BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-084E08
Chromosome19 (Build37)
Map Location 14,766,427 - 14,920,655
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneOlfr1491, Olfr1492-ps1, Olfr1493-ps1, Olfr1494, Olfr1495, Olfr1496, Olfr1497, Olfr1498-ps1, Olfr1499, Olfr1500, Olfr1501, Olfr1502, Olfr1503-ps1, Olfr1504, Olfr1505, EG667433, Tle4
Downstream geneEG433225, EG635497, Pomc-ps1, LOC667482
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-084E08.bB6Ng01-084E08.g
ACCDH898277DH898278
length1,1191,168
definitionDH898277|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084E08, 5' end.DH898278|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-084E08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,766,427 - 14,767,562)(14,919,480 - 14,920,655)
sequence
gaattcatcttccagcattttttagttttgatgacctacaagaatgtatt
gcataacagaagtaaataattaatagtaagtattattcccaaggaccata
aatacgggctggtgaaaccttgcatagcaaagcatttgttctttaggatg
acaaggaggtgagtgttcactccagtttctgccccttgagatggaaaagc
tgcctgttggtattttatgtagggttacacaagtaaggactgaaatttct
ccatcagtagaccatgtgggtcatggaacttgctgaaaattatgttctga
aggtggcctttcaaaccagaacttaacaacaactggtgccaggtttccct
ttttatatatttaaaaagtttagatggaaatatgattcagtaagaggcta
caatgagtcagcaaggactcccaaaggaggccatgaaccctgtagagagt
ctaacagagacctctgctggctgacttttgggcttcttgactggtagtta
ccaacacagccttgccatctctaacatgcttataagtatagttatggatc
acttaagggtggaatacaagttgcaaagtgcatctactgatggtttcatc
atcatgtgaacttcacagactaagttgtctgtgatgccattaggttgtat
aaagtgatgtaaatacatagtgttgttgaccaagacgtcattacacggca
tgtgagcttaaatataaataataataattcttatgtttgtcatacagaat
tatttattgctctttggtgtatcaaaggtatgttcatgtttatgttaaaa
attttccttctgcatgtgatcaaattatgctaatcaagtttcagttttgt
tcaagcattgatacaggagctcacattataatgtagagcagtggttttcc
acctgggggtcttgactcctttggggttcacatatcaaatatcctgtgca
tcatatatttatattactattcatacagtacagaaatacattatgaaata
gcacaaaatatttatggatggggctcacacaacctgagatctgtataaag
ggtcacagcatagagcttgaaccactggtttagagcatgatggcatggac
atcttattagcagaataga
gaattccagtttttttcctcttattcagaaatgtagaattgtcatctaaa
gatgtaaagaatgggcatttgcaaggcaaaaatttggcctcaggtatctc
atgttggttatacgtggaaaaaaattaatttcaaagggagatcatttcac
agggagcagatgagaaatggagcgaagctttccctcaaattccaagtgtt
ccccacacctctcccaaatgaagagtcggtagaattgatgaggatggtct
gaggtaagatgctaaaaccccagccagcttgctaagcaagtaaattggaa
aacataaaaagtcgtgttggaacacctcctttaataatacatgcaggaaa
agtaatttctattaattagagtgtacattattaataaagtatttagaact
cttaccttaatttaggtgttatgaggaaattaaagtgcttctaatttcac
cctaaaggttgacagctgaatatttagaatagcaagcaagaaatggcaag
ctgcaaatacccaaccggaggtgctgggaaaggcaccaaggtttggaaag
ttctatgagatgccaagctgtgcaggtgatcaaatgcatgtgcaggctcc
agattctctgccactaagtctgtatacccacaatatcccacactgtacct
ccacagtctaaccctaaggccccacaccacgagctccccaatcagggagg
cagttagcattttcttgtctgatcagcaatttcactgggcagacctccta
ctgaaagggcccacttactgcacacgcagatgtaaggggccagtgggacc
cacgatttctttctcactattgcctctcaaggcttttcttcattttgttt
gctgctgcaatttcttccttgttcaagactttctatatgttcttcagatc
catcttcctacaacactaaaatctgacactgaaacttctttgtaactttc
tttggtctggtgtctgtgggtgatattttgcacacacactcaaacttacc
catgctgctctgcttctcagctttggtagctattccccaaggcttcatca
aatgcacttgtccttctataggttatctgtgggtacaatccacttagaac
atccctgcttcagtgagagagactgacctaatctctgaactggcatgggt
aaattgtctcaatggcgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_14766427_14767562
seq2: B6Ng01-084E08.b_47_1165

seq1  GAATTCATCTTCCAGCATTTTTTAGTTTTGATGACCTACAAGAATGTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTCCAGCATTTTTTAGTTTTGATGACCTACAAGAATGTATT  50

seq1  GCATAACAGAAGTAAATAATTAATAGTAAGTATTATTCCCAAGGACCATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAACAGAAGTAAATAATTAATAGTAAGTATTATTCCCAAGGACCATA  100

seq1  AATACGGGCTGGTGAAACCTTGCATAGCAAAGCATTTGTTCTTTAGGATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACGGGCTGGTGAAACCTTGCATAGCAAAGCATTTGTTCTTTAGGATG  150

seq1  ACAAGGAGGTGAGTGTTCACTCCAGTTTCTGCCCCTTGAGATGGAAAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGAGGTGAGTGTTCACTCCAGTTTCTGCCCCTTGAGATGGAAAAGC  200

seq1  TGCCTGTTGGTATTTTATGTAGGGTTACACAAGTAAGGACTGAAATTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTTGGTATTTTATGTAGGGTTACACAAGTAAGGACTGAAATTTCT  250

seq1  CCATCAGTAGACCATGTGGGTCATGGAACTTGCTGAAAATTATGTTCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCAGTAGACCATGTGGGTCATGGAACTTGCTGAAAATTATGTTCTGA  300

seq1  AGGTGGCCTTTCAAACCAGAACTTAACAACAACTGGTGCCAGGTTTCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGCCTTTCAAACCAGAACTTAACAACAACTGGTGCCAGGTTTCCCT  350

seq1  TTTTATATATTTAAAAAGTTTAGATGGAAATATGATTCAGTAAGAGGCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATATATTTAAAAAGTTTAGATGGAAATATGATTCAGTAAGAGGCTA  400

seq1  CAATGAGTCAGCAAGGACTCCCAAAGGAGGCCATGAACCCTGTAGAGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGTCAGCAAGGACTCCCAAAGGAGGCCATGAACCCTGTAGAGAGT  450

seq1  CTAACAGAGACCTCTGCTGGCTGACTTTTGGGCTTCTTGACTGGTAGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACAGAGACCTCTGCTGGCTGACTTTTGGGCTTCTTGACTGGTAGTTA  500

seq1  CCAACACAGCCTTGCCATCTCTAACATGCTTATAAGTATAGTTATGGATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACACAGCCTTGCCATCTCTAACATGCTTATAAGTATAGTTATGGATC  550

seq1  ACTTAAGGGTGGAATACAAGTTGCAAAGTGCATCTACTGATGGTTTCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAGGGTGGAATACAAGTTGCAAAGTGCATCTACTGATGGTTTCATC  600

seq1  ATCATGTGAACTTCACAGACTAAGTTGTCTGTGATGCCATTAGGTTGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGTGAACTTCACAGACTAAGTTGTCTGTGATGCCATTAGGTTGTAT  650

seq1  AAAGTGATGTAAATACATAGTGTTGTTGACCAAGACGTCATTACACGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGATGTAAATACATAGTGTTGTTGACCAAGACGTCATTACACGGCA  700

seq1  TGTGAGCTTAAATATAAATAATAATAATTCTTATGTTTGTCATACAGAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCTTAAATATAAATAATAATAATTCTTATGTTTGTCATACAGAAT  750

seq1  TATTTATTGCTCTTTGGTGTATCAAAGGTATGTTCATGTTTATGTTAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTGCTCTTTGGTGTATCAAAGGTATGTTCATGTTTATGTTAAAA  800

seq1  ATTTTCCTTCTGCATGTGATCAAATTATGCTAATCAAGTTTCAGTTTTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTTCTGCATGTGATCAAATTATGCTAATCAAGTTTCAGTTTTGT  850

seq1  TCAAGCATTGATACAGGAGCTCACATTATAATGTAGAGCAGTGGTTTTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCATTGATACAGGAGCTCACATTATAATGTAGAGCAGTGGTTTTCC  900

seq1  ACCTGGGGGTCTTGACTCCTTTGGGGTTCACATATCAAATATCCTGTGCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGGGGTCTTGACTCCTTTGGGGTTCACATATCAAATATCCTGTGCA  950

seq1  TCATATATTTATATTACTATTCATAACAGTACAGAAATTACAATTATGAA  1000
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||
seq2  TCATATATTTATATTACTATTCAT-ACAGTACAGAAA-TAC-ATTATGAA  997

seq1  ATAGCAACAAAATAATTTTATGGATGGGGCTCACCACAACCTGAAGATCT  1050
      ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  ATAGC-ACAAAATA--TTTATGGATGGGGCTCA-CACAACCTG-AGATCT  1042

seq1  GTATTAAAGGGTCACAGCATTAGGAAGCTTGGAAACCACTGGTATAGAGC  1100
      ||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||||
seq2  GTA-TAAAGGGTCACAGCA-TAG--AGCTTG--AACCACTGGTTTAGAGC  1086

seq1  ATGATGGGCAATTGGACATCTTATTAGCAGATTAGA  1136
      ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGAT-GGCA--TGGACATCTTATTAGCAGAATAGA  1119

seq1: chr19_14919480_14920655
seq2: B6Ng01-084E08.g_67_1234 (reverse)

seq1  CCGCCATTGAGACAATATACACAATGGCAGGTCAGAGATAAAGTCAGTCT  50
      |||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| | ||||||||
seq2  CCGCCATTGAGACAATTTAC-CCATGCCAGTTCAGAGATTAGGTCAGTCT  49

seq1  CATCTCACTGAAAAGCAGGGATG-TCTAAGTTGGATGTGACCCACAGATA  99
      | ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||
seq2  C-TCTCACTG--AAGCAGGGATGTTCTAAG-TGGATTGTACCCACAGATA  95

seq1  ACCTATAGAAAGGACAAGTGCATTTGATGGAGCCCTGGGGGAATAGCTAC  149
      |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||
seq2  ACCTATAG-AAGGACAAGTGCATTTGATGAAG-CCTTGGGGAATAGCTAC  143

seq1  CAGAGCTGGAGAAGCAGAGCAGCATGGGTAAGTTTGAGTGTGTGTGCAAA  199
      || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCT-GAGAAGCAGAGCAGCATGGGTAAGTTTGAGTGTGTGTGCAAA  192

seq1  ATATCACCCACAGACACCAGACCAAAGAAAGTTACAAAGAAGTTTTCAGT  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATATCACCCACAGACACCAGACCAAAGAAAGTTACAAAGAAG-TTTCAGT  241

seq1  GTCAGATTTTAGTGTTGTAGGAAGATGGATCTGAAGAACATATAGAAAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGATTTTAGTGTTGTAGGAAGATGGATCTGAAGAACATATAGAAAGT  291

seq1  CTTGAACAAGGAAGAAATTGCAGCAGCAAACAAAATGAAGAAAAGCCTTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACAAGGAAGAAATTGCAGCAGCAAACAAAATGAAGAAAAGCCTTG  341

seq1  AGAGGCAATAGTGAGAAAGAAATCGTGGGTCCCACTGGCCCCTTACATCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAATAGTGAGAAAGAAATCGTGGGTCCCACTGGCCCCTTACATCT  391

seq1  GCGTGTGCAGTAAGTGGGCCCTTTCAGTAGGAGGTCTGCCCAGTGAAATT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGTGCAGTAAGTGGGCCCTTTCAGTAGGAGGTCTGCCCAGTGAAATT  441

seq1  GCTGATCAGACAAGAAAATGCTAACTGCCTCCCTGATTGGGGAGCTCGTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATCAGACAAGAAAATGCTAACTGCCTCCCTGATTGGGGAGCTCGTG  491

seq1  GTGTGGGGCCTTAGGGTTAGACTGTGGAGGTACAGTGTGGGATATTGTGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGGGCCTTAGGGTTAGACTGTGGAGGTACAGTGTGGGATATTGTGG  541

seq1  GTATACAGACTTAGTGGCAGAGAATCTGGAGCCTGCACATGCATTTGATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACAGACTTAGTGGCAGAGAATCTGGAGCCTGCACATGCATTTGATC  591

seq1  ACCTGCACAGCTTGGCATCTCATAGAACTTTCCAAACCTTGGTGCCTTTC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCACAGCTTGGCATCTCATAGAACTTTCCAAACCTTGGTGCCTTTC  641

seq1  CCAGCACCTCCGGTTGGGTATTTGCAGCTTGCCATTTCTTGCTTGCTATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCTCCGGTTGGGTATTTGCAGCTTGCCATTTCTTGCTTGCTATT  691

seq1  CTAAATATTCAGCTGTCAACCTTTAGGGTGAAATTAGAAGCACTTTAATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATATTCAGCTGTCAACCTTTAGGGTGAAATTAGAAGCACTTTAATT  741

seq1  TCCTCATAACACCTAAATTAAGGTAAGAGTTCTAAATACTTTATTAATAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCATAACACCTAAATTAAGGTAAGAGTTCTAAATACTTTATTAATAA  791

seq1  TGTACACTCTAATTAATAGAAATTACTTTTCCTGCATGTATTATTAAAGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACACTCTAATTAATAGAAATTACTTTTCCTGCATGTATTATTAAAGG  841

seq1  AGGTGTTCCAACACGACTTTTTATGTTTTCCAATTTACTTGCTTAGCAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTCCAACACGACTTTTTATGTTTTCCAATTTACTTGCTTAGCAAG  891

seq1  CTGGCTGGGGTTTTAGCATCTTACCTCAGACCATCCTCATCAATTCTACC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGGGTTTTAGCATCTTACCTCAGACCATCCTCATCAATTCTACC  941

seq1  GACTCTTCATTTGGGAGAGGTGTGGGGAACACTTGGAATTTGAGGGAAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTTCATTTGGGAGAGGTGTGGGGAACACTTGGAATTTGAGGGAAAG  991

seq1  CTTCGCTCCATTTCTCATCTGCTCCCTGTGAAATGATCTCCCTTTGAAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCGCTCCATTTCTCATCTGCTCCCTGTGAAATGATCTCCCTTTGAAAT  1041

seq1  TAATTTTTTTCCACGTATAACCAACATGAGATACCTGAGGCCAAATTTTT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTTTCCACGTATAACCAACATGAGATACCTGAGGCCAAATTTTT  1091

seq1  GCCTTGCAAATGCCCATTCTTTACATCTTTAGATGACAATTCTACATTTC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGCAAATGCCCATTCTTTACATCTTTAGATGACAATTCTACATTTC  1141

seq1  TGAATAAGAGGAAAAAAACTGGAATTC  1176
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAAGAGGAAAAAAACTGGAATTC  1168