BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-420A07.T7 (MSMg01no420_a07.b1) | MSMg01-420A07.TJ (MSMg01no420_a07.g1) |
ACC | AG514983 | AG514984 |
length | 756 | 727 |
length of high quality (start - end) | 244 (73 - 316) | 584 (66 - 649) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no420_a07.b1 PHD_FILE: MSMg01no420_a07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:39:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no420_a07.g1 PHD_FILE: MSMg01no420_a07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:39:43 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTGCGGCCGCTAAACGACNCACATATTTCGTACCCGGCGGAATTCNTTGN
NCAGTTTCGAAAACCATTTTTNAATGGGGTTATTTGATTTTCTGAAGATG
GAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAATGG
CTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATT
CCAACTCAATTCTTCAACGAATTGGAAGGAGCAATTTGCAAATTTGTCTG
GAATAACAAAAAACCTAGGATAGCAAAAAGTCTTCTCAAGGATAAAAGAA
CTTCTGGCGGAATCATTTTTCTTTACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATT
GTGATAAAAACTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGAAAAGTAGACCAATG
GAATAGAATTGAAGACCCGGAAATGAACCCACACACCTATGGTCACTTGA
TCTTCGACAAGGGAGCTAAAACCATCCAGTGGAAGAAAGACAGCATTTTC
AACAATTGGTGCTGGCACAACTGGTTGTTATCGTGTAGAAGAATGGGAAT
CGATCCATACTTATCTCCTTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGG
AACTTCACATAAAACCAGAGACACTGAAACTTATAGAGGAAGAAGTGGGG
AAAAGCCTTGAAGATATGGGCACAGGGGAAAAATTCCCTGAACAGAACAG
CAATGGCCTTGTGCTGTAAGATCGAGAATTGACAAATGGGACCCTAATGA
AACTCC
| TGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXTTTCGGAAAATCTCAGCCATGCAGACTGGGGTCGGAGTACCTTTTGG
GCTACCAATCTATTTAACATCATGAAAACAGAAGAGAAAGGAGTTTATTA
TGTGTAGGATGTAATGACTCCCAGTCCTTCCCCTAACACATTCTCCCCAA
ACATATGATGAAAAATCCCCTTTTTCTTAGCAAGAAACCTTTTTAAAAAA
TCATTTTCAATGGTTTATTTATTTTTATTTTATGCAGATTGATGTTCTAC
TTTTTCCCATTATATTTTTTATTCATTCATTTTGGATTTCAAATGTTGCC
CCCTCCCAGTCCCCCCCTCACAGAGTTCCTCTTTCTCCTCTTCTCATCTG
AAGAGTATCTTCCCCCTCTCACCTTGGCACTTCAAGACTCTGCAGGGTTG
AAGTCTCTATGCACATCTCCCACTGAGGCCAGACAAGGAAGTCCAGTTGG
GGAATGGGTTCCACAGATAGGCAACAGCTTTAGGGATAGTTCCAGTTGTT
GAGCTCCAGTTTTGGGGGGACTCACATGGATACTGACCTGCACATCTGCT
ACACATGTGCTGGATGCTTTGCCCCAACCTGTGTATGCTCTTTGGTTGGT
GGTTCAGTCTCTGAGAGGCCCCAAGGGTTCAGGTTAATTGCCTCTGTTGG
TCTTCCTGTGAAGTTCCTATTCCCTTC
|
quality values | Open.Hide.31 37 37 37 37 37 31 31 30 22 19 8 8 8 21 21 21 3 0 3 13 19 17 12 10 6 7 7 6 6 6 7 8 10 11 11 9 11 9 21 21 29 21 21 3 0 3 29 3 0
0 3 6 6 6 6 6 9 9 9 9 11 11 12 12 12 12 11 11 12 3 0 3 25 25 39 41 42 50 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 47 53 53 53 53
53 68 68 51 51 42 42 39 31 33 25 24 24 25 43 25 25 24 28 27 36 48 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 59 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 11 11 11 27 27
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 42 42 42 35
35 35 42 44 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 48 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 57 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 50 34 32 22 13 8 8 8 7 7 6 6 6 6 12 12 17 29 30 59 59 59 59 59 50 50 53 53 53 57 57 48 48 48 53 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 47 46 48 48 48 48 46 47 59 57 57 48 59 43 43 43 44 44 47 57 57 68 68 68 68 68 59 59 68 27 27 9 9 9 24 27 59 57 46 46 46 46 57 59 59 59
68 68 54 54 54 57 57 57 57 68 57 59 57 48 19 19 8 8 8 8 19 27 59 59 59 59 48 47 47 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 27 27 9 9 9 23 25 39 47 47 46
46 48 43 39 36 36 39 37 37 35 36 36 39 59 39 41 47 50 50 48 59 48 48 46 40 41 39 37 36 39 35 41 44 59 59 59 59 41 41 48 48 48 48 57 59 57 57 53 53 48
48 48 57 57 57 50 43 43 42 43 43 47 57 57 57 39 39 34 34 34 43 31 39 39 39 39 43 43 48 57 48 48 48 48 41 41 35 33 31 32 26 22 22 28 26 29 43 43 41 41
41 43 41 41 34 37 41 43 47 47 47 47 41 41 41 39 32 31 37 32 33 33 37 37 37 37 30 25 17 23 19 22 20 20 13 13 12 13 12 21 41 27 27 28 37 30 25 25 28 31
30 23 24 18 18 22 22 30 37 23 17 9 9 9 12 11 22 28 34 33 24 32 32 36 37 24 22 22 25 24 22 27 24 24 22 22 11 8 8 10 8 6 6 8 10 10 9 11 21 17
17 17 22 22 25 25 22 27 25 21 16 12 11 10 10 10 12 15 14 13 11 11 12 17 20 27 19 17 17 18 17 20 14 14 14 19 14 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 12 9 9
16 21 22 21 16 11 11 10 14 11 9 9 9 10 16 12 12 16 12 12 12 19 12 12 11 6 6 6 6 6 11 16 21 17 11 9 9 9 10 10 12 9 9 8 10 8 8 8 10 12
11 10 19 19 15 15 | Open.Hide. 6 8 15 6 6 6 8 19 21 47 42 42 46 41 41 39 41 39 39 41 41 25 25 9 9 6 7 7 6 6 6 6 8 11 11 15 12 12 25 21 26 14 14 17 26 26 19 15 11 17
8 7 7 7 8 8 6 6 6 6 8 9 10 12 14 17 22 27 32 44 44 53 53 53 53 50 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 50 50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 48 48 47 31 31 18 36 36 44 42 39 39 35 42 42 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 43 43 43 48 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59 44 36 27 27 23 27 27
32 44 44 57 57 57 57 57 57 54 57 57 48 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 50 50 42 34 23 11 10 8 8 8 11 13 26 30 23 23 18 27 27 47 47 48 48 53 53 57 59 59 57 57 57 57 53 53 53 53 53 48 59 48 48 48 59 59 59
57 57 57 54 48 48 46 46 48 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 59 57 57 48 57 57 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 52
52 52 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 44 57 57 59 59 59 59 57 48 47 47 47 42 42 47 47 48 57 44 42 35 35 35 39 44 57
57 57 57 57 57 59 44 44 43 46 44 44 41 43 41 43 43 54 54 54 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 54 48 48 42 42 48 43 48 48 48 48 48 59 59 57 48 48 39
39 35 35 39 39 47 47 39 35 35 31 31 31 35 37 47 47 59 59 37 35 31 32 39 32 29 29 29 29 37 41 37 39 32 30 39 39 46 46 41 43 59 39 31 26 31 20 21 12 13
13 16 20 18 12 10 10 10 18 17 27 29 30 19 25 25 34 28 27 24 29 28 28 27 27 29 31 32 32 37 30 22 17 17 16 18 24 31 31 36 31 32 43 34 34 20 20 24 20 13
10 10 11 15 16 19 24 24 30 32 35 31 19 15 10 8 8 10 13 13 30 30 28 19 16 13 13 |