BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-190O02
Chromosome19 (Build37)
Map Location 30,780,886 - 31,011,502
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrkg1, LOC625995
Upstream geneMlana, 9930021J03Rik, Ranbp6, Il33, Trpd52l3, Uhrf2, Gldc, EG625917, Mbl2, LOC100042088, LOC668020, EG546723, Dkk1
Downstream geneCstf2t, 8430431K14Rik, 1810073H04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-190O02.bB6Ng01-190O02.g
ACCGA014526GA014527
length8931,025
definitionB6Ng01-190O02.b B6Ng01-190O02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,010,615 - 31,011,502)(30,780,886 - 30,781,895)
sequence
gaattccacacccctaagccccttaccccataaaaccccctagcttttga
gcctcatggccggcatccgttatctcctgtgtgggatacatgtcggtccg
gagctccgtaattaaacgtcctcatgtaattacaacaagatgggtcctcg
tgtttctttgggtgctctcacactcccgagactagagtgggggtccccga
aagggggtcttacagtgactgaatacttcttgtgagtattcagttggaca
ccgtggaagatttcctttctgacagtacaggttcttggaggtaatttttc
caaattagattaaagcatagcattagcccttataatttagagttttatga
taaagacatatataaaagtatagagaaaggttgcttaatcctttctagag
gttgcaactgatgaataggttgtaatcagagaaggataagatcataaaaa
tcattaaatcatccaaaaatgatagagaggaaaagtcactctaggtagag
aaatagaaagtacagaagagtaaggctatatatttttcctttaattgtgt
ctgtatgggttgtgtggtggatgtgcccatgggtgaatatggaggacaga
gcaggacagtgtgcgtctttctctaattccttccaccttgttgacatggt
ctcttagccattgaacttgggatttacctgtgtgtgaccccgggagcatg
cctggctttttaacctggctgctaaggattcaaactcaggtctttcctga
tttcagaacaagcactgtaacccactgagccatctccctagccccagggt
acttaatgtttgagagtttcaagacctttgacatacctaaatgtttatgt
ttatcaaaggcaaatatagatgggatgggaggggaaagggggg
gaattcttcctttccaatagaatccattttggtctcctttagttgtcttg
ttgctttagctaaaagttcaagtaccatattgaagagatgcacagtggac
caccttgccttgtcctttattttagtggaattgctttatttaatttgatg
ttagctattggcttgatgtatattgcctttattatgtttatgtgtgtctt
gtatctctgatctctccaagacttttaacatgaaggggtgttggattttg
tcaaagttctttttagcatctaagttctttttagcatctaatgaaatggt
catgtttttcaatttgtttatatggtggattacattgatgaattttccta
tattgaaccatccctgcatccatgtattaaagcctacttgatcatggtgg
atgatgttttcaataatcatttttaaaggctgcctttgaactgttgagat
ggagcaatggatgaaggcacttgctaccaagcctgcattagatccttgaa
actcgcatggtagaagaagagaatcaactcttgtgagttgccctctgaca
tcaacacacatgatgtggcttaggcacgcatgcatgtgcacacacaccaa
aacaaaacaaaaaagacccaatgtataaattttaagtatataaatagcat
agtgcataagagcaaaacagataataatcactcactgttcctaactatca
ccgtatatttagctcatattctacacaaatgtgtaatttaaaataatcta
agcaaatcaataacctgagcacctgctggtttactttaagctattttcaa
acgatcagggtggctttaggaggattgattctctgaacactgccatcttt
ctttcagcccaggactctctcattcaaccttgttcagaaaagaatgacac
tttcttctgaaaggaatttctcaggacctgtgtgagaattctgaatacag
ttcttgggaaaagaacttattttttcaagcatttcaatgaaatgatttct
gaacccaagaggcctagccaactac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_31010615_31011502
seq2: B6Ng01-190O02.b_31_922 (reverse)

seq1  CCCCCTTTCCC--TCCAT-CCATCTATATTTGCCTTTGAT-AACATTAAC  46
      |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  CCCCCTTTCCCCTCCCATCCCATCTATATTTGCCTTTGATAAACATAAAC  50

seq1  ATTTAGGTATGTCAAAGGTCTTGAAACTCTCAAAACATTAAGTACCCTGG  96
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGGTATGTCAAAGGTCTTGAAACTCTC-AAACATTAAGTACCCTGG  99

seq1  GGCTAGGGAGATGGCTCAGTGGGTTACAGTGCTTGTTCTGAAATCAGG-A  145
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGCTAGGGAGATGGCTCAGTGGGTTACAGTGCTTGTTCTGAAATCAGGAA  149

seq1  AGACCTGAGTTTGAATCCTTAGCAGCCAGGTTAAAAAGCCAGGCATGCTC  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTGAGTTTGAATCCTTAGCAGCCAGGTTAAAAAGCCAGGCATGCTC  199

seq1  CCGGGGTCACACACAGGTAAATCCCAAGTTCAATGGCTAAGAGACCATGT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGGGTCACACACAGGTAAATCCCAAGTTCAATGGCTAAGAGACCATGT  249

seq1  CAACAAGGTGGAAGGAATTAGAGAAAGACGCACACTGTCCTGCTCTGTCC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGGTGGAAGGAATTAGAGAAAGACGCACACTGTCCTGCTCTGTCC  299

seq1  TCCATATTCACCCATGGGCACATCCACCACACAACCCATACAGACACAAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATATTCACCCATGGGCACATCCACCACACAACCCATACAGACACAAT  349

seq1  TAAAGGAAAAATATATAGCCTTACTCTTCTGTACTTTCTATTTCTCTACC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAAAAATATATAGCCTTACTCTTCTGTACTTTCTATTTCTCTACC  399

seq1  TAGAGTGACTTTTCCTCTCTATCATTTTTGGATGATTTAATGATTTTTAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGACTTTTCCTCTCTATCATTTTTGGATGATTTAATGATTTTTAT  449

seq1  GATCTTATCCTTCTCTGATTACAACCTATTCATCAGTTGCAACCTCTAGA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTATCCTTCTCTGATTACAACCTATTCATCAGTTGCAACCTCTAGA  499

seq1  AAGGATTAAGCAACCTTTCTCTATACTTTTATATATGTCTTTATCATAAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATTAAGCAACCTTTCTCTATACTTTTATATATGTCTTTATCATAAA  549

seq1  ACTCTAAATTATAAGGGCTAATGCTATGCTTTAATCTAATTTGGAAAAAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAAATTATAAGGGCTAATGCTATGCTTTAATCTAATTTGGAAAAAT  599

seq1  TACCTCCAAGAACCTGTACTGTCAGAAAGGAAATCTTCCACGGTGTCCAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCCAAGAACCTGTACTGTCAGAAAGGAAATCTTCCACGGTGTCCAA  649

seq1  CTGAATACTCACAAGAAGTATTCAGTCACTGTAAGACCCCCTTTCGGGGA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATACTCACAAGAAGTATTCAGTCACTGTAAGACCCCCTTTCGGGGA  699

seq1  CCCCCACTCTAGTCTCGGGAGTGTGAGAGCACCCAAAGAAACACGAGGAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACTCTAGTCTCGGGAGTGTGAGAGCACCCAAAGAAACACGAGGAC  749

seq1  CCATCTTGTTGTAATTACATGAGGACGTTTAATTACGGAGCTCCGGACCG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTGTTGTAATTACATGAGGACGTTTAATTACGGAGCTCCGGACCG  799

seq1  ACATGTATCCCACACAGGAGATAACGGATGCCGGCCATGAGGCTCAAAAG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTATCCCACACAGGAGATAACGGATGCCGGCCATGAGGCTCAAAAG  849

seq1  CTAGGGGGTTTTATGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  888
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGGGTTTTATGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  892

seq1: chr19_30780886_30781895
seq2: B6Ng01-190O02.g_63_1086

seq1  GAATTCTTCCTTTCCAATAGAATCCATTTTGGTCTCCTTTAGTTGTCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTTCCAATAGAATCCATTTTGGTCTCCTTTAGTTGTCTTG  50

seq1  TTGCTTTAGCTAAAAGTTCAAGTACCATATTGAAGAGATGCACAGTGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTAGCTAAAAGTTCAAGTACCATATTGAAGAGATGCACAGTGGAC  100

seq1  CACCTTGCCTTGTCCTTTATTTTAGTGGAATTGCTTTATTTAATTTGATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTGCCTTGTCCTTTATTTTAGTGGAATTGCTTTATTTAATTTGATG  150

seq1  TTAGCTATTGGCTTGATGTATATTGCCTTTATTATGTTTATGTGTGTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTATTGGCTTGATGTATATTGCCTTTATTATGTTTATGTGTGTCTT  200

seq1  GTATCTCTGATCTCTCCAAGACTTTTAACATGAAGGGGTGTTGGATTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTCTGATCTCTCCAAGACTTTTAACATGAAGGGGTGTTGGATTTTG  250

seq1  TCAAAGTTCTTTTTAGCATCTAAGTTCTTTTTAGCATCTAATGAAATGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGTTCTTTTTAGCATCTAAGTTCTTTTTAGCATCTAATGAAATGGT  300

seq1  CATGTTTTTCAATTTGTTTATATGGTGGATTACATTGATGAATTTTCCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTTTCAATTTGTTTATATGGTGGATTACATTGATGAATTTTCCTA  350

seq1  TATTGAACCATCCCTGCATCCATGTATTAAAGCCTACTTGATCATGGTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAACCATCCCTGCATCCATGTATTAAAGCCTACTTGATCATGGTGG  400

seq1  ATGATGTTTTCAATAATCATTTTTAAAGGCTGCCTTTGAACTGTTGAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGTTTTCAATAATCATTTTTAAAGGCTGCCTTTGAACTGTTGAGAT  450

seq1  GGAGCAATGGATGAAGGCACTTGCTACCAAGCCTGCATTAGATCCTTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAATGGATGAAGGCACTTGCTACCAAGCCTGCATTAGATCCTTGAA  500

seq1  ACTCGCATGGTAGAAGAAGAGAATCAACTCTTGTGAGTTGCCCTCTGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGCATGGTAGAAGAAGAGAATCAACTCTTGTGAGTTGCCCTCTGACA  550

seq1  TCAACACACATGATGTGGCTTAGGCACGCATGCATGTGCACACACACCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACACACATGATGTGGCTTAGGCACGCATGCATGTGCACACACACCAA  600

seq1  AACAAAACAAAAAAGACCCAATGTATAAATTTTAAGTATATAAATAGCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAACAAAAAAGACCCAATGTATAAATTTTAAGTATATAAATAGCAT  650

seq1  AGTGCATAAGAGCAAAACAGATAATAATCACTCACTGTTCCTAACTATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATAAGAGCAAAACAGATAATAATCACTCACTGTTCCTAACTATCA  700

seq1  CCGTATATTTAGCTCATATTCTACACAAATGTGTAATTTAAAATAATCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTATATTTAGCTCATATTCTACACAAATGTGTAATTTAAAATAATCTA  750

seq1  AGCAAATCAATAACCTGAGCACCTGCTGGTTTACTTTAAGCTATTTTCAA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGCAAATCAATAACCTGAGCACCTGCTGGTTTACTTTAAGCTATTTTC-A  799

seq1  AACGATCAGGGTGGC-TTAGGAGGATTGATTCTCTGAACACTGCCATCTT  849
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGATCAGGGTGGCTTTAGGAGGATTGATTCTCTGAACACTGCCATCTT  849

seq1  TTCTTCAGCCCAGGACTCTCTCATTCAACCTTGTCAAGAAA--GATGACA  897
      |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||
seq2  TCTTTCAGCCCAGGACTCTCTCATTCAACCTTGTTCAGAAAAGAATGACA  899

seq1  CTT--CTCTGAAAGGAATTTCTCAGGACCTGTGAG---ATTCTGAATACA  942
      |||   ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||
seq2  CTTTCTTCTGAAAGGAATTTCTCAGGACCTGTGTGAGAATTCTGAATACA  949

seq1  GTTTCTTGGAAAAGAACT--ATTTTTCAAGCA-TTCAA-GGAATGA-TTC  987
      |||  | |||||||||||   ||||||||||| ||||| | ||||| |||
seq2  GTTCTTGGGAAAAGAACTTATTTTTTCAAGCATTTCAATGAAATGATTTC  999

seq1  TGAA-CCAAGAGG-CTAGCAAACTA  1010
      |||| |||||||| ||||| |||||
seq2  TGAACCCAAGAGGCCTAGCCAACTA  1024