BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147K14
Chromosome19 (Build37)
Map Location 27,060,975 - 27,180,192
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042576
Upstream gene1700048O14Rik, LOC100041846, LOC100041857, Smarca2, Gm815
Downstream geneVldlr, LOC100042588, Kcnv2, D19Bwg1357e, LOC667868, LOC100042612, Rfx3, LOC666997, LOC433235
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147K14.bB6Ng01-147K14.g
ACCDH944480DH944481
length9621,086
definitionDH944480|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147K14, 5' end.DH944481|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,060,975 - 27,061,816)(27,179,094 - 27,180,192)
sequence
gaattctggtgggccgagcgtaacaagtccctaggatctatgtcatggag
atgtcattaaagcacactgagatgtctttgcctccagatatcctcagcaa
ataggcaaacaaaatccttgcacattcagtagtgtctgtctgtgatgtgc
cactggcatacaccttttaggaagtgacctaggatgctcaatgaatcata
acaacagctaacccatgccctgtgtctatttctgcatacaaactcatcag
tctgcatgcaggcagagaggtggttgtgagagggagcaacatactgaaga
tttgacagggtgtttgcaagattcttcctggattgcagtaagagtcacag
gtcttcagaggaagagaacacacatacacaggaggaggagagaggcaaaa
taaggaactgaccatggggccatggtggcagcatggccccacagtctgac
atttgtgagctggaagcaaagggaagatggaggtgtagattcagtcctga
ttaaagggcatgaagtctagggaagccgatgttatgtcttggtccaaggg
cacaagactgatgtcccatctcaagcagttaggagaaaagatacatataa
aatgtccttttccttgcttcttcattccattcaagcctcaatggcttgca
ccacacaggagcacatctgtgcatgcttgcatacacacatgcacacacac
acacacacacacacacactgtgcagggcaatctgccttattgagtccact
gattcaaatggtaatcttatctgaaaacaccccccccacacacacacaca
cacgagacattctgtttaatccaaccacatggcatagtcaaggtgacata
tacttttagtcatcagtacacaaatgagtcctgtgaaaggacagatagaa
gttattttagccttgtagtgccatctgggtttctattcacaattacacca
acaccaccgctg
gaattcaacagtggattctggaaaagatggagcagggataattcagcccc
taacaacatcatctgtctaaagacagtgcaactcagttctttaacacccc
tattagcttttattcctgtcatactaatttcaatagtctcgtttcccact
ttctcttaccctgagatagcataccggagtgtagttataactaagaattt
tcacagacgcttcaaagaattcaatttaggggaaaataaagccgaaacaa
attccaggcagcaatgactattattaatatggcccagaaatactcatttg
ggggataaacatgaacttttcattactccgtgatggatagatgatgttga
aatttgtaggcataatttttaagaattattttataagctgtattttgtta
ttaaattgtgataatgagaacatgtctgttcccccgaccccctttgggtc
tctttacttctgagagatgagatcccccatggagggaagcttcatctcct
gatgtacctcgggtacacttttggcaggaccatagccaatacaggcatta
cattcatctaaaatggttttgtcagtggaaggatgctgaaaccatccata
ggagaggaggaggcagctatatcagtttagtgctctgtagaggctcacct
gcacatttgctagaatatagttttcttgtgttggaccaaatggtctcttg
gggaaggatgctctaaataaggcaaatatgtctttcagccatatgctggt
agtcaaggtcatcagcctcacatcaatctaagatgttttgatttgtggcc
tctgaaaataaatataagaatgttgaactccactccatagactccattct
tccttgtcttgtgtggcccaaggtgcttgctggaagtgggtggctactgg
caacaccactatgctccttctgagcccacagtcaaatcttcttagacttg
caagcttcatcaggcacatcggcagtattcatggctgagactttcctccc
aaccacatgctcagggaagcttgttgaactaaccataacactagacatgt
ttcttgtggaacctgtagtgtcagaagagctgtatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_27060975_27061816
seq2: B6Ng01-147K14.b_48_889

seq1  GAATTCTGGTGGGCCGAGCGTAACAAGTCCCTAGGATCTATGTCATGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGTGGGCCGAGCGTAACAAGTCCCTAGGATCTATGTCATGGAG  50

seq1  ATGTCATTAAAGCACACTGAGATGTCTTTGCCTCCAGATATCCTCAGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCATTAAAGCACACTGAGATGTCTTTGCCTCCAGATATCCTCAGCAA  100

seq1  ATAGGCAAACAAAATCCTTGCACATTCAGTAGTGTCTGTCTGTGATGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCAAACAAAATCCTTGCACATTCAGTAGTGTCTGTCTGTGATGTGC  150

seq1  CACTGGCATACACCTTTTAGGAAGTGACCTAGGATGCTCAATGAATCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGCATACACCTTTTAGGAAGTGACCTAGGATGCTCAATGAATCATA  200

seq1  ACAACAGCTAACCCATGCCCTGTGTCTATTTCTGCATACAAACTCATCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAGCTAACCCATGCCCTGTGTCTATTTCTGCATACAAACTCATCAG  250

seq1  TCTGCATGCAGGCAGAGAGGTGGTTGTGAGAGGGAGCAACATACTGAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCATGCAGGCAGAGAGGTGGTTGTGAGAGGGAGCAACATACTGAAGA  300

seq1  TTTGACAGGGTGTTTGCAAGATTCTTCCTGGATTGCAGTAAGAGTCACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAGGGTGTTTGCAAGATTCTTCCTGGATTGCAGTAAGAGTCACAG  350

seq1  GTCTTCAGAGGAAGAGAACACACATACACAGGAGGAGGAGAGAGGCAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGAGGAAGAGAACACACATACACAGGAGGAGGAGAGAGGCAAAA  400

seq1  TAAGGAACTGACCATGGGGCCATGGTGGCAGCATGGCCCCACAGTCTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAACTGACCATGGGGCCATGGTGGCAGCATGGCCCCACAGTCTGAC  450

seq1  ATTTGTGAGCTGGAAGCAAAGGGAAGATGGAGGTGTAGATTCAGTCCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGAGCTGGAAGCAAAGGGAAGATGGAGGTGTAGATTCAGTCCTGA  500

seq1  TTAAAGGGCATGAAGTCTAGGGAAGCCGATGTTATGTCTTGGTCCAAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGGCATGAAGTCTAGGGAAGCCGATGTTATGTCTTGGTCCAAGGG  550

seq1  CACAAGACTGATGTCCCATCTCAAGCAGTTAGGAGAAAAGATACATATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGACTGATGTCCCATCTCAAGCAGTTAGGAGAAAAGATACATATAA  600

seq1  AATGTCCTTTTCCTTGCTTCTTCATTCCATTCAAGCCTCAATGGCTTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCCTTTTCCTTGCTTCTTCATTCCATTCAAGCCTCAATGGCTTGCA  650

seq1  CCACACAGGAGCACATCTGTGCATGCTTGCATACACACATGCACACACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAGGAGCACATCTGTGCATGCTTGCATACACACATGCACACACAC  700

seq1  ACACACACACACACACACTGTGCAGGGCAATCTGCCTTATTGAGTCCACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACTGTGCAGGGCAATCTGCCTTATTGAGTCCACT  750

seq1  GATTCAAATGGTAATCTTATCTGAAAACACCCCCCCCACACACACACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAAATGGTAATCTTATCTGAAAACACCCCCCCCACACACACACACA  800

seq1  CACGAGACATTCTGTTTAATCCAACCACATGGCATAGTCAAG  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGAGACATTCTGTTTAATCCAACCACATGGCATAGTCAAG  842

seq1: chr19_27179094_27180192
seq2: B6Ng01-147K14.g_69_1154 (reverse)

seq1  AATACAGCTTACTTCTGGACACTTACAGGTTCCCACAAGAAACATGTTCT  50
      |||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   
seq2  AATACAGCT--CTTCT-GACAC-TACAGGTT-CCACAAGAAACATGTCTA  45

seq1  GTGTTATGGGTTAGTTTCAACAGCCTTCCCTGAGCATGTGGGTTGGGGAG  100
      ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | |||||
seq2  GTGTTAT-GGTTAG-TTCAACAAGCTTCCCTGAGCATGTGG--TTGGGAG  91

seq1  GAAAGTCCTCAGCCATGAAATACTGCCGATGTGCCTGATGAAGCCTTGCA  150
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAAAGT-CTCAGCCATG-AATACTGCCGATGTGCCTGATGAAG-CTTGCA  138

seq1  AGTCTAAGAAGATTTTGACTGTGGGCTCAGAAGGAGCATAGTGGTGTTTG  200
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGTCTAAGAAGA-TTTGACTGTGGGCTCAGAAGGAGCATAGTGGTG-TTG  186

seq1  CCAGTAGCCACCCACTTCCAGCAAGCACCTTGGGCCACACAAGACAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAGCCACCCACTTCCAGCAAGCACCTTGGGCCACACAAGACAAGGA  236

seq1  AGAATGGAGTCTATGGAGTGGAGTTCAACATTCTTATATTTATTTTCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGAGTCTATGGAGTGGAGTTCAACATTCTTATATTTATTTTCAGA  286

seq1  GGCCACAAATCAAAACATCTTAGATTGATGTGAGGCTGATGACCTTGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACAAATCAAAACATCTTAGATTGATGTGAGGCTGATGACCTTGACT  336

seq1  ACCAGCATATGGCTGAAAGACATATTTGCCTTATTTAGAGCATCCTTCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCATATGGCTGAAAGACATATTTGCCTTATTTAGAGCATCCTTCCC  386

seq1  CAAGAGACCATTTGGTCCAACACAAGAAAACTATATTCTAGC-AATGTGC  449
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAAGAGACCATTTGGTCCAACACAAGAAAACTATATTCTAGCAAATGTGC  436

seq1  AGGTGAGCCTCTACAGAGCACTAAACTGATATAGCTGCCTCCTCCTCTCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGCCTCTACAGAGCACTAAACTGATATAGCTGCCTCCTCCTCTCC  486

seq1  TATGGATGGTTTCAGCATCCTTCCACTGACAAAACCATTTTAGATGAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATGGTTTCAGCATCCTTCCACTGACAAAACCATTTTAGATGAATG  536

seq1  TAATGCCTGTATTGGCTATGGTCCTGCCAAAAGTGTACCCGAGGTACATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCCTGTATTGGCTATGGTCCTGCCAAAAGTGTACCCGAGGTACATC  586

seq1  AGGAGATGAAGCTTCCCTCCATGGGGGATCTCATCTCTCAGAAGTAAAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATGAAGCTTCCCTCCATGGGGGATCTCATCTCTCAGAAGTAAAGA  636

seq1  GACCCAAAGGGGGTCGGGGGAACAGACATGTTCTCATTATCACAATTTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAAAGGGGGTCGGGGGAACAGACATGTTCTCATTATCACAATTTAA  686

seq1  TAACAAAATACAGCTTATAAAATAATTCTTAAAAATTATGCCTACAAATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAAATACAGCTTATAAAATAATTCTTAAAAATTATGCCTACAAATT  736

seq1  TCAACATCATCTATCCATCACGGAGTAATGAAAAGTTCATGTTTATCCCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACATCATCTATCCATCACGGAGTAATGAAAAGTTCATGTTTATCCCC  786

seq1  CAAATGAGTATTTCTGGGCCATATTAATAATAGTCATTGCTGCCTGGAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAGTATTTCTGGGCCATATTAATAATAGTCATTGCTGCCTGGAAT  836

seq1  TTGTTTCGGCTTTATTTTCCCCTAAATTGAATTCTTTGAAGCGTCTGTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTCGGCTTTATTTTCCCCTAAATTGAATTCTTTGAAGCGTCTGTGA  886

seq1  AAATTCTTAGTTATAACTACACTCCGGTATGCTATCTCAGGGTAAGAGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTTAGTTATAACTACACTCCGGTATGCTATCTCAGGGTAAGAGAA  936

seq1  AGTGGGAAACGAGACTATTGAAATTAGTATGACAGGAATAAAAGCTAATA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAAACGAGACTATTGAAATTAGTATGACAGGAATAAAAGCTAATA  986

seq1  GGGGTGTTAAAGAACTGAGTTGCACTGTCTTTAGACAGATGATGTTGTTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGTTAAAGAACTGAGTTGCACTGTCTTTAGACAGATGATGTTGTTA  1036

seq1  GGGGCTGAATTATCCCTGCTCCATCTTTTCCAGAATCCACTGTTGAATTC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTGAATTATCCCTGCTCCATCTTTTCCAGAATCCACTGTTGAATTC  1086