seq1: chr19_51580584_51581649
seq2: B6Ng01-209K19.b_45_1094
seq1 GAATTCTTTGTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTTGTTTAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATT 50
seq1 TTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTAGAAAAACAAGAAAGCTAGGTGAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTAGAAAAACAAGAAAGCTAGGTGAA 100
seq1 TACATCCACCAAGGTACATTGCCACAAAACAAAGAAAATGCATACATAAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACATCCACCAAGGTACATTGCCACAAAACAAAGAAAATGCATACATAAA 150
seq1 AAGATATTGGGAGCCAAGCTGTGTTTACAATTGCTGCATGTGTATATGCA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGATATTGGGAGCCAAGCTGTGTTTACAATTGCTGCATGTGTATATGCA 200
seq1 CATCCTTTAAACATTTTAATAAGATTATCACCACTAGTATTGACTTTTTC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATCCTTTAAACATTTTAATAAGATTATCACCACTAGTATTGACTTTTTC 250
seq1 AGTTTTCATTAACTGATTTACATCTGATCTGGGTATATGTTTTCTATTTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTTTTCATTAACTGATTTACATCTGATCTGGGTATATGTTTTCTATTTC 300
seq1 ATGGTCTACCCGGTAGTTTCTAACAAGCCAGGATATTGAATATGTAACTG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGGTCTACCCGGTAGTTTCTAACAAGCCAGGATATTGAATATGTAACTG 350
seq1 AATATCTAGCTTTTCTTGTATTGTTTTTATGGATATCAAATATTATTTCC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATATCTAGCTTTTCTTGTATTGTTTTTATGGATATCAAATATTATTTCC 400
seq1 CCTTGAAGATTCTTAATATGGATTAAAATGGGTGAAGAGACCTCATTTCT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTTGAAGATTCTTAATATGGATTAAAATGGGTGAAGAGACCTCATTTCT 450
seq1 TAGATATATTCTGGATGTAGAATCCAAAGCAAAGGATTTTCAGGTTTTTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGATATATTCTGGATGTAGAATCCAAAGCAAAGGATTTTCAGGTTTTTT 500
seq1 TCATCAATATTCTAGGTGTTCAAACAGTTTTCTCTCTCTGACTTATTAGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCATCAATATTCTAGGTGTTCAAACAGTTTTCTCTCTCTGACTTATTAGA 550
seq1 AACCAGAAACTAAAGTTTCTGATAATTTTTAATATCAACTTCATTGTCCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACCAGAAACTAAAGTTTCTGATAATTTTTAATATCAACTTCATTGTCCT 600
seq1 ATAACTGTTGAGTGGCTGTTTGTTCTGTGTTTCTGCCTTTTACCAGAGAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAACTGTTGAGTGGCTGTTTGTTCTGTGTTTCTGCCTTTTACCAGAGAG 650
seq1 CAGATATGTTGCCCAGGGAAGAAGAAACACAGGGACATTAGGCTGACCTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGATATGTTGCCCAGGGAAGAAGAAACACAGGGACATTAGGCTGACCTT 700
seq1 CTTTATTGCCACTGGGATGCCCGGCCACTGAAACACTGCTCAGGGAAGGC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTATTGCCACTGGGATGCCCGGCCACTGAAACACTGCTCAGGGAAGGC 750
seq1 GAAGTGCAGTCTAAGATCAGGGTTCCAGCTGGTGTTTCTCCAGGTGAGAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGTGCAGTCTAAGATCAGGGTTCCAGCTGGTGTTTCTCCAGGTGAGAA 800
seq1 TCAGTGGGAGCTGGAAGGGATGCTGTGGTTCTCAAGCTCCTGTGTACATG 850
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGTGGGAGCTGGAAAGGATGCTGTGGTTCTCAAGCTCCTGTGTACATG 850
seq1 GAGGAGTTGGGGACAGGAGTCTGCAGATGGTGGGGGAAGTAGGAATCCAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGAGTTGGGGACAGGAGTCTGCAGATGGTGGGGGAAGTAGGAATCCAG 900
seq1 CTTAGCTTTACATGAGTACCAGGAGTGCTAAGTGGCTAGAAGAAGGATCT 950
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2 CTTAGCTTTACATGAGTA-CAGGAGTGCTAAGTGGCTAGAA-AAGGAT-T 947
seq1 TCTCCCAGAGGGAGACTTGGCACAGCTCTGTATGGTGAAGCACTTCCCCC 1000
| | ||||| |||||||| | | | |||| |||| ||||||||| ||||
seq2 TTTTCCAGA-GGAGACTT-GTAAACTTCTG-ATGG-GAAGCACTT-CCCC 992
seq1 TCCCCACCATGGTAGTTCTTGATGAAGAAGACAGTCTCTGCTTGTCCAAA 1050
|||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |
seq2 TCCC--ACATGGT-GT--CTGAAGAAGAAGACAGTC-CTGC-TGTCC-CA 1034
seq1 CTGTTTTTTTTTTTTT 1066
||||||||| ||||||
seq2 CTGTTTTTTATTTTTT 1050
| seq1: chr9_59371276_59371650
seq2: B6Ng01-209K19.g_83_147 (reverse)
seq1 --TCTCACACACACACACACACACACACACACACACAT---GAGATTGGG 45
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
seq2 TCTCACACACACACACACACACACACACACACACACATACACACACAAAT 50
seq1 GTTTGAAACAGGTTTGGCTATGTAACCCAGGGTAGTCTCGAACTCACTAT 95
||| ||| |||
seq2 CCCAGAACCAG--ATGG--------------------------------- 65
seq1 CTTCTTCCCTCAGTCTACCAAGGAATAAGATTACAGGCATGTGCTACCAT 145
seq2 -------------------------------------------------- 65
seq1 GCTTAACATATATATATATATATGTTATATATTTTTATTTATTTATTTAT 195
seq2 -------------------------------------------------- 65
seq1 TTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAG 245
seq2 -------------------------------------------------- 65
seq1 CTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTGG 295
seq2 -------------------------------------------------- 65
seq1 GCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCTGACTGCTCTTCCGAAGG 345
seq2 -------------------------------------------------- 65
seq1 TCTGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGG 375
seq2 ------------------------------ 65
|
