BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-377F08.T7 (MSMg01no377_f08.b1) | MSMg01-377F08.TJ (MSMg01no377_f08.g1) |
ACC | AG482440 | AG482441 |
length | 760 | 765 |
length of high quality (start - end) | 438 (51 - 488) | 416 (81 - 496) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_f08.b1 PHD_FILE: MSMg01no377_f08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_f08.g1 PHD_FILE: MSMg01no377_f08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNTTTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCAAGCCATTTTTGAGACAGTGTTTTTTACTGGACCTGGAGC
TAATGACTTGGATAAGCTGGTGGTCAGTAAACTATATTAAACCCACCTAA
CTGCCCTTCGCCACGTTCTGGGGTCACAGACATGTGCTACTCTGCTCATC
TTTTACCCATGCACTAGGAGTCAGTGCTCATGCTTGCCATGGCCCCAGTT
CGTTGGCATTCTCTTCTTTTTTGAGGTGAATCTCACTAGGTAACCCCGGC
TGGCTCAGACGTGCAGACAACAGGCATGAGTCACTCCTTCAGGATTGCTT
TCCTTTGTCATTTCTCCCTTTTAAGAGGGAGACTTTACTGTATTCTTCAT
TTCTTCCTTTTTTATTTTGGATAGGGTCTAACTCCGTAGCCCAGGCTAAC
CTCAAACTTGGAGCANATTTTCTGCCCCAACTTACTTAGTGTTGGGATGA
AAGGTACGAGTCAAGCCTGGGTGAGACTTTCTAGGGGATCCTTATAATTG
TCATGGACACCCATGTACCTGCCGGAACTATAAGCCAATTAACTATTATA
AGTAAAGGGGTAAAAAAAAAAAAACCCAAAAGTTTGGGAAATAACTCCAA
AATAATGGGGGCCATAAAAAAACGTAAAACCAATTAACAGGCTAACGGGG
TAAAAACCCGGCTGCCCCTAAAAGATAACAGGTTTGCTCCCCCCCCCAAA
TCAACGTTCT
| NNNCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTGAGAAACAACCAGTGAG
CTACACATCATTCATCTCACAAAGTCAGGGGCTCAAGCAGTCTAAGCTAC
AGAACAACAACTTTTCCTAAAAACAAATTAATAATAAAATGCCGGCTAGT
TGGCACACATCTCTAATCCCTGCAGTAGGGAGGCTGAGATAGTCTTGATG
AGATCAAGAGCAGCCTGGTTCTCATAGTGAGTTCTAGGATAGTCTGAAGT
ACATAGTGAAAATTTGCCTAATCATAAAATATAGAGGAAAACTACAATGA
TTATAAAATGTTCGTGGGTTAGAAGATTCTATTATAGAAATGTGGATTTT
ACTGTTCTATAGATTAAATTAATCTCATTAAAAGCACACAGTTGCTGATG
GGTTAGTTCTTTGGTATATTAAAACTGTATGAAGGGGGCTGGAGAGATGG
CTCANCAGTTAAAAGCACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGGTCAATTTCCA
GCAACCACATGGTGGGGTCAAACCATTCCGAAAGAAAATTGACGCCCTCT
TCTGTGGGGGTGGAAAAAAAAAACATGGAATCCCATTCATTAAAAAATTT
TTATAACAACCGGCTCGCACCGGCTTTTTTATTTCCCAGCCTTCAAAGTA
TCCCCCCATTTCTCCTTGGCGGGCTACCCCTCAATAAAGGTATATTTGGT
TTCCCGTTTTTAAAA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 8 9 11 13 13 22 30 34 37 37 32 29 31 37 37 37 35 29 34 37 37 37 41 30 28 28 25 23 27 30 17 15 12 11 11 11 21 19 16 16 14 12 12
24 23 37 37 35 36 26 26 34 34 37 40 40 28 28 37 29 40 33 35 24 28 25 32 33 42 42 48 48 59 68 68 68 68 57 57 54 46 46 46 48 43 44 39 42 44 44 57 47 47
57 57 57 57 57 57 57 47 48 43 68 68 68 57 57 43 43 57 57 57 57 44 44 33 33 43 44 59 59 50 43 50 50 57 57 68 68 68 59 59 57 52 52 52 52 52 54 57 57 57
57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 52 57 57 57 59 59 59 43 43 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57
57 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 62 62 62 68 44 44 52 52 52 62 62 62 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 35 39 62 62 43 59 59 35
43 41 62 62 62 62 62 62 62 44 62 52 52 52 62 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 52 52 44 44 59 59 68 57 44 44 43 52 52 43 42 47 47
57 59 44 44 21 38 14 38 24 43 43 57 44 59 43 44 32 43 43 52 52 52 57 52 52 52 59 59 59 59 35 43 50 59 54 54 54 57 44 43 37 50 50 57 57 57 57 59 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 43 44 43 59 47 57 43 47 47 59 59 59 34 34 17 17 17 34 32 43 43 43 47 47 48
59 59 48 48 46 59 47 54 54 59 59 59 59 35 35 35 47 59 43 43 37 39 35 37 37 39 35 35 39 47 37 37 30 28 23 18 21 15 20 18 22 32 23 22 28 37 32 39 31 22
22 28 20 20 26 26 39 39 39 29 29 25 18 18 3 0 3 12 12 27 24 30 30 30 25 22 32 28 22 22 34 34 47 41 41 28 28 13 13 14 14 15 17 28 23 30 17 11 11 17
18 13 11 15 15 15 15 13 9 9 9 9 9 9 9 13 9 8 8 8 9 13 19 9 9 9 10 10 18 14 15 12 9 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 14 15 14 9
10 10 10 10 16 14 9 8 8 12 8 9 10 9 11 11 12 12 10 10 9 9 9 10 13 12 14 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 8 6
6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 11 11 16 16 18 19 14 14 14 8 10 10 10 8 8 8 9 8 9 10 10 11 12 12 12 18 20 15 14 10 8 6 6 6 6 6 10 11 9
8 8 8 8 8 10 11 11 9 9 10 10 6 6 6 7 13 8 10 10 10 9 9 9 8 8 9 8 13 13 11 10 11 11 12 12 10 8 8 10 11 8 8 6 8 8 8 8 8 8
11 16 17 12 11 10 10 10 12 14 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 13 13 9 9 6 6 6 7 6 8 10 22 10 10 10 9 9 10 16 25 37 37 28 28 14 15 12 11 11
11 6 6 7 6 8 8 10 7 7 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 12 8 10 8 8 8 8 9 9 9 19 12 25 24 31 31 41 39 37 37 37 31 28 26 32 37 37 27 27 12 11 11 12 18 15 23 28 28 28 30 37 39 39
39 39 37 37 37 37 37 37 39 59 46 53 41 28 28 10 12 18 19 28 28 40 43 43 47 47 37 37 36 36 36 40 42 53 68 68 43 48 48 54 48 48 48 42 42 43 48 57 57 57
57 54 57 54 54 47 47 47 47 57 50 57 47 47 47 47 47 47 47 50 57 57 57 59 48 48 57 57 57 59 57 57 47 50 47 57 50 57 50 50 37 37 50 50 59 54 54 57 57 54
54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 54 54 52 50 59 59 57 57 57 52 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 45 45 62 62 62 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 44 44 62 43 44 43 52 52 44 44 68 68 68 68 59 59 52 57 57 59 57 68 68 68 57 57 45 45 57 59 59 57 57 57
52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 59 57 52 52 52 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 52 52 50 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 42 42 35 47 59 59 68 68 68 68 68 68 43 43 39 41 43 43 43 47 59 59 59 59 68 68 68 68 35 35 20 20 20 35 32 54 54 57 59
57 44 44 23 27 23 37 37 43 47 46 59 48 48 48 48 48 53 53 53 57 59 39 35 39 39 40 39 43 43 48 59 59 48 47 47 46 41 34 34 28 15 15 26 26 28 32 20 20 14
27 24 35 28 34 20 16 15 26 28 36 28 27 12 12 11 21 21 37 33 36 36 40 37 31 31 20 20 20 32 32 37 32 32 32 36 39 35 32 30 24 24 15 15 14 18 14 14 14 24
22 18 18 3 0 3 23 9 10 10 15 23 26 16 17 20 23 17 20 12 8 8 8 8 9 8 8 8 10 11 14 11 10 10 10 10 10 8 8 8 11 14 12 19 19 11 11 11 10 8
8 13 12 16 14 13 19 12 12 10 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 11 11 8 8 8 10 10 9 8 9 8 9 8 9 8 8 8 8 8 9 12 10 10 10 10
12 10 10 7 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 13 13 12 11 14 15 15 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 15 15 11 12 12 12 13 18 11 11 10 10 10 11 11 11 11
17 13 10 9 10 11 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 13 13 14 12 11 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 11 12 12 11 11 11 11 8 8 7 6 8 8 6 6 8 10 15 15 8 8 6 6 8 8 10 10 10 12 10
11 11 10 11 8 8 8 8 9 9 9 9 12 12 10 |