BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-301I21
Chromosome19 (Build37)
Map Location 14,652,249 - 14,799,462
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTle4
Upstream geneOlfr1484, GA_x5J8B7W6KF8-5463415-5462623, Olfr1486-ps1, LOC671653, Olfr1487, GA_x5J8B7W6KF8-5425983-5425664, Olfr1489, Olfr1490, Olfr1491, Olfr1492-ps1, Olfr1493-ps1, Olfr1494, Olfr1495, Olfr1496, Olfr1497, Olfr1498-ps1, Olfr1499, Olfr1500, Olfr1501, Olfr1502, Olfr1503-ps1, Olfr1504, Olfr1505, EG667433
Downstream geneEG433225, EG635497, Pomc-ps1, LOC667482
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-301I21.bB6Ng01-301I21.g
ACCGA095836GA095837
length1,1691,127
definitionB6Ng01-301I21.b B6Ng01-301I21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,798,264 - 14,799,462)(14,652,249 - 14,653,406)
sequence
gaattcccagaacacctagggatatgtaagaacaggtgtgaacagccatc
caactcttgtgaacaccaggctgttgccagctgaggacaggctctctgtt
tgcattttgtttgtacaaacaaaaggatgttgcaagaaggtcactttctg
gggccgagcagcctgtgctgcttggcatagccacacacaaagcttgaccc
caaacagaagcatttccagttatgctcttgggtgtggaggaaacccttag
aatgtgcaccgtgcacgtggccaccactcctgcagcaggcagagtttggg
tggccttgttgtgctcctggttgcctgctcttggctacaggccccaatga
agggcataagggcaacagtagccttaaatcttcataaaattaagacagtt
tcaatgacttggtttgaactgattatattattgaaaagaggcagagaggt
taggcaatgcactggagcaaaaagatctggaatcccagggcaagtctctc
agtttctctcaacaaaaatagactcaggtgtaaaccaagtttttattctt
cactaaataaatggcattaaagctcactcttgaggaaatagaagttttac
ttagtgtccttatgatgtctcaccagacagttgattgtgaccaaaccaat
ggacataggtgtgacccctcacctggtgttcctcttcagcaaaagctagg
tctgtgggcattcaatagatcaacattttggacttgttcagacttttgtg
ttttattttttgatgttgctgttcatattttgagcctgtagatgatctca
ttaaatcagaacaaatgtatcacgctgttgattttcaccatgaagatttg
agtgtatataacttcccacgcgatttattggcttagtactgagagaacag
cactgcaagaggtaaggaaacagagactagattttcctctgaccctcaga
aaaccatcattactgaggtatggtacactggtaaagcacttttagattcc
caagggttctcagttgatctcacacaacaacatatgcgtggtgtgcacac
atttgtaagaaaacattctgctttgaaggtaggttaagtcattatatatt
tggagtacttgacatatcatgagcagtatcctcgcactggaaatcctttt
aagctgttttaaagcagtt
gaattcattgaggagcaggacctcatcagccagtgtatagaagacagcac
agtccctgccttcagcctttgcctggtccacagtaacttctttagcttgc
tgaaattctgttaatattccattcctttaatattactttctatacccaaa
acaaagcatctaagccctatctttaaagagctcagtctacctcagactga
aaacaaacaggtcattactgtgtttagagaaagcactcagaaacatagaa
gccataagcagcagacccaagaaaacatttctaccactgttgaccttctt
gttgatgatcattcaaatgacactaaattaccagcagctgtatgggttca
ggacaggcaatgtaaagctgtgctaacgttaaagaaaacatctcacactc
cataaagcaacgtatgtttctgatggttacaacagactgcatgacagagc
agtaaaaccacaccctgtcccccctttagactagatctgtggcgtcatgc
catgccaccaagcagtattttggttacaaatgttttctttgggcttctta
atttcatgtgtactcaacttttcttactatcactgctattccaactcaac
tgcagaagcttaagaagtttctaaaagggtactgtatgtgacgcatgctc
catattgagggaaggggtaaacaaacacaaaaaatttatgtttactaaat
aaagtacctattatagtttttgtgtttagctcatcaagaacaggatggga
aaaaatcattatttcttttgaaaaatagtagttcttcaagcaaatttaac
tcaagtttcatgtttactatgttacaacacaacaaaagaatcactaatgt
actcaggaacgtgagtcaaggatataagacttttataaaagacaagaata
tttgaaatacttcaatgcctgataaataatttagaggattgtgaacctat
attaatattcagatatctccaaagaggagaagttaagtaaatactcaaat
cctatcgatatatatatgcaagatcacacaaatgatcacaaaagctataa
ggtcgccaacagccaaatgttccttaagaaaccgtccaaccaatgcacag
atgcctggctaacctccttgtgtctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_14798264_14799462
seq2: B6Ng01-301I21.b_45_1213 (reverse)

seq1  AACTGCTTTAAAACAAGCTTTTAAAAAAGTTATTTTCTCCAGGTTGCTGA  50
      |||||||||||||| |||||    |||||  |||   |||||  ||| ||
seq2  AACTGCTTTAAAAC-AGCTT----AAAAG-GATT---TCCAG--TGC-GA  38

seq1  GTACTTTCCTCCCTGTATAT-TTAAGTACTCCAAATTATTTATAATGAAT  99
      | |   | || | || |||| | |||||||||||   || ||||||| | 
seq2  GGATACTGCT-CATG-ATATGTCAAGTACTCCAA---ATATATAATG-AC  82

seq1  TTATACTACTTTCAAAGCCAGAAAAGGTTTTTCTTTAACAATTGTGTGCA  149
      |||  |||| ||||||| |||||     |||||||  |||| ||||||||
seq2  TTAACCTACCTTCAAAG-CAGAA---TGTTTTCTT--ACAAATGTGTGCA  126

seq1  CA-CACGCATATTGTGTTGTGTTGGAGATCAAACTGAG-ACCCTTGGGAA  197
      || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |
seq2  CACCACGCATATGTTGTTGTGT--GAGATC-AACTGAGAACCCTTGGG-A  172

seq1  ATCTAAAAGTGCTTTACCAGTGTACCATACCCTCAGTTAAATGATTGGTT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||
seq2  ATCTAAAAGTGCTTTACCAGTGTACCATA-CCTCAGT--AATGA-TGGTT  218

seq1  TTCTGAGGGTCAGAGGAAAATTCTTAGTCTCTGTTTCCTTACCTCTTGCA  297
      |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGGGTCAGAGGAAAAT--CTAGTCTCTGTTTCCTTACCTCTTGCA  266

seq1  GTGCTGTTCTCTCAGTACTAAGCCAATAAATCGCGT-GGAAGTTATATAC  346
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GTGCTGTTCTCTCAGTACTAAGCCAATAAATCGCGTGGGAAGTTATATAC  316

seq1  ACTCAAATCTTCATGGTGAAAATCAACAGCGTGATACATTTGTTCTGATT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAATCTTCATGGTGAAAATCAACAGCGTGATACATTTGTTCTGATT  366

seq1  TAATGAGATCATCTACAGGCTCAAAATATGAACAGCAACATCAAAAAATA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAGATCATCTACAGGCTCAAAATATGAACAGCAACATCAAAAAATA  416

seq1  AAACACAAAAGTCTGAACAAGTCCAAAATGTTGATCTATTGAATGCCCAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAAAAGTCTGAACAAGTCCAAAATGTTGATCTATTGAATGCCCAC  466

seq1  AGACCTAGCTTTTGCTGAAGAGGAACACCAGGTGAGGGGTCACACCTATG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTAGCTTTTGCTGAAGAGGAACACCAGGTGAGGGGTCACACCTATG  516

seq1  TCCATTGGTTTGGTCACAATCAACTGTCTGGTGAGACATCATAAGGACAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTGGTTTGGTCACAATCAACTGTCTGGTGAGACATCATAAGGACAC  566

seq1  TAAGTAAAACTTCTATTTCCTCAAGAGTGAGCTTTAATGCCATTTATTTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAAAACTTCTATTTCCTCAAGAGTGAGCTTTAATGCCATTTATTTA  616

seq1  GTGAAGAATAAAAACTTGGTTTACACCTGAGTCTATTTTTGTTGAGAGAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGAATAAAAACTTGGTTTACACCTGAGTCTATTTTTGTTGAGAGAA  666

seq1  ACTGAGAGACTTGCCCTGGGATTCCAGATCTTTTTGCTCCAGTGCATTGC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGAGACTTGCCCTGGGATTCCAGATCTTTTTGCTCCAGTGCATTGC  716

seq1  CTAACCTCTCTGCCTCTTTTCAATAATATAATCAGTTCAAACCAAGTCAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCTCTCTGCCTCTTTTCAATAATATAATCAGTTCAAACCAAGTCAT  766

seq1  TGAAACTGTCTTAATTTTATGAAGATTTAAGGCTACTGTTGCCCTTATGC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTGTCTTAATTTTATGAAGATTTAAGGCTACTGTTGCCCTTATGC  816

seq1  CCTTCATTGGGGCCTGTAGCCAAGAGCAGGCAACCAGGAGCACAACAAGG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATTGGGGCCTGTAGCCAAGAGCAGGCAACCAGGAGCACAACAAGG  866

seq1  CCACCCAAACTCTGCCTGCTGCAGGAGTGGTGGCCACGTGCACGGTGCAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCAAACTCTGCCTGCTGCAGGAGTGGTGGCCACGTGCACGGTGCAC  916

seq1  ATTCTAAGGGTTTCCTCCACACCCAAGAGCATAACTGGAAATGCTTCTGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAAGGGTTTCCTCCACACCCAAGAGCATAACTGGAAATGCTTCTGT  966

seq1  TTGGGGTCAAGCTTTGTGTGTGGCTATGCCAAGCAGCACAGGCTGCTCGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGTCAAGCTTTGTGTGTGGCTATGCCAAGCAGCACAGGCTGCTCGG  1016

seq1  CCCCAGAAAGTGACCTTCTTGCAACATCCTTTTGTTTGTACAAACAAAAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGAAAGTGACCTTCTTGCAACATCCTTTTGTTTGTACAAACAAAAT  1066

seq1  GCAAACAGAGAGCCTGTCCTCAGCTGGCAACAGCCTGGTGTTCACAAGAG  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACAGAGAGCCTGTCCTCAGCTGGCAACAGCCTGGTGTTCACAAGAG  1116

seq1  TTGGATGGCTGTTCACACCTGTTCTTACATATCCCTAGGTGTTCTGGGAA  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATGGCTGTTCACACCTGTTCTTACATATCCCTAGGTGTTCTGGGAA  1166

seq1  TTC  1199
      |||
seq2  TTC  1169

seq1: chr19_14652249_14653406
seq2: B6Ng01-301I21.g_65_1191

seq1  GAATTCATTGAGGAGCAGGACCTCATCAGCCAGTGTATAGAAGACAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGAGGAGCAGGACCTCATCAGCCAGTGTATAGAAGACAGCAC  50

seq1  AGTCCCTGCCTTCAGCCTTTGCCTGGTCCACAGTAACTTCTTTAGCTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCTGCCTTCAGCCTTTGCCTGGTCCACAGTAACTTCTTTAGCTTGC  100

seq1  TGAAATTCTGTTAATATTCCATTCCTTTAATATTACTTTCTATACCCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATTCTGTTAATATTCCATTCCTTTAATATTACTTTCTATACCCAAA  150

seq1  ACAAAGCATCTAAGCCCTATCTTTAAAGAGCTCAGTCTACCTCAGACTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCATCTAAGCCCTATCTTTAAAGAGCTCAGTCTACCTCAGACTGA  200

seq1  AAACAAACAGGTCATTACTGTGTTTAGAGAAAGCACTCAGAAACATAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACAGGTCATTACTGTGTTTAGAGAAAGCACTCAGAAACATAGAA  250

seq1  GCCATAAGCAGCAGACCCAAGAAAACATTTCTACCACTGTTGACCTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATAAGCAGCAGACCCAAGAAAACATTTCTACCACTGTTGACCTTCTT  300

seq1  GTTGATGATCATTCAAATGACACTAAATTACCAGCAGCTGTATGGGTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATGATCATTCAAATGACACTAAATTACCAGCAGCTGTATGGGTTCA  350

seq1  GGACAGGCAATGTAAAGCTGTGCTAACGTTAAAGAAAACATCTCACACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGGCAATGTAAAGCTGTGCTAACGTTAAAGAAAACATCTCACACTC  400

seq1  CATAAAGCAACGTATGTTTCTGATGGTTACAACAGACTGCATGACAGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAGCAACGTATGTTTCTGATGGTTACAACAGACTGCATGACAGAGC  450

seq1  AGTAAAACCACACCCTGTCCCCCCTTTAGACTAGATCTGTGGCGTCATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAACCACACCCTGTCCCCCCTTTAGACTAGATCTGTGGCGTCATGC  500

seq1  CATGCCACCAAGCAGTATTTTGGTTACAAATGTTTTCTTTGGGCTTCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCACCAAGCAGTATTTTGGTTACAAATGTTTTCTTTGGGCTTCTTA  550

seq1  ATTTCATGTGTACTCAACTTTTCTTACTATCACTGCTATTCCAACTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATGTGTACTCAACTTTTCTTACTATCACTGCTATTCCAACTCAAC  600

seq1  TGCAGAAGCTTAAGAAGTTTCTAAAAGGGTACTGTATGTGACGCATGCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAAGCTTAAGAAGTTTCTAAAAGGGTACTGTATGTGACGCATGCTC  650

seq1  CATATTGAGGGAAGGGGTAAACAAACACAAAAAATTTATGTTTACTAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTGAGGGAAGGGGTAAACAAACACAAAAAATTTATGTTTACTAAAT  700

seq1  AAAGTACCTATTATAGTTTTTGTGTTTAGCTCATCAAGAACAGGATGGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACCTATTATAGTTTTTGTGTTTAGCTCATCAAGAACAGGATGGGA  750

seq1  AAAAATCATTATTTCTTTTGAAAAATAGTAGTTCTTCAAGCAAATTTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATCATTATTTCTTTTGAAAAATAGTAGTTCTTCAAGCAAATTTAAC  800

seq1  TCAAGTTTCATGTTTACTATGTTACAACACAACAAAAGAATCACTAATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTTCATGTTTACTATGTTACAACACAACAAAAGAATCACTAATGT  850

seq1  ACTCAGGAACGTGAGTCAAGGATATAAGACTTTTATAAAAGACAAGAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGAACGTGAGTCAAGGATATAAGACTTTTATAAAAGACAAGAATA  900

seq1  TTTGAAATACTTCAATGCCTGATAAATAATTTAGAGGATTGTGAACCTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAATACTTCAATGCCTGATAAATAATTTAGAGGATTGTGAACCTAT  950

seq1  ATTAATATTCAGAATATCTCCAAAGAGGAAGAAGTTAAAAGTAAAATTAC  1000
      |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||
seq2  ATTAATATTCAG-ATATCTCCAAAGAGG-AGAAGTT--AAGTAAA--TAC  994

seq1  TCAAAATTCCTATCGATATAATAATTATGGCAAGAATCACACAAAATGAT  1050
      |||||  |||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| 
seq2  TCAAA--TCCTATCGATAT-ATA--TAT-GCAAG-ATCACAC-AAATGA-  1035

seq1  TCACAAAAGCTTATAAAGTCGCCCAACAGCCAAATGTTTCCCTTAAAAGG  1100
      |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||   |
seq2  TCACAAAAGC-TATAAGGTCG-CCAACAGCCAAATGTT--CCTTAA---G  1078

seq1  AAACGTTCCCCAAACCACTGCCCACAAGGATTGCCTGGCTAACTCTCTTG  1150
      ||||  |||   ||||| ||| || |     ||||||||||||   ||||
seq2  AAACCGTCC---AACCAATGCACAGA-----TGCCTGGCTAACCTCCTTG  1120

seq1  TGGTCTGG  1158
      | ||||||
seq2  T-GTCTGG  1127