BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091E12
Chromosome19 (Build37)
Map Location 32,808,291 - 32,936,995
singlet/doubletdoublet
Overlap genePten, B430203M17Rik
Upstream genePrkg1, 1810073H04Rik, Asah2, EG668042, Sgms1, 2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1
Downstream gene6530404N21Rik, LOC638381, EG668095, LOC628236, AI747699, EG668106, EG668112, EG668114, EG329055, EG433241, LOC668127
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091E12.bB6Ng01-091E12.g
ACCDH903349DH903350
length1,1981,007
definitionDH903349|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091E12, 5' end.DH903350|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091E12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,935,777 - 32,936,995)(32,808,291 - 32,809,294)
sequence
gaattctctttaatttttttttaaaactgtctgtacatatttaaaccaca
tcgaagaatttagtgacagagtttaacaggcataggctaacacgtctctc
ctagagcagacatgaataattcagtcacattttagcaataacgaaagtat
ctttccgtgccttcctaaactgaaaaagactgtgcttaaatctgatcata
attccccagctgactctttgaggtgtctcagaatatgtcaagaatggcca
ccctcccttaacccttcctcctcttccctctcccctcccttttgaacttc
atgttccccaaaggcaccatcagcttccaacattacaagccagctgtttc
cagggcagaggcactctttgcaagccctcgtgagctattcagcaaatttc
tcatttcctccccttctttccctttatttaaactacagtattttcttagc
atatgatcttgaaccaggcctcctgatgtctaccccctgctaaccatcag
aactgatgtcccttagggcagttaatgaaccaatccccagctcccctgac
tctctttgacctaccagaggcatttcaaaggttaattcctccttcccttc
ctggttccctgttatgaatcgtaatgtaaatatttgacatgcaggatatc
tgatattccaaccctatgaaagagtcgtttgacccccaaagaggtcacag
tccacaggttgagaaccgatgcatgaaaagctactcggtgaatggggctc
tgaacgcttctaggtccagatgaatcctggcaagaaaacccttgtaagtg
acttctggcacatccgagcttgactataatgtacacatgcacgtggaggt
cagaggtcaatatcctcttacctccaattatccttctttaccttagtttt
agagacagggtctctcgctgagcatagaagtcatcaatttgggtagactg
gccagtcagtgagttttggatcctctgtctctggatctccaatactagga
ttgggggctacataccgtgccagcatttgactgaactcaagtcctcatgc
ttccacaagcatttacaactgagccgcttggagtctcattccctataatt
attttcttctttcatttgttcttccattttagaattgaacaaaagtaaag
atgatccatcaccatggcctattggaagtcaggtggaccttggaggca
gaattcactgaaatcagaaaactggttataatgtaataggacaaggtgag
ggatgttccaggcccagcaagcaatggaacatggcagcttcagccatgtg
gctctgactttagaggtaagactagacggggttactggaacaactgagtg
ctggttagctggggctaagaaattagtagtaattaaaaagagaccagcat
cactgagatgaaatcttctgggaagtgtcttctgaaagcacaaagaagct
gtgttccaaagatattcaaggttgtacctcatgctgaagatgaactttgt
aatgtgtaagaatcacccaggtggtactggtcttgaaggcatgaagaaat
catggagagccgctgaggcttggcactatgagaggccatgtaaggccatt
ggtgaaggtacagcctcagttgcagttgatagcccaggactgaaggagtc
atacaaagaagttaaggcttggtatcatgaagagagcctatgaaggctat
tggagattcatctgaacaagcctatgagggctagggatgtggtggtttga
atatgcttcacccagggagtggtgctattaggagtgtggccttgttggag
cagggatagccttgttggaggaagtgtgtcaccatgggactggaggtggg
gggcaggtggctttgagacccttcatgattctgctcttggcttcctttgg
ataaagatgtagaactcttagatcctctagtaccatgcctgtctggacgg
tgccgtgcttctcgccatgatgataatggactgaatcactgaacctgtaa
gtcagccccaataaaatgttttccttttttaagagttgccttgggttggg
aggcagaggcaggtggatttctgagttcgaggccagcctggtctacagag
tgagtgccaggacagccagggctacacagagaaatcctgtcttgaaaaac
aaaacaaacaaacaaaaagagttgccttggtcatggtgtctctcgagcat
ggaaacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_32935777_32936995
seq2: B6Ng01-091E12.b_45_1242 (reverse)

seq1  TGCCTCCCACATGTCCACCTGACTCTCAAATTAGCCATGGTGATGGGATC  50
      |||||||   | |||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||
seq2  TGCCTCC--AAGGTCCACCTGACT-TCCAATAGGCCATGGTGAT-GGATC  46

seq1  ACTCTTTACTTTTGTTCAATTTCTTAAAAATGAAAGAACAAAATGGAAAG  100
      | ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||  || 
seq2  A-TCTTTACTTTTGTTCAA-TTCT--AAAATGGAAGAAC-AAATG--AAA  89

seq1  GAAGAGAATACATTATAGGGAATGAGACTGCAAGGCGGCTCAGTTGGTAA  150
      ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |
seq2  GAAGAAAATA-ATTATAGGGAATGAGACTCCAA-GCGGCTCAGTTG--TA  135

seq1  AATGCTTGTGGAAGCATGAGGACTTGAGGTTCAGTCAAATGCTGGGCACG  200
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  AATGCTTGTGGAAGCATGAGGACTTGA-GTTCAGTCAAATGCT-GGCACG  183

seq1  GTTATGTAGCCCCCCAATCCTAGTATTGGAGATCCAGAGACAGGAGGATC  250
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  G-TATGTAG-CCCCCAATCCTAGTATTGGAGATCCAGAGACA-GAGGAT-  229

seq1  CCAAAACTCACTGACTGGCCAGTCTACCCAAATTGATGACTTCTATGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAACTCACTGACTGGCCAGTCTACCCAAATTGATGACTTCTATGCTC  279

seq1  AGCGAGAGACCCTGTCTCTAAAACTAAGGTAAAGAAGGATAATTGGAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAGAGACCCTGTCTCTAAAACTAAGGTAAAGAAGGATAATTGGAGGT  329

seq1  AAGAGGATATTGACCTCTGACCTCCACGTGCATGTGTACATTATAGTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGATATTGACCTCTGACCTCCACGTGCATGTGTACATTATAGTCAA  379

seq1  GCTCGGATGTGCCAGAAGTCACTTACAAGGGTTTTCTTGCCAGGATTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGGATGTGCCAGAAGTCACTTACAAGGGTTTTCTTGCCAGGATTCAT  429

seq1  CTGGACCTAGAAGCGTTCAGAGCCCCATTCACCGAGTAGCTTTTCATGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCTAGAAGCGTTCAGAGCCCCATTCACCGAGTAGCTTTTCATGCA  479

seq1  TCGGTTCTCAACCTGTGGACTGTGACCTCTTTGGGGGTCAAACGACTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTTCTCAACCTGTGGACTGTGACCTCTTTGGGGGTCAAACGACTCTT  529

seq1  TCATAGGGTTGGAATATCAGATATCCTGCATGTCAAATATTTACATTACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGGGTTGGAATATCAGATATCCTGCATGTCAAATATTTACATTACG  579

seq1  ATTCATAACAGGGAACCAGGAAGGGAAGGAGGAATTAACCTTTGAAATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAACAGGGAACCAGGAAGGGAAGGAGGAATTAACCTTTGAAATGC  629

seq1  CTCTGGTAGGTCAAAGAGAGTCAGGGGAGCTGGGGATTGGTTCATTAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTAGGTCAAAGAGAGTCAGGGGAGCTGGGGATTGGTTCATTAACT  679

seq1  GCCCTAAGGGACATCAGTTCTGATGGTTAGCAGGGGGTAGACATCAGGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTAAGGGACATCAGTTCTGATGGTTAGCAGGGGGTAGACATCAGGAG  729

seq1  GCCTGGTTCAAGATCATATGCTAAGAAAATACTGTAGTTTAAATAAAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGTTCAAGATCATATGCTAAGAAAATACTGTAGTTTAAATAAAGGG  779

seq1  AAAGAAGGGGAGGAAATGAGAAATTTGCTGAATAGCTCACGAGGGCTTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGGGGAGGAAATGAGAAATTTGCTGAATAGCTCACGAGGGCTTGC  829

seq1  AAAGAGTGCCTCTGCCCTGGAAACAGCTGGCTTGTAATGTTGGAAGCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTGCCTCTGCCCTGGAAACAGCTGGCTTGTAATGTTGGAAGCTGA  879

seq1  TGGTGCCTTTGGGGAACATGAAGTTCAAAAGGGAGGGGAGAGGGAAGAGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCCTTTGGGGAACATGAAGTTCAAAAGGGAGGGGAGAGGGAAGAGG  929

seq1  AGGAAGGGTTAAGGGAGGGTGGCCATTCTTGACATATTCTGAGACACCTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGGTTAAGGGAGGGTGGCCATTCTTGACATATTCTGAGACACCTC  979

seq1  AAAGAGTCAGCTGGGGAATTATGATCAGATTTAAGCACAGTCTTTTTCAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTCAGCTGGGGAATTATGATCAGATTTAAGCACAGTCTTTTTCAG  1029

seq1  TTTAGGAAGGCACGGAAAGATACTTTCGTTATTGCTAAAATGTGACTGAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGAAGGCACGGAAAGATACTTTCGTTATTGCTAAAATGTGACTGAA  1079

seq1  TTATTCATGTCTGCTCTAGGAGAGACGTGTTAGCCTATGCCTGTTAAACT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCATGTCTGCTCTAGGAGAGACGTGTTAGCCTATGCCTGTTAAACT  1129

seq1  CTGTCACTAAATTCTTCGATGTGGTTTAAATATGTACAGACAGTTTTAAA  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACTAAATTCTTCGATGTGGTTTAAATATGTACAGACAGTTTTAAA  1179

seq1  AAAAAATTAAAGAGAATTC  1219
      |||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATTAAAGAGAATTC  1198

seq1: chr19_32808291_32809294
seq2: B6Ng01-091E12.g_78_1074

seq1  AAATCAGAAAACTGGTTATAATGTAATAGGACAAGGTGAGGGATGTTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGAAAACTGGTTATAATGTAATAGGACAAGGTGAGGGATGTTCCA  50

seq1  GGCCCAGCAAGCAATGGAACATGGCAGCTTCAGCCATGTGGCTCTGACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCAGCAAGCAATGGAACATGGCAGCTTCAGCCATGTGGCTCTGACTT  100

seq1  TAGAGGTAAGACTAGACGGGGTTACTGGAACAACTGAGTGCTGGTTAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTAAGACTAGACGGGGTTACTGGAACAACTGAGTGCTGGTTAGCT  150

seq1  GGGGCTAAGAAATTAGTAGTAATTAAAAAGAGACCAGCATCACTGAGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTAAGAAATTAGTAGTAATTAAAAAGAGACCAGCATCACTGAGATG  200

seq1  AAATCTTCTGGGAAGTGTCTTCTGAAAGCACAAAGAAGCTGTGTTCCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTCTGGGAAGTGTCTTCTGAAAGCACAAAGAAGCTGTGTTCCAAA  250

seq1  GATATTCAAGGTTGTACCTCATGCTGAAGATGAACTTTGTAATGTGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTCAAGGTTGTACCTCATGCTGAAGATGAACTTTGTAATGTGTAAG  300

seq1  AATCACCCAGGTGGTACTGGTCTTGAAGGCATGAAGAAATCATGGAGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACCCAGGTGGTACTGGTCTTGAAGGCATGAAGAAATCATGGAGAGC  350

seq1  CGCTGAGGCTTGGCACTATGAGAGGCCATGTAAGGCCATTGGTGAAGGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGAGGCTTGGCACTATGAGAGGCCATGTAAGGCCATTGGTGAAGGTA  400

seq1  CAGCCTCAGTTGCAGTTGATAGCCCAGGACTGAAGGAGTCATACAAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTCAGTTGCAGTTGATAGCCCAGGACTGAAGGAGTCATACAAAGAA  450

seq1  GTTAAGGCTTGGTATCATGAAGAGAGCCTATGAAGGCTATTGGAGATTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGGCTTGGTATCATGAAGAGAGCCTATGAAGGCTATTGGAGATTCA  500

seq1  TCTGAACAAGCCTATGAGGGCTAGGGATGTGGTGGTTTGAATATGCTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACAAGCCTATGAGGGCTAGGGATGTGGTGGTTTGAATATGCTTCA  550

seq1  CCCAGGGAGTGGTGCTATTAGGAGTGTGGCCTTGTTGGAGCAGGGATAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGGAGTGGTGCTATTAGGAGTGTGGCCTTGTTGGAGCAGGGATAGC  600

seq1  CTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACCATGGGACTGGAGGTGGGGGGCAGGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACCATGGGACTGGAGGTGGGGGGCAGGTGG  650

seq1  CTTTGAGACCCTTCATGATTCTGCTCTTGGCTTCCTTTGGATAAAGATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGACCCTTCATGATTCTGCTCTTGGCTTCCTTTGGATAAAGATGT  700

seq1  AGAACTCTTAGATCCTCTAGTACCATGCCTGTCTGGACGGTGCCGTGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCTTAGATCCTCTAGTACCATGCCTGTCTGGACGGTGCCGTGCTT  750

seq1  CTCGCCATGATGATAATGGACTGAATCACTGAACCTGTAAGTCAGCCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCCATGATGATAATGGACTGAATCACTGAACCTGTAAGTCAGCCCCA  800

seq1  ATAAAATGTTTTCCTTTTTTAAGAGTTGCCTT-GGTTGGGAGGCAGAGGC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATAAAATGTTTTCCTTTTTTAAGAGTTGCCTTGGGTTGGGAGGCAGAGGC  850

seq1  AGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTGCCAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTGCCAG  900

seq1  GACAGCCAGGGCTACACAGAGAAATCCTGTCTTGAAAAAAACAAAACAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||
seq2  GACAGCCAGGGCTACACAGAGAAATCCTGTCTTG--AAAAACAAAAC-AA  947

seq1  ACAAAACAAAAAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTCCTCAAAGCAATGG  999
      |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||
seq2  ACAAA--CAAAAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCT-CTC-GAGC-ATGG  992

seq1  AAACC  1004
      |||||
seq2  AAACC  997