BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-048P14
Chromosome19 (Build37)
Map Location 60,174,381 - 60,327,994
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043093, D19Ertd737e, 4933412A08Rik
Upstream geneVax1, LOC668627, Kcnk18, Slc18a2, Pdzd8, LOC100034727, LOC100043073, Emx2os, Emx2, Rab11fip2, LOC100043087, LOC100043091
Downstream genePrlhr, 2700078E11Rik, Nanos1, Eif3s10, 1810055E12Rik, Sfxn4, Prdx3, Gprk5, LOC671322, BC029127, LOC100043112, EG547091, LOC433261, EG633057, Csf2ra, LOC100043120
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-048P14.bB6Ng01-048P14.g
ACCDH873371DH873372
length1,0991,033
definitionDH873371|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048P14, 5' end.DH873372|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048P14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,174,381 - 60,175,492)(60,326,953 - 60,327,994)
sequence
gaattctatcaggcagtagactggaatgacaggaagagaagcacttcaca
ggcagagagaacagcaaaggtcccaaggcacagacaagaaagccagggtg
gttgaccaactgtcgcaaagaatgaggttggggagcaagtgaagactaat
tatgcgcaggaacatgctgagtacttgagggtttagatttaagtgaagta
aaaaaggtaagtcaggaatggctccaaataagaaaaatggtctcacattg
aggaaatgaatttggcacggagaaagcaggctcagcatggagaaaacagg
tgcaatgtggggagaatggggtcacatggaagaaacaaactcagaacaag
ggagatgggctgggtaggaaaaacgggctcatcatggggaaagtgagcta
tggtttatatcttatactgatattatttaattatttaagttcagagccag
actgaacagagtacataaagtccccctatactaccatccacatgcatggc
ctcctcgatggtcagccccagtacagaggcacgtcacttgtagtccatac
acttccatgtcaggaagtcaaggatgcggactttcttgaaggcttatgtt
tcgctagctcttgcatatggcccatgaccacatgcataggaaagttgcta
tctacattgggctagcacctcccacatcaaccattaatcgagacagttcc
ctacagacatggccatggaataatctgaaatgttcagttcttgaaacaag
actctattagatgaatctaggctatgtcaagataatagataaagctgaca
acctcaggtgaataaataaaccatggcacacctagacaacagatgcacaa
ccttaagtgcatattactatcaaaagaaaccactcacaagcctggtggtg
atgccccactgctttaatcccagaacttggggaggcagaggcagaggtag
aaggtctctgagttataggcaactgatctacagtagtacagacagcagag
tacatagtaaatccttgtctggacaaacaaataaaacaggcaacaaacag
ctatcttcaggatactgcatagtgtgtaggtccactatattgacattgt
gaattccacaggaagatacataagtgcatagtgtgaattatgaaagtact
aaatacctgggataaacacctaagtctttcacctatgagctcttgtgact
tgagcacctatgaccttgaatgagttttttttttccccttgtttgtttgt
ttgtctgtcctgttttggaagaagtgtgtaactttcctgtgtgaccattt
ctatagaagtgcatgtaaccatagcacctttaaggtagggttgatgtgag
agtgtccagataatcttctctttgtccctttgacccagatttcaacagtt
ctcttccctgttctatactttggaaggctaacccatacattaggcatcaa
ggggcgttttgcctctggtcttctgttagttagctgagaggaggctgcag
ccagagagcccaaggcaggaagagactgaggttggaggtgtttatcttgc
ttcttcttctaccaggtggccaagaattgtctgcaacccaaggctcttgc
caagctgcctctggaaagaagctctccttgggatacctccgggtatgtgt
gtgagggtacccttatgagtccctgcaggctgtgtaggagggggtgagag
gcgccatgccaaggttaggcagagtgttgcatgatcccttactgagttcc
ccagagccatgcgggagcttcgtcgttttattcgggcgcacttcaatgta
tccaatttgtgtatgccatctgtttcctgccaagatcccgattaatagga
ccagggtcttcgttctgaagcacttagaacaatagctggcttgtggaagc
actgtataaatatttgataacaaaagaaaggaggataggaccattttgta
gtcaacattaaaacaaatgtctctgtagccatttaaagcaagacttcaca
gctcctttcccaaataaaactactctcctcgtggatttatgtggatggag
ctaccatcaattttcaatcatatttgtagtgtttggtttaaagggaaaag
aacttttaaataaaatagggttatgtatttgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_60174381_60175492
seq2: B6Ng01-048P14.b_51_1149

seq1  GAATTCTATCAGGCAGTAGACTGGAATGACAGGAAGAGAAGCACTTCACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATCAGGCAGTAGACTGGAATGACAGGAAGAGAAGCACTTCACA  50

seq1  GGCAGAGAGAACAGCAAAGGTCCCAAGGCACAGACAAGAAAGCCAGGGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGAGAACAGCAAAGGTCCCAAGGCACAGACAAGAAAGCCAGGGTG  100

seq1  GTTGACCAACTGTCGCAAAGAATGAGGTTGGGGAGCAAGTGAAGACTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACCAACTGTCGCAAAGAATGAGGTTGGGGAGCAAGTGAAGACTAAT  150

seq1  TATGCGCAGGAACATGCTGAGTACTTGAGGGTTTAGATTTAAGTGAAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCGCAGGAACATGCTGAGTACTTGAGGGTTTAGATTTAAGTGAAGTA  200

seq1  AAAAAGGTAAGTCAGGAATGGCTCCAAATAAGAAAAATGGTCTCACATTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGTAAGTCAGGAATGGCTCCAAATAAGAAAAATGGTCTCACATTG  250

seq1  AGGAAATGAATTTGGCACGGAGAAAGCAGGCTCAGCATGGAGAAAACAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAATGAATTTGGCACGGAGAAAGCAGGCTCAGCATGGAGAAAACAGG  300

seq1  TGCAATGTGGGGAGAATGGGGTCACATGGAAGAAACAAACTCAGAACAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATGTGGGGAGAATGGGGTCACATGGAAGAAACAAACTCAGAACAAG  350

seq1  GGAGATGGGCTGGGTAGGAAAAACGGGCTCATCATGGGGAAAGTGAGCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATGGGCTGGGTAGGAAAAACGGGCTCATCATGGGGAAAGTGAGCTA  400

seq1  TGGTTTATATCTTATACTGATATTATTTAATTATTTAAGTTCAGAGCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTATATCTTATACTGATATTATTTAATTATTTAAGTTCAGAGCCAG  450

seq1  ACTGAACAGAGTACATAAAGTCCCCCTATACTACCATCCACATGCATGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACAGAGTACATAAAGTCCCCCTATACTACCATCCACATGCATGGC  500

seq1  CTCCTCGATGGTCAGCCCCAGTACAGAGGCACGTCACTTGTAGTCCATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCGATGGTCAGCCCCAGTACAGAGGCACGTCACTTGTAGTCCATAC  550

seq1  ACTTCCATGTCAGGAAGTCAAGGATGCGGACTTTCTTGAAGGCTTATGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCATGTCAGGAAGTCAAGGATGCGGACTTTCTTGAAGGCTTATGTT  600

seq1  TCGCTAGCTCTTGCATATGGCCCATGACCACATGCATAGGAAAGTTGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTAGCTCTTGCATATGGCCCATGACCACATGCATAGGAAAGTTGCTA  650

seq1  TCTACATTGGGCTAGCACCTCCCACATCAACCATTAATCGAGACAGTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACATTGGGCTAGCACCTCCCACATCAACCATTAATCGAGACAGTTCC  700

seq1  CTACAGACATGGCCATGGAATAATCTGAAATGTTCAGTTCTTGAAACAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGACATGGCCATGGAATAATCTGAAATGTTCAGTTCTTGAAACAAG  750

seq1  ACTCTATTAGATGAATCTAGGCTATGTCAAGATAATAGATAAAGCTGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTATTAGATGAATCTAGGCTATGTCAAGATAATAGATAAAGCTGACA  800

seq1  ACCTCAGGTGAATAAATAAACCATGGCACACCTAGACAACAAGATGCACA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACCTCAGGTGAATAAATAAACCATGGCACACCTAGACAAC-AGATGCACA  849

seq1  ACCTTAAGTGCATATTACTATCAAAAAGAAACCACTCACAAGCCTGGT-G  899
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACCTTAAGTGCATATTACTATC-AAAAGAAACCACTCACAAGCCTGGTGG  898

seq1  TGATGCCCCACTGCTTTAATCCCAGAACTT-GGGAGGCAGAGGCAGAGGT  948
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGATGCCCCACTGCTTTAATCCCAGAACTTGGGGAGGCAGAGGCAGAGGT  948

seq1  AGACAGGTCTCTGAGTTATAGGCCAACCTGATCTACAAGTAAGTTACAAG  998
      ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||   ||| ||
seq2  AGA-AGGTCTCTGAGTTATAGGC--AACTGATCTAC-AGTA--GTAC-AG  991

seq1  ACAGCAAGAGTACATAGTAAATCCTTGTCTTGAACAAACAAAATAAAACA  1048
      ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| 
seq2  ACAGC-AGAGTACATAGTAAATCCTTGTC-TGGACAAAC-AAATAAAAC-  1037

seq1  AGGCAAAACAAAACAGCTATCTTCA-GATACTGCATAGTGTGTAAGTCCA  1097
      ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| 
seq2  AGGCAA---CAAACAGCTATCTTCAGGATACTGCATAGTGTGTAGGTCC-  1083

seq1  ACTATA-TGACATTGT  1112
      |||||| |||||||||
seq2  ACTATATTGACATTGT  1099

seq1: chr19_60326953_60327994
seq2: B6Ng01-048P14.g_70_1102 (reverse)

seq1  GTCAAATAAAAATAACCCTAATATTTTATTTAAAAGGTCTTTTTCTCCTT  50
      |||||||  | |||||||   ||||||||||||||| ||||||   ||||
seq2  GTCAAAT--ACATAACCC---TATTTTATTTAAAAGTTCTTTT--CCCTT  43

seq1  TAAACCAAAACACTACAAAATGTGATTGAAAATTGATGGTTGCTCCATCC  100
      |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAAACC-AAACACTAC-AAATATGATTGAAAATTGATGGTAGCTCCATCC  91

seq1  ACATAAAATCCACTGAGGAGAGTAGTTTTATTTGGGAAAAGAGCTGTGAA  150
      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACAT-AAATCCAC-GAGGAGAGTAGTTTTATTTGGGAAAGGAGCTGTGAA  139

seq1  GTTTTGCTTTAAATGGCTACAGAGACATATG-TTTAATGTTGACTACAAA  199
      || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGCTTTAAATGGCTACAGAGACATTTGTTTTAATGTTGACTACAAA  189

seq1  TGGTTCCTATTCTCATTTCTTTTGTTTATCAAATATTTATACAGTGCTTA  249
        | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATGGTCCTATCCTCCTTTCTTTTG-TTATCAAATATTTATACAGTGCTT-  237

seq1  CCACAAGCCAGCTATTGTTCTAAGTGCTTCAGAACGAAGA-CCTGGTCCT  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CCACAAGCCAGCTATTGTTCTAAGTGCTTCAGAACGAAGACCCTGGTCCT  287

seq1  ATTAATCGGGATCTTGGCAGGAAACAGATGGCATACACAAATTGGATACA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATCGGGATCTTGGCAGGAAACAGATGGCATACACAAATTGGATACA  337

seq1  TTGAAGTGCG-CCGAATAAAACGGCGAAGCT-CCGCATGGCTCTGGGGAA  396
      |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGTGCGCCCGAATAAAACGACGAAGCTCCCGCATGGCTCTGGGGAA  387

seq1  CTCAGTAAGGGATCATGCAACACTCTGCCTAACCTTGGCATGGCGCCTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTAAGGGATCATGCAACACTCTGCCTAACCTTGGCATGGCGCCTCT  437

seq1  CACCCCCTCCTACACAGCCTGCAGGGACTCATAAGGGTACCCTCACACAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCTCCTACACAGCCTGCAGGGACTCATAAGGGTACCCTCACACAC  487

seq1  ATACCCGGAGGTATCCCAAGGAGAGCTTCTTTCCAGAGGCAGCTTGGCAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCGGAGGTATCCCAAGGAGAGCTTCTTTCCAGAGGCAGCTTGGCAA  537

seq1  GAGCCTTGGGTTGCAGACAATTCTTGGCCACCTGGTAGAAGAAGAAGCAA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTGGGTTGCAGACAATTCTTGGCCACCTGGTAGAAGAAGAAGCAA  587

seq1  GATAAACACCTCCAACCTCAGTCTCTTCCTGCCTTGGGCTCTCTGGCTGC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAACACCTCCAACCTCAGTCTCTTCCTGCCTTGGGCTCTCTGGCTGC  637

seq1  AGCCTCCTCTCAGCTAACTAACAGAAGACCAGAGGCAAAACGCCCCTTGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCTCTCAGCTAACTAACAGAAGACCAGAGGCAAAACGCCCCTTGA  687

seq1  TGCCTAATGTATGGGTTAGCCTTCCAAAGTATAGAACAGGGAAGAGAACT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAATGTATGGGTTAGCCTTCCAAAGTATAGAACAGGGAAGAGAACT  737

seq1  GTTGAAATCTGGGTCAAAGGGACAAAGAGAAGATTATCTGGACACTCTCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAATCTGGGTCAAAGGGACAAAGAGAAGATTATCTGGACACTCTCA  787

seq1  CATCAACCCTACCTTAAAGGTGCTATGGTTACATGCACTTCTATAGAAAT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAACCCTACCTTAAAGGTGCTATGGTTACATGCACTTCTATAGAAAT  837

seq1  GGTCACACAGGAAAGTTACACACTTCTTCCAAAACAGGACAGACAAACAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACACAGGAAAGTTACACACTTCTTCCAAAACAGGACAGACAAACAA  887

seq1  ACAAACAAGGGGAAAAAAAAAACTCATTCAAGGTCATAGGTGCTCAAGTC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAGGGGAAAAAAAAAACTCATTCAAGGTCATAGGTGCTCAAGTC  937

seq1  ACAAGAGCTCATAGGTGAAAGACTTAGGTGTTTATCCCAGGTATTTAGTA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAGCTCATAGGTGAAAGACTTAGGTGTTTATCCCAGGTATTTAGTA  987

seq1  CTTTCATAATTCACACTATGCACTTATGTATCTTCCTGTGGAATTC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATAATTCACACTATGCACTTATGTATCTTCCTGTGGAATTC  1033