BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168F23
Chromosome19 (Build37)
Map Location 32,033,218 - 32,086,640
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAsah2
Upstream genePrkg1, Cstf2t, 8430431K14Rik, 1810073H04Rik
Downstream geneEG668042, Sgms1, 2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168F23.bB6Ng01-168F23.g
ACCDH959627DH959628
length1,1671,086
definitionDH959627|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168F23, 5' end.DH959628|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168F23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,085,466 - 32,086,640)(32,033,218 - 32,034,321)
sequence
gaattctctgctgatctcttggtagcctcctgtactatgtttggcaacac
tgacaaataatgtttccttatttggtggaacctctgtagaagaaatctgc
ctatgcttgtgacctgtaaaagagatgagggaaaacatgaaaagttcaca
agcctggcattccaaaggaaaaggggtccagtggattaaggaagtatgca
gacttgaaatgatattaaaacacttaagcatcagtttagatagtaaaaag
acagaagaatattttacgcctgtatcttttacagtctttcctatccccac
aagggaaatttgttgaactagcccttgaatatttttcttctttcaagaat
tcatcaaattcttacattctgcccaacacatcctatcattcccatcactg
ccatcattcacacagattatttcactacctttcaatttgggttcctccat
ggctcctctgtagtcctttttcaacaggacacccaactccattcctttac
agtggtggctctcagccttcctaatgctgtgaccctttaacctaggtcct
catgttgtgatctttcctactttattactgtgattttgctacttttatga
atcacaatttaaatattgccaaaatttgaatatgtgccaaaggggttgtg
acccacgcgttgagaacctctgcttcaaaccatgaactaaacatgctact
tctctgtcccagatcacccagccctttcccatcttcttccaggcactcac
ccacttccttccactttctttacaggtccacgcagactgtatctcagcaa
gttccctgctgtgatttcttttggctttccttctttttcaccctgcttca
gccatcctgcatcactgttaaaggttttcttgtatagagagaaatgtacc
tgctaagaacatgcaccactaagcatgttctagacttggagattttgaac
ttatggttctttctgtagaaaacacattctcttcagctagcctcaaggcc
aagtctttgaatttttttaaatcctttgcttaaatcttctaatggagatg
ctatactattcatactacataaaagcatcgtactaacagcaacagctgtt
ctctcgcacatcagcacagcaccagtatcggacacactaatgccatcacc
tcaagtcatttcacctt
gaattcctgccccagtggtgtctttgacatgactgacatttcagaaacta
tggtagaaaataaagaccgaaacgtgatgacaatgttggttaggtcaatg
ctagttgttggtagttggtttttttgagacagagtttctctgtgtagccc
cagctgtcctggaactcactctaaaccaaggtagtctctaactcacagat
ctacctacctctgtctcctgagtgctgggtttaaagatgtgcaccacact
atccatctgggtcaatgctttttcaagctcccaaacatgaacatattatg
attacaatgcctgcttccttggtatgttaaatttccatctcctttgaatg
tccctaacaagtaacaaaatgataatacaccaggcctagcgatagggatc
atgctggcagccaggcctctcctccaccctttggcaaatattgaaatcta
ctcagctgctctctgttgacctttagagcaacctcaatttatatgtatat
gtatatatatatatgacttaacaagttctaggccagtgagagagcctgtc
tttaatatatacatacatgtatgtatgtatgcatctatatatacatgcat
acagtaagatgcttgaggagagaagcaaggccttcttgttggtatcacac
tgctcaccctgcttctccatgatgctgtcttcactatgaattatactctt
ttacttccttataccattcctgtccaagctttgacattacaatatatcat
tgttatttaatgacaaaagtttcaacacacacacacacacacacacacac
acactgttttgtctttactatactcccagaactaaagttatcattaacaa
aactacttacagacagcttattttaaaaaaagtaaaacctctctgcagcc
acatcaaagagctggtctctaaactaaatacagatgtcttcacttgtagc
caatactttgggtaataactgctctgtctcactgtatttctcagctagtc
atctgtccgtcttgctctgtataagtactgccaaaatgaaacgttctgac
tgtgtctacaaagtttcgtagtaaaataattaacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_32085466_32086640
seq2: B6Ng01-168F23.b_47_1213 (reverse)

seq1  AAGGTGAAATGGAATTATAGGAGTGATGGCATTAGTGTTGGTGCCGATAC  50
      |||||||||| || ||   |  ||||||||||||||||  || |||||||
seq2  AAGGTGAAAT-GACTT---GAGGTGATGGCATTAGTGT--GT-CCGATAC  43

seq1  TGGTGCTGGTGCTGATGTGCGAGAG-ACAGCTGGTTGCTGTTAGTAACGA  99
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||
seq2  TGGTGCT-GTGCTGATGTGCGAGAGAACAGCT-GTTGCTGTTAGT-ACGA  90

seq1  TGCTTTTATGTAGTATGAATAGTATTAGCATCTCCATTAG-AGATTTAAG  148
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGCTTTTATGTAGTATGAATAGTA-TAGCATCTCCATTAGAAGATTTAAG  139

seq1  CAAAGGATTTAAAAAAATTCAAAGACTTGGCCTTGAGGCTAGCTGAAGAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGATTTAAAAAAATTCAAAGACTTGGCCTTGAGGCTAGCTGAAGAG  189

seq1  AATGTGTTTTCTACAGAAAGAACCATAAGTTCAAAATCTCCAAGTCTAGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTTTTCTACAGAAAGAACCATAAGTTCAAAATCTCCAAGTCTAGA  239

seq1  ACATGCTTAGTGGTGCATGTTCTTAGCAGGTACATTTCTCTCTATACAAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCTTAGTGGTGCATGTTCTTAGCAGGTACATTTCTCTCTATACAAG  289

seq1  AAAACC-TTAACAGTGATGCAGGATGGCTGAAGCAGGGTGAAAAAGAAGG  347
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCTTTAACAGTGATGCAGGATGGCTGAAGCAGGGTGAAAAAGAAGG  339

seq1  AAAGCCAAAAGAAATCACAGCAGGGAACTTGCTGAGATACAGTCTGCGTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCAAAAGAAATCACAGCAGGGAACTTGCTGAGATACAGTCTGCGTG  389

seq1  GACCTGTAAAGAAAGTGGAAGGAAGTGGGTGAGTGCCTGGAAGAAGATGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTAAAGAAAGTGGAAGGAAGTGGGTGAGTGCCTGGAAGAAGATGG  439

seq1  GAAAGGGCTGGGTGATCTGGGACAGAGAAGTAGCATGTTTAGTTCATGGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCTGGGTGATCTGGGACAGAGAAGTAGCATGTTTAGTTCATGGT  489

seq1  TTGAAGCAGAGGTTCTCAACGCGTGGGTCACAACCCCTTTGGCACATATT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCAGAGGTTCTCAACGCGTGGGTCACAACCCCTTTGGCACATATT  539

seq1  CAAATTTTGGCAATATTTAAATTGTGATTCATAAAAGTAGCAAAATCACA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTTGGCAATATTTAAATTGTGATTCATAAAAGTAGCAAAATCACA  589

seq1  GTAATAAAGTAGGAAAGATCACAACATGAGGACCTAGGTTAAAGGGTCAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAAGTAGGAAAGATCACAACATGAGGACCTAGGTTAAAGGGTCAC  639

seq1  AGCATTAGGAAGGCTGAGAGCCACCACTGTAAAGGAATGGAGTTGGGTGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTAGGAAGGCTGAGAGCCACCACTGTAAAGGAATGGAGTTGGGTGT  689

seq1  CCTGTTGAAAAAGGACTACAGAGGAGCCATGGAGGAACCCAAATTGAAAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTGAAAAAGGACTACAGAGGAGCCATGGAGGAACCCAAATTGAAAG  739

seq1  GTAGTGAAATAATCTGTGTGAATGATGGCAGTGATGGGAATGATAGGATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTGAAATAATCTGTGTGAATGATGGCAGTGATGGGAATGATAGGATG  789

seq1  TGTTGGGCAGAATGTAAGAATTTGATGAATTCTTGAAAGAAGAAAAATAT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGGCAGAATGTAAGAATTTGATGAATTCTTGAAAGAAGAAAAATAT  839

seq1  TCAAGGGCTAGTTCAACAAATTTCCCTTGTGGGGATAGGAAAGACTGTAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGGCTAGTTCAACAAATTTCCCTTGTGGGGATAGGAAAGACTGTAA  889

seq1  AAGATACAGGCGTAAAATATTCTTCTGTCTTTTTACTATCTAAACTGATG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACAGGCGTAAAATATTCTTCTGTCTTTTTACTATCTAAACTGATG  939

seq1  CTTAAGTGTTTTAATATCATTTCAAGTCTGCATACTTCCTTAATCCACTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTGTTTTAATATCATTTCAAGTCTGCATACTTCCTTAATCCACTG  989

seq1  GACCCCTTTTCCTTTGGAATGCCAGGCTTGTGAACTTTTCATGTTTTCCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCTTTTCCTTTGGAATGCCAGGCTTGTGAACTTTTCATGTTTTCCC  1039

seq1  TCATCTCTTTTACAGGTCACAAGCATAGGCAGATTTCTTCTACAGAGGTT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCTTTTACAGGTCACAAGCATAGGCAGATTTCTTCTACAGAGGTT  1089

seq1  CCACCAAATAAGGAAACATTATTTGTCAGTGTTGCCAAACATAGTACAGG  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAAATAAGGAAACATTATTTGTCAGTGTTGCCAAACATAGTACAGG  1139

seq1  AGGCTACCAAGAGATCAGCAGAGAATTC  1175
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTACCAAGAGATCAGCAGAGAATTC  1167

seq1: chr19_32033218_32034321
seq2: B6Ng01-168F23.g_68_1153

seq1  GAATTCCTGCCCCAGTGGTGTCTTTGACATGACTGACATTTCAGAAACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCCCCAGTGGTGTCTTTGACATGACTGACATTTCAGAAACTA  50

seq1  TGGTAGAAAATAAAGACCGAAACGTGATGACAATGTTGGTTAGGTCAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGAAAATAAAGACCGAAACGTGATGACAATGTTGGTTAGGTCAATG  100

seq1  CTAGTTGTTGGTAGTTGGTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTGTGTAGCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTGTTGGTAGTTGGTTTTTTTGAGACAGAGTTTCTCTGTGTAGCCC  150

seq1  CAGCTGTCCTGGAACTCACTCTAAACCAAGGTAGTCTCTAACTCACAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTCCTGGAACTCACTCTAAACCAAGGTAGTCTCTAACTCACAGAT  200

seq1  CTACCTACCTCTGTCTCCTGAGTGCTGGGTTTAAAGATGTGCACCACACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTACCTCTGTCTCCTGAGTGCTGGGTTTAAAGATGTGCACCACACT  250

seq1  ATCCATCTGGGTCAATGCTTTTTCAAGCTCCCAAACATGAACATATTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCTGGGTCAATGCTTTTTCAAGCTCCCAAACATGAACATATTATG  300

seq1  ATTACAATGCCTGCTTCCTTGGTATGTTAAATTTCCATCTCCTTTGAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAATGCCTGCTTCCTTGGTATGTTAAATTTCCATCTCCTTTGAATG  350

seq1  TCCCTAACAAGTAACAAAATGATAATACACCAGGCCTAGCGATAGGGATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAACAAGTAACAAAATGATAATACACCAGGCCTAGCGATAGGGATC  400

seq1  ATGCTGGCAGCCAGGCCTCTCCTCCACCCTTTGGCAAATATTGAAATCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGGCAGCCAGGCCTCTCCTCCACCCTTTGGCAAATATTGAAATCTA  450

seq1  CTCAGCTGCTCTCTGTTGACCTTTAGAGCAACCTCAATTTATATGTATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTGCTCTCTGTTGACCTTTAGAGCAACCTCAATTTATATGTATAT  500

seq1  GTATATATATATATGACTTAACAAGTTCTAGGCCAGTGAGAGAGCCTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATATATATGACTTAACAAGTTCTAGGCCAGTGAGAGAGCCTGTC  550

seq1  TTTAATATATACATACATGTATGTATGTATGCATCTATATATACATGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATATATACATACATGTATGTATGTATGCATCTATATATACATGCAT  600

seq1  ACAGTAAGATGCTTGAGGAGAGAAGCAAGGCCTTCTTGTTGGTATCACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAAGATGCTTGAGGAGAGAAGCAAGGCCTTCTTGTTGGTATCACAC  650

seq1  TGCTCACCCTGCTTCTCCATGATGCTGTCTTCACTATGAATTATACTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACCCTGCTTCTCCATGATGCTGTCTTCACTATGAATTATACTCTT  700

seq1  TTACTTCCTTATACCATTCCTGTCCAAGCTTTGACATTACAATATATCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTCCTTATACCATTCCTGTCCAAGCTTTGACATTACAATATATCAT  750

seq1  TGTTATTTAATGAC-AAAGTTTCAACACACACACACACACACACACACAC  799
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTTAATGACAAAAGTTTCAACACACACACACACACACACACACAC  800

seq1  ACACTGTTTTGTCTTTACTATACTCCCAGAACTAAAGTTATCATTAACAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGTTTTGTCTTTACTATACTCCCAGAACTAAAGTTATCATTAACAA  850

seq1  AACTACTTACAGACAGCTTATTTTAAAAAAAAGTAAAACCTCTCTGCAGC  899
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACTTACAGACAGCTTATTTT-AAAAAAAGTAAAACCTCTCTGCAGC  899

seq1  CAACAATCAAAGAGCTGGTCTCCTAAACTAAATACAGATGTCTTCACTTG  949
      ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CA--CATCAAAGAGCTGGTCT-CTAAACTAAATACAGATGTCTTCACTTG  946

seq1  TAGCCAAATACTTTGGGTAATAACTTGCTTCTGTTCTCACTGTATTTTCT  999
      ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||
seq2  TAGCC-AATACTTTGGGTAATAAC-TGC-TCTG-TCTCACTGTA-TTTCT  991

seq1  CAGCTAGTTCATCTGTCCGTCTTTGCCTCTGTATAAGTACCTGCCAAATA  1049
      ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |
seq2  CAGCTAG-TCATCTGTCCGTCTT--GCTCTGTATAAGTA-CTGCCAAA-A  1036

seq1  TGAAACGTTCTGACTGTGTCTTACCAAAAGTTTTCGTAGTTAAAATAATT  1099
      |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||
seq2  TGAAACGTTCTGACTGTGTC-TAC--AAAG-TTTCGTAG-TAAAATAATT  1081

seq1  TACAG  1104
       ||||
seq2  AACAG  1086