BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-022D06
Chromosome19 (Build37)
Map Location 29,357,352 - 29,495,848
singlet/doubletdoublet
Overlap geneJak2, Insl6, Rln1, 5033414D02Rik, Cd274, Pdcd1lg2
Upstream geneGlis3, EG434460, EG627788, Slc1a1, LOC545262, 4430402I18Rik, Ppapdc2, LOC100042006, EG226086, Cdc37l1, LOC672214, Ak3, Rcl1, LOC433238
Downstream geneC030046E11Rik, D19Wsu12e, Mlana, 9930021J03Rik, Ranbp6, Il33, Trpd52l3, Uhrf2, Gldc, EG625917, Mbl2, LOC100042088
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-022D06.bB6Ng01-022D06.g
ACCDH854487DH854488
length1,076826
definitionDH854487|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022D06, 5' end.DH854488|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022D06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,357,352 - 29,358,428)(29,495,023 - 29,495,848)
sequence
gaattctttaagtaatttaaagttaacattgtttcctttactctttaact
tctgaaatttaagtacaatcataagactaattgattttgataatataatt
aattctattatatttgcattggaacactgaaactgttcacatgtatcatt
cgtatatgatttcagcaatttagtattatattaatttttaaaatagttaa
taattctctacttttctgacaatcattctttttaatattaactgggttaa
gttctgtatcacactgtcatactttaatgctctcactttttttagtatgt
ttttttttaagatttatttattttatatatgtaagtacactgtcactcta
ttcagacacaccagaagagggcatctgatcccattacagatggttgtgag
ccaccatgtggttgctgggaattgaactcaggacctctggaagaacaagc
agccagtgctcttaatcgctgagccctctctccagcccctagtgctctca
ttttgaagtcaatacaagaaacataaacttcgtcttcaggttcaatattt
aggagaagtaatctcatccgatgcctatacattgttgtcagtgtcccttt
agagaactttaagtggctatcagcaccttcttaagcttcgtttgatgtca
ctgtgccttcctaaatgttcttgattacaggacgtacagttatattgtga
tttccctgatattattgatgtcagtattaagcaagcaaaccaggaatgct
caaatgaaagtagaattgtaactgtccataaacaagatggtaaagttttg
gtaagtttgtattatacattagtaatgtttccattttagaaattttcaga
agtacaatagagtcttagtatcaaagttacttaagtattttgattatagc
cgtaagtatgctctaaagagtgccagcccagcaaaccctttattgtatgc
aatctgggaactagaggaaaggcaagaggatgcatctttctctgatgcgt
gagtcatcacttctctgatgtccactccgctggtgttcaaagtcccatgt
ttgccggttttcccatgggtatcaac
gaattcttccttatggctgactaatgttctatcatcattcatatatatat
atatatatgtatatgcatatatatgtatatatatgtatatgcatatatat
gtatatatacatatatgcatatatacatatgtatgtatatatattccatt
tatctatcagtgagcacctgggtcagcaacataacttgcttactataaat
ggtagagcaataagcatggatatatgaatatttggaagctgacgtagact
tcactgggtatacttggaggaggggaacagctggatcatatggtggtgcc
agttttagttgttttattaaggaatatccatgctgatttccatagtggct
gtactaatttacactcccatcagcagtgtgcaagggttaattttgcctgc
atctttgccaatatctgttgttttgatgtttccttgacgatagccatttt
gattgggtgggtgtctgtgttttatgagagctctcaggtctgccggggtc
aggaggtgtggtaggccctgctctaggggacaggaggtatgactggcagg
ccctgctctagctcagtgtggctccatctcctgtttcacttctgacctca
ggttttctgcatccacagagtgctcatgtttgaagccagctgggaagaca
cactgctgtcaacccttctgtcttgaggctttattagccagagtaagctg
cacgcctcaggcccggggaaagcagagccagtaagccggtggagggcttc
gctctggagccccggggactttgtctgcatttttagagaggacggtgctt
tggtatagagtagactgctttggaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_29357352_29358428
seq2: B6Ng01-022D06.b_46_1121

seq1  GAATTCTTTAAGTAATTTAAAGTTAACATTGTTTCCTTTACTCTTTAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAAGTAATTTAAAGTTAACATTGTTTCCTTTACTCTTTAACT  50

seq1  TCTGAAATTTAAGTACAATCATAAGACTAATTGATTTTGATAATATAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAATTTAAGTACAATCATAAGACTAATTGATTTTGATAATATAATT  100

seq1  AATTCTATTATATTTGCATTGGAACACTGAAACTGTTCACATGTATCATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTATTATATTTGCATTGGAACACTGAAACTGTTCACATGTATCATT  150

seq1  CGTATATGATTTCAGCAATTTAGTATTATATTAATTTTTAAAATAGTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTATATGATTTCAGCAATTTAGTATTATATTAATTTTTAAAATAGTTAA  200

seq1  TAATTCTCTACTTTTCTGACAATCATTCTTTTTAATATTAACTGGGTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCTCTACTTTTCTGACAATCATTCTTTTTAATATTAACTGGGTTAA  250

seq1  GTTCTGTATCACACTGTCATACTTTAATGCTCTCACTTTTTTTAGTATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGTATCACACTGTCATACTTTAATGCTCTCACTTTTTTTAGTATGT  300

seq1  TTTTTTTTAAGATTTATTTATTTTATATATGTAAGTACACTGTCACTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTAAGATTTATTTATTTTATATATGTAAGTACACTGTCACTCTA  350

seq1  TTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCTGATCCCATTACAGATGGTTGTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCTGATCCCATTACAGATGGTTGTGAG  400

seq1  CCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAACAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAACAAGC  450

seq1  AGCCAGTGCTCTTAATCGCTGAGCCCTCTCTCCAGCCCCTAGTGCTCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTGCTCTTAATCGCTGAGCCCTCTCTCCAGCCCCTAGTGCTCTCA  500

seq1  TTTTGAAGTCAATACAAGAAACATAAACTTCGTCTTCAGGTTCAATATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAAGTCAATACAAGAAACATAAACTTCGTCTTCAGGTTCAATATTT  550

seq1  AGGAGAAGTAATCTCATCCGATGCCTATACATTGTTGTCAGTGTCCCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAGTAATCTCATCCGATGCCTATACATTGTTGTCAGTGTCCCTTT  600

seq1  AGAGAACTTTAAGTGGCTATCAGCACCTTCTTAAGCTTCGTTTGATGTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACTTTAAGTGGCTATCAGCACCTTCTTAAGCTTCGTTTGATGTCA  650

seq1  CTGTGCCTTCCTAAATGTTCTTGATTACAGGACGTACAGTTATATTGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCTTCCTAAATGTTCTTGATTACAGGACGTACAGTTATATTGTGA  700

seq1  TTTCCCTGATATTATTGATGTCAGTATTAAGCAAGCAAACCAGGAATGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTGATATTATTGATGTCAGTATTAAGCAAGCAAACCAGGAATGCT  750

seq1  CAAATGAAAGTAGAATTGTAACTGTCCATAAACAAGATGGTAAAGTTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAAAGTAGAATTGTAACTGTCCATAAACAAGATGGTAAAGTTTTG  800

seq1  GTAAGTTTGTATTATACATTAGTAATGTTTCCATTTTAGAAATTTTCAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTTTGTATTATACATTAGTAATGTTTCCATTTTAGAAATTTTCAGA  850

seq1  AGTACAATAGAGTCTTAGTATCAAAGTTACTTAAGTATTTTGATTATAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAATAGAGTCTTAGTATCAAAGTTACTTAAGTATTTTGATTATAGC  900

seq1  CGTAAGTATGCTCTAAAGAGTGCCAGCCCAGCAAACCCTTTATTGTATGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAAGTATGCTCTAAAGAGTGCCAGCCCAGCAAACCCTTTATTGTATGC  950

seq1  AATCTGGGAACTAGAGGAAAGGCAGGAGGATGCATCCTTCTCTGATGCGT  1000
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  AATCTGGGAACTAGAGGAAAGGCAAGAGGATGCATCTTTCTCTGATGCGT  1000

seq1  GAGTCATCACTTCTCTGATGTCCACTCCGCTGGTGTTCAGAGTCCCATGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAGTCATCACTTCTCTGATGTCCACTCCGCTGGTGTTCAAAGTCCCATGT  1050

seq1  TTGTCTGGTTTTCCCATGTGTATCAAC  1077
      ||| | |||||||||||| ||||||||
seq2  TTG-CCGGTTTTCCCATGGGTATCAAC  1076

seq1: chr19_29495023_29495848
seq2: B6Ng01-022D06.g_69_894 (reverse)

seq1  CTTCCAAAGCAGTCTACTCTCTAACCAAAGCACCGTCCTCTCTAAAAATG  50
      |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAAAGCAGTCTACTCTAT-ACCAAAGCACCGTCCTCTCTAAAAATG  49

seq1  CAGACAAAGTCCCCGGGGCTCCAGAGCGAAGCCCTCCACCGGCTTACTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAAAGTCCCCGGGGCTCCAGAGCGAAGCCCTCCACCGGCTTACTGG  99

seq1  CTCTGCTTT-CCCGGGCCTGAGGCGTGCAGCTTACTCTGGCTAATAAAGC  149
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTTTCCCCGGGCCTGAGGCGTGCAGCTTACTCTGGCTAATAAAGC  149

seq1  CTCAAGACAGAAGGGTTGACAGCAGTGTGTCTTCCCAGCTGGCTTCAAAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGACAGAAGGGTTGACAGCAGTGTGTCTTCCCAGCTGGCTTCAAAC  199

seq1  ATGAGCACTCTGTGGATGCAGAAAACCTGAGGTCAGAAGTGAAACAGGAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCACTCTGTGGATGCAGAAAACCTGAGGTCAGAAGTGAAACAGGAG  249

seq1  ATGGAGCCACACTGAGCTAGAGCAGGGCCTGCCAGTCATACCTCCTGTCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGCCACACTGAGCTAGAGCAGGGCCTGCCAGTCATACCTCCTGTCC  299

seq1  CCTAGAGCAGGGCCTACCACACCTCCTGACCCCGGCAGACCTGAGAGCTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAGCAGGGCCTACCACACCTCCTGACCCCGGCAGACCTGAGAGCTC  349

seq1  TCATAAAACACAGACACCCACCCAATCAAAATGGCTATCGTCAAGGAAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAAACACAGACACCCACCCAATCAAAATGGCTATCGTCAAGGAAAC  399

seq1  ATCAAAACAACAGATATTGGCAAAGATGCAGGCAAAATTAACCCTTGCAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAACAACAGATATTGGCAAAGATGCAGGCAAAATTAACCCTTGCAC  449

seq1  ACTGCTGATGGGAGTGTAAATTAGTACAGCCACTATGGAAATCAGCATGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTGATGGGAGTGTAAATTAGTACAGCCACTATGGAAATCAGCATGG  499

seq1  ATATTCCTTAATAAAACAACTAAAACTGGCACCACCATATGATCCAGCTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCTTAATAAAACAACTAAAACTGGCACCACCATATGATCCAGCTG  549

seq1  TTCCCCTCCTCCAAGTATACCCAGTGAAGTCTACGTCAGCTTCCAAATAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTCCTCCAAGTATACCCAGTGAAGTCTACGTCAGCTTCCAAATAT  599

seq1  TCATATATCCATGCTTATTGCTCTACCATTTATAGTAAGCAAGTTATGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATATCCATGCTTATTGCTCTACCATTTATAGTAAGCAAGTTATGTT  649

seq1  GCTGACCCAGGTGCTCACTGATAGATAAATGGAATATATATACATACATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACCCAGGTGCTCACTGATAGATAAATGGAATATATATACATACATA  699

seq1  TGTATATATGCATATATGTATATATACATATATATGCATATACATATATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATATGCATATATGTATATATACATATATATGCATATACATATATA  749

seq1  TACATATATATGCATATACATATATATATATATATATGAATGATGATAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATATATGCATATACATATATATATATATATATGAATGATGATAGA  799

seq1  ACATTAGTCAGCCATAAGGAAGAATTC  826
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAGTCAGCCATAAGGAAGAATTC  826