BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159L08
Chromosome19 (Build37)
Map Location 51,020,121 - 51,202,872
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG433251, Sorcs1
Downstream geneLOC100042924, LOC100042928, LOC668536, LOC100042936
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159L08.bB6Ng01-159L08.g
ACCDH953291DH953292
length9521,116
definitionDH953291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159L08, 5' end.DH953292|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,202,316 - 51,202,872)(51,020,121 - 51,021,243)
sequence
gaattccatttttgccacatatatgtcagtacctgttgggaagatcacct
aaggtttatgaagaagaattttaatctagcaacatggctgctctagcaag
gaattgattgtctcatgtgtgatctggtcagaatgcacacaaacccttag
tagatggctttatagtaaaattagtttgtagaaggaagcagccatgtttg
aaagttatgtctaatcaaggggcaggcaaagtaatgagtcagagcaaaat
cagacagcgtgggtcagagacaggatacacccaactctcagaagggcagc
acgggaaatagaagctatttaaaagcagaacagggagagtcagtcagttg
ggagtcagtacagtgagtacattgcagtggtattgagtttgttcatgagt
tcctgcaggtcaatgcaggtgaacagaggaagttgaggccagagaataaa
aaggggccagatgattaggacgaattactattctcagttgtaagctaagc
agagcaatccaatgagaatcagagagaaaccagactgaatcagtcagctt
agagaggagtcttgatccagaacagttgatctgaatgagctacacagagt
tcagaaaggggtgagcttattaagcagtaagtctcagaaatcacaattac
atcagttgaatagaaattacatttacaggtataacctgctactgttataa
aaaataacctaattatttctaaatatttatgttcatacatatctacatgg
gttctcttttttcagtagataatcaagaccatagaaatgcacaactagtc
taaacagcacaagaggttaaaaattcagcctgtaattagaaaatgaactg
ggtagagtttgtctactttacacatgctaaagtcctctgagaagagtgga
gaaaatgcctacaacaggttgaactgtaaaaagtatctttgggcatcgtc
tt
gaattcttagtagcaataccacaaataagaacaaatgttgttcaagttat
gggaaaaggttactctcatacattgttagtgggaatgtgagttagttccc
tactatgaagataagtacagtatagaggtccatcagaaacactgaagcac
aaacctccagatgacccacctattccatgttcaggtatgtaaagacttca
agagaagctactacaaagaccattgaatatctgcctataacagcaccatt
cataacagccgagtgtctttcaacaggagaatgaataaagaattcaaatt
ttattcagccataaagaaaagtgaaattatatcatttactggaaaatggg
cacacttttagatgtccacattacataaaataagtcagactcacaaaagc
aaaagtttatgttttctcaaatttttgtgtcctaaaatttatacacaata
tatatagacatatatatgtatgtatatatatatacatatatatatacata
tatatatacatatatatatacacatacatacacacacacacatacatata
tatgtatatacacatacacaccaatatatatattggattaggtgaaggta
tgcagccaccaagaagaagttggtattgtaaaagtaggtaaaggttaaag
agaatatgggatatgcttggaattatctatgtgatggcaaatggaacatc
caatgaaactgcaccaatcgagcatggaaattaaagcctggcctgcagca
tgagattccgagttggtccccacttctctgcaaacttatacaagaataag
gtgacactgttctctttttctgagatacagcaacttaaaattttcatcct
atgagaaccacacttggtagtcagttctttatggaaaagcattctattcc
ccagtgctggcttctgtcatcatgaagaattctagtctgctctgttttat
attcaaccatgctctctcaatttggcacactcctccctctctgtgcagct
ctttatgctagtcacttctcttaatgcccccttactcaatcccagatcaa
ctttatcctttggatatttgccaattacctttctatggatgtccatcatt
atatatgctctttcaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_51202316_51202872
seq2: B6Ng01-159L08.b_47_603 (reverse)

seq1  CCTCTCTAAGCTGACTGATTCAGTCTGGTTTCTCTCTGATTCTCATTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTAAGCTGACTGATTCAGTCTGGTTTCTCTCTGATTCTCATTGGA  50

seq1  TTGCTCTGCTTAGCTTACAACTGAGAATAGTAATTCGTCCTAATCATCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCTGCTTAGCTTACAACTGAGAATAGTAATTCGTCCTAATCATCTG  100

seq1  GCCCCTTTTTATTCTCTGGCCTCAACTTCCTCTGTTCACCTGCATTGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTTTTTATTCTCTGGCCTCAACTTCCTCTGTTCACCTGCATTGACC  150

seq1  TGCAGGAACTCATGAACAAACTCAATACCACTGCAATGTACTCACTGTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGAACTCATGAACAAACTCAATACCACTGCAATGTACTCACTGTAC  200

seq1  TGACTCCCAACTGACTGACTCTCCCTGTTCTGCTTTTAAATAGCTTCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCCCAACTGACTGACTCTCCCTGTTCTGCTTTTAAATAGCTTCTAT  250

seq1  TTCCCGTGCTGCCCTTCTGAGAGTTGGGTGTATCCTGTCTCTGACCCACG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCGTGCTGCCCTTCTGAGAGTTGGGTGTATCCTGTCTCTGACCCACG  300

seq1  CTGTCTGATTTTGCTCTGACTCATTACTTTGCCTGCCCCTTGATTAGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGATTTTGCTCTGACTCATTACTTTGCCTGCCCCTTGATTAGACA  350

seq1  TAACTTTCAAACATGGCTGCTTCCTTCTACAAACTAATTTTACTATAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTCAAACATGGCTGCTTCCTTCTACAAACTAATTTTACTATAAAG  400

seq1  CCATCTACTAAGGGTTTGTGTGCATTCTGACCAGATCACACATGAGACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTACTAAGGGTTTGTGTGCATTCTGACCAGATCACACATGAGACAA  450

seq1  TCAATTCCTTGCTAGAGCAGCCATGTTGCTAGATTAAAATTCTTCTTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCCTTGCTAGAGCAGCCATGTTGCTAGATTAAAATTCTTCTTCAT  500

seq1  AAACCTTAGGTGATCTTCCCAACAGGTACTGACATATATGTGGCAAAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTAGGTGATCTTCCCAACAGGTACTGACATATATGTGGCAAAAAT  550

seq1  GGAATTC  557
      |||||||
seq2  GGAATTC  557

seq1: chr19_51020121_51021243
seq2: B6Ng01-159L08.g_69_1184

seq1  GAATTCTTAGTAGCAATACCACAAATAAGAACAAATGTTGTTCAAGTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGTAGCAATACCACAAATAAGAACAAATGTTGTTCAAGTTAT  50

seq1  GGGAAAAGGTTACTCTCATACATTGTTAGTGGGAATGTGAGTTAGTTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAAGGTTACTCTCATACATTGTTAGTGGGAATGTGAGTTAGTTCCC  100

seq1  TACTATGAAGATAAGTACAGTATAGAGGTCCATCAGAAACACTGAAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATGAAGATAAGTACAGTATAGAGGTCCATCAGAAACACTGAAGCAC  150

seq1  AAACCTCCAGATGACCCACCTATTCCATGTTCAGGTATGTAAAGACTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTCCAGATGACCCACCTATTCCATGTTCAGGTATGTAAAGACTTCA  200

seq1  AGAGAAGCTACTACAAAGACCATTGAATATCTGCCTATAACAGCACCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGCTACTACAAAGACCATTGAATATCTGCCTATAACAGCACCATT  250

seq1  CATAACAGCCGAGTGTCTTTCAACAGGAGAATGAATAAAGAATTCAAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACAGCCGAGTGTCTTTCAACAGGAGAATGAATAAAGAATTCAAATT  300

seq1  TTATTCAGCCATAAAGAAAAGTGAAATTATATCATTTACTGGAAAATGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCAGCCATAAAGAAAAGTGAAATTATATCATTTACTGGAAAATGGG  350

seq1  CACACTTTTAGATGTCCACATTACATAAAATAAGTCAGACTCACAAAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTTTTAGATGTCCACATTACATAAAATAAGTCAGACTCACAAAAGC  400

seq1  AAAAGTTTATGTTTTCTCAAATTTTTGTGTCCTAAAATTTATACACAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTTTATGTTTTCTCAAATTTTTGTGTCCTAAAATTTATACACAATA  450

seq1  TATATAGACATATATATGTATGTATATATATATACATATATATATACATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGACATATATATGTATGTATATATATATACATATATATATACATA  500

seq1  TATATATACATATATATATACACATACATACACACACACACATACATATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATACATATATATATACACATACATACACACACACACATACATATA  550

seq1  TATGTATATACACATACACACCAATATATATATTGGATTAGGTGAAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATACACATACACACCAATATATATATTGGATTAGGTGAAGGTA  600

seq1  TGCAGCCACCAAGAAGAAGTTGGTATTGTAAAAGTAGGTAAAGGTTAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCCACCAAGAAGAAGTTGGTATTGTAAAAGTAGGTAAAGGTTAAAG  650

seq1  AGAATATGGGATATGCTTGGAATTATCTATGTGATGGCAAATGGAACATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATATGGGATATGCTTGGAATTATCTATGTGATGGCAAATGGAACATC  700

seq1  CAATGAAACTGCACCAATCGAGCATGGAAATTAAAGCCTGGCCTGCAGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAAACTGCACCAATCGAGCATGGAAATTAAAGCCTGGCCTGCAGCA  750

seq1  TGAGATTCCGAGTTGGTCCCCACTTCTCTGCAAACTTATACAAGAATAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATTCCGAGTTGGTCCCCACTTCTCTGCAAACTTATACAAGAATAAG  800

seq1  GTGACACTGTTCTCTTTTTCTGAGATACAGCAACTTAAAATTTTCATCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACACTGTTCTCTTTTTCTGAGATACAGCAACTTAAAATTTTCATCCT  850

seq1  ATGAGAACCACACTTGGTAGTCAGTTCTTTATGGAAAGGCATTCTATTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATGAGAACCACACTTGGTAGTCAGTTCTTTATGGAAAAGCATTCTATTCC  900

seq1  CCAGTGCTGGCTTCTGTCATCATGAAGAATTCTAGTCTGCTCTGTTTTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGCTGGCTTCTGTCATCATGAAGAATTCTAGTCTGCTCTGTTTTAT  950

seq1  ATTCAACCATGCTCTCCTCATTTGGGCACACTCCTCCCTCTCTGTGCAGC  1000
      ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAACCATGCTCT-CTCAATTTGGCACACTCCTCCCTCTCTGTGCAGC  999

seq1  TCTTTATGCTAGTCACTTCCTCCTTATTGCCCCCTTACTCAATCCCAGAT  1050
      |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATGCTAGTCACTTC--TCTTAATGCCCCCTTACTCAATCCCAGAT  1047

seq1  C-ACTTTATTCCTTTGGGAATATTTG-CAGTTACCTTTCTAATGATGTCC  1098
      | |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||  |||||||
seq2  CAACTTTA-TCCTTTGG--ATATTTGCCAATTACCTTTCTATGGATGTCC  1094

seq1  ATCATTTATATAATTGCTCTTTCAA  1123
      |||| |||||||  |||||||||||
seq2  ATCA-TTATATA--TGCTCTTTCAA  1116