6 6 8 10 10 12 12 10 10 9
9 |