BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214F08
Chromosome19 (Build37)
Map Location 31,922,775 - 32,048,834
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1810073H04Rik
Upstream genePrkg1, LOC625995, Cstf2t, 8430431K14Rik
Downstream geneAsah2, EG668042, Sgms1, 2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214F08.bB6Ng01-214F08.g
ACCGA031610GA031611
length1,022597
definitionB6Ng01-214F08.b B6Ng01-214F08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,047,811 - 32,048,834)(31,922,775 - 31,923,371)
sequence
gaattcaccaacttgcttctaatatgcaatgtagcctgtactgaagattt
ctgtctcagtgggattccctggctctttcatggtagtcccttgtttgggt
gagactaactactgtccttagtaaacactgtgcagaccagccctgagctg
ctggctccatcttttgtaatgattaattagttactgtctctatcaagctc
ctcggcttcaagcattttctaggacattggaacactggcgaaggctctgg
ctatgtcagaattcaaacttaaaagacacttataataaaataatactaaa
agagagcacgcggatccatacactagactaatgctgggatagggtgtgag
tatacaggttatgagaacgccaaagctccaggaggtaagttccttttgaa
actctatgcctcgtgagtgctcctaggcttctcagcctgtcaagaagact
tcactggagggtgcgtggcaatcccccctttttttccttttgtacctaga
accaggtagcatgtttcaggaaaaaggaatcctgctgcaatttctgttcc
atctttggtgcttctccgtaagaagagtctaagttatatggcttcttcat
agtttgtctaagccttgatttgtcttgaggttgaatttggctttctaagc
agaaaggtgttcttttcaatgccatggtgggccagaactacacacaggtg
aggcagcatatctctagagatctaaaatgtgtgaaaataagttggggtcc
tagatgacatttggtgatatggatgctcagccagctgtgtggtaaaagta
gacagatggctcggggcagctccagtgaggatgggaccttggacctttag
accccagcatctgtggctagctcccaagtgaaatgtgggatgttaacctt
tgagtgatgactgccatggaatttaagtggaaaggaatagtcctcacagt
atcatgttttcttgatacactctctctccattaagtgttattaagtgtat
ggaagaatttggcaaaatttgt
gaattctctaatgctgagtttccttcaagatgcaaccataaggccatgaa
ggaaagcatcatgggagaaatgcacctgtcagcatagcagcaagccactt
aagcaggttaagggagtggtgagtttgggacaagatcccacccagctaag
catgcaaatatggtgggtagtacatatctttaatcctaggagaaagaggc
aagcagatatttgaattcaaagccagcctggtatagagcaagttgaagta
ataaataaataaataaataaataaataaataaataaaaaacttaagtgca
ggaatggtggtacatgcctttgatcccaacattcaggacacagagccttg
caggtctcttgagttcaaggtcaagctacagagcaagttccttgacagct
aagcttaggcagtgaaggagttggaaaacagaaagctggtgataatgtaa
tagaacaagtcagggggcatgttccagctccaacaagcagcagaacttgg
cagtttcggccacgtagctctggctttagagtcaagaatgggagactact
gggacaattggtgctggttaggtgaagctaagatattagtggtgatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_32047811_32048834
seq2: B6Ng01-214F08.b_47_1068 (reverse)

seq1  ACAAATTTTTGCCTAATTTCTTTCCATACACTTAATAACACTTAATGGAG  50
      ||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAA-TTTTGCCAAATT--CTTCCATACACTTAATAACACTTAATGGAG  47

seq1  AGAGAGTGTATC-AGAAAACATGATACTTGTGAGGACTATTTCTTTTCCA  99
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||
seq2  AGAGAGTGTATCAAGAAAACATGATAC-TGTGAGGACTA-TTCCTTTCCA  95

seq1  CTTAATTTCCATGGCAGTCATCACTC-AAGGTTAACATCCCACATTTCAC  148
      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATTCCATGGCAGTCATCACTCAAAGGTTAACATCCCACATTTCAC  145

seq1  TTGGGAGCTAGCCACAGATGCTGGGGTCT-AAGGTCCAAGGTCCCATCCT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGCTAGCCACAGATGCTGGGGTCTAAAGGTCCAAGGTCCCATCCT  195

seq1  CACTGGAGCTGCCCCGAGCCATCTGTCTACTTTTACCACACAGCTGGCTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAGCTGCCCCGAGCCATCTGTCTACTTTTACCACACAGCTGGCTG  245

seq1  AGCATCCATATCACCAAATGTCATCTAGGACCCCAACTTATTTTCACACA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCATATCACCAAATGTCATCTAGGACCCCAACTTATTTTCACACA  295

seq1  TTTTAGATCTCTAGAGATATGCTGCCTCACCTGTGTGTAGTTCTGGCCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGATCTCTAGAGATATGCTGCCTCACCTGTGTGTAGTTCTGGCCCA  345

seq1  CCATGGCATTGAAAAGAACACCTTTCTGCTTAGAAAGCCAAATTCAACCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGCATTGAAAAGAACACCTTTCTGCTTAGAAAGCCAAATTCAACCT  395

seq1  CAAGACAAATCAAGGCTTAGACAAACTATGAAGAAGCCATATAACTTAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACAAATCAAGGCTTAGACAAACTATGAAGAAGCCATATAACTTAGA  445

seq1  CTCTTCTTACGGAGAAGCACCAAAGATGGAACAGAAATTGCAGCAGGATT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTTACGGAGAAGCACCAAAGATGGAACAGAAATTGCAGCAGGATT  495

seq1  CCTTTTTCCTGAAACATGCTACCTGGTTCTAGGTACAAAAGGAAAAAAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTCCTGAAACATGCTACCTGGTTCTAGGTACAAAAGGAAAAAAAG  545

seq1  GGGGGATTGCCACGCACCCTCCAGTGAAGTCTTCTTGACAGGCTGAGAAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGATTGCCACGCACCCTCCAGTGAAGTCTTCTTGACAGGCTGAGAAG  595

seq1  CCTAGGAGCACTCACGAGGCATAGAGTTTCAAAAGGAACTTACCTCCTGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGAGCACTCACGAGGCATAGAGTTTCAAAAGGAACTTACCTCCTGG  645

seq1  AGCTTTGGCGTTCTCATAACCTGTATACTCACACCCTATCCCAGCATTAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTGGCGTTCTCATAACCTGTATACTCACACCCTATCCCAGCATTAG  695

seq1  TCTAGTGTATGGATCCGCGTGCTCTCTTTTAGTATTATTTTATTATAAGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTGTATGGATCCGCGTGCTCTCTTTTAGTATTATTTTATTATAAGT  745

seq1  GTCTTTTAAGTTTGAATTCTGACATAGCCAGAGCCTTCGCCAGTGTTCCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTAAGTTTGAATTCTGACATAGCCAGAGCCTTCGCCAGTGTTCCA  795

seq1  ATGTCCTAGAAAATGCTTGAAGCCGAGGAGCTTGATAGAGACAGTAACTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCTAGAAAATGCTTGAAGCCGAGGAGCTTGATAGAGACAGTAACTA  845

seq1  ATTAATCATTACAAAAGATGGAGCCAGCAGCTCAGGGCTGGTCTGCACAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATCATTACAAAAGATGGAGCCAGCAGCTCAGGGCTGGTCTGCACAG  895

seq1  TGTTTACTAAGGACAGTAGTTAGTCTCACCCAAACAAGGGACTACCATGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTACTAAGGACAGTAGTTAGTCTCACCCAAACAAGGGACTACCATGA  945

seq1  AAGAGCCAGGGAATCCCACTGAGACAGAAATCTTCAGTACAGGCTACATT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCCAGGGAATCCCACTGAGACAGAAATCTTCAGTACAGGCTACATT  995

seq1  GCATATTAGAAGCAAGTTGGTGAATTC  1024
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATTAGAAGCAAGTTGGTGAATTC  1022

seq1: chr19_31922775_31923371
seq2: B6Ng01-214F08.g_67_663

seq1  GAATTCTCTAATGCTGAGTTTCCTTCAAGATGCAACCATAAGGCCATGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTAATGCTGAGTTTCCTTCAAGATGCAACCATAAGGCCATGAA  50

seq1  GGAAAGCATCATGGGAGAAATGCACCTGTCAGCATAGCAGCAAGCCACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGCATCATGGGAGAAATGCACCTGTCAGCATAGCAGCAAGCCACTT  100

seq1  AAGCAGGTTAAGGGAGTGGTGAGTTTGGGACAAGATCCCACCCAGCTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGTTAAGGGAGTGGTGAGTTTGGGACAAGATCCCACCCAGCTAAG  150

seq1  CATGCAAATATGGTGGGTAGTACATATCTTTAATCCTAGGAGAAAGAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAAATATGGTGGGTAGTACATATCTTTAATCCTAGGAGAAAGAGGC  200

seq1  AAGCAGATATTTGAATTCAAAGCCAGCCTGGTATAGAGCAAGTTGAAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGATATTTGAATTCAAAGCCAGCCTGGTATAGAGCAAGTTGAAGTA  250

seq1  ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAACTTAAGTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAAACTTAAGTGCA  300

seq1  GGAATGGTGGTACATGCCTTTGATCCCAACATTCAGGACACAGAGCCTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGGTGGTACATGCCTTTGATCCCAACATTCAGGACACAGAGCCTTG  350

seq1  CAGGTCTCTTGAGTTCAAGGTCAAGCTACAGAGCAAGTTCCTTGACAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCTCTTGAGTTCAAGGTCAAGCTACAGAGCAAGTTCCTTGACAGCT  400

seq1  AAGCTTAGGCAGTGAAGGAGTTGGAAAACAGAAAGCTGGTGATAATGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTAGGCAGTGAAGGAGTTGGAAAACAGAAAGCTGGTGATAATGTAA  450

seq1  TAGAACAAGTCAGGGGGCATGTTCCAGCTCCAACAAGCAGCAGAACTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACAAGTCAGGGGGCATGTTCCAGCTCCAACAAGCAGCAGAACTTGG  500

seq1  CAGTTTCGGCCACGTAGCTCTGGCTTTAGAGTCAAGAATGGGAGACTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTCGGCCACGTAGCTCTGGCTTTAGAGTCAAGAATGGGAGACTACT  550

seq1  GGGACAATTGGTGCTGGTTAGGTGAAGCTAAGATATTAGTGGTGATT  597
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAATTGGTGCTGGTTAGGTGAAGCTAAGATATTAGTGGTGATT  597