| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-482P03.T7 (MSMg01no482_p03.b1) | MSMg01-482P03.TJ (MSMg01no482_p03.g1) |
|---|
| ACC | AG562990 | AG562991 |
|---|
| length | 748 | 1,275 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 242 (72 - 313) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_p03.b1 PHD_FILE: MSMg01no482_p03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:03:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_p03.g1 PHD_FILE: MSMg01no482_p03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:03:58 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTCCACACTGAGCCGGCGGA
ATCTGAGATGCCTACACCATGGGGACAGGNCTTGTTCCTAAAACATCTGG
TAGAAGGGATCTTAAGTCATGATTTATAAATGCATGTCCACAGCCATTCT
GGAAGATGAGTCAAGACGACCACAGGTAAAAACTAGCGTGGTCTGTAAAG
CCAGCCCTGAAAGACCTTGTTCAAAGTCAGCCAGACAGAAGCAGGATTTA
TCCTCTACTAGAGTGATTTCAGGTTACAAGGCTTTCATACTTGACCCTGT
TGGCTCTACAGTATTTATTCTTTATGGACAGCAATTTTGCAGGCATAATG
CAGATCTGGTCTGGGAGAAAGACTGGCTTGGTGAAGATGCAGGGTACCAT
GCCAGACACGTACCACCTTAAAAGCGCTGTCAGTAGAGTGGTAGCCCCCG
CACTCACTTAAGGTGCATGCCTGAGAAGAGAGCCTACATTTAGCTAGCCA
TCACCCACTTAGGGTTGTCACCTGTACGATTTACCCCTCATCCTCCCTGC
CCTGCCACAGCTTGCCCTGGCCTTCTGGAACCCAGGAAGTTCAGTTTTGA
GGAGTGACAAGCTCCTGTTGCATTTGAGTGATGTCTACTCAAAGCTTGGC
AAGAGCGTCATAGCAGCCAGACATGTCCTCAGCGTTGGCTGTTGTCAGCG
AAGTCCATGCTGCTGGTCCCACCATGGGCATATCTAGCGACCTCTCCG
| NCCACCACAACATAAACAAGATAATAAGAACGGCACCCNCCCCACACCCA
AGTGCAATCACAGAAGACGGTGNANANNCACNNCNNAACGTTTTCCCGCA
AACAAAGAGCGNCGCAAGGAAAAANCAGCCCGAANACAAAACAAACGCGC
CAACACAGACACACAGTATACTCTTCTTCATCAAACCAACCACATAGTAA
CGAGCATACTAAACACACATATATCATAATCTAAAATATCACCACTATAA
ACGACGGGGCGCCCCAACAATTTATAAAGCCAACATCNCCCGATACTCAC
AACACTACCCTTCGAACCATCACATACTCACCCACCACATACCACATATT
AACCCCCAAAACACTTAACAAAAACACCAACCTACCGCGAGTATAACCAC
CAACAACCATAACACAACCACAACAGTCGCTAAACCAATTAAATAATAAA
AGCAATATTGGCCAGACCCACAACATCCACCGNCGACACACCACCACACT
ACATACACCNCCACCAAACCACCCCACCACGGAACCAACACAAAACAACA
CTCGACTACCCTTATTACATTCTTTAATCTAATACATAACAAGATACCAG
AGGCGACCCACACCCACAGCACCCCACCNAACACACGACGCAGAGACCCA
CCACGACACACCGCACCCACACCACATATACCCACATAATATATATAACA
TTACTCCACACCACACAGTCACAACTAACTCTACCTCTCATAACTAATAA
ATACACCCCATCTAATCTACCCCGCACCATAAATATACACCACTCTAAGA
TATCCTAACCCACCATCACCTTTCACTCATATAACCCGCCCACAATACAA
CCAACAACTAACCAACCTCTAAACCACTATTACTACGAATATACAATATC
TCTCACGCACCCCACCATCTCATCATAAATATTAATCATACAACATAAAT
ACTCACTACTCTACTAATAAAACTCACAAACAATCACACCACACGCAACT
TAAACCATACACCAATATAATACCACCAACCATAACACCTCTTAAGACAC
ACAAAATACTATAAACACCTAACACTCACAACATACATACACTTCTTATC
TACCCGTACTCATACAAGTATTCAATCTATATCGAAAGCCTCCCTATGCA
ATCACTACTAACATCAATACACACATGAATCGCATGATCAATATGTAAAC
ATTTACCCTCACACTAACTACACCCAGCCGCTGTATAATCACGTGCGTAT
CGACACGTACTAATCCTAATATCAN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 9 11 12 15 21 27 26 36 36 24 21 14 22 21 15 13 10 14 14 14 18 21 13 10 13 9 6 6 7 7 9 9 10 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 11 27 29 25
20 20 13 10 15 11 9 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 10 12 12 12 15 28 32 39 23 23 3 0 3 27 27 59 47 37 37 32 33 32 41 36 36 28 26 28 28 39 39 41
41 43 43 43 47 47 33 28 28 16 16 10 10 10 10 10 10 10 10 15 19 33 33 33 33 43 39 43 43 48 47 47 47 47 47 47 48 48 42 42 42 42 42 54 54 54 54 48 50 50
48 48 48 42 21 23 18 18 12 21 28 36 30 31 23 24 24 30 28 28 24 24 21 28 32 44 59 59 57 57 57 57 57 57 32 32 20 41 41 43 42 48 48 57 48 48 48 57 59 57
44 43 43 37 43 43 50 57 57 52 54 57 57 57 52 52 50 57 43 37 37 44 44 44 57 59 43 35 33 28 28 18 17 17 32 32 43 42 42 44 41 25 24 12 12 22 24 43 28 30
28 36 36 48 59 59 68 57 57 40 40 28 37 37 47 48 57 57 57 57 57 47 47 43 47 43 43 43 43 43 43 43 48 42 47 48 48 48 57 43 57 43 43 43 43 43 39 39 39 33
30 33 37 34 47 35 28 28 17 10 8 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 8 11 11 22 22 39 39 37 31 28 28 23 23 23 32 34 36 29 22 16 16 21 32 47 48 59 48 37 30
23 14 12 23 12 12 11 12 12 12 15 15 24 18 25 28 28 30 39 39 39 39 39 39 37 30 28 28 32 28 28 23 23 32 28 30 43 43 34 23 14 14 14 18 18 34 32 28 30 39
39 37 43 33 28 24 19 19 9 10 12 10 8 8 8 8 8 8 15 14 14 14 15 18 19 24 28 28 30 28 24 19 17 17 17 30 30 46 41 39 37 30 30 30 25 28 31 39 39 39
39 40 37 37 29 29 16 19 18 25 21 18 18 22 22 30 25 24 12 12 12 20 23 26 28 28 19 19 23 23 23 32 25 34 25 25 12 12 12 22 19 15 8 8 8 15 20 36 33 37
25 18 14 11 9 9 12 19 18 22 13 13 13 24 24 18 14 14 19 22 22 26 30 41 37 39 39 39 41 43 39 47 43 48 37 37 30 30 30 30 30 29 29 27 28 30 27 22 15 11
11 13 13 21 22 12 15 15 15 15 21 34 30 30 18 18 24 32 31 30 25 28 36 33 35 35 35 33 27 24 24 17 24 14 17 19 30 28 31 22 15 14 9 9 20 22 30 22 20 12
12 12 19 30 31 22 24 20 20 20 20 32 43 43 43 39 36 36 33 30 25 30 25 25 32 37 30 31 31 28 23 23 18 18 11 12 11 10 10 10 15 11 21 30 15 11 11 8 8 8
8 9 14 18 13 13 13 28 22 13 8 6 6 6 6 10 12 12 11 11 13 17 18 20 12 10 10 10 10 11 11 11 11 12 11 19 14 15 21 28 28 28 28 23 20 11 10 10 10 13
17 10 10 10 10 13 21 25 25 23 23 15 15 15 11 9 13 7 7 7 10 10 14 12 22 14 11 11 11 16 16 33 30 24 24 16 16 10 13 9 8 8 10 12 11 11 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 6 8 6 8 6 6 6 6 7 9 9 8 8 8 6 6 8 8 9 7 7 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 11 11 9 7 7 8 10 9 9 6
6 6 6 6 6 8 7 7 7 8 8 8 8 9 6 6 6 6 7 6 9 3 0 3 0 3 0 0 3 8 3 0 0 3 0 0 3 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 9 9 8
10 6 6 6 7 6 6 6 6 7 3 0 3 6 8 8 6 6 6 8 14 11 11 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 12 12 19 15 11 7 7 6 6 6 6 6 8 8
8 8 9 8 10 8 8 8 8 17 8 6 6 7 7 7 6 6 6 6 9 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 11 9 9 9 9 9 12 9 6 6 6 6 8 8 8
7 7 7 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 6 7 7 7 8 8 8 10 8 8 8 8 11 13 12 8 12 7 7 8 8 8 9 9 9 9 9 8 10 10 10 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 12 12 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 9 12 3 0 3 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 6 6 6 6 8 10 12 16 10 12 10 10 8 6 6 6 6 6 11 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 9 9 7 10 6 8 8
7 7 9 9 7 13 9 9 9 13 11 12 9 7 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 17 9 8 8 12 8 8 8 6 6 7 13 15 17 15 12 9 10 10
10 10 10 11 10 10 9 10 8 8 8 8 10 10 8 8 7 8 11 12 6 6 10 6 6 8 6 6 6 6 8 9 8 13 10 9 8 10 8 8 8 8 8 7 9 7 7 7 7 8
6 6 6 6 10 10 15 12 13 10 8 8 8 8 9 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 9 3 0 3 7 8 10 15 8 8 8 12 10 10 8 6 8 7 6 8
8 8 8 8 8 8 6 7 3 0 3 8 8 10 6 6 8 6 6 6 7 7 17 25 29 15 15 9 10 6 6 6 6 7 7 12 12 9 9 9 9 9 10 18 15 11 8 8 8 8
10 10 6 6 6 7 8 6 9 9 9 9 9 8 8 8 6 8 7 7 6 8 10 10 8 8 8 9 12 8 9 8 8 8 7 11 8 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 10 6 6 8 8 6 6 6 6 10 10 11 13 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 13 10 10 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 6 7 7 9 9
9 13 13 8 6 6 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 13 6 8 9 16 12 9 9 9 8 12 8 8 6 7 7 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 10 10 9 9 9
8 9 12 12 10 13 12 15 10 8 8 8 8 8 7 9 9 7 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 11 10 12 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8
8 9 14 11 9 8 9 9 7 7 6 6 6 6 6 6 6 7 8 9 8 9 8 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 11 7 6 8 6 6 6 6 6 6
6 6 6 8 6 6 8 8 8 10 13 15 11 6 7 8 6 8 10 8 10 8 8 10 11 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 9 14 10 10 7 7 6 6 8 6 6 6
6 8 12 8 9 8 8 10 10 10 9 9 8 12 7 6 6 6 8 8 8 10 8 10 9 6 6 7 8 13 9 8 8 11 11 8 8 8 10 10 13 13 8 6 9 9 7 7 8 8
8 6 7 8 11 8 6 7 7 8 7 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 19 15 12 14 9 6 6 6 6
8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 6 6 10 10 10 10 8 8 7 6 12 8 8
8 8 8 8 8 15 8 8 8 13 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 10 10 13 13 8 8 8 9 8 8 9 9 10 9 9 9 9 8 11 10 6 6 6 6 9 10
8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 10 10 15 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 15 10 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 13 10
10 9 8 13 8 8 8 10 10 10 13 9 9 9 8 10 8 8 8 13 10 9 6 10 6 8 8 10 12 28 17 15 8 8 7 8 7 9 9 10 9 9 10 8 8 7 7 7 7 13
8 8 8 6 7 6 8 8 8 10 15 19 10 8 8 13 15 11 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 6 6 8 12 11 12 15 18 9 9 9 9 9 6 7
7 6 6 6 6 6 8 8 8 9 10 8 10 10 10 8 8 6 8 7 6 6 6 11 6 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 9 9 9 9 9 9
9 8 8 7 13 6 6 6 6 9 9 15 10 7 7 7 10 10 15 19 12 8 7 3 0 |
|---|
