BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097M06
Chromosome19 (Build37)
Map Location 16,466,420 - 16,598,839
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGna14, LOC666665
Upstream geneLOC667482, Psat1, LOC100041424, Cep78, LOC100042048, Gnaq, E030024N20Rik, LOC624438
Downstream geneVps13a, Foxb2, A230083H22Rik, Gcnt1, Rfk, Pcsk5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097M06.bB6Ng01-097M06.g
ACCDH908046DH908047
length1,009539
definitionDH908046|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097M06, 5' end.DH908047|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097M06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,466,420 - 16,467,061)(16,598,295 - 16,598,839)
sequence
gaattcaacactgagaaaccaatttagtgatgctgaatataagcagttaa
agactccctctgacaaaaccatcctgtaggagggtaagatggcagaagaa
tgcatgcaaatgtcataaggagtcatactgagaaaaaaactaatacatgt
aagtctgtgtataaatatacaatgtgtaatgtaagtgaattttctcatct
gggttgacaatgcaccctccaagagccaaagaccacctaacagccccaac
aggaagcctaagacgctttcttttgagttgttggtcagggctgtccaaga
gatgccctaacattacagattaatgctgttgcccttgattgattgtcctc
ccccaagggatggaaggacagtcgctactgttgaagacactgtgcactgt
aggcacagggtccagatgcccctaagctggaactgacctgcatgcctgct
ccctgaggactagcttccatagtgacagaaggtgccatgtgagcttgtga
agcatagagacagccaacagtcctagctatgaggcccatgaaccacaaca
accaacatggcaagataaccatgttgcagtaatgacatacattcctttac
atagctctctaattggacttaagacccacccaacaaaaggaaaatcgctc
ctggtactggaaacctagccacctacccatggctactgaagtcatgggtc
ttgaaagagaatctacaaccaccactttaccatcataatccctaactgtg
ctctaaatatttgtccttatatacccacaggtaaatgtaatccttacccc
tcatcaatgacatgtctctttgcacagacggagaccactccagaaaaacc
acaaccaaatcaaaatgcagaattgtggtgcctagtcccagtggatatga
gtacaaaacaattcctgaacttaagcgcctggaacattgtagaagatggg
gctaaatgattctagagctcgagggtcgggagtctgctatgagactttgt
agtaatgtc
acctgctgaaggagactgactcctggttgatttacaaaaagggcaaacgc
acgtgttttcgtgaatggctgtagagcctcccacatatcactgctacttc
tgaaaataagcaccccttcccattcttacagtaacatccactgagaaatc
ctagcatcagggcactggtagggagtggctcagagcctgtggagggtgct
gaggccacactaacattagaacaactgactccaagagagcctgcagtcag
aactgccctggcacatcgtgacaaccgttccagagttggatatgttgtga
gtggaaggaaagtgaactctggaagagcagttagtgctcttaaccgctga
gccatctctccagccctatttatttcattttcaaaaacaaccgaaagatt
catattatctttggtggttacttttggtttgttatcctgacttgattgag
tgaagcctggaaaatagataccaagatgtaggatggttgtaaatatactg
gatgatgtggaaagggagtttgtgggaggaagatggaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_16466420_16467061
seq2: B6Ng01-097M06.b_46_687

seq1  GAATTCAACACTGAGAAACCAATTTAGTGATGCTGAATATAAGCAGTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACACTGAGAAACCAATTTAGTGATGCTGAATATAAGCAGTTAA  50

seq1  AGACTCCCTCTGACAAAACCATCCTGTAGGAGGGTAAGATGGCAGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCCCTCTGACAAAACCATCCTGTAGGAGGGTAAGATGGCAGAAGAA  100

seq1  TGCATGCAAATGTCATAAGGAGTCATACTGAGAAAAAAACTAATACATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCAAATGTCATAAGGAGTCATACTGAGAAAAAAACTAATACATGT  150

seq1  AAGTCTGTGTATAAATATACAATGTGTAATGTAAGTGAATTTTCTCATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTGTGTATAAATATACAATGTGTAATGTAAGTGAATTTTCTCATCT  200

seq1  GGGTTGACAATGCACCCTCCAAGAGCCAAAGACCACCTAACAGCCCCAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGACAATGCACCCTCCAAGAGCCAAAGACCACCTAACAGCCCCAAC  250

seq1  AGGAAGCCTAAGACGCTTTCTTTTGAGTTGTTGGTCAGGGCTGTCCAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCCTAAGACGCTTTCTTTTGAGTTGTTGGTCAGGGCTGTCCAAGA  300

seq1  GATGCCCTAACATTACAGATTAATGCTGTTGCCCTTGATTGATTGTCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCCTAACATTACAGATTAATGCTGTTGCCCTTGATTGATTGTCCTC  350

seq1  CCCCAAGGGATGGAAGGACAGTCGCTACTGTTGAAGACACTGTGCACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAGGGATGGAAGGACAGTCGCTACTGTTGAAGACACTGTGCACTGT  400

seq1  AGGCACAGGGTCCAGATGCCCCTAAGCTGGAACTGACCTGCATGCCTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACAGGGTCCAGATGCCCCTAAGCTGGAACTGACCTGCATGCCTGCT  450

seq1  CCCTGAGGACTAGCTTCCATAGTGACAGAAGGTGCCATGTGAGCTTGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGGACTAGCTTCCATAGTGACAGAAGGTGCCATGTGAGCTTGTGA  500

seq1  AGCATAGAGACAGCCAACAGTCCTAGCTATGAGGCCCATGAACCACAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGAGACAGCCAACAGTCCTAGCTATGAGGCCCATGAACCACAACA  550

seq1  ACCAACATGGCAAGATAACCATGTTGCAGTAATGACATACATTCCTTTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAACATGGCAAGATAACCATGTTGCAGTAATGACATACATTCCTTTAC  600

seq1  ATAGCTCTCTAATTGGACTTAAGACCCACCCAACAAAAGGAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTCTCTAATTGGACTTAAGACCCACCCAACAAAAGGAA  642

seq1: chr19_16598295_16598839
seq2: B6Ng01-097M06.g_71_615 (reverse)

seq1  CTTCCATCTTCCTCCCACAAACTCCCTTTCCACATCATCCAGTATATTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATCTTCCTCCCACAAACTCCCTTTCCACATCATCCAGTATATTTA  50

seq1  CAACCATCCTACATCTTGGTATCTATTTTCCAGGCTTCACTCAATCAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATCCTACATCTTGGTATCTATTTTCCAGGCTTCACTCAATCAAGT  100

seq1  CAGGATAACAAACCAAAAGTAACCACCAAAGATAATATGAATCTTTCGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATAACAAACCAAAAGTAACCACCAAAGATAATATGAATCTTTCGGT  150

seq1  TGTTTTTGAAAATGAAATAAATAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGGTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTGAAAATGAAATAAATAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGGTTAA  200

seq1  GAGCACTAACTGCTCTTCCAGAGTTCACTTTCCTTCCACTCACAACATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTAACTGCTCTTCCAGAGTTCACTTTCCTTCCACTCACAACATAT  250

seq1  CCAACTCTGGAACGGTTGTCACGATGTGCCAGGGCAGTTCTGACTGCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCTGGAACGGTTGTCACGATGTGCCAGGGCAGTTCTGACTGCAGG  300

seq1  CTCTCTTGGAGTCAGTTGTTCTAATGTTAGTGTGGCCTCAGCACCCTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTGGAGTCAGTTGTTCTAATGTTAGTGTGGCCTCAGCACCCTCCA  350

seq1  CAGGCTCTGAGCCACTCCCTACCAGTGCCCTGATGCTAGGATTTCTCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTCTGAGCCACTCCCTACCAGTGCCCTGATGCTAGGATTTCTCAGT  400

seq1  GGATGTTACTGTAAGAATGGGAAGGGGTGCTTATTTTCAGAAGTAGCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTTACTGTAAGAATGGGAAGGGGTGCTTATTTTCAGAAGTAGCAGT  450

seq1  GATATGTGGGAGGCTCTACAGCCATTCACGAAAACACGTGCGTTTGCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGTGGGAGGCTCTACAGCCATTCACGAAAACACGTGCGTTTGCCCT  500

seq1  TTTTGTAAATCAACCAGGAGTCAGTCTCCTTCAGCAGGTGAATTC  545
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAAATCAACCAGGAGTCAGTCTCCTTCAGCAGGTGAATTC  545