BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-413D19.T7 (MSMg01no413_d19.b1) | MSMg01-413D19.TJ (MSMg01no413_d19.g1) |
ACC | AG509818 | AG509819 |
length | 742 | 767 |
length of high quality (start - end) | 642 (34 - 675) | 513 (59 - 571) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no413_d19.b1 PHD_FILE: MSMg01no413_d19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:30:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no413_d19.g1 PHD_FILE: MSMg01no413_d19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:30:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGCTATACGACTCACTATATGCAGAGAATGCGCGGAATTCCTTTCTTCTT
ACAATTTTCTTCTGTTTTTTTTTTTTCATTTTTTCTGATGCATAATGAGA
TCTGGGTGTACAGTCTGTAGTCCAACTTCCCAACAATGGTCAGCAGTAGC
TGTGAATAGAAGTCCAAGGATCCATGAGTTGCTCAGTCCCACAAGGCAAG
CAGGCAAAGAAGAGAGAGCCTGGAGCATCTTCTGGGTATATGCCCAGGAG
TGGTATTGCTGGGTCCTCAGGTAGTAAGTACTATGCCCAGTTTTCTGAGG
AACTGCCATATTGTATTTCCAGAGTGGTTGTACCAGCTTTCAATACTACA
AGAAATGGAGGTGTGTTCCTCTTTCTTCACATCCTGGTCAACATCTGCTG
TTTACCTGAGTTTTTGGTCTTAGCCATTCTGACTGCTGTGAAGTGGAATC
TCAGAGTTGTTTTGATTTCCATTTCCTGATGACTAAGGATTTTAAGGATT
TCTTTAGGTGCTTCTCATTCATTTGGTTTTCCTCAGTTGAGAATTCTTTG
TTTATCTCTGTATCCCATTTGTTAATAGATTATTTGGTTCTCTAGACTCT
AACTTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGGATATTAGCCCTCTATCGAATGT
ATGGTTGGTAAAGATCTTTTCCCAAACTGTTGGTTGTGGTTTTTGTCCTA
CTGACAGGGTCCCTTGCTTTACAGAAGTTTTGTAATTTTATG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTAGAATTTTCCACACAAAATTAAGCTCCACTACAGTAGCTAA
ATATTGATGGATTGGAAAAGGCTCCAAAGTGAATGGAAGGTCTGTCAAAG
CTCTCCCAATCTAGGGCTGAGGGTGTGGCCAAGGTGTTGAATGCTTACCA
GGTGTGTGTGAAGCCCTGGCTCAACCCTAGTGCCATAAAGAGGCCCATTT
AGCTAACCATGTTTGCTTACTTAATATTTTAATTAAAGCACTCCTATGGA
AATGTGAAAATTCTAAAATTTAAACTGTAGTTCATTATTTTTGATAGATT
TAAAAACTAGTGTCAGGAATGTTCTGTCCAAGGATAGCTGGTATTCTTGG
TTGCCAGTTTTGCTTAAAAATATCAGATGCACAGCAAAGCATAATTCAAT
AAAACATGACACTTTGAATAATAGTTGCAAACTGTAATTATTCCTCTGAC
TTGGACCATTGAGCTGAATAAAATCTCATTTTTCCCCTTCTTGCCATTGT
ACCTGGACATTTCTCAGTTAGATAATTCATTGCTGGATGTGAACCAGACA
TTTACCAGACTCTGTGAAAGTTAAAGCCCAAAGAAAACTGCAGATCATTG
TGTGAAGCCCGTCATTTACAGAAAAGAGGGACCCGGCGGGTAATTATGTT
GTGGAGGTCCCCCTTTATTAAACCAGAAAAAATTCTGTACGCCGGTTTTT
TATTGATCTTTGGCCCA
|
quality values | Open.Hide.18 19 9 9 9 14 13 19 27 41 22 13 16 14 15 19 19 6 6 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 8 8 13 20 29 29 31 33 33 33 59 59 59 59 27 25 9 9 9 9
9 9 10 10 10 15 23 28 31 37 43 34 34 39 43 48 57 59 59 59 59 59 59 59 43 43 48 48 42 47 57 68 57 57 57 48 48 47 43 54 54 54 54 48 57 57 57 47 47 47
48 46 48 47 43 47 44 57 41 41 44 42 37 48 46 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 47 50 44 57 57 57 57 57 57 57 50 50 47 52 52
57 57 57 50 50 36 36 35 42 43 52 52 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 54 54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 59 52 57 52 52 52 52 59
59 52 52 52 52 59 59 57 43 43 35 35 35 47 47 57 57 57 57 50 57 43 47 47 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 44 29 32 30 36 39 37 37 37 32 44 43 48 48 57
57 48 48 47 47 59 48 57 54 48 48 48 48 46 47 47 47 43 59 47 54 57 54 59 59 59 43 43 48 59 57 57 59 59 59 50 53 47 47 42 42 59 59 59 57 48 48 48 48 41
41 39 34 28 16 12 9 9 9 11 9 9 9 9 15 15 23 27 41 41 41 43 43 39 39 39 59 43 48 48 48 48 50 50 48 48 50 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 43 43
43 43 43 48 48 57 54 57 57 59 43 43 43 46 46 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 41 42 39 47 42 42 54 48 48 47 50 43 43 43 44
57 57 57 57 57 54 50 50 44 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 44 44 33 43 43 57 57 57 57 38 44 27 23 18 38 38 59 59 52 52 52 38 38 14 14 14 27 24 43 43 43
27 24 13 12 17 32 32 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 57 57 57 59 54 54 54 48 59 59 59 57 57 57 54 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57
57 68 68 57 54 42 43 30 30 30 42 42 59 57 57 57 59 57 57 57 48 48 48 57 48 59 57 48 48 48 48 48 39 39 32 32 39 28 30 14 12 12 23 23 30 33 46 41 43 43
43 43 43 43 48 48 48 47 43 43 36 36 43 43 41 41 41 41 34 32 23 20 22 34 28 24 24 33 24 27 26 36 37 37 27 25 30 32 26 30 26 28 28 28 28 35 34 34 43 43
39 43 43 43 43 46 57 47 48 48 48 48 48 48 34 27 22 11 11 12 23 24 35 37 37 39 31 31 38 37 33 33 30 25 17 17 12 12 13 14 18 25 25 37 37 28 34 34 24 26
12 12 10 10 10 12 15 17 36 37 39 33 36 36 37 32 29 29 39 37 22 22 19 24 25 25 24 21 12 12 11 12 12 18 20 12 10 8 8 8 10 11 20 18 25 15 10 10 13 16
19 23 18 16 15 15 12 10 10 10 10 17 21 34 31 37 30 20 17 20 13 10 10 15 12 12 12 9 9 17 15 12 12 15 16 16 21 24 16 18 12 12 | Open.Hide.26 26 26 30 39 39 39 39 39 39 39 44 59 39 23 23 9 9 9 9 13 9 9 9 17 17 16 23 19 22 32 31 21 12 12 12 26 21 44 44 50 41 27 21 9 13 10 10 9 11
11 9 9 18 21 33 33 33 43 43 36 36 36 50 36 38 36 42 37 37 50 50 53 53 53 53 57 57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 44 43 35 35 35 35 35 26 30 28 43 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 57
59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 54 54 54 54 54 48 48 54 54 46 57 46 46 46 46 59 59 48 48 48 48 43 43 48 57 57 48 53 59 59 59 59 47 39 37
37 39 26 26 28 22 22 30 34 37 37 30 37 37 43 39 37 36 41 39 39 41 40 40 41 47 41 41 41 59 59 59 44 41 41 43 43 47 43 41 29 29 23 20 20 32 32 43 25 25
25 19 19 25 27 27 30 30 30 37 41 47 39 30 29 17 17 22 28 15 13 11 12 12 16 15 16 19 19 15 24 14 17 17 21 21 24 24 17 17 17 26 19 16 16 12 9 8 8 8
8 13 22 30 14 14 11 11 9 12 12 28 24 17 15 10 11 10 12 12 20 26 25 25 32 30 18 14 9 9 9 9 9 15 21 19 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12
13 10 10 8 8 8 10 12 15 11 10 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 10 15 10 9 7 7 9 9 9 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8
8 10 9 8 9 8 8 8 8 11 12 13 8 8 8 8 8 14 10 8 9 9 8 8 8 10 8 9 18 16 15 12 9 9 9 6 6 6 6 6 6 10 9 10 10 10 15 22 32 18
13 9 9 9 9 10 10 11 10 11 8 8 8 8 8 8 8 |