BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-497F05.T7 (MSMg01no497_f05.b1) | MSMg01-497F05.TJ (MSMg01no497_f05.g1) |
ACC | AG573921 | AG573922 |
length | 753 | 755 |
length of high quality (start - end) | 629 (51 - 679) | 556 (79 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_f05.b1 PHD_FILE: MSMg01no497_f05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_f05.g1 PHD_FILE: MSMg01no497_f05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCTCTTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCCTGATCTTTCCAAAACTTTTATCATGAATGGGTGTTGGAT
CTTGTCAAATGCTTTTTCTGCATCTAACGAGATGATCATGTGGTTTTTGT
CTTTGAGTTTGTTTATATAATGGATTACATTGATGGATTTTCGTATATTA
AACCATCCCTGCATCCCTGGAATAAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGAT
TGCTTTAATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTTTATTGAGGATTT
TTGCATCGATATTCATAAGAGAAATTGGTCTGAAGTTCTCTATCTTTGTT
GGGTCTTTCTGTGGTTTAGGTATCAGAGTAATAGTGGCTTCATAAAATGA
GTTGGATAGAGTACCTTCTACTTCTATTTTGTGAAATAGTTTGTGCAGAA
CTGGAATTAGATCTTCTTTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACCCA
TCTGGTCCTGGGCTTTTTTTGGTTGGGAGACTATTAATAACTGCTTCTAT
TTCTTTAGGTGATATGGGACTGTTTAGATGATCAACTTGATCCTGATTCA
ACTTTGGTACCTGGTATCTGTCCAGAAATTTGTCCATTTCGTCCAGGTTT
TCCAGTTTTGTTGAGTATAGCCTTTTGTAGAAGGATCTGATGGTGTTTTG
GATTTCTTCAGGATCTGTTGTTATGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGT
TAA
| NNNTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTGAGGGAAGTGGGATTCATT
GAAGAGACTATACTAGTAACGCAGGCTGGTCTGGAACTCACACTTCTATG
TTGACTTTCCAAGTGATGGGATTCCAGTTGTATGGCACCATGCCCAGGTG
GGGCTTCCTCTTGGGCACAGAATCATCCTTTTCTGCAATAGCGCTAGCAC
GTGCACGCCATCCAAAGTAATAAACAAATTCAAGCCAATGTTACTTGTGT
GTTCCAGTTTACTGTTGATGATATGTAATAAAGGAAATCCAAAGTCAGGA
GTGAATGAAACAACATAAGAACTAACTGTGCCCATCTTGGTCTCAGTCAC
AAAATCCTGAGTAATGACGTGTATCCTGTTAAGGTACTGTCATCTCAAAA
GATGACATAATAATCAAATACAAACCAGAGGAAGTCAGATTATAGAAAGA
TCCTCAAGAAAGAGAGAGAGAGCTACCCTTAGGAAGATCATGTCTAGAGA
GAAGATCCACAGTGGAAGGGATGTCAGGCAGGGAGCTCTGCACCACACAC
ACTGCTAAGCCATCTGACTGTGTGCTGATTAGAGAGAAGATCCACAGTGG
AAGGGATGTCAGGCAGGGAGCTCTGCACTACACACACTGCTAAGCCATCT
GACTGTGTGCTGATTAGACTTTTGTGTTTGATTACTGTTTTAAAACAGAA
GCTGG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 8 8 8 10 15 27 27 37 37 37 18 18 15 15 14 17 25 40 37 37 47 41 30 30 31 30 27 19 23 9 9 9 11 11 15 23 29 28 28 28 28 26
28 43 47 43 36 36 35 37 39 34 48 48 32 35 23 23 23 34 15 21 15 15 24 42 47 54 54 54 54 54 50 47 47 47 47 48 53 48 48 48 50 57 68 68 68 68 68 57 57 46
46 46 57 57 44 41 41 57 44 57 48 54 54 59 59 59 48 44 37 37 37 37 35 43 43 59 44 47 47 50 50 50 50 50 50 44 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 50 50 50 37
37 52 57 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 43 43 35 35 44 44 68 68 68 68 57
59 43 41 39 39 43 43 43 52 43 47 43 43 39 43 43 52 52 62 62 62 68 68 68 62 62 43 35 35 43 43 52 52 62 62 62 35 35 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 52 43 62 62 62 44 44 43 26 26 44 44 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
62 62 62 43 43 39 31 31 44 44 44 44 43 39 39 39 39 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 43 59 59 68 59 59 43 43 43 52 52 62 52 52 52 62 62 68 68 68
68 62 62 43 43 62 62 52 43 43 62 44 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 43 43 26 44 44 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 44 44 43 26 26 44 44 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 43 62 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 35 44 44 57
57 57 59 57 68 68 68 68 68 38 38 36 32 43 43 41 41 59 59 59 59 59 59 59 35 35 43 59 44 68 68 59 59 38 38 35 43 43 43 43 52 52 52 57 50 43 37 37 43 43
43 52 43 44 44 35 35 43 43 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 47 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 47 47 43 39 39 59 59
59 42 41 41 32 34 47 47 47 48 57 54 54 54 59 59 59 59 54 57 57 48 48 43 46 43 43 43 42 32 42 33 30 30 42 43 59 57 43 43 37 37 36 43 43 39 31 28 24 24
28 34 43 47 46 41 39 39 39 31 31 39 32 31 34 28 32 32 37 37 32 28 31 36 36 29 30 32 29 27 34 37 35 35 39 39 37 34 32 23 23 28 28 37 34 34 32 29 21 28
22 28 18 22 18 24 27 30 30 25 22 22 34 28 25 28 28 32 25 30 22 22 22 28 37 37 24 22 12 12 12 11 11 11 14 14 18 18 28 13 12 12 12 12 11 12 12 30 30 25
25 20 18 18 28 28 19 18 18 15 16 22 15 15 12 22 11 11 11 11 11 11 13 18 12 18 12 21 13 20 20 22 22 29 37 30 30 25 25 25 30 21 17 11 11 10 11 11 15 12
12 16 16 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 8 10 10 10 10 15 16 9 9 11 11 11 37 37 39 37 37 37 39 50 50 47 47 25 23 17 9 9 9 10 9 9 3 0 3 13 15 18 25 18 20 34
34 33 36 36 33 44 39 59 47 27 27 9 15 9 9 9 9 10 9 15 13 10 8 8 22 22 30 31 46 40 33 33 36 36 38 53 57 57 57 57 53 42 47 37 37 34 37 37 42 42
57 68 68 68 47 47 39 48 48 57 57 54 44 44 44 44 44 44 36 43 41 40 31 43 43 59 59 59 59 43 43 47 47 54 57 57 57 44 41 41 46 44 47 47 48 48 48 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 52 52 59 59 54 52 52 52 57 57 57 44 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 57
59 59 52 43 44 43 43 43 43 41 41 44 43 57 57 57 52 57 45 57 43 43 43 39 39 43 43 57 57 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 62 62 62 52 62
62 62 52 52 52 43 43 39 43 43 52 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 35 35 35 43 43 62 62 62 68 68 68 68 62 62 52 52 45 52 62 62 62 43 43 39 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 52 52 52 52 52 52 43 57 43 59 42 42 43 43 23 44 33 43 43 52
52 57 57 59 52 52 52 43 44 50 57 57 59 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 57 52 52 59 59 59 57 57 57 52 50 47 50 39 37 43 42 43 43 35 33 44 44 57
57 57 57 57 48 48 48 59 59 68 68 59 44 35 33 33 44 44 57 46 43 43 44 42 32 32 20 41 41 57 57 68 44 48 32 36 30 44 44 59 59 57 57 57 59 68 59 57 44 43
43 39 34 32 23 23 37 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 47 37 39 40 39 23 27 23 31 31 43 30 34 28 32 28 35 47 59 43 43 43 59 59 57 57 57
57 57 32 30 15 28 26 25 20 31 28 37 43 43 39 39 35 31 31 31 35 39 37 26 21 14 21 21 37 39 39 41 41 39 34 34 28 32 32 34 34 43 40 43 43 48 57 48 48 48
48 48 46 46 46 39 39 28 28 20 24 32 35 37 39 41 36 33 33 33 33 39 47 36 39 34 37 30 16 16 20 22 12 24 21 28 28 13 11 11 16 11 15 18 24 28 28 39 32 32
36 22 22 19 28 23 32 28 28 26 25 24 25 32 30 26 19 25 24 23 23 15 24 25 30 30 41 41 43 43 43 41 40 40 40 40 39 41 36 36 25 27 13 13 13 18 25 28 31 28
34 23 18 18 13 14 17 20 20 32 29 34 28 14 14 11 11 11 17 12 20 23 23 10 13 13 18 18 24 28 17 17 17 26 21 21 10 10 9 16 12 11 17 26 20 21 11 11 11 11
11 11 19 21 21 |