BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-207H22
Chromosome19 (Build37)
Map Location 10,095,539 - 10,232,470
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRab3il1, Fads3, Fads2
Upstream geneAhnak, Scgb1a1, Asrgl1, EG621699, LOC100040104, LOC623810, Pcna-ps2, LOC100040130, LOC100040137, LOC100040143, LOC100040152, Stxbp3b, LOC623688, LOC100040178, LOC100040192, 6720475J19Rik, LOC100040203, Incenp, LOC100040215, Fth1, Best1
Downstream geneLOC100040227, Fads1, Fen1, 1810006K21Rik, Gm98, Dagla, Syt7, Gm705, 4930579J09Rik, 0610038F07Rik, 5730453I16Rik, 2810441K11Rik, Tmem138, Cybasc3, Dak, Ddb1, Vwce, Pga5, 2210404E10Rik, Vps37c, Cd5, Cd6, Slc15a3, Tmem132a, Tmem109, Prpf19, Zp1, Gpr44, Ccdc86, Ms4a10, E530011F12Rik, 5033428B15Rik, AW112010, Ms4a8a, Gm336, LOC624395, 1700025F22Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-207H22.bB6Ng01-207H22.g
ACCGA026630GA026631
length7171,093
definitionB6Ng01-207H22.b B6Ng01-207H22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,095,539 - 10,096,255)(10,231,383 - 10,232,470)
sequence
gaattctgaacctaacacagtcctgggaacattatggttcgttggcagag
tccagagactgagttctgcactggttctgtcccactgggcagccacacga
cattggtgtgaccagctggtctcagtttctccacttcctggataggacaa
atcatacatatctctagggagacccaaattctaatggagatcaccctgcc
tcccaggagttaaaggccatgcctttacccctggccagcgactagggagt
tccacagttgcaggtgtctgggctctgcagtcttgagcaagtcacttacc
tgttttgggccttcactgccccaagagcttctgccatgagacctaagtca
ggggactgagggccccaggatcaggcagatgctctccccactcaaccctg
gcccttcaacagatggaagtatcttgccttctcttccttaccctgtactt
ttgtgtgtaggatctgaccagataccctcagtagagccctgcctctccag
gcctgggaactggatgtatcctcggaaaaccttgggaaatgaggagggga
gggtacaaagcaaaatagatggtgaggaggggatgccatggtggctcctg
aaatcttccttgcacctatggaaggatcagggtgtggaagctggccaagt
aggtgttcactaggtgcatgctataaatgtcaaaggtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgagaga
gaattcaagcagagctcgcaaaggctgacacatggcttaggcatctggga
cttgtgggagggtgtgtgagaaaggagggttcacagagaggcagcaccat
ggagtacttacgtcttcagccaatgctaaacattttagctggtttgaggt
gaagctctgtatgcctgacaaagagaaactatgggcctcactgtgctgag
ggtgatatagaaacctctgtaagctggggccaaaagaccttactatattc
tttagcattcaactggaactctagggaaaataacatgccttgggctggtg
agatggctagatgagtaaaggtactggccactaacggtgacaacctaact
ttcatccttgaggaccccatggcgaaggagagaagtgactcttgggattt
gtcttttgagctctgaatgcatgctgtggtacatgcacattcacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacaatcaatcaatcaatcaa
tcaatcaattaattgatgtaaattttcttattgagtttggagagatactt
tgcagttcggagcacttgttgctcttacaaagaactcaggttcaagtccc
agtgtctatgtggtggcacactagttttaattgcagtccaaagggattcc
atgccctattgtgacctcatggagccccaagcatgtacatagtacacata
catgtataaaagcaaaatatacataaaacacattgaataaatataataga
atttaacataaacaaacctaaaaaatacatagaagaaatgccatgtatca
gaagtagaactgtcctggtcctaaaatatggactaaatagatcttcccag
gaagcttaaaaataaactcaaagactccagattagcaattgatgtcttcc
tgaaaaaaaatcataacccaaatctttctttttatatcacaaggtgcagt
ttcccctcccttcctcttctcccagtctctcccccttcgcccaccccctc
tactcctcatttctctcagaaaagggctgacttcaatggctatcatcagt
ccatggcaatagcaagttgcagtagactagggcatcctccgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_10095539_10096255
seq2: B6Ng01-207H22.b_50_766

seq1  GAATTCTGAACCTAACACAGTCCTGGGAACATTATGGTTCGTTGGCAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAACCTAACACAGTCCTGGGAACATTATGGTTCGTTGGCAGAG  50

seq1  TCCAGAGACTGAGTTCTGCACTGGTTCTGTCCCACTGGGCAGCCACACGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAGACTGAGTTCTGCACTGGTTCTGTCCCACTGGGCAGCCACACGA  100

seq1  CATTGGTGTGACCAGCTGGTCTCAGTTTCTCCACTTCCTGGATAGGACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGTGTGACCAGCTGGTCTCAGTTTCTCCACTTCCTGGATAGGACAA  150

seq1  ATCATACATATCTCTAGGGAGACCCAAATTCTAATGGAGATCACCCTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATACATATCTCTAGGGAGACCCAAATTCTAATGGAGATCACCCTGCC  200

seq1  TCCCAGGAGTTAAAGGCCATGCCTTTACCCCTGGCCAGCGACTAGGGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGAGTTAAAGGCCATGCCTTTACCCCTGGCCAGCGACTAGGGAGT  250

seq1  TCCACAGTTGCAGGTGTCTGGGCTCTGCAGTCTTGAGCAAGTCACTTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGTTGCAGGTGTCTGGGCTCTGCAGTCTTGAGCAAGTCACTTACC  300

seq1  TGTTTTGGGCCTTCACTGCCCCAAGAGCTTCTGCCATGAGACCTAAGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGGGCCTTCACTGCCCCAAGAGCTTCTGCCATGAGACCTAAGTCA  350

seq1  GGGGACTGAGGGCCCCAGGATCAGGCAGATGCTCTCCCCACTCAACCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTGAGGGCCCCAGGATCAGGCAGATGCTCTCCCCACTCAACCCTG  400

seq1  GCCCTTCAACAGATGGAAGTATCTTGCCTTCTCTTCCTTACCCTGTACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTCAACAGATGGAAGTATCTTGCCTTCTCTTCCTTACCCTGTACTT  450

seq1  TTGTGTGTAGGATCTGACCAGATACCCTCAGTAGAGCCCTGCCTCTCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGTAGGATCTGACCAGATACCCTCAGTAGAGCCCTGCCTCTCCAG  500

seq1  GCCTGGGAACTGGATGTATCCTCGGAAAACCTTGGGAAATGAGGAGGGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGAACTGGATGTATCCTCGGAAAACCTTGGGAAATGAGGAGGGGA  550

seq1  GGGTACAAAGCAAAATAGATGGTGAGGAGGGGATGCCATGGTGGCTCCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACAAAGCAAAATAGATGGTGAGGAGGGGATGCCATGGTGGCTCCTG  600

seq1  AAATCTTCCTTGCACCTATGGAAGGATCAGGGTGTGGAAGCTGGCCAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTCCTTGCACCTATGGAAGGATCAGGGTGTGGAAGCTGGCCAAGT  650

seq1  AGGTGTTCACTAGGTGCATGCTATAAATGTCAAAGGTGTGTGTGTGTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTCACTAGGTGCATGCTATAAATGTCAAAGGTGTGTGTGTGTGTG  700

seq1  TGTGTGTGTGTGAGAGA  717
      |||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGAGAGA  717

seq1: chr19_10231383_10232470
seq2: B6Ng01-207H22.g_68_1160 (reverse)

seq1  AGCGGAGG-TG-CCTAGTCTTACTGCAACTTGCTA-TGCCATGGCTGGAT  47
      |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||
seq2  AGCGGAGGATGCCCTAGTC-TACTGCAACTTGCTATTGCCATGGACTGAT  49

seq1  GATAGCCATTGAAGTCAGCCCTTTTCTGAAGAGAAATGAGGAGTAGAGGG  97
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCCATTGAAGTCAGCCCTTTTCTG-AGAGAAATGAGGAGTAGAGGG  98

seq1  GGTGGGCG-AGGGGGAGAGACTGGGAGAAGAGG-AGGGAGGGGAAACTGC  145
      |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGTGGGCGAAGGGGGAGAGACTGGGAGAAGAGGAAGGGAGGGGAAACTGC  148

seq1  A-CTTGTGATAT-AAAAGAAAGATTT-GGTTATGA-TTTTTTTCAGGAAG  191
      | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  ACCTTGTGATATAAAAAGAAAGATTTGGGTTATGATTTTTTTTCAGGAAG  198

seq1  ACATCAATTTGCTAATCTGGAGTCTTTTGAGTTTATTTTTAAGCTTCCTG  241
      ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAA-TTGCTAATCTGGAGTC-TTTGAGTTTATTTTTAAGCTTCCTG  246

seq1  GGAAGATCTATTTAGTCCATATTTTAGGACCAGGACAGTTCTACTTCTGA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATCTATTTAGTCCATATTTTAGGACCAGGACAGTTCTACTTCTGA  296

seq1  TACATGGCATTTCTTCTATGTATTTTTTAGGTTTGTTTATGTTAAATTCT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGGCATTTCTTCTATGTATTTTTTAGGTTTGTTTATGTTAAATTCT  346

seq1  ATTATATTTATTCAATGTGTTTTATGTATATTTTGCTTTTATACATGTAT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTTATTCAATGTGTTTTATGTATATTTTGCTTTTATACATGTAT  396

seq1  GTGTACTATGTACATGCTTGGGGCTCCATGAGGTCACAATAGGGCATGGA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACTATGTACATGCTTGGGGCTCCATGAGGTCACAATAGGGCATGGA  446

seq1  ATCCCTTTGGACTGCAATTAAAACTAGTGTGCCACCACATAGACACTGGG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTTTGGACTGCAATTAAAACTAGTGTGCCACCACATAGACACTGGG  496

seq1  ACTTGAACCTGAGTTCTTTGTAAGAGCAACAAGTGCTCCGAACTGCAAAG  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAACCTGAGTTCTTTGTAAGAGCAACAAGTGCTCCGAACTGCAAAG  546

seq1  TATCTCTCCAAACTCAATAAGAAAATTTACATCAATTAATTGATTGATTG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCTCCAAACTCAATAAGAAAATTTACATCAATTAATTGATTGATTG  596

seq1  ATTGATTGATTGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTGATTGATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  646

seq1  TGTGTGAATGTGCATGTACCACAGCATGCATTCAGAGCTCAAAAGACAAA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGAATGTGCATGTACCACAGCATGCATTCAGAGCTCAAAAGACAAA  696

seq1  TCCCAAGAGTCACTTCTCTCCTTCGCCATGGGGTCCTCAAGGATGAAAGT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGAGTCACTTCTCTCCTTCGCCATGGGGTCCTCAAGGATGAAAGT  746

seq1  TAGGTTGTCACCGTTAGTGGCCAGTACCTTTACTCATCTAGCCATCTCAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTGTCACCGTTAGTGGCCAGTACCTTTACTCATCTAGCCATCTCAC  796

seq1  CAGCCCAAGGCATGTTATTTTCCCTAGAGTTCCAGTTGAATGCTAAAGAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAAGGCATGTTATTTTCCCTAGAGTTCCAGTTGAATGCTAAAGAA  846

seq1  TATAGTAAGGTCTTTTGGCCCCAGCTTACAGAGGTTTCTATATCACCCTC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTAAGGTCTTTTGGCCCCAGCTTACAGAGGTTTCTATATCACCCTC  896

seq1  AGCACAGTGAGGCCCATAGTTTCTCTTTGTCAGGCATACAGAGCTTCACC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGTGAGGCCCATAGTTTCTCTTTGTCAGGCATACAGAGCTTCACC  946

seq1  TCAAACCAGCTAAAATGTTTAGCATTGGCTGAAGACGTAAGTACTCCATG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACCAGCTAAAATGTTTAGCATTGGCTGAAGACGTAAGTACTCCATG  996

seq1  GTGCTGCCTCTCTGTGAACCCTCCTTTCTCACACACCCTCCCACAAGTCC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGCCTCTCTGTGAACCCTCCTTTCTCACACACCCTCCCACAAGTCC  1046

seq1  CAGATGCCTAAGCCATGTGTCAGCCTTTGCGAGCTCTGCTTGAATTC  1088
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCCTAAGCCATGTGTCAGCCTTTGCGAGCTCTGCTTGAATTC  1093