BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-047N13
Chromosome19 (Build37)
Map Location 19,646,214 - 19,764,424
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneOstf1, LOC666712, BC016495, LOC100042193, 2410127L17Rik, LOC100042184, D030056L22Rik, Trpm6, Rorb
Downstream geneLOC100042218, LOC100041541, Anxa1, LOC100041560, 1500015L24Rik, E030003E18Rik, EG626549, Aldh1a1
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-047N13.bB6Ng01-047N13.g
ACCDH872591DH872592
length1,071725
definitionDH872591|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-047N13, 5' end.DH872592|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-047N13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,763,330 - 19,764,424)(19,646,214 - 19,646,938)
sequence
gaattctttctctagatgtttaatatttcaatctaccttccattctgtta
tttattccactggtcaaccaaaattaatatacagagaaagcccattatgt
aaattataatcttcattttccacactggcatagcttactataaaatcgac
acactccttcaacagaatatgttattccacaatttaccttttcttcttca
tcttcttttattccttaaaatttatcacacaattgttctataaaaatgtg
aagttaacatcaaagttaatgatgctgcaaccagcaaaatgatagcaaca
agcctccaagagggataaaatcaaatgcacttgagcagaatagggtggaa
agaacatctttaaagatgtcctgtataagaagactggtgcaattttggtt
attcctctccttttaaactaactactgaaagcttagagatagactgagct
tcaagttacaacttccatttcaaatatagagttgtttcacctttgttttg
ctatctttcagtctttacattttttcctcatatttttacttttataatgg
tcttgttataattagttttctatcataaatacctttgaaacaaactagat
ataaaacaaataaatagataaattaggtctaagcaaataacttcctggtt
aaataaagttatcattctcaccttaacccaagacagtgataggatctaga
acaaagactgacaataagtacttttcaaaacacagtggacaagcatcatg
tacctattctatacctatataaagcagccaggccactatctccctcttca
atgctagtgaataattgactgtgttgtgaattatattcttgttagaatta
tttctcctagcattcacatgttatcaagaattctacatcctcaacaaagt
agagagacttttacatcatgtctgtgcatattttaggctctaaatgagca
gtagagtctacacatacctactttgaaatgtgcatgaatcacatcactac
agctctattacagcagcacatgtgaggctcagcaaatagaaacttattga
cgactgtcctctcctttacat
gaattcaccagcaagggagggtcacatccaaagaccttctatgtctatat
atgatcctgctgggtagaaaagcttgtggctacacatgtgtttactgaat
attgtttaaattatccattaatcagaggttgattatttctgcatgttagt
tactctataagataatgagactctatactggaaaacaaaaatatagaact
tcggttttcatgggaagggtctgtctctagcttttctaatgctatcttct
caccaaaatatgatctagcacctagtagaggcttaataaataaacaatga
gtaagtgaacagaagcaataagttagcttttaaatgtacagttaaggaag
tatggacactgaattccatgaccgaggacaccttaagtatcttccaggta
aagcataaattgatgggaaatatgagatacttttaagaatcaaataaatt
ttgagatacaaggaaaatatgaagtaaagatttatatgtgaggaggagac
aaggccaggtaatgaggaattaagtcacagaagaaattaagcagaatatg
acacactagtatctgattcaaaaacatcattttgctgcttcctacaaata
tgattcaataaatattctattttcaggagaaaatgcttaagaactacaga
tagaaaataggaaaaatgctagggatgaagatgttcaaggaaggatgacg
ggtgggggtgatagaggtgaaaaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_19763330_19764424
seq2: B6Ng01-047N13.b_47_1117 (reverse)

seq1  ATGTAAAGGAGAGGACAGTCTGGTTCCAATAAGTTTTCTATTTGCTGAGC  50
      ||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATGTAAAGGAGAGGACAGTC--GT--CAATAAG-TTTCTATTTGCTGAGC  45

seq1  CTCACATGTGCTTGGCCTGTAATAGAGCTGTAGTGATTGTGAATTTCATT  100
      ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||  |||| |
seq2  CTCACATGTGCT---GCTGTAATAGAGCTGTAGTGA-TGTGA--TTCA-T  88

seq1  GCACAATTTTCAAAGTTAGGGTATGTGTAGACTCTACTGCTCCATTTAGA  150
      |||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GCACA--TTTCAAAGT--AGGTATGTGTAGACTCTACTGCT-CATTTAGA  133

seq1  GCCCTTAAAATTATGGCACAAGGACATGATGTAAAAGTCTCTCTACTTTG  200
      |||  ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCC--TAAAA-TAT-GCACA--GACATGATGTAAAAGTCTCTCTACTTTG  177

seq1  TTGAGGATGTAGAATTCTTGATAACATGTGGAATGCTAGGAGAAATAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGATGTAGAATTCTTGATAACATGT-GAATGCTAGGAGAAATAATT  226

seq1  CTAACAAGAATATAATTCACAACACAGTCAATTATTCACTAGCATTGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAAGAATATAATTCACAACACAGTCAATTATTCACTAGCATTGAAG  276

seq1  AGGGAGATAGTGGCCTGGCTGCTTTATATAGGTATAGAATAGGTACATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGATAGTGGCCTGGCTGCTTTATATAGGTATAGAATAGGTACATGA  326

seq1  TGCTTGTCCACTGTGTTTTGAAAAGTACTTATTGTCAGTCTTTGTTCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTCCACTGTGTTTTGAAAAGTACTTATTGTCAGTCTTTGTTCTAG  376

seq1  ATCCTATCACTGTCTTGGGTTAAGGTGAGAATGATAACTTTATTTAACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATCACTGTCTTGGGTTAAGGTGAGAATGATAACTTTATTTAACCA  426

seq1  GGAAGTTATTTGCTTAGACCTAATTTATCTATTTATTTGTTTTATATCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTTATTTGCTTAGACCTAATTTATCTATTTATTTGTTTTATATCTA  476

seq1  GTTTGTTTCAAAGGTATTTATGATAGAAAACTAATTATAACAAGACCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTCAAAGGTATTTATGATAGAAAACTAATTATAACAAGACCATT  526

seq1  ATAAAAGTAAAAATATGAGGAAAAAATGTAAAGACTGAAAGATAGCAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGTAAAAATATGAGGAAAAAATGTAAAGACTGAAAGATAGCAAAA  576

seq1  CAAAGGTGAAACAACTCTATATTTGAAATGGAAGTTGTAACTTGAAGCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTGAAACAACTCTATATTTGAAATGGAAGTTGTAACTTGAAGCTC  626

seq1  AGTCTATCTCTAAGCTTTCAGTAGTTAGTTTAAAAGGAGAGGAATAACCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTATCTCTAAGCTTTCAGTAGTTAGTTTAAAAGGAGAGGAATAACCA  676

seq1  AAATTGCACCAGTCTTCTTATACAGGACATCTTTAAAGATGTTCTTTCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGCACCAGTCTTCTTATACAGGACATCTTTAAAGATGTTCTTTCCA  726

seq1  CCCTATTCTGCTCAAGTGCATTTGATTTTATCCCTCTTGGAGGCTTGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATTCTGCTCAAGTGCATTTGATTTTATCCCTCTTGGAGGCTTGTTG  776

seq1  CTATCATTTTGCTGGTTGCAGCATCATTAACTTTGATGTTAACTTCACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCATTTTGCTGGTTGCAGCATCATTAACTTTGATGTTAACTTCACAT  826

seq1  TTTTATAGAACAATTGTGTGATAAATTTTAAGGAATAAAAGAAGATGAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAGAACAATTGTGTGATAAATTTTAAGGAATAAAAGAAGATGAAG  876

seq1  AAGAAAAGGTAAATTGTGGAATAACATATTCTGTTGAAGGAGTGTGTCGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAGGTAAATTGTGGAATAACATATTCTGTTGAAGGAGTGTGTCGA  926

seq1  TTTTATAGTAAGCTATGCCAGTGTGGAAAATGAAGATTATAATTTACATA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAGTAAGCTATGCCAGTGTGGAAAATGAAGATTATAATTTACATA  976

seq1  ATGGGCTTTCTCTGTATATTAATTTTGGTTGACCAGTGGAATAAATAACA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCTTTCTCTGTATATTAATTTTGGTTGACCAGTGGAATAAATAACA  1026

seq1  GAATGGAAGGTAGATTGAAATATTAAACATCTAGAGAAAGAATTC  1095
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGAAGGTAGATTGAAATATTAAACATCTAGAGAAAGAATTC  1071

seq1: chr19_19646214_19646938
seq2: B6Ng01-047N13.g_67_791

seq1  GAATTCACCAGCAAGGGAGGGTCACATCCAAAGACCTTCTATGTCTATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAGCAAGGGAGGGTCACATCCAAAGACCTTCTATGTCTATAT  50

seq1  ATGATCCTGCTGGGTAGAAAAGCTTGTGGCTACACATGTGTTTACTGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCCTGCTGGGTAGAAAAGCTTGTGGCTACACATGTGTTTACTGAAT  100

seq1  ATTGTTTAAATTATCCATTAATCAGAGGTTGATTATTTCTGCATGTTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTTAAATTATCCATTAATCAGAGGTTGATTATTTCTGCATGTTAGT  150

seq1  TACTCTATAAGATAATGAGACTCTATACTGGAAAACAAAAATATAGAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTATAAGATAATGAGACTCTATACTGGAAAACAAAAATATAGAACT  200

seq1  TCGGTTTTCATGGGAAGGGTCTGTCTCTAGCTTTTCTAATGCTATCTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTTTCATGGGAAGGGTCTGTCTCTAGCTTTTCTAATGCTATCTTCT  250

seq1  CACCAAAATATGATCTAGCACCTAGTAGAGGCTTAATAAATAAACAATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAAATATGATCTAGCACCTAGTAGAGGCTTAATAAATAAACAATGA  300

seq1  GTAAGTGAACAGAAGCAATAAGTTAGCTTTTAAATGTACAGTTAAGGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTGAACAGAAGCAATAAGTTAGCTTTTAAATGTACAGTTAAGGAAG  350

seq1  TATGGACACTGAATTCCATGACCGAGGACACCTTAAGTATCTTCCAGGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGACACTGAATTCCATGACCGAGGACACCTTAAGTATCTTCCAGGTA  400

seq1  AAGCATAAATTGATGGGAAATATGAGATACTTTTAAGAATCAAATAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATAAATTGATGGGAAATATGAGATACTTTTAAGAATCAAATAAATT  450

seq1  TTGAGATACAAGGAAAATATGAAGTAAAGATTTATATGTGAGGAGGAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATACAAGGAAAATATGAAGTAAAGATTTATATGTGAGGAGGAGAC  500

seq1  AAGGCCAGGTAATGAGGAATTAAGTCACAGAAGAAATTAAGCAGAATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCAGGTAATGAGGAATTAAGTCACAGAAGAAATTAAGCAGAATATG  550

seq1  ACACACTAGTATCTGATTCAAAAACATCATTTTGCTGCTTCCTACAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTAGTATCTGATTCAAAAACATCATTTTGCTGCTTCCTACAAATA  600

seq1  TGATTCAATAAATATTCTATTTTCAGGAGAAAATGCTTAAGAACTACAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCAATAAATATTCTATTTTCAGGAGAAAATGCTTAAGAACTACAGA  650

seq1  TAGAAAATAGGAAAAATGCTAGGGATGAAGATGTTCAAGGAAGGATGACG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAATAGGAAAAATGCTAGGGATGAAGATGTTCAAGGAAGGATGACG  700

seq1  GGTGGGGGTGATAGAGGTGAAAAGA  725
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGGTGATAGAGGTGAAAAGA  725