BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-278D06
Chromosome19 (Build37)
Map Location 32,066,047 - 32,239,202
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAsah2, EG668042, Sgms1
Upstream genePrkg1, Cstf2t, 8430431K14Rik, 1810073H04Rik
Downstream gene2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik, 6530404N21Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-278D06.bB6Ng01-278D06.g
ACCGA078511GA078512
length1,1611,079
definitionB6Ng01-278D06.b B6Ng01-278D06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,066,047 - 32,067,217)(32,238,116 - 32,239,202)
sequence
gaattctacagaatcatctcaactccttcacccagctcacttctcaaccg
gtttacaaaaaggctggctagtctttccaggaatccctgtgaccagggaa
aactgaagttcatggaagcttgtctggggccatagctcagagatatggca
ccttcttactatgtgccagaatctagattccacctactacaccactgaaa
taaagccaaagaatggcagctaacaccccattagtacctaatcctaaaga
aagctgcactatgctgcttccagtcaagacagtcaaaatgaggcctaata
aatctgttaaatgtggccagaaggagccttgggaatttggtatgattaat
attatgtattgagaagtcttttagtttgtccttcctacattgtgaagcaa
ctgttttctaagcttccaagacaaatgatcaatagacatgtttacctcgt
ctcccaggaggcatcgttatacattatctgccagtcagctacagagtcct
cgtatttctccacagtgaggaaggtttgatgggtctgaaatacaattaac
accacttatcaagctcaagcagttagagggaggtccggtctgcactgtct
ctccttgatacacagcaatccagtcatgcctgctgctgtgagcacacaca
aggattttacccaaataactagataacccctgtattcagtgtcttcagaa
taacagtttaccctccctcaaataaaatggaagtttaggaattttaaaaa
agcataattatggtgttcacagcaaattagagctgagaagaaattcaaca
tgaaatgcgattttaaaaagatttaagtcaagattaagagtgaaagattt
tctctaatcagcaagggaatgggacttcaactctgcctttggataactga
attattagttgccatgccttcctcagtcaaaaaggtaaaaaaactcataa
attgcccctgtcctagggtctaaagacacctctactaataatagatgcct
agaaactatacataaacagattgtgtttctattactgaagatactataaa
gcattggttcagaccagagtcagcttcaaatacaggagaagaattggaat
aatatgaacaataataataaaatggccatggtgtcacttactatcagact
taagctgcctc
gaattctagaccagtcatcatctgactggacttcaatctctaaaaattat
agataaatgagagttcccatacctcttctgtctctcaaattatgtaatat
ttgaagaggaaatgtttatttcatttttattcttctgttatttcttccct
attttgtacaataaatccagtaagctaggccatgtattagttcaacctgg
cttttctagatgatggtggttgttacccaagccgacctgtcttctagatc
aagctgtaaagatgttttgcctgtctccatttggaactgcttcactacat
ctctattgagtgagcaaggccaggagaaaaatgagtttctcgcttctgca
tctacagcctggccctggagtctctgaacaaagttgttagcaggtgccaa
atgaaaagctaaacctctgtgtagcaggtcccttccacagaagttacctt
tcccagatgcctaacttcagcatcagctccaggaaaacagccggaatact
tgttttcaagcttcaaagcttgcttaagagtaaaggttcatgtccccgta
aagctggaaaattatctttgccctgcattagagagatcggacattaggaa
agttacctagaagtgacagcttccatgagcatttatgaagtgttactgtg
gccgcgctgggcattgggaaagaagctaggacgttatttaaagaataaga
tgcttaatgaagaaacccaaggtttttattcctttaatgtggctggagtc
tcgtaatggttgtaccctgtgtgaatgtgggtgagatacttattaggctt
ttttgttgttgttgttgttgttgttgttaagtcaaatagtctcggaacag
gtaaaggactttgataagtcatcagtgttgactgcctgacatgttaattc
ttgagcactatccaagtggtctccccccacaaatacaaatagttagattc
tgttgtattgcgtggatgtagtgagaagatttggagatgtagaagcagaa
gacttatggaagacctcttaccgcatcgtcaagatgagacaggaatcagt
cagggaagtatgggatatgtattcagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_32066047_32067217
seq2: B6Ng01-278D06.b_46_1206

seq1  GAATTCTACAGAATCATCTCAACTCCTTCACCCAGCTCACTTCTCAACCG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACAGAATCATCTCAACTCCTTCACCCAGCTCACTTCTCAACCG  50

seq1  GTTTACAAAAAGGCTGGCTAGTCTTTCCAGGAATCCCTGTGACCAGGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACAAAAAGGCTGGCTAGTCTTTCCAGGAATCCCTGTGACCAGGGAA  100

seq1  AACTGAAGTTCATGGAAGCTTGTCTGGGGCCATAGCTCAGAGATATGGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAGTTCATGGAAGCTTGTCTGGGGCCATAGCTCAGAGATATGGCA  150

seq1  CCTTCTTACTATGTGCCAGAATCTAGATTCCACCTACTACACCACTGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTACTATGTGCCAGAATCTAGATTCCACCTACTACACCACTGAAA  200

seq1  TAAAGCCAAAGAATGGCAGCTAACACCCCATTAGTACCTAATCCTAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCCAAAGAATGGCAGCTAACACCCCATTAGTACCTAATCCTAAAGA  250

seq1  AAGCTGCACTATGCTGCTTCCAGTCAAGACAGTCAAAATGAGGCCTAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGCACTATGCTGCTTCCAGTCAAGACAGTCAAAATGAGGCCTAATA  300

seq1  AATCTGTTAAATGTGGCCAGAAGGAGCCTTGGGAATTTGGTATGATTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTTAAATGTGGCCAGAAGGAGCCTTGGGAATTTGGTATGATTAAT  350

seq1  ATTATGTATTGAGAAGTCTTTTAGTTTGTCCTTCCTACATTGTGAAGCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTATTGAGAAGTCTTTTAGTTTGTCCTTCCTACATTGTGAAGCAA  400

seq1  CTGTTTTCTAAGCTTCCAAGACAAATGATCAATAGACATGTTTACCTCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTCTAAGCTTCCAAGACAAATGATCAATAGACATGTTTACCTCGT  450

seq1  CTCCCAGGAGGCATCGTTATACATTATCTGCCAGTCAGCTACAGAGTCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGGAGGCATCGTTATACATTATCTGCCAGTCAGCTACAGAGTCCT  500

seq1  CGTATTTCTCCACAGTGAGGAAGGTTTGATGGGTCTGAAATACAATTAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTATTTCTCCACAGTGAGGAAGGTTTGATGGGTCTGAAATACAATTAAC  550

seq1  ACCACTTATCAAGCTCAAGCAGTTAGAGGGAGGTCCGGTCTGCACTGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTTATCAAGCTCAAGCAGTTAGAGGGAGGTCCGGTCTGCACTGTCT  600

seq1  CTCCTTGATACACAGCAATCCAGTCATGCCTGCTGCTGTGAGCACACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTGATACACAGCAATCCAGTCATGCCTGCTGCTGTGAGCACACACA  650

seq1  AGGATTTTACCCAAATAACTAGATAACCCCTGTATTCAGTGTCTTCAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTTTACCCAAATAACTAGATAACCCCTGTATTCAGTGTCTTCAGAA  700

seq1  TAACAGTTTACCCTCCCTCAAATAAAATGGAAGTTTAGGAATTTTAAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGTTTACCCTCCCTCAAATAAAATGGAAGTTTAGGAATTTTAAAAA  750

seq1  AGCATAATTATGGTGTTCACAGCAAATTAGAGCTGAGAAGAAATTCAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAATTATGGTGTTCACAGCAAATTAGAGCTGAGAAGAAATTCAACA  800

seq1  TGAAATGCGATTTTAAAAAGATTTAAGTCAAGATTAAGAGTGAAAGATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGCGATTTTAAAAAGATTTAAGTCAAGATTAAGAGTGAAAGATTT  850

seq1  TCTCTAATCAGCAAGGGAATGGGACTTCAACTCTGCCTTTGGATAACTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAATCAGCAAGGGAATGGGACTTCAACTCTGCCTTTGGATAACTGA  900

seq1  ATTATTAGTTGCCATGCCTTCCTCAGTCAAAAAGGTAAAAAAACTCATAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTAGTTGCCATGCCTTCCTCAGTCAAAAAGGTAAAAAAACTCATAA  950

seq1  ATTGCCCCTGTCCTAGGGTTCTAAAGACACCTCTACTAATAATAGATGCC  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCCCTGTCCTAGGG-TCTAAAGACACCTCTACTAATAATAGATGCC  999

seq1  TAGAAACTATAACATAAACAGATTGTGTTTCTA-TACTGAAAGATAACTA  1049
      |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| 
seq2  TAGAAACTAT-ACATAAACAGATTGTGTTTCTATTACTG-AAGAT-ACT-  1045

seq1  ATAAAGCATTGGTTTCAGACCAAGAGTCCAGCCTCAAATACAGGAGA--G  1097
      |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||   
seq2  ATAAAGCATTGG-TTCAGACC-AGAGT-CAGCTTCAAATACAGGAGAAGA  1092

seq1  ATTTGAATAATATGACAAATTAATAAATAAAAATGGCCAT-GTGTCCACT  1146
      ||| ||||||||||| | | ||||||   ||||||||||| |||||   |
seq2  ATTGGAATAATATGA-ACAATAATAA--TAAAATGGCCATGGTGTCACTT  1139

seq1  ACTATCAAGACATTTAGGCTGCCTC  1171
      |||||| ||||  ||| ||||||||
seq2  ACTATC-AGAC--TTAAGCTGCCTC  1161

seq1: chr19_32238116_32239202
seq2: B6Ng01-278D06.g_68_1146 (reverse)

seq1  CCCCTGAATACATACCCCATACTTCCCCTGACTTGAATCCTGTCTTCATC  50
      |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||
seq2  CCCCTGAATACATATCCCATACTT-CCCTGAC-TGATTCCTGTC-TCATC  47

seq1  TTGACGATGC-GTAAGA-GTCTTCCCTAAGTCTTCTGCTTTTCTACATCC  98
      |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |
seq2  TTGACGATGCGGTAAGAGGTCTTCCATAAGTCTTCTGC--TTCTACAT-C  94

seq1  TCCAAATTCCTTCCTCACTACCATCCACGC-ATACAACAGAATCTAACTA  147
      |||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAT--CTT-CTCACTA-CATCCACGCAATACAACAGAATCTAACTA  140

seq1  TTTGTATTTGT-GGGGGAGACCACTTGGATAGTGCTCAAAGAATTAACAT  196
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTTGTATTTGTGGGGGGAGACCACTTGGATAGTGCTC-AAGAATTAACAT  189

seq1  GTCAGGCAGTCAACACTGATGACTTATCAAAGTCCTTTACCTGTTCCGAG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGCAGTCAACACTGATGACTTATCAAAGTCCTTTACCTGTTCCGAG  239

seq1  ACTATTTTGACTTAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAAAGCCTAAT  296
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTA-TTTGACTTAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAAAGCCTAAT  288

seq1  AAGTATCTCACCCACATTCACACAGGGTACAACCATTACGAGACTCCAGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATCTCACCCACATTCACACAGGGTACAACCATTACGAGACTCCAGC  338

seq1  CACATTAAAGGAATAAAAACCTTGGGTTTCTTCATTAAGCATCTTATTCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTAAAGGAATAAAAACCTTGGGTTTCTTCATTAAGCATCTTATTCT  388

seq1  TTAAATAACGTCCTAGCTTCTTTCCCAATGCCCAGCGCGGCCACAGTAAC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAACGTCCTAGCTTCTTTCCCAATGCCCAGCGCGGCCACAGTAAC  438

seq1  ACTTCATAAATGCTCATGGAAGCTGTCACTTCTAGGTAACTTTCCTAATG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCATAAATGCTCATGGAAGCTGTCACTTCTAGGTAACTTTCCTAATG  488

seq1  TCCGATCTCTCTAATGCAGGGCAAAGATAATTTTCCAGCTTTACGGGGAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGATCTCTCTAATGCAGGGCAAAGATAATTTTCCAGCTTTACGGGGAC  538

seq1  ATGAACCTTTACTCTTAAGCAAGCTTTGAAGCTTGAAAACAAGTATTCCG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACCTTTACTCTTAAGCAAGCTTTGAAGCTTGAAAACAAGTATTCCG  588

seq1  GCTGTTTTCCTGGAGCTGATGCTGAAGTTAGGCATCTGGGAAAGGTAACT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTTTCCTGGAGCTGATGCTGAAGTTAGGCATCTGGGAAAGGTAACT  638

seq1  TCTGTGGAAGGGACCTGCTACACAGAGGTTTAGCTTTTCATTTGGCACCT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGAAGGGACCTGCTACACAGAGGTTTAGCTTTTCATTTGGCACCT  688

seq1  GCTAACAACTTTGTTCAGAGACTCCAGGGCCAGGCTGTAGATGCAGAAGC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACAACTTTGTTCAGAGACTCCAGGGCCAGGCTGTAGATGCAGAAGC  738

seq1  GAGAAACTCATTTTTCTCCTGGCCTTGCTCACTCAATAGAGATGTAGTGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACTCATTTTTCTCCTGGCCTTGCTCACTCAATAGAGATGTAGTGA  788

seq1  AGCAGTTCCAAATGGAGACAGGCAAAACATCTTTACAGCTTGATCTAGAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTCCAAATGGAGACAGGCAAAACATCTTTACAGCTTGATCTAGAA  838

seq1  GACAGGTCGGCTTGGGTAACAACCACCATCATCTAGAAAAGCCAGGTTGA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGTCGGCTTGGGTAACAACCACCATCATCTAGAAAAGCCAGGTTGA  888

seq1  ACTAATACATGGCCTAGCTTACTGGATTTATTGTACAAAATAGGGAAGAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATACATGGCCTAGCTTACTGGATTTATTGTACAAAATAGGGAAGAA  938

seq1  ATAACAGAAGAATAAAAATGAAATAAACATTTCCTCTTCAAATATTACAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAGAAGAATAAAAATGAAATAAACATTTCCTCTTCAAATATTACAT  988

seq1  AATTTGAGAGACAGAAGAGGTATGGGAACTCTCATTTATCTATAATTTTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGAGAGACAGAAGAGGTATGGGAACTCTCATTTATCTATAATTTTT  1038

seq1  AGAGATTGAAGTCCAGTCAGATGATGACTGGTCTAGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTGAAGTCCAGTCAGATGATGACTGGTCTAGAATTC  1079