BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050O23.T7 (MSMg01no050_o23.b1) | MSMg01-050O23.TJ (MSMg01no050_o23.g1) |
ACC | AG279860 | AG279861 |
length | 1,195 | 1,209 |
length of high quality (start - end) | 408 (114 - 521) | 279 (113 - 391) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_o23.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_o23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_o23.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_o23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:54 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATTGGGGCTAACGATTCATATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTGGGCAG
CAGGCCAAACCATTAAGGCATTCTTTGGGGTCCTTTCCTGTGGGCTGCCA
CCTTTAAGGAGTGGCCCAGACCTAGGGGAGTCTTTCTCATCCACTTATCT
AAGAAACTCCCTCCCAGGAGCACTCCCCAGCTTGGGTTTCAGTCGCTTCC
CATCTGACAACCAAGATTAGCCACTGCATCACCGTAAACCGGGAGCCAAT
ACAAACCTCTCCTCTCCTAGGTTGTTTCTGTAGGGCATCACAGTACATGG
ACAAAAAGCGTAATTGAAAGCTTCCAAATGCCTGAGCCACTGACTGCTCT
GGCAAGAGTATTTTCATCAGACATCCTAGCCCACGGATAGTGATTTGTTT
AGCAACTTAGCAGCCACGCTGCCCTCTGGACCATGTGTGCCCCATATTCA
GTTTGGATTGTGGTCCTCCTTGCCCAGTGGTAGTGAATGGGTCCCTCTCA
GAATTCCATCCTGCTTCCAACGTCGTGGAACCATGTTTGGTACCAGTTCT
GTTAGCTTGTCTGTTGCAATAAGTGGAAATAAAAGGCTATAAAGGTTATA
AAAGAAATAGCCTGTGGAAGAGAAAGGATGACAGAGGCTAAGAGAGAGCC
TCTGTTAGGATTGTGTGGACTTCTGGGGAAAGGTTTTGGCTAAGCTGTTG
GTGGAGGGCAGGGACTCCTCTAAACTCCTACTGTGAATAGGTACAATCCC
CCATCCCACGTAACCTTTTTACAAACTTTAAATATTCCCTTATCGTCCAA
GGGTTGCAATAACTTTGGCCCCTATATTCCTCCAGTTCTTAATCCCAGAT
CAATGTAGACTTCCTGTAATGGCCTTAATGGCCCTGGTTCAGGTCAACCT
GGACCGTTTCCTAGTTTTGGGTGGGAAAATCAAATTGGCTATGTCTAACT
TCATAGGTCAATAATTAATTTTTTTTCCCCTTCCTTTTGTCTTTTCTTTT
AAAATTTGGCTAAATCCGGGGTCGGGGCTATAAATTAATGGTTTGTGTTC
CCCCTGGTAAACCCTCAATTTTCAGTGAATAGGTCCCTGGTATATTTAAT
ATAAAAATCTTCCCTATACCCCATAATACCTCTAAAATTTTTTTTTATAA
AATTCTCTTCTACCAGCCTTCCGATTGGTGCAATCTTCTTTCCTA
| ATATGGTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXCCCTTTAATGAGCAATACCGAATGGCTGAGGAGCAACTGA
ACCCTTGTAAAGCATCCTTAACCATCAGGGGAATGCAAATCAAAACAACC
CTGTGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGG
TGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATT
GTTGGTGGGACTGCAAGCTTGTACAACCACTTTGGAAATCAGTCTGGCGG
TTCCTCATAAAATTGGACATAGTACTACTGGAGGATCCCGCAATACCTCT
CCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAAGAAGGACACATGTT
CCACTATGTTTAAGACAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGACAGAT
GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGACAATGTGCTACATTTACACAATG
GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAACGAATTTATGAAATTCCTAGGCAA
CTGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTAAGGTAACCCAGTCACAAA
AGAACTCATACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAGAAT
CTTATAATACCTATACATATAAGATACAATTTGCAAAACACTTTGAACTC
TAGATTAATGAAGATCATCATGTGGACACTTTGCCCCCTTCTTACTAACT
GGGATCCACACACCCTTGGAAGGAGTTACCGAATACAAAGTTTTGTAGCT
TGTGATCAAAGGATGGAACCATTCTAGATACTGTCATATTCCGGAGAATT
CCATCCCCATAATCATCATCCCAAACACTTGGACCCCATTTGTTTACTTT
TCCCATTGATTTTCCTTTGAAATGCACCCCTGGAATAAATACTTTTTTCT
TTTTATATAGGTTTTTTTTCTGTGTGTCCTATAATATAAACCCCTTAATA
TGTGAATGTTTTTCCCCGTTTTCGCCTTTATTGGTAAGGGGAATTCATCA
GGGGTCCCCCCTTAATGGTAAGTGAACCCTTTCAAGTATAAATTCTCCCC
CAATGGTCCTCTTTAATAGAGGATAATTCTCCCATACTCCCCAATTTAAT
GTGGTGGAAATCTACATCCCATATAATTGCTTATCCCTAAACCTCTTATT
CTCCCTCCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 10 10 10 9 9 13 10 8 8 11 9 9 8 10 10 10 22 22 32 29 16 20 20 28 28 28 34 34 34 34 34 39 36 33 22 22 29 31 39 39 39 32 20 15 10 10 9
19 18 39 21 23 11 11 10 10 8 8 6 6 8 8 10 9 11 11 11 11 18 30 37 37 24 24 9 9 9 9 24 39 37 37 37 40 40 43 43 43 46 40 33 33 28 28 27 17 12
9 10 10 10 13 19 12 12 11 11 18 18 21 15 18 20 41 34 26 23 11 11 11 17 24 36 43 39 39 47 47 57 43 43 43 42 42 42 42 42 46 41 39 39 32 39 39 42 42 42
42 37 39 43 43 44 48 43 57 37 47 42 42 41 47 47 44 44 43 39 35 32 24 11 16 19 19 21 25 32 39 41 46 44 44 44 48 50 50 50 50 41 41 50 50 50 57 57 57 57
57 57 52 52 52 57 52 52 52 52 52 38 38 20 20 27 38 38 52 52 52 52 52 43 50 38 38 38 43 43 52 52 52 57 57 35 35 35 42 42 43 39 39 33 33 33 35 35 39 43
43 43 52 43 44 33 43 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 62 52 52 52 62 62 45 43 43 43 43 35 26 27 15 15 34 36 36 52 52 62
62 52 52 45 43 43 35 35 35 43 41 39 39 43 43 43 43 21 21 27 35 43 43 43 35 35 39 43 43 43 45 43 62 43 52 45 45 45 52 52 62 62 62 62 52 52 52 52 62 44
44 38 26 26 35 44 44 52 45 45 52 62 38 38 17 17 14 38 38 43 43 31 31 31 43 43 43 39 35 39 39 39 35 33 43 43 39 44 33 33 33 31 39 26 33 13 10 10 10 13
12 12 27 27 52 52 57 57 52 52 52 43 43 39 42 39 39 39 43 43 45 45 34 36 22 22 22 36 43 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 54 52 52 52 52 52 43 52
52 44 43 38 35 35 43 43 52 52 52 52 57 52 50 50 42 43 44 59 50 50 37 35 35 31 29 29 29 29 28 32 24 24 11 12 12 12 24 19 31 42 33 27 28 23 27 21 32 14
14 14 24 32 22 18 17 17 27 30 32 32 28 28 42 33 33 25 28 23 15 13 10 10 10 13 16 19 19 18 15 15 14 14 14 26 28 30 25 25 40 33 35 32 36 26 26 19 13 10
10 9 9 10 16 21 21 22 14 14 26 26 24 21 18 19 19 16 21 17 12 10 10 12 16 18 19 19 16 22 20 16 17 11 11 12 13 13 11 11 11 18 24 32 35 36 33 33 24 18
15 13 13 19 18 12 12 11 11 11 12 10 11 10 10 11 19 19 21 14 14 14 21 15 15 12 16 16 21 12 10 8 8 8 10 11 8 8 8 8 11 12 15 21 15 23 23 23 20 23
22 24 28 28 28 31 25 19 23 13 13 15 15 15 22 24 22 28 19 15 9 9 9 12 11 10 11 14 14 18 14 15 10 10 10 22 22 10 9 11 12 15 9 9 9 9 11 12 12 10
10 10 9 9 9 14 12 12 15 11 11 11 11 11 11 10 10 11 14 11 8 8 8 8 8 9 12 14 14 10 10 8 8 8 8 13 20 22 12 12 6 6 8 8 12 12 8 10 10 15
13 11 11 11 10 14 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 10 9 12 12 10 10 10 8 13 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 9 11 8 8 8 10 13 16
11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 11 11 10 14 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 13 11 9 9 8 8 9 9 10 8 8 6
7 8 8 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 10 10 11 9 10 9 9 9 9 10 10 15 16 16 15 18 10
10 10 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 9 8 11 8 8 8 8 9 9 10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9
14 10 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 16 20 16 16 10 9 10 9 9 10 9 14 13 17 13 11 9 9 10 12 12 12 10 10 10 10 10 11
11 18 18 19 13 13 10 8 8 8 8 8 10 10 11 12 8 9 9 9 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 9 12 11 11 8 8 8 8 8 8 11 16 10 10 6 6 8 8 13
11 15 9 9 6 6 6 7 10 10 11 12 8 8 8 8 8 6 8 15 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 13 10 9 8 8 8 8 10 12 8 8 6 6
6 7 10 10 8 8 6 6 8 8 7 7 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 17 21 29 19 14 12 15 17 10 10 11 8
6 6 10 15 10 10 8 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 10 9 11 10 9 8 8 8 8 8 8 7 7 9 12 7 9 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 6 10 6 9 9 8 15 8 10 8 10 6 9 9 8 8 6 6 8 11 19 23 10 15 8 6 6 10 8 19 19 26 27 30 50 50 50 50 39
39 48 37 23 23 11 11 12 9 11 9 10 10 11 9 9 9 11 11 12 12 12 16 19 23 27 30 37 44 48 53 44 35 36 25 25 25 36 33 47 37 37 36 36 25 28 16 20 19 17
11 10 11 10 12 6 8 6 6 8 8 15 19 25 24 28 30 30 36 33 30 30 30 37 37 43 43 39 37 28 28 28 30 34 32 30 28 28 40 40 43 40 43 42 42 30 30 32 32 32
33 31 29 32 37 42 43 44 44 35 35 35 42 42 44 41 44 43 46 37 37 37 37 37 24 24 13 20 20 28 24 37 28 44 23 19 19 32 24 32 35 44 42 42 42 44 31 29 28 32
32 43 32 32 32 38 32 20 20 20 36 36 36 32 27 20 20 38 38 32 35 32 44 43 29 29 29 27 33 33 44 43 52 52 43 52 52 43 43 33 39 39 57 57 57 57 39 43 39 43
39 35 35 33 43 32 38 26 26 23 38 35 35 26 35 35 43 43 43 57 57 52 52 57 43 43 39 39 39 43 43 43 43 35 39 39 43 43 62 43 45 45 43 43 43 39 35 43 27 31
31 43 33 43 29 24 11 13 13 38 29 34 13 13 12 38 23 39 39 43 43 43 21 23 35 43 44 52 52 43 43 39 43 43 35 43 43 62 43 52 52 62 62 52 62 52 54 62 62 62
62 44 44 35 27 26 27 27 35 43 43 62 43 43 39 35 38 32 14 14 14 38 26 26 18 24 16 20 23 23 35 43 43 43 35 18 18 13 13 12 18 26 15 15 12 18 11 11 11 16
13 14 20 20 44 38 32 13 13 13 28 28 27 24 24 24 24 33 39 23 35 35 19 19 10 10 13 20 26 38 43 21 21 20 27 18 24 13 13 13 21 24 13 14 14 16 16 27 32 32
27 27 33 33 41 38 20 17 17 32 32 31 29 32 29 29 28 32 23 23 22 21 30 18 14 14 9 11 13 13 19 28 19 10 9 9 9 11 24 44 57 40 36 24 23 20 20 18 22 23
11 11 11 18 19 19 24 10 10 13 26 18 15 15 12 19 19 24 12 14 14 21 21 21 23 19 19 23 28 29 40 39 43 37 36 28 25 25 28 32 39 34 28 26 13 13 18 15 8 8
6 6 8 8 12 15 11 11 12 12 12 16 12 12 12 19 17 18 10 13 12 13 10 10 10 19 18 23 14 21 21 21 19 11 11 11 16 19 27 26 22 10 10 10 14 14 14 15 16 21
13 14 14 18 18 12 12 11 11 15 15 15 17 22 21 28 15 20 20 28 24 28 22 22 19 18 16 11 11 10 11 11 15 15 13 13 13 13 17 10 12 10 16 17 18 18 11 9 9 9
9 9 16 10 13 10 15 16 25 25 10 12 7 7 12 12 19 23 20 15 15 10 10 10 10 9 16 19 29 30 37 32 26 16 15 15 19 22 12 8 7 7 10 17 10 8 8 8 10 6
6 8 8 9 9 10 15 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 13 13 14 11 9 9 11 10 11 10 12 19 22 20 18 17 18 28 23 19 10 11 10 12 13 23 15 15 13 11 12
11 9 11 10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 13 10 10 10 8 9 10 9 10 15 12 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 10 16 12 11 11 16 23 22 15 10 9 9 9 8 10
11 11 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 15 9 11 11 9 12 10 10 9 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 16 12 10 10 9 8 8 8 8 10 10
13 10 10 9 10 9 10 10 10 10 9 8 11 10 10 10 11 13 10 10 10 11 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 10 15 10 10 10 8 11 10 9 9 9 15 10 10 10 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 15 10 12 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 16 12 17 17 14 15 15 16 18 8 8 6 7 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8
8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 12 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 13 10 10 17 13 14 15 11 8 8
8 6 6 8 6 9 9 9 9 9 10 8 10 10 10 10 9 9 7 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 8 8 8 9 9 12 12 10 9 12 10 10 10 10 8 8
8 8 8 8 7 8 8 11 12 12 7 6 8 8 10 10 10 11 10 10 10 11 8 8 8 8 6 8 6 7 10 8 10 10 6 6 8 15 8 10 10 10 11 9 10 10 15 15 10 13
10 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 9 11 11 12 9 11 11 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 16 12 11 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 10 6 6 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 9 9 8 7 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8
13 13 10 9 9 11 9 13 11 |