BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-045H07
Chromosome19 (Build37)
Map Location 15,303,045 - 15,440,564
singlet/doubletdoublet
Overlap genePomc-ps1
Upstream geneEG667433, Tle4, EG433225, EG635497
Downstream geneLOC667482, Psat1, LOC100041424, Cep78, LOC100042048, Gnaq, E030024N20Rik, LOC624438
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-045H07.bB6Ng01-045H07.g
ACCDH870907DH870908
length1,1011,052
definitionDH870907|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045H07, 5' end.DH870908|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045H07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,303,045 - 15,304,143)(15,439,506 - 15,440,564)
sequence
gaattctttgtttagctctgtaccccatttttaatagggttatttggttc
tctggagtttaaattcttgagttctttgtatatattgcatattagtcttc
tattgaatgtaggattggtaaagatcttttcctaatctgttggctctcat
ttgtcttattgacagtgtcctttgccttagagaagcttttcaattttatg
agatgccatttggctagtggatcttagagcctgagccattagtattctgt
tcaggcatagctttgcaaacagagtattgtcaaagctgacttttgacttt
tcataggactcatacacagaaacaagtaatatgccagaatatcccgtgta
tatataagaagcatagaggtaaaagctgcttgtgaaggttccacaatcct
aatgtgtttagtgtgaggcagaacactgtgataagacattagagcagtag
aggcagaccaggccacagagggctccatgtcacttgtaagagttgatatg
tagaagcttcccaaattcccagtaagctacatgctgaatgccttgcctga
agcttttgagaaatctggaacccctagaatttaggagtagttttcaacct
tatctaatgctgtgaccctttgatgcgatttctcatcttgtggtgacccc
caaccataaaactatttcattgctacttcataactgtaaattggctactg
ttttaaactgtaatataaatatctggtatgcaggtgactcccatgaatga
gtcatttgaccaccaaagggatcctgacacaggttgagaactactgaggt
aagacctaaagagacaaagtataggtcacagaggagatgggtttgggaac
tattaggacttcagcctagtcccctgtctctttactgtctgacaccagga
gatgaggagatctctttctgctcccacctggatgtactgtggtaacacag
gcccaaagcacagagcccagtgaccgttgattgggatctctaaacctcaa
aattaaacttttccacttaatcatttttttggcttgggtttttgggtctc
actatagctgactacctagttcaggaagaatggaaggactgaagtactac
c
gaattccacaggatgggttgtatagtaatgatcaatgtaaagaataaatc
ttgtcagattattgtagcttcttgctgtgatctagcagaaaactctatgc
cttaaaaaggataaagtggaatgaggttgctataaatttactataaattc
agtaaaactcttggttttaattcctataacttgatcatcagaaagtgttg
gcaaacctacccatctatggcagtaaagactgccttgaatcattaaactt
cgacttatttgtacactgagctatgtggattagaagttttagatataaac
acttgctgagtctagcttgagagctaagtaactctcaacattcagtattg
aatacaatactgaaatgtgtacttatagcctaaacataaaatagctgatg
tatatacaaaacagtggccaggactgttcctggagtcaccatagtgttgc
agttaaatgtcatcatttctatgtttgtgacacggggaaaattaggttat
aagaagagtttagaaatattctttatatttttatcatacaggctataagg
cttgaagtttataaaatgactgtatcatgtcagtgatccatctgacatat
ccaagatattcattcaccttggaagctctgtaaggtacaatactaattca
aggagatagaaaaacaaatgtaagatactatatataaataaatatatata
tataatatatatatatatatttcatatatacatatgtataaatcagtgac
ccagaattgttcctatctaagagaaatgcagggacaaaactggagcagaa
attgaaggaaaggccatccagtgactgccccaacttgggatccatcccat
gagcaggcactaatcctgacactattattgatgccatgttgtgcttgcag
acaggagcctcacatggttgtcctctgagagactctaccagcagctgacg
agacagacacagatcttccagccatcattggactgaggtagggtcttgcg
cacgccggactagcagcagtacaactctgcaacaggatccttctgccatg
tt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_15303045_15304143
seq2: B6Ng01-045H07.b_41_1141

seq1  GAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTATTTGGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTATTTGGTTC  50

seq1  TCTGGAGTTTAAATTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGCATATTAGTCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAGTTTAAATTCTTGAGTTCTTTGTATATATTGCATATTAGTCTTC  100

seq1  TATTGAATGTAGGATTGGTAAAGATCTTTTCCTAATCTGTTGGCTCTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAATGTAGGATTGGTAAAGATCTTTTCCTAATCTGTTGGCTCTCAT  150

seq1  TTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTAGAGAAGCTTTTCAATTTTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTAGAGAAGCTTTTCAATTTTATG  200

seq1  AGATGCCATTTGGCTAGTGGATCTTAGAGCCTGAGCCATTAGTATTCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCCATTTGGCTAGTGGATCTTAGAGCCTGAGCCATTAGTATTCTGT  250

seq1  TCAGGCATAGCTTTGCAAACAGAGTATTGTCAAAGCTGACTTTTGACTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCATAGCTTTGCAAACAGAGTATTGTCAAAGCTGACTTTTGACTTT  300

seq1  TCATAGGACTCATACACAGAAACAAGTAATATGCCAGAATATCCCGTGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGGACTCATACACAGAAACAAGTAATATGCCAGAATATCCCGTGTA  350

seq1  TATATAAGAAGCATAGAGGTAAAAGCTGCTTGTGAAGGTTCCACAATCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAAGAAGCATAGAGGTAAAAGCTGCTTGTGAAGGTTCCACAATCCT  400

seq1  AATGTGTTTAGTGTGAGGCAGAACACTGTGATAAGACATTAGAGCAGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTTTAGTGTGAGGCAGAACACTGTGATAAGACATTAGAGCAGTAG  450

seq1  AGGCAGACCAGGCCACAGAGGGCTCCATGTCACTTGTAAGAGTTGATATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGACCAGGCCACAGAGGGCTCCATGTCACTTGTAAGAGTTGATATG  500

seq1  TAGAAGCTTCCCAAATTCCCAGTAAGCTACATGCTGAATGCCTTGCCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGCTTCCCAAATTCCCAGTAAGCTACATGCTGAATGCCTTGCCTGA  550

seq1  AGCTTTTGAGAAATCTGGAACCCCTAGAATTTAGGAGTAGTTTTCAACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTGAGAAATCTGGAACCCCTAGAATTTAGGAGTAGTTTTCAACCT  600

seq1  TATCTAATGCTGTGACCCTTTGATGCGATTTCTCATCTTGTGGTGACCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAATGCTGTGACCCTTTGATGCGATTTCTCATCTTGTGGTGACCCC  650

seq1  CAACCATAAAACTATTTCATTGCTACTTCATAACTGTAAATTGGCTACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATAAAACTATTTCATTGCTACTTCATAACTGTAAATTGGCTACTG  700

seq1  TTTTAAACTGTAATATAAATATCTGGTATGCAGGTGACTCCCATGAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAACTGTAATATAAATATCTGGTATGCAGGTGACTCCCATGAATGA  750

seq1  GTCATTTGACCACCAAAGGGATCCTGACACAGGTTGAGAACTACTGAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTGACCACCAAAGGGATCCTGACACAGGTTGAGAACTACTGAGGT  800

seq1  AAGACCTAAAGAGACAAAGTATAGGTCACAGAGGAGAT-GGTTTGGGAAC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAGACCTAAAGAGACAAAGTATAGGTCACAGAGGAGATGGGTTTGGGAAC  850

seq1  TATTAGGACTTCAGCCTAGTCCCCTGTCTCTTTACTGTCTGACACCAGGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGGACTTCAGCCTAGTCCCCTGTCTCTTTACTGTCTGACACCAGGA  900

seq1  GATGAGGAGATCTC-TTCTGCTCCCACCTGGATGTACTGTGGTAACACAG  948
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGGAGATCTCTTTCTGCTCCCACCTGGATGTACTGTGGTAACACAG  950

seq1  GCCCAAAGCACAGAGCCAAGTGACCGTTGATTGGGATCTCTAAA-CTCAA  997
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCCCAAAGCACAGAGCCCAGTGACCGTTGATTGGGATCTCTAAACCTCAA  1000

seq1  AATTAAAC-TTTCCACTTAATCAATTTTTTTGGCTTGGGTTTTT-GGTCT  1045
      |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AATTAAACTTTTCCACTTAATC-ATTTTTTTGGCTTGGGTTTTTGGGTCT  1049

seq1  CACTAATAGCTGACTAACATAGTTCTAGAGAGATGGAAGGCATGAAGTAC  1095
      |||| |||||||||| || ||||||  ||   ||||||||  ||||||||
seq2  CACT-ATAGCTGACT-ACCTAGTTCAGGAAGAATGGAAGGACTGAAGTAC  1097

seq1  TACC  1099
      ||||
seq2  TACC  1101

seq1: chr19_15439506_15440564
seq2: B6Ng01-045H07.g_66_1117 (reverse)

seq1  AACATGTGCAGAAGGATCCTGTTGCAGAGTTGTTACTGCTGGCTAGTCCG  50
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
seq2  AACATG-GCAGAAGGATCCTGTTGCAGAGTTG-TACTGCT-GCTAGTCCG  47

seq1  GCGTGCGCAAGACCCTACCTCAGTCCAATGATTGGCTGGAAGTATCTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  GCGTGCGCAAGACCCTACCTCAGTCCAATGA-TGGCTGGAAG-ATCTGTG  95

seq1  TCTGTCTCGGTCAGCTGCTGGTAGAGTCTCTCAGAGGACAACCATGTGAG  150
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTC-GTCAGCTGCTGGTAGAGTCTCTCAGAGGACAACCATGTGAG  144

seq1  GCTCCTGTCTGCAAGCACAACATGGCATCAATAATAGTGTCAGGATTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCTCCTGTCTGCAAGCACAACATGGCATCAATAATAGTGTCAGGA-TTAG  193

seq1  TGCCTGCTCATGGGATGGATCCCAAGTTGGGGCAGTCACTGGATGGCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCTCATGGGATGGATCCCAAGTTGGGGCAGTCACTGGATGGCCTT  243

seq1  TCCTTCAATTTCTGCTCCAGTTTTGTCCCTGCATTTCTCTTAGATAGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCAATTTCTGCTCCAGTTTTGTCCCTGCATTTCTCTTAGATAGGAA  293

seq1  CAATTCTGGGTCACTGATTTATACATATGTATATATGAAATATATATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTGGGTCACTGATTTATACATATGTATATATGAAATATATATATA  343

seq1  TATATTATATATATATATTTATTTATATATAGTATCTTACATTTGTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTATATATATATATTTATTTATATATAGTATCTTACATTTGTTTTT  393

seq1  CTATCTCCTTGAATTAGTATTGTACCTTACAGAGCTTCCAAGGTGAATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTCCTTGAATTAGTATTGTACCTTACAGAGCTTCCAAGGTGAATGA  443

seq1  ATATCTTGGATATGTCAGATGGATCACTGACATGATACAGTCATTTTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTTGGATATGTCAGATGGATCACTGACATGATACAGTCATTTTATA  493

seq1  AACTTCAAGCCTTATAGCCTGTATGATAAAAATATAAAGAATATTTCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAAGCCTTATAGCCTGTATGATAAAAATATAAAGAATATTTCTAA  543

seq1  ACTCTTCTTATAACCTAATTTTCCCCGTGTCACAAACATAGAAATGATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCTTATAACCTAATTTTCCCCGTGTCACAAACATAGAAATGATGA  593

seq1  CATTTAACTGCAACACTATGGTGACTCCAGGAACAGTCCTGGCCACTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAACTGCAACACTATGGTGACTCCAGGAACAGTCCTGGCCACTGTT  643

seq1  TTGTATATACATCAGCTATTTTATGTTTAGGCTATAAGTACACATTTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATACATCAGCTATTTTATGTTTAGGCTATAAGTACACATTTCAG  693

seq1  TATTGTATTCAATACTGAATGTTGAGAGTTACTTAGCTCTCAAGCTAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTATTCAATACTGAATGTTGAGAGTTACTTAGCTCTCAAGCTAGAC  743

seq1  TCAGCAAGTGTTTATATCTAAAACTTCTAATCCACATAGCTCAGTGTACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAGTGTTTATATCTAAAACTTCTAATCCACATAGCTCAGTGTACA  793

seq1  AATAAGTCGAAGTTTAATGATTCAAGGCAGTCTTTACTGCCATAGATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGTCGAAGTTTAATGATTCAAGGCAGTCTTTACTGCCATAGATGGG  843

seq1  TAGGTTTGCCAACACTTTCTGATGATCAAGTTATAGGAATTAAAACCAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTTGCCAACACTTTCTGATGATCAAGTTATAGGAATTAAAACCAAG  893

seq1  AGTTTTACTGAATTTATAGTAAATTTATAGCAACCTCATTCCACTTTATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTACTGAATTTATAGTAAATTTATAGCAACCTCATTCCACTTTATC  943

seq1  CTTTTTAAGGCATAGAGTTTTCTGCTAGATCACAGCAAGAAGCTACAATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAGGCATAGAGTTTTCTGCTAGATCACAGCAAGAAGCTACAATA  993

seq1  ATCTGACAAGATTTATTCTTTACATTGATCATTACTATACAACCCATCCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGACAAGATTTATTCTTTACATTGATCATTACTATACAACCCATCCT  1043

seq1  GTGGAATTC  1059
      |||||||||
seq2  GTGGAATTC  1052