BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283P23
Chromosome19 (Build37)
Map Location 33,188,605 - 33,327,878
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6530404N21Rik
Upstream geneSgms1, 2700046G09Rik, LOC100042138, LOC672490, LOC100042823, Minpp1, Papss2, Atad1, Pten, B430203M17Rik
Downstream geneLOC638381, EG668095, LOC628236, AI747699, EG668106, EG668112, EG668114, EG329055, EG433241, LOC668127, Lipf, Lipk, EG383462, Lipn, Ankrd22, Stambpl1, Acta2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283P23.bB6Ng01-283P23.g
ACCGA082812GA082813
length8881,131
definitionB6Ng01-283P23.b B6Ng01-283P23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,326,992 - 33,327,878)(33,188,605 - 33,189,739)
sequence
gaattcagtaatattgagtagattgatttttctactttactgtttagaaa
caagcatacaaattagtcctggaatattccataaacatttatgtttatgg
ggggcagttctctcatgcatgcttttctgggacttcctgccttttctcta
gttccatcatttctgctggagtccatcattcctccaacccaaacacttcc
ctcttcattctaaccgccctttcttgttggaatgcattttcttccttttt
acttatctgaatgtttaatatacacactggagaaataacgtttggtttgg
tttcttttctatagcagctattgtctaaaacacttacatacactgttcta
tacctttagttactaatttacacgaaaaatacttaaccagattgtcaact
cctcaatgacactgtgccttatactttcacatccaaccttaaaccttggt
acaataattcaaaataactcttgatgagatgacttgctccaaaccacctt
aaacatacttcacatcaaaatagaactaaatgcagcacactggggacagt
aacctgtgggtgcatagggagagttcatgtactaccaccatacaggggga
taaagtgggaggtgccaacagagtttcacctgtatctgttactggtcgat
ttgtactttgtttttattgatttgacatgtcctttctttagtttttgctt
gatttatactttggagataggtaattgacataagaacacttaacttttca
tctaatttcatgcagtaacaaaaatgctactgcaagattgtttattttac
aagaaagtatttcaaaacaaagcaagagacagctactgcatctgggccat
ctgttccgatgaagtgtagggaaggagtggggtggggg
gaattcactaaaccccaacctcctgttgaattgaggttgagacgaatgca
gaggctgtacattggacaaagcttgatctggtgacatggaggctggaggc
tccttgaaaacaggcaggtagccactataccttggaggctactttgctcc
tttaataacatcttgtgatcagaaatgaatgtaattctgaaaatttaaac
ttcagcatcagtatttcactggcaacctcttgggcaaagttgaaatgctc
ttcacaattccccatacttaaatctccagcagtgttttctttgtttttgg
aaaacaacaaaattaaaattatcctagaatcattttttttcttcaaaaac
acatattttaggcctgtgttgagactcagactgaaatggatttgtttaaa
aaaatgtctgtgtatttgatgtgggagactagtgacctttggtagtttgt
ataaaaaaaatgtttgatgtctcaaatttccctactgagcttgtattgtt
gctgcattttttttttctgtgatttttttccatgctctatcatcccccac
attcaacataagctctttaatcactcaacagagctcattccaatggcatc
ctcagatgaccgccactcacatcatgatgtcaagattgacatgagtctaa
ttctaacaatggtgaaaaaaattcaagacagagcccaagagacactgtca
ttgttgggggcgtggtaagactcatgggggaaccctgctgcctttacact
ggtggaacactgtgcacaccgacacagtcactcagaatacaaatctctaa
cagcacgatcctcagagactacaagaactcctgcagaggaagtcagtggg
cagctggcagtggcagggtcagtaggaatgacacagacccttttcttcat
taggatgagcagaaaacgatgtcaaaagggtgacaagctcagaacaccac
aaattcagcataccaacgaatccctggagccttgtctatgttcagctgtg
cagcaaagctagccactggggacaaatgtggagtaacagtgaagaagaag
caatttctaaacaccactgagctagctccacacaggtctgtgcttacaaa
ttgtaatgtcctatacttctggactaaccga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_33326992_33327878
seq2: B6Ng01-283P23.b_47_934 (reverse)

seq1  CCCCCA-CCCACTCCTTCCCTACACTTCATCGGAACAGATGGCCCAGATG  49
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCCCACTCCTTCCCTACACTTCATCGGAACAGATGGCCCAGATG  50

seq1  CAGTAGCTGTCTCTTGCTTTGTTTTGAAATACTTTCTTGTAAAATAAACA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGCTGTCTCTTGCTTTGTTTTGAAATACTTTCTTGTAAAATAAACA  100

seq1  ATCTTGCAGTAGCATTTTTGTTACTGCATGAAATTAGATGAAAAGTTAAG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGCAGTAGCATTTTTGTTACTGCATGAAATTAGATGAAAAGTTAAG  150

seq1  TGTTCTTATGTCAATTACCTATCTCCAAAGTATAAATCAAGCAAAAACTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTATGTCAATTACCTATCTCCAAAGTATAAATCAAGCAAAAACTA  200

seq1  AAGAAAGGACATGTCAAATCAATAAAAACAAAGTACAAATCGACCAGTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGGACATGTCAAATCAATAAAAACAAAGTACAAATCGACCAGTAA  250

seq1  CAGATACAGGTGAAACTCTGTTGGCACCTCCCACTTTATCCCCCTGTATG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACAGGTGAAACTCTGTTGGCACCTCCCACTTTATCCCCCTGTATG  300

seq1  GTGGTAGTACATGAACTCTCCCTATGCACCCACAGGTTACTGTCCCCAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAGTACATGAACTCTCCCTATGCACCCACAGGTTACTGTCCCCAGT  350

seq1  GTGCTGCATTTAGTTCTATTTTGATGTGAAGTATGTTTAAGGTGGTTTGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGCATTTAGTTCTATTTTGATGTGAAGTATGTTTAAGGTGGTTTGG  400

seq1  AGCAAGTCATCTCATCAAGAGTTATTTTGAATTATTGTACCAAGGTTTAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGTCATCTCATCAAGAGTTATTTTGAATTATTGTACCAAGGTTTAA  450

seq1  GGTTGGATGTGAAAGTATAAGGCACAGTGTCATTGAGGAGTTGACAATCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGATGTGAAAGTATAAGGCACAGTGTCATTGAGGAGTTGACAATCT  500

seq1  GGTTAAGTATTTTTCGTGTAAATTAGTAACTAAAGGTATAGAACAGTGTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAGTATTTTTCGTGTAAATTAGTAACTAAAGGTATAGAACAGTGTA  550

seq1  TGTAAGTGTTTTAGACAATAGCTGCTATAGAAAAGAAACCAAACCAAACG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTGTTTTAGACAATAGCTGCTATAGAAAAGAAACCAAACCAAACG  600

seq1  TTATTTCTCCAGTGTGTATATTAAACATTCAGATAAGTAAAAAGGAAGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCTCCAGTGTGTATATTAAACATTCAGATAAGTAAAAAGGAAGAA  650

seq1  AATGCATTCCAACAAGAAAGGGCGGTTAGAATGAAGAGGGAAGTGTTTGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATTCCAACAAGAAAGGGCGGTTAGAATGAAGAGGGAAGTGTTTGG  700

seq1  GTTGGAGGAATGATGGACTCCAGCAGAAATGATGGAACTAGAGAAAAGGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAGGAATGATGGACTCCAGCAGAAATGATGGAACTAGAGAAAAGGC  750

seq1  AGGAAGTCCCAGAAAAGCATGCATGAGAGAACTGCCCCCCATAAACATAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTCCCAGAAAAGCATGCATGAGAGAACTGCCCCCCATAAACATAA  800

seq1  ATGTTTATGGAATATTCCAGGACTAATTTGTATGCTTGTTTCTAAACAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTATGGAATATTCCAGGACTAATTTGTATGCTTGTTTCTAAACAGT  850

seq1  AAAGTAGAAAAATCAATCTACTCAATATTACTGAATTC  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAGAAAAATCAATCTACTCAATATTACTGAATTC  888

seq1: chr19_33188605_33189739
seq2: B6Ng01-283P23.g_63_1193

seq1  GAATTCACTAAACCCCAACCTCCTGTTGAATTGAGGTTGAGACGAATGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAAACCCCAACCTCCTGTTGAATTGAGGTTGAGACGAATGCA  50

seq1  GAGGCTGTACATTGGACAAAGCTTGATCTGGTGACATGGAGGCTGGAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGTACATTGGACAAAGCTTGATCTGGTGACATGGAGGCTGGAGGC  100

seq1  TCCTTGAAAACAGGCAGGTAGCCACTATACCTTGGAGGCTACTTTGCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGAAAACAGGCAGGTAGCCACTATACCTTGGAGGCTACTTTGCTCC  150

seq1  TTTAATAACATCTTGTGATCAGAAATGAATGTAATTCTGAAAATTTAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATAACATCTTGTGATCAGAAATGAATGTAATTCTGAAAATTTAAAC  200

seq1  TTCAGCATCAGTATTTCACTGGCAACCTCTTGGGCAAAGTTGAAATGCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCATCAGTATTTCACTGGCAACCTCTTGGGCAAAGTTGAAATGCTC  250

seq1  TTCACAATTCCCCATACTTAAATCTCCAGCAGTGTTTTCTTTGTTTTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAATTCCCCATACTTAAATCTCCAGCAGTGTTTTCTTTGTTTTTGG  300

seq1  AAAACAACAAAATTAAAATTATCCTAGAATCATTTTTTTTCTTCAAAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAACAAAATTAAAATTATCCTAGAATCATTTTTTTTCTTCAAAAAC  350

seq1  ACATATTTTAGGCCTGTGTTGAGACTCAGACTGAAATGGATTTGTTTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTTTAGGCCTGTGTTGAGACTCAGACTGAAATGGATTTGTTTAAA  400

seq1  AAAATGTCTGTGTATTTGATGTGGGAGACTAGTGACCTTTGGTAGTTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTCTGTGTATTTGATGTGGGAGACTAGTGACCTTTGGTAGTTTGT  450

seq1  ATAAAAAAAATGTTTGATGTCTCAAATTTCCCTACTGAGCTTGTATTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAAAATGTTTGATGTCTCAAATTTCCCTACTGAGCTTGTATTGTT  500

seq1  GCTGCATTTTTTTTTTCTGTGATTTTTTTCCATGCTCTATCATCCCCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCATTTTTTTTTTCTGTGATTTTTTTCCATGCTCTATCATCCCCCAC  550

seq1  ATTCAACATAAGCTCTTTAATCACTCAACAGAGCTCATTCCAATGGCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAACATAAGCTCTTTAATCACTCAACAGAGCTCATTCCAATGGCATC  600

seq1  CTCAGATGACCGCCACTCACATCATGATGTCAAGATTGACATGAGTCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATGACCGCCACTCACATCATGATGTCAAGATTGACATGAGTCTAA  650

seq1  TTCTAACAATGGTGAAAAAAATTCAAGACAGAGCCCAAGAGACACTGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACAATGGTGAAAAAAATTCAAGACAGAGCCCAAGAGACACTGTCA  700

seq1  TTGTTGGGGGCGTGGTAAGACTCATGGGGGAACCCTGCTGCCTTTACACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGGGGCGTGGTAAGACTCATGGGGGAACCCTGCTGCCTTTACACT  750

seq1  GGTGGAACACTGTGCACACCGACACAGTCACTCAGAATACAAATCTCTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAACACTGTGCACACCGACACAGTCACTCAGAATACAAATCTCTAA  800

seq1  CAGCACGATCCTCAGAGACTACAAGAACTCCTGCAGAGGAAGTCAGTGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACGATCCTCAGAGACTACAAGAACTCCTGCAGAGGAAGTCAGTGGG  850

seq1  CAGCTGGCAGTGGCAGGGTCAGTAGGAATGACACAGACCC-TTTCTTCAT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CAGCTGGCAGTGGCAGGGTCAGTAGGAATGACACAGACCCTTTTCTTCAT  900

seq1  TAGGATGAGCAGAAAACGATGTCAAAAGGGTGACAAGCTCAGAACACCAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATGAGCAGAAAACGATGTCAAAAGGGTGACAAGCTCAGAACACCAC  950

seq1  AAATTCAGGCAATACCAACGAATCCCTGGAGCCTTGTCTATGTTCAGCCT  999
      ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAATTCAG--CATACCAACGAATCCCTGGAGCCTTGTCTATGTTCAG-CT  997

seq1  GTGCAGCCAAAGCTAGCCACTGGGGACAAATGTGGAGTAAACAGTGAAAG  1049
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  GTGCAG-CAAAGCTAGCCACTGGGGACAAATGTGGAGT-AACAGTG-AAG  1044

seq1  AAGAAGCAAATTCTAAACACCACTGAGCAAGCT-CACACAGGGTCTGGTG  1098
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||
seq2  AAGAAGCAATTTCTAAACACCACTGAGCTAGCTCCACACA-GGTCT-GTG  1092

seq1  C-TACAAATTGTAAATGTC--ATACTTCTTGACTTACCGA  1135
      | |||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||
seq2  CTTACAAATTGT-AATGTCCTATACTTCTGGACTAACCGA  1131