BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056F14
Chromosome19 (Build37)
Map Location 22,640,308 - 22,759,491
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrpm3
Upstream gene1110059E24Rik, 5730446C15Rik, Tmem2, EG433229, EG433230
Downstream geneKlf9, Smc5, Mamdc2, 1700028P14Rik, LOC670565, LOC226030, EG625193
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056F14.bB6Ng01-056F14.g
ACCDH878532DH878533
length1,032935
definitionDH878532|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056F14, 5' end.DH878533|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,758,448 - 22,759,491)(22,640,308 - 22,641,250)
sequence
gaattctcaccaggctccagccattctgaaaaatgtccccggctgagcta
ttcaacacatatgtaaaactgtaattctgtttcagtgagaacccaaatgt
tactaagacattgttatgattaaatgataacttggcatttcttattctgc
cttcgagagagtttctaagactggaacatggtgttcccttatcctctttc
cttaccaaataacaaagcaaacccaacattgctgttctagctataatagg
cagaacctttccaagattcataattttttcctccctgccaatctatcaat
tatgaataattgaaccggagggtaacagcaaccctacttagataattgga
agcaacatacaagcatacaggtccagcaaagccaatgtagtgttcctatc
attctatgggaaatggaaaacattttgatgttaagcatatctctgtctgc
tagtcatcactctctgtcaagttgcttgcttgttaggtagaaaataaagc
ccgtggtgaaatggtaatgcaacagtcctcatgttgttgaaggttgccaa
gcctacctccaaaacactgttactgctctccctaaacactgaccacagag
gtctgtatctgtctgtgtgtgtttctttgtttgctcatataacacctctt
tggaagactttaaatcctggagatatatatatacacacacacacacacac
acatatgtatgtatgtatatatatgtacatatatacacatacgcacatat
acacacacatatatgtatgtatgtatgtatatatatatatatatatatat
ataccctttcactaaatatattttgacagacatgtacaaggaaatgaata
tgaattcaaatgtatgcataagaatcttggaggtagcgcaacaatacaga
ccatggttcaatgaagatcctacttaagggggttaatgtaatatctaaaa
gggttaatctgggaaaaggcttgagttgagaggagcccatgaagagggac
aagaggatccgaaaatgggcaggggtaataaa
gaattctccatggaaatcaggctgggcttcaactcagtgatccgcctacc
actgcctcctgagtgatggaattaaaggcaagtgccaccacacacgtcta
gctcttatagagagaagcacttaattgaaggcttgcttacagttttagag
ggttagtctattatcatcatggtcgaaagcagacaagcatagctcaagaa
caatagctgagagttttacatcctgatccacaggcagcaggcagaaagcg
caaaagagagagacagagagagacagagacagagagtcagaaacaggacc
gagcatgggcttttgaaaccttaaagcccactctacagggacacacctcc
ttcaacaaggccacacctcttaatccttccctagtctaggaactcatgac
ttagttttcaaatacataagcctctgttggccattctcattcaaactacc
acaggtacctttatactacatgctgttcactagagaaggagctcagacct
agggggtctctctgagcccttttaatgtaacatcccaaggcaatttacaa
agagataatggcttccttccatgctttcctgagtacattttactttctta
tgcaaccagaaagagaaggagctgctcttaacaatcttatgatatcaaac
cagtctgtaaattcatcttcctttctgataagcaactgatgggacttcat
taaaaaaaaaaaaaaaaaataaggttgtcacagacagaactgcctagatt
gtgtttaatggattatcaaatgattttggaatctgcctaccataatattc
atgtacaaagattatatgggaaaggaaattccactaacatattcagacaa
gaggaatgctgaggactgagtttctaggcagaggagttggtgtctgaaat
ctctattgataagttttcttgattggtggtggtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_22758448_22759491
seq2: B6Ng01-056F14.b_47_1078 (reverse)

seq1  TTTACTACCCCTGCCCCATCTTCGGCTCCTCTTTGTCCCTC-TCATGGGC  49
      |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TTTATTACCCCTG-CCCATTTTCGGATCCTC-TTGTCCCTCTTCATGGGC  48

seq1  TCCTCTCTAATTTCATAGCCTATACCCAGACTCAGCCCTACTTAGATATC  99
      |||||||  |  ||| ||||| | |||||| | | || |  |||||||| 
seq2  TCCTCTC--AACTCA-AGCCTTTTCCCAGATTAACCCTT--TTAGATAT-  92

seq1  TACATTTAAACACTGTAAGCTAGGGTCTGCATATGAGCCATGGTCTGTAT  149
      |||| |||| | |  |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||| 
seq2  TACA-TTAACCCCCTTAAG-TAGGATCTTCAT-TGAACCATGGTCTGTA-  138

seq1  TTGTTGTGCTACCTTCTAAGATTCTTTATGCATACATTTGAATTCATATT  199
      |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGCGCTACC-TCCAAGATTC-TTATGCATACATTTGAATTCATATT  186

seq1  CATTTCCTTGTACATGTCTTGTAAAATATATTTAGTG-AAGGATATATAT  248
      |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||
seq2  CATTTCCTTGTACATGTCTGTCAAAATATATTTAGTGAAAGGGTATATAT  236

seq1  ATATATATATATATATATACATACATACATACATATATGTGTGTGTATAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATACATACATACATACATATATGTGTGTGTATAT  286

seq1  GTGCGTATGTGTATATATGTACATATATATACATACATACATATGTGTGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTATGTGTATATATGTACATATATATACATACATACATATGTGTGT  336

seq1  GTGTGTGTGTGTGTATATATATATCTCCAGGATTTAAAGTCTTCCAAAGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTATATATATATCTCCAGGATTTAAAGTCTTCCAAAGA  386

seq1  GGTGTTATATGAGCAAACAAAGAAACACACACAGACAGATACAGACCTCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTATATGAGCAAACAAAGAAACACACACAGACAGATACAGACCTCT  436

seq1  GTGGTCAGTGTTTAGGGAGAGCAGTAACAGTGTTTTGGAGGTAGGCTTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCAGTGTTTAGGGAGAGCAGTAACAGTGTTTTGGAGGTAGGCTTGG  486

seq1  CAACCTTCAACAACATGAGGACTGTTGCATTACCATTTCACCACGGGCTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTTCAACAACATGAGGACTGTTGCATTACCATTTCACCACGGGCTT  536

seq1  TATTTTCTACCTAACAAGCAAGCAACTTGACAGAGAGTGATGACTAGCAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTACCTAACAAGCAAGCAACTTGACAGAGAGTGATGACTAGCAG  586

seq1  ACAGAGATATGCTTAACATCAAAATGTTTTCCATTTCCCATAGAATGATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATATGCTTAACATCAAAATGTTTTCCATTTCCCATAGAATGATA  636

seq1  GGAACACTACATTGGCTTTGCTGGACCTGTATGCTTGTATGTTGCTTCCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACACTACATTGGCTTTGCTGGACCTGTATGCTTGTATGTTGCTTCCA  686

seq1  ATTATCTAAGTAGGGTTGCTGTTACCCTCCGGTTCAATTATTCATAATTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTAAGTAGGGTTGCTGTTACCCTCCGGTTCAATTATTCATAATTG  736

seq1  ATAGATTGGCAGGGAGGAAAAAATTATGAATCTTGGAAAGGTTCTGCCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATTGGCAGGGAGGAAAAAATTATGAATCTTGGAAAGGTTCTGCCTA  786

seq1  TTATAGCTAGAACAGCAATGTTGGGTTTGCTTTGTTATTTGGTAAGGAAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGCTAGAACAGCAATGTTGGGTTTGCTTTGTTATTTGGTAAGGAAA  836

seq1  GAGGATAAGGGAACACCATGTTCCAGTCTTAGAAACTCTCTCGAAGGCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATAAGGGAACACCATGTTCCAGTCTTAGAAACTCTCTCGAAGGCAG  886

seq1  AATAAGAAATGCCAAGTTATCATTTAATCATAACAATGTCTTAGTAACAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGAAATGCCAAGTTATCATTTAATCATAACAATGTCTTAGTAACAT  936

seq1  TTGGGTTCTCACTGAAACAGAATTACAGTTTTACATATGTGTTGAATAGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTCTCACTGAAACAGAATTACAGTTTTACATATGTGTTGAATAGC  986

seq1  TCAGCCGGGGACATTTTTCAGAATGGCTGGAGCCTGGTGAGAATTC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCGGGGACATTTTTCAGAATGGCTGGAGCCTGGTGAGAATTC  1032

seq1: chr19_22640308_22641250
seq2: B6Ng01-056F14.g_69_1003

seq1  GAATTCTCCATGGAAATCAGGCTGGGCTTCAACTCAGTGATCCGCCTACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATGGAAATCAGGCTGGGCTTCAACTCAGTGATCCGCCTACC  50

seq1  ACTGCCTCCTGAGTGATGGAATTAAAGGCAAGTGCCACCACACACGTCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTCCTGAGTGATGGAATTAAAGGCAAGTGCCACCACACACGTCTA  100

seq1  GCTCTTATAGAGAGAAGCACTTAATTGAAGGCTTGCTTACAGTTTTAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTATAGAGAGAAGCACTTAATTGAAGGCTTGCTTACAGTTTTAGAG  150

seq1  GGTTAGTCTATTATCATCATGGTCGAAAGCAGACAAGCATAGCTCAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGTCTATTATCATCATGGTCGAAAGCAGACAAGCATAGCTCAAGAA  200

seq1  CAATAGCTGAGAGTTTTACATCCTGATCCACAGGCAGCAGGCAGAAAGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCTGAGAGTTTTACATCCTGATCCACAGGCAGCAGGCAGAAAGCG  250

seq1  CAAAAGAGAGAGACAGAGAGAGACAGAGACAGAGAGTCAGAAACAGGACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGAGAGAGACAGAGAGAGACAGAGACAGAGAGTCAGAAACAGGACC  300

seq1  GAGCATGGGCTTTTGAAACCTTAAAGCCCACTCTACAGGGACACACCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGGGCTTTTGAAACCTTAAAGCCCACTCTACAGGGACACACCTCC  350

seq1  TTCAACAAGGCCACACCTCTTAATCCTTCCCTAGTCTAGGAACTCATGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACAAGGCCACACCTCTTAATCCTTCCCTAGTCTAGGAACTCATGAC  400

seq1  TTAGTTTTCAAATACATAAGCCTCTGTTGGCCATTCTCATTCAAACTACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTTCAAATACATAAGCCTCTGTTGGCCATTCTCATTCAAACTACC  450

seq1  ACAGGTACCTTTATACTACATGCTGTTCACTAGAGAAGGAGCTCAGACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTACCTTTATACTACATGCTGTTCACTAGAGAAGGAGCTCAGACCT  500

seq1  AGGGGGTCTCTCTGAGCCCTTTTAATGTAACATCCCAAGGCAATTTACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTCTCTCTGAGCCCTTTTAATGTAACATCCCAAGGCAATTTACAA  550

seq1  AGAGATAATGGCTTCCTTCCATGCTTTCCTGAGTACATTTTAC-TTCTTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGAGATAATGGCTTCCTTCCATGCTTTCCTGAGTACATTTTACTTTCTTA  600

seq1  TGCAACCAGAAAGAGAAGGAGCTGCTCTTAACAATCTTATGATATCAAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACCAGAAAGAGAAGGAGCTGCTCTTAACAATCTTATGATATCAAAC  650

seq1  CAGTCTGTAAATTCATCTTCCTTTCTGATAAGCAACTGATGGGACTTCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGTAAATTCATCTTCCTTTCTGATAAGCAACTGATGGGACTTCAT  700

seq1  TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGTCACAGACAGAACTGCCTAG  749
      |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  T---AAAAAAAAAAAAAAAAAATAAGGTTGTCACAGACAGAACTGCCTAG  747

seq1  ATTTGTGTTTAATGGATTATCAAATGATTTTGGAATCTGCCTACCATAAT  799
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TTGTGTTTAATGGATTATCAAATGATTTTGGAATCTGCCTACCATAAT  796

seq1  ATTCATGTACAAAGAATATAATGGAAAGGAAATTCCACTAACATATTCAA  849
      ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATTCATGTACAAAGATTATATGGGAAAGGAAATTCCACTAACATATTC-A  845

seq1  GACAAGAGGAATGCTAGAGGACTGAGTTCCTAGGCAAGAGGAGTTGGTGT  899
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  GACAAGAGGAATGCT-GAGGACTGAGTTTCTAGGC-AGAGGAGTTGGTGT  893

seq1  CTGAAATCTCATATTGATTAGTTTTCTTAGATTGGTGGTGGTGG  943
      |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTGAAATCTC-TATTGATAAGTTTTCTT-GATTGGTGGTGGTGG  935