BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232L15
Chromosome19 (Build37)
Map Location 35,798,688 - 35,970,380
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA830019P07Rik
Upstream geneSlc16a12, LOC676714, Pank1, Mphosph1, LOC383464, LOC100042292
Downstream geneHtr7, Rpp30, Ankrd1, LOC668195, Pcgf5, LOC668201, Hectd2, LOC668215, Ppp1r3c, Tnks2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232L15.bB6Ng01-232L15.g
ACCGA044986GA044987
length214800
definitionB6Ng01-232L15.b B6Ng01-232L15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,798,688 - 35,798,901)(35,969,584 - 35,970,380)
sequence
catcatatcagaggaaggatgtgttagatacagttgacggtgttgtcata
aatcaatgggaggagaggtccttggtcctatgaaggctttatatagatgc
tccagtgtaggggaactgagggcagagaggtgggaggaggtaggtggtag
gaggagcaccctcatagaagaagggggagggaggatgaaatagtgggttc
cttgggggggggga
gaattctctctaatttatacaattttatctttccagaatcttttctccat
atctctcagtgttcacatgtacgtctatggcttaaataaatgcctaagca
atgaaattccatatataaatatatatatgtaagtatatgtattttatgtg
aacatgtatatatgtacttatatacatatacacatatgcataaaaatata
tggaattatattgcatatgtgtgtgtatatctatgcatgtgcgtgcttgt
gtatcaattactagtactcaattttgcaaaaatataatatctgtgttgag
gattaagctcagccactaaagtgttctgatgcaaacaagaggatctgagt
gctgcatgaaaagtctgggtgtggttgtacaaatttatattcctggcatt
gggaaggaagaggcaaaagcattcctgaggacccctgccgagccagttta
tcctaaccactgaattccaagtcaatgcacggtctctaaaaataaagtgg
tggttcccgagaagcagttgaggttgacttctggtcaccacatacacttt
aacaatttctctgtatatgtgcagacaattgtgtggtgtatatgtatgta
ggcataggcactttgtttatgaatattgtgtatgtatgtatatgtatgtg
tgagagagcacaatatattgtacttctatactgactattttgacttaact
ggggtaatgttcactatgtatttagggtgtattataattttcagtaggtg
tcattttagttttaattattttcactgtactttgccatttgctattgtta

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_35798688_35798901
seq2: B6Ng01-232L15.b_49_262

seq1  CATCATATCAGAGGAAGGATGTGTTAGATACAGTTGACGGTGTTGTCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATATCAGAGGAAGGATGTGTTAGATACAGTTGACGGTGTTGTCATA  50

seq1  AATCAATGGGAGGAGAGGTCCTTGGTCCTATGAAGGCTTTATATAGATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATGGGAGGAGAGGTCCTTGGTCCTATGAAGGCTTTATATAGATGC  100

seq1  TCCAGTGTAGGGGAACTGAGGGCAGAGAGGTGGGAGGAGGTAGGTGGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGTAGGGGAACTGAGGGCAGAGAGGTGGGAGGAGGTAGGTGGTAG  150

seq1  GAGGAGCACCCTCATAGAAGAAGGGGGAGGGAGGATGAAATAGTGGGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCACCCTCATAGAAGAAGGGGGAGGGAGGATGAAATAGTGGGTTC  200

seq1  CTTGGGGGGGGGGA  214
      ||||||||||||||
seq2  CTTGGGGGGGGGGA  214

seq1: chr19_35969584_35970380
seq2: B6Ng01-232L15.g_68_867 (reverse)

seq1  TAACAATAGCAAATGGCAAAGTACAGTGAAAAT-ATTAAAACT-AAATGA  48
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  TAACAATAGCAAATGGCAAAGTACAGTGAAAATAATTAAAACTAAAATGA  50

seq1  CACCTACTGAAAATTATAATACACCCTAAATACATAGTGAACATTACCCC  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTACTGAAAATTATAATACACCCTAAATACATAGTGAACATTACCCC  100

seq1  AGTTAAGTCAAAATAGTCAGTATAGAAGTACAATATATTGTGCTCTCTCA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAGTCAAAATAGTCAGTATAGAAGTACAATATATTGTGCTCTCTCA  150

seq1  CACATACATATACATACATACACAATATTCATAAACAAA-TGCCTATGCC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACATACATATACATACATACACAATATTCATAAACAAAGTGCCTATGCC  200

seq1  TACATACATATACACCACACAATTGTCTGCACATATACAGAGAAATTGTT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACATATACACCACACAATTGTCTGCACATATACAGAGAAATTGTT  250

seq1  AAAGTGTATGTGGTGACCAGAAGTCAACCTCAACTGCTTCTCGGGAACCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTATGTGGTGACCAGAAGTCAACCTCAACTGCTTCTCGGGAACCA  300

seq1  CCACTTTATTTTTAGAGACCGTGCATTGACTTGGAATTCAGTGGTTAGGA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTATTTTTAGAGACCGTGCATTGACTTGGAATTCAGTGGTTAGGA  350

seq1  TAAACTGGCTCGGCAGGGGTCCTCAGGAATGCTTTTGCCTCTTCCTTCCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGGCTCGGCAGGGGTCCTCAGGAATGCTTTTGCCTCTTCCTTCCC  400

seq1  AATGCCAGGAATATAAATTTGTACAACCACACCCAGACTTTTCATGCAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCAGGAATATAAATTTGTACAACCACACCCAGACTTTTCATGCAGC  450

seq1  ACTCAGATCCTCTTGTTTGCATCAGAACACTTTAGTGGCTGAGCTTAATC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGATCCTCTTGTTTGCATCAGAACACTTTAGTGGCTGAGCTTAATC  500

seq1  CTCAACACAGATATTATATTTTTGCAAAATTGAGTACTAGTAATTGATAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACACAGATATTATATTTTTGCAAAATTGAGTACTAGTAATTGATAC  550

seq1  ACAAGCACGCACATGCATAGATATACACACACATATGCAATATAATTCCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCACGCACATGCATAGATATACACACACATATGCAATATAATTCCA  600

seq1  TATATTTTTATGCATATGTGTATATGTATATAAGTACATATATACATGTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTTTATGCATATGTGTATATGTATATAAGTACATATATACATGTT  650

seq1  CACATAAAATACATATACTTACATATATATATTTATATATGGAATTTCAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAAAATACATATACTTACATATATATATTTATATATGGAATTTCAT  700

seq1  TGCTTAGGCATTTATTTAAGCCATAGACGTACATGTGAACACTGAGAGAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGGCATTTATTTAAGCCATAGACGTACATGTGAACACTGAGAGAT  750

seq1  ATGGAGAAAAGATTCTGGAAAGATAAAATTGTATAAATTAGAGAGAATTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGAAAAGATTCTGGAAAGATAAAATTGTATAAATTAGAGAGAATTC  800