MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-149K05
Chromosome	19 (Build37)
Map Location	51,865,624 - 51,866,683
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC100042924, LOC100042928
Downstream gene	LOC668536, LOC100042936, Ins1
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-149K05.b	B6Ng01-149K05.g
ACC	DH945923	DH945924
length	968	1,049
definition	DH945923\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149K05, 5' end.	DH945924\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149K05, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctcaactgaggaataccaaagtgctgggaagcacttgaaaaaata ttcaacatccttaatcatcagggatgcaaattcaaacatccctgtgatac cacctcacaccagtaagaatgcctaggaacaaaaattcaggtgacagcag atgctggtgaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgctggtggg attgcaagctgggacaacaactctgtaaatcagtttggcagggttttttt ttttgttttttgttttgttttgttttgtttttgtttttgtttgtttgttt gtttttttcagaaaactggacatagtactaccggtagatgcagcaattcc tctcctgggcatatatacccagaagatgtatcaacctgtaataagaacac atgctctactattttcatagcagccttatttataatagccagaagctgaa aagaacccagatttccttcaacaaaggaatggttacagaaaatgtggtat atttacacaatggaatactactcagctattaaaaacaatgaatttatgaa attcttgggcaaatggatgtatctagaggatatcatcctgagtgaggtaa cccaatcagaaaagaagtcacttaatatgcactcactgataagtggatat tagcccagaaacctagaatacccaagatacaacttccaaaacacaagaaa atcaagaagaaagatcaacgtggggatacttcattcctccctagaatagg gaataaaatatccatggaaggagttgcagagatgaagtttggagctaaga tgaaaggatgaaccatccagagacagccctacctgggagttcatcccata tcaaccaccaaacacagacactatttgcatatgccagcaagattttgctg aaagatgctaatatagctgtctcgttgaggcttgccgtgcctggcaaata cagaagtgatgctctagt	gaattcttaagcatgattgcatacatatatctttggaaattagcttgaac attttggtgtccatattctgaagtcacgtgacgatcataccccaagttat atatgtaagtgtttgaggtgcctccatactcatttacataatgattggat aatttgcattcctatctgtagagaatctataaatacaggttcttcttgcc aagtatcattaacaattgttcttagtttctttttatttttgtatttaatt cttttttttctttttcatattttagttttttgataaattcatgcatgtgt tttgattatatttaccttacccaatttcttacaaatctacctcctccctt ctacgcccacccaacattgtattgtctgttttgtttttgacccatcaaat ctaatttatgatgtctattcattcttggatttatgacctcccaggagagc attgttgacctaccaagtgttacacctttaaagtaaacaatccctttctg aggaactatccttcctcagtagcattcatgctaaaagttcaggagaattt caagggtagtcctctatacaagctgagaattttccacgcataagcttatt tatgctgttataatactttgatttaatatgggcaactttccaccagtgtt taaaagacactgtttccttgcagtttctgactgccaccatagtctttctg acccatgtgtcacaatgatccctgagtcttaggagttgggagtgtaatgt aagcattccatttaggcctggacattccattgtcacttattctctttcaa ttaagcaaatgcagatctttgtgataaatgtaacttactgaaaatagctc tttctggtgagagctgtgagatcattgatctgaggtctagtctttgtgga tccagtttatacatgtctactttgcagaataagagtatgacttagtccta tctagtgagctcctgtactgagacatagtttaaaatatgagttcatcttg tgcagggacctaatttgatggtcaactcttatcagactggtccctgtag
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr19_51865624_51866683 seq2: B6Ng01-149K05.g_69_1117 (reverse) seq1 CTACAGTGACCAGTCTGATAAGACGTTGACCATTCAATTTTAGGTTCCCT 50 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| seq2 CTACAGGGACCAGTCTGATAAGA-GTTGACCATCAAA--TTAGG-TCCCT 46 seq1 GCACAAGATGAAACTCATATTTTAAACTATGTCTCAGTACAGGAGCTTCA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| seq2 GCACAAGATG-AACTCATATTTTAAACTATGTCTCAGTACAGGAGC-TCA 94 seq1 CTAGATAAGACCTAGGTCATTACTCTTATTCTGCAAAGTAGACATTGTAT 150 \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| seq2 CTAGATAGGA-CTAAGTCA-TACTCTTATTCTGCAAAGTAGACA-TGTAT 141 seq1 AAAACTGAAT-CACAAAGACTAGACCTCAGATCAATGAATCTCACAGCTC 199 \|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 -AAACTGGATCCACAAAGACTAGACCTCAGATCAATG-ATCTCACAGCTC 189 seq1 TCACCAGAAAGAAGCTATTTTCAGTAAGTTACAATTATCACAAAGATCTG 249 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCACCAGAAAG-AGCTATTTTCAGTAAGTTACATTTATCACAAAGATCTG 238 seq1 CATTTGCTTAATTGAAAGAGAATAAGTGACAATGGAATGTCCAGGCCTAA 299 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATTTGCTTAATTGAAAGAGAATAAGTGACAATGGAATGTCCAGGCCTAA 288 seq1 ATGGAATGCTTACATTACACTCCCAACTCCTAAGACTCAGGGATCATTGT 349 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGAATGCTTACATTACACTCCCAACTCCTAAGACTCAGGGATCATTGT 338 seq1 GACACATGGGTCAGAAAGACTATGGTGGCAGTCAGAAACTGCAAGGAAAC 399 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACACATGGGTCAGAAAGACTATGGTGGCAGTCAGAAACTGCAAGGAAAC 388 seq1 AGTGTCTTTTAAACACTGGTGGAAAGTTGCCCATATTAAATCAAAGTATT 449 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTGTCTTTTAAACACTGGTGGAAAGTTGCCCATATTAAATCAAAGTATT 438 seq1 ATAACAGCATAAATAAGCTTATGCGTGGAAAATTCTCAGCTTGTATAGAG 499 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAACAGCATAAATAAGCTTATGCGTGGAAAATTCTCAGCTTGTATAGAG 488 seq1 GACTACCCTTGAAATTCTCCTGAACTTTTAGCATGAATGCTACTGAGGAA 549 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACTACCCTTGAAATTCTCCTGAACTTTTAGCATGAATGCTACTGAGGAA 538 seq1 GGATAGTTCCTCAGAAAGGGATTGTTTACTTTAAAGGTGTAACACTTGGT 599 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGATAGTTCCTCAGAAAGGGATTGTTTACTTTAAAGGTGTAACACTTGGT 588 seq1 AGGTCAACAATGCTCTCCTGGGAGGTCATAAATCCAAGAATGAATAGACA 649 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGTCAACAATGCTCTCCTGGGAGGTCATAAATCCAAGAATGAATAGACA 638 seq1 TCATAAATTAGATTTGATGGGTCAAAAACAAAACAGACAATACAATGTTG 699 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATAAATTAGATTTGATGGGTCAAAAACAAAACAGACAATACAATGTTG 688 seq1 GGTGGGCGTAGAAGGGAGGAGGTAGATTTGTAAGAAATTGGGTAAGGTAA 749 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTGGGCGTAGAAGGGAGGAGGTAGATTTGTAAGAAATTGGGTAAGGTAA 738 seq1 ATATAATCAAAACACATGCATGAATTTATCAAAAAACTAAAATATGAAAA 799 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATATAATCAAAACACATGCATGAATTTATCAAAAAACTAAAATATGAAAA 788 seq1 AGAAAAAAAAGAATTAAATACAAAAATAAAAAGAAACTAAGAACAATTGT 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAAAAAAAAGAATTAAATACAAAAATAAAAAGAAACTAAGAACAATTGT 838 seq1 TAATGATACTTGGCAAGAAGAACCTGTATTTATAGATTCTCTACAGATAG 899 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAATGATACTTGGCAAGAAGAACCTGTATTTATAGATTCTCTACAGATAG 888 seq1 GAATGCAAATTATCCAATCATTATGTAAATGAGTATGGAGGCACCTCAAA 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATGCAAATTATCCAATCATTATGTAAATGAGTATGGAGGCACCTCAAA 938 seq1 CACTTACATATATAACTTGGGGTATGATCGTCACGTGACTTCAGAATATG 999 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACTTACATATATAACTTGGGGTATGATCGTCACGTGACTTCAGAATATG 988 seq1 GACACCAAAATGTTCAAGCTAATTTCCAAAGATATATGTATGCAATCATG 1049 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACACCAAAATGTTCAAGCTAATTTCCAAAGATATATGTATGCAATCATG 1038 seq1 CTTAAGAATTC 1060 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTAAGAATTC 1049

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr19_51865624_51866683
seq2: B6Ng01-149K05.g_69_1117 (reverse)

seq1  CTACAGTGACCAGTCTGATAAGACGTTGACCATTCAATTTTAGGTTCCCT  50
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||||
seq2  CTACAGGGACCAGTCTGATAAGA-GTTGACCATCAAA--TTAGG-TCCCT  46

seq1  GCACAAGATGAAACTCATATTTTAAACTATGTCTCAGTACAGGAGCTTCA  100
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GCACAAGATG-AACTCATATTTTAAACTATGTCTCAGTACAGGAGC-TCA  94

seq1  CTAGATAAGACCTAGGTCATTACTCTTATTCTGCAAAGTAGACATTGTAT  150
      ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTAGATAGGA-CTAAGTCA-TACTCTTATTCTGCAAAGTAGACA-TGTAT  141

seq1  AAAACTGAAT-CACAAAGACTAGACCTCAGATCAATGAATCTCACAGCTC  199
       |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  -AAACTGGATCCACAAAGACTAGACCTCAGATCAATG-ATCTCACAGCTC  189

seq1  TCACCAGAAAGAAGCTATTTTCAGTAAGTTACAATTATCACAAAGATCTG  249
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCACCAGAAAG-AGCTATTTTCAGTAAGTTACATTTATCACAAAGATCTG  238

seq1  CATTTGCTTAATTGAAAGAGAATAAGTGACAATGGAATGTCCAGGCCTAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGTGTCTTTTAAACACTGGTGGAAAGTTGCCCATATTAAATCAAAGTATT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACCCTTGAAATTCTCCTGAACTTTTAGCATGAATGCTACTGAGGAA  538

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAACAATGCTCTCCTGGGAGGTCATAAATCCAAGAATGAATAGACA  638

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAAATTAGATTTGATGGGTCAAAAACAAAACAGACAATACAATGTTG  688

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGCGTAGAAGGGAGGAGGTAGATTTGTAAGAAATTGGGTAAGGTAA  738

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CTTAAGAATTC  1060
      |||||||||||
seq2  CTTAAGAATTC  1049

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