BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148B05
Chromosome19 (Build37)
Map Location 33,304,030 - 33,439,385
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6530404N21Rik
Upstream geneSgms1, 2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik
Downstream geneLOC638381, EG668095, LOC628236, AI747699, EG668106, EG668112, EG668114, EG329055, EG433241, LOC668127, Lipf, Lipk, EG383462, Lipn, Ankrd22, Stambpl1, Acta2, Fas
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148B05.bB6Ng01-148B05.g
ACCDH944780DH944781
length1,1741,113
definitionDH944780|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148B05, 5' end.DH944781|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,304,030 - 33,305,232)(33,438,248 - 33,439,385)
sequence
gaattctttaggtacatatgaaaggatgagggacagtaagttgaggctaa
aaggaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaaacacagttatt
tttaccactacccactagcaaatataaactgtaggtaaataaaaaagaag
gcataactagggaactgaaaagacggctcacaagttaagagtgtgtgctg
ttcttgaagtcccgaggttgattaccagcgcgtctaccaggtggctcaca
atggcctataattctatcatgtcagctcgagagtgatcaggcctctatga
cacctgcccccaggtacctaataacccccccgacatacacataattaaaa
gtaaaataattcttgcagcagctccctagtgtagccttcaacataaaaat
aaaataaatcctaaaaagaaagtataggtatatttgtaattatcatattt
aaaagacaggttcataaagcaataaatataaatttacattggtatgtata
taacatattaaatgtgtggtttgtatgaccataaaagcaccagggaaggg
gcagagaataaacaggaggaaagagtttgtataatattaaagttaatata
aacccaaagtgaactggtatacaaatataccattaagatgctaactataa
gcctagggaaactgtactacatcataatcaccaccaccaccaccaccatc
atcatcatcatcatcattattgctactattgtatatggtgtgtgtgtgtg
tgcacgcgcatgtgccacagcacacatgtggagatcagagttggtgttcc
ccttctactatgtgtatccttacagtcaaatttagtttgattaaagttaa
ttaataaaaattaagaaatttaaatttaaagatgggaaaacatggctcaa
gcattatggggacggtctaagagtataccattgcgcgcacacacacagta
gtaaactatggccacacaacaaacatagtaatcaggtgttcagatcactg
cagcaagggaaactgagtgaccagaactgggtgcagccctggccaaattc
tactctgtttatatttgtaattatgctcatgcatctactggggaaattct
gaaagcaatgaacattctggttcaattagcacgcttaggaaactaatact
tgcaactgactgcgagcgagggac
gaattccaaaggcacaaacaataaaagcagacacagacaagtgagcttgc
atcagacctagaagcccctgtccaggaaaaggatcgatagtgaacgctgg
tgataataggactttgacagcaagaagctggccttcaagtctgcatttct
agtcactagcaaaatgatagatactacatgcttatgtaatgaatttagtt
ctgtaatctgttgttctttccatgtgtggaatggaaaactctgtgcaagt
tgccatgatgtcatattcctgttgtttcagcatcaaggaagctgtacaag
agggctattagttcaagggtagcctgggctacatatacgtgtatttcttt
aaaagtgaacacaactggttatctaatgatgtttgctgaatgtgagtttt
aaaattgctttagctaacttcttaaatcgccaaatttactaaatggcacc
aactcctcaaatacttgatctcaaatgcttgttctacaattgtagattgg
cctgctcatatcaatatagcaaatagtcacctgctggtatctggaatcat
ccatacagacatgtgactagtaacaaaataaatagagacaaaaccagagg
aaactggttcagggccatgagtgaaattaaaagataattagaaaatgcag
ataatttgacttgctgcctgtagaactgaaatggaagtcacaggaagagt
tcccaacagtgttaaagggccggagtgagggagagtattgagaaatacac
tttagctttgggattcacttttaaaggatcagatttttatttccacattg
ttcacagtagcttattcggaaaacatttctaaaagttatgaagaagttca
gtgcataagctgctcagcagtggagactgatgtggtattcagcatctgtg
aaaagcttgcatcggaagcatgtggcatattatttagatagagggctgtt
ctcaaacagagcagtgtagacatgcaaaccaatgagatagatcacagtgt
aactacacagccatgtgacatagtgaggtctcagcaagttcctctcagag
ccactgttttcaatgcatagaagaaaatgtggtcagttgaagcattgtgc
gtgcatatgctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_33304030_33305232
seq2: B6Ng01-148B05.b_45_1218

seq1  GAATTCTTTAGGTACATATGAAAGGATGAGGGACAGTAAGTTGAGGCTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGGTACATATGAAAGGATGAGGGACAGTAAGTTGAGGCTAA  50

seq1  AAGGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAACACAGTTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAACACAGTTATT  100

seq1  TTTACCACTACCCACTAGCAAATATAAACTGTAGGTAAATAAAAAAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCACTACCCACTAGCAAATATAAACTGTAGGTAAATAAAAAAGAAG  150

seq1  GCATAACTAGGGAACTGAAAAGACGGCTCACAAGTTAAGAGTGTGTGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAACTAGGGAACTGAAAAGACGGCTCACAAGTTAAGAGTGTGTGCTG  200

seq1  TTCTTGAAGTCCCGAGGTTGATTACCAGCGCGTCTACCAGGTGGCTCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGAAGTCCCGAGGTTGATTACCAGCGCGTCTACCAGGTGGCTCACA  250

seq1  ATGGCCTATAATTCTATCATGTCAGCTCGAGAGTGATCAGGCCTCTATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCTATAATTCTATCATGTCAGCTCGAGAGTGATCAGGCCTCTATGA  300

seq1  CACCTGCCCCCAGGTACCTAATAACCCCCCCGACATACACATAATTAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGCCCCCAGGTACCTAATAACCCCCCCGACATACACATAATTAAAA  350

seq1  GTAAAATAATTCTTGCAGCAGCTCCCTAGTGTAGCCTTCAACATAAAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATAATTCTTGCAGCAGCTCCCTAGTGTAGCCTTCAACATAAAAAT  400

seq1  AAAATAAATCCTAAAAAGAAAGTATAGGTATATTTGTAATTATCATATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAATCCTAAAAAGAAAGTATAGGTATATTTGTAATTATCATATTT  450

seq1  AAAAGACAGGTTCATAAAGCAATAAATATAAATTTACATTGGTATGTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACAGGTTCATAAAGCAATAAATATAAATTTACATTGGTATGTATA  500

seq1  TAACATATTAAATGTGTGGTTTGTATGACCATAAAAGCACCAGGGAAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATATTAAATGTGTGGTTTGTATGACCATAAAAGCACCAGGGAAGGG  550

seq1  GCAGAGAATAAACAGGAGGAAAGAGTTTGTATAATATTAAAGTTAATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGAATAAACAGGAGGAAAGAGTTTGTATAATATTAAAGTTAATATA  600

seq1  AACCCAAAGTGAACTGGTATACAAATATACCATTAAGATGCTAACTATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAAAGTGAACTGGTATACAAATATACCATTAAGATGCTAACTATAA  650

seq1  GCCTAGGGAAACTGTACTACATCATAATCACCACCACCACCACCACCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGGGAAACTGTACTACATCATAATCACCACCACCACCACCACCATC  700

seq1  ATCATCATCATCATCATTATTGCTACTATTGTATATGGTGTGTGTGTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCATCATCATCATTATTGCTACTATTGTATATGGTGTGTGTGTGTG  750

seq1  TGCACGCGCATGTGCCACAGCACACATGTGGAGATCAGAGTTGGTGTTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACGCGCATGTGCCACAGCACACATGTGGAGATCAGAGTTGGTGTTCC  800

seq1  CCTTCTACTATGTGTATCCTTACAGTCAAATTTAGTTTGATTAAAGTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTACTATGTGTATCCTTACAGTCAAATTTAGTTTGATTAAAGTTAA  850

seq1  TTAATAAAAATTAAGAAATTTAAATTTAAAGATGGGAAAACATGGCTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAAAAATTAAGAAATTTAAATTTAAAGATGGGAAAACATGGCTCAA  900

seq1  GCATTATGGGGACGGTCTAAAGAGTATACCATTGCGCGCACACACACAAG  950
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCATTATGGGGACGGTCT-AAGAGTATACCATTGCGCGCACACACAC-AG  948

seq1  TAGTAAACTATGGCCAACACAAACAAACATAGTAACCAGGTGTTCAGATC  1000
      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAGTAAACTATGGCC-ACAC-AACAAACATAGTAATCAGGTGTTCAGATC  996

seq1  ACTGCAGCAAGGGAAACCTGAGGTGACCCAGACACTGGGTGCAGCCCTGG  1050
      |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGCAAGGGAAA-CTGA-GTGA-CCAGA-ACTGGGTGCAGCCCTGG  1042

seq1  CCAAATTCTACTCTGTTTATTATTTGGTAATTTATTGCTCATGCCATCTA  1100
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||
seq2  CCAAATTCTACTCTGTTTA-TATTT-GTAATT--ATGCTCATG-CATCTA  1087

seq1  CTTGGGGAACATCTGAAAGGCATATGAACATTCTGAGTTACAAATTAGGC  1150
      | |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||  
seq2  C-TGGGGAAATTCTGAAA-GCA-ATGAACATTCTG-GTT--CAATTAG--  1129

seq1  AACGCTAGGAAAACTAAAATCACGTGGCCAACTGACTGCTAGAGCAGAGG  1200
       |||||  | |||||||    || ||  |||||||||||  |||| ||||
seq2  CACGCTTAGGAAACTAA---TACTTG--CAACTGACTGC--GAGC-GAGG  1171

seq1  GAC  1203
      |||
seq2  GAC  1174

seq1: chr19_33438248_33439385
seq2: B6Ng01-148B05.g_68_1180 (reverse)

seq1  TTAGCATAATGCAGCCACAATGCTCTTCCAACTGACCACATTGTCTTCTA  50
      ||||||| |||||  ||||||||   | |||||||||||||| |||||| 
seq2  TTAGCAT-ATGCACGCACAATGC---TTCAACTGACCACATTTTCTTCT-  45

seq1  ATGCATTTGAAAAACCAGTGGCTCTGAGGAGGAGACTTTGCTGAGACCTC  100
      ||||| |||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||
seq2  ATGCA-TTGAAAA--CAGTGGCTCTGA-GAGGA-AC-TTGCTGAGACCTC  89

seq1  ACTAATGTTCACATGGCTGTGGTTAGTTACATCTTGTTGATCTAATCTCC  150
      ||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||   |||||| |||| |
seq2  ACT-ATG-TCACATGGCTGTG--TAGTTACA-CT--GTGATCT-ATCT-C  130

seq1  ATTGGTTCTGCATTGTCTACACTGCTCTGTTTTGAGAACAGCCCTCTATC  200
      ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTT-TGCA-TGTCTACACTGCTCTG-TTTGAGAACAGCCCTCTATC  177

seq1  TAAATAATATGCCACATGCTTCCGATGCAAGGCTTTTCACAGATGCTGAA  250
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TAAATAATATGCCACATGCTTCCGATGCAA-GCTTTTCACAGATGCTGAA  226

seq1  TACCACATCAGTCTCCACCTGCTGAGCAGCTTATGCACTGAACTTCTTCA  300
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACATCAGTCTCCA-CTGCTGAGCAGCTTATGCACTGAACTTCTTCA  275

seq1  TAACTTTTAGAAATGTTTTCCGAATAAGCTACTGTGAACAATGTGGAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTTAGAAATGTTTTCCGAATAAGCTACTGTGAACAATGTGGAAAT  325

seq1  AAAAATCTGATCCTTTAAAAGTGAATCCCAAAGCTAAAGTGTATTTCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATCTGATCCTTTAAAAGTGAATCCCAAAGCTAAAGTGTATTTCTCA  375

seq1  ATACTCTCCCTCACTCCGGCCCTTTAACACTGTTGGGAACTCTTCCTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCTCCCTCACTCCGGCCCTTTAACACTGTTGGGAACTCTTCCTGTG  425

seq1  ACTTCCATTTCAGTTCTACAGGCAGCAAGTCAAATTATCTGCATTTTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCATTTCAGTTCTACAGGCAGCAAGTCAAATTATCTGCATTTTCTA  475

seq1  ATTATCTTTTAATTTCACTCATGGCCCTGAACCAGTTTCCTCTGGTTTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTTTTAATTTCACTCATGGCCCTGAACCAGTTTCCTCTGGTTTTG  525

seq1  TCTCTATTTATTTTGTTACTAGTCACATGTCTGTATGGATGATTCCAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATTTATTTTGTTACTAGTCACATGTCTGTATGGATGATTCCAGAT  575

seq1  ACCAGCAGGTGACTATTTGCTATATTGATATGAGCAGGCCAATCTACAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCAGGTGACTATTTGCTATATTGATATGAGCAGGCCAATCTACAAT  625

seq1  TGTAGAACAAGCATTTGAGATCAAGTATTTGAGGAGTTGGTGCCATTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAACAAGCATTTGAGATCAAGTATTTGAGGAGTTGGTGCCATTTAG  675

seq1  TAAATTTGGCGATTTAAGAAGTTAGCTAAAGCAATTTTAAAACTCACATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTGGCGATTTAAGAAGTTAGCTAAAGCAATTTTAAAACTCACATT  725

seq1  CAGCAAACATCATTAGATAACCAGTTGTGTTCACTTTTAAAGAAATACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAACATCATTAGATAACCAGTTGTGTTCACTTTTAAAGAAATACAC  775

seq1  GTATATGTAGCCCAGGCTACCCTTGAACTAATAGCCCTCTTGTACAGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGTAGCCCAGGCTACCCTTGAACTAATAGCCCTCTTGTACAGCTT  825

seq1  CCTTGATGCTGAAACAACAGGAATATGACATCATGGCAACTTGCACAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGATGCTGAAACAACAGGAATATGACATCATGGCAACTTGCACAGAG  875

seq1  TTTTCCATTCCACACATGGAAAGAACAACAGATTACAGAACTAAATTCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCATTCCACACATGGAAAGAACAACAGATTACAGAACTAAATTCAT  925

seq1  TACATAAGCATGTAGTATCTATCATTTTGCTAGTGACTAGAAATGCAGAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAAGCATGTAGTATCTATCATTTTGCTAGTGACTAGAAATGCAGAC  975

seq1  TTGAAGGCCAGCTTCTTGCTGTCAAAGTCCTATTATCACCAGCGTTCACT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGCCAGCTTCTTGCTGTCAAAGTCCTATTATCACCAGCGTTCACT  1025

seq1  ATCGATCCTTTTCCTGGACAGGGGCTTCTAGGTCTGATGCAAGCTCACTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGATCCTTTTCCTGGACAGGGGCTTCTAGGTCTGATGCAAGCTCACTT  1075

seq1  GTCTGTGTCTGCTTTTATTGTTTGTGCCTTTGGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTCTGCTTTTATTGTTTGTGCCTTTGGAATTC  1113