BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062M13.T7 (MSMg01no062_m13.b1) | MSMg01-062M13.TJ (MSMg01no062_m13.g1) |
ACC | AG288677 | AG288678 |
length | 1,163 | 1,209 |
length of high quality (start - end) | --- | 716 (86 - 801) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_m13.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_m13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_m13.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_m13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:44 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCGTTTTTTGTNTNTACATTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCAGATATTTGGTGCAGCCCATTTTTGAATTGTGATTCCT
TTAGAGATACAGAAATAGACCAGAAGTGAGTCTGTTTCACGAGCATCCTG
AATCTCAAGGATGAGATCAGGACTAACAATTTCAAGCATGGCTCATTATT
GGACACTCAGAGTCATGAAGACAGGTCTAAATGACTACTGTAATCATTGA
ACATCAAATAATACTCCGGTTAGCGGTCCCCTAACTGTAGGTCATGAGAC
TGTGGTGAGACTGATAAGTGGTGGCCACCTAGGTGAAAATGTTACCTGAC
AAGTGTGGAGACCTGTCTCTCATGTAAAGCAAGGGATTCCTCAGTTCAGG
TTCTTCTTGTGTTAACATTATAAAGTACCCTGCAGAGGATACGCGTAGAG
TACCTTACATGCTATATACGAAATTCTGAATCGACTCCCTCCTATTGATA
ACTAATTCCGCCATGTATATTATGGCGACTGAGATGTGATATCTTATGCC
GCTGCACTGTTTTTATTTTTAATATATCATACTCTTGCTCTGCGCAAGAT
TAATCACCAACCCAATTTCATTGCACACTTTCTCCCTCATACAATCAGTC
TTGCTACCTGTTTTTCTCAAAGCAGCCGGACCCATTTTTTGCTAGATTAC
AGTATACATCTGAATAAGAGCTTGAGCACGTACTGCTGTTAACTTGAGAG
ATTGTATTTGATAGAGTTTTCACAGGCCTCGCGAATTTGTGCCTTATTCT
TTGCTTACTGAGAGAGATTTTCATGGCAGTCTTAGTTTTTAAAAATACGA
ACATTCTGACTCCGAACCAATTGCTACCTTCGTTATTGACTGAAACATCA
CTTGTATTTGATTTTATTGGGCAGACCTGATGTCAATATACTTGGTAAGA
GGTTCCAAAAATCCTGTCATTCGTTTTGTCATTTTACTTTAATCTAGGCT
GATACTCTTGTTTTCTCTCTCTGTAATTTACTTTTATTTTTTTTTTTGGA
ATACCAAGTTTTCTTGGTCTACTTCTAACCCTTTTGTTTTTTAAAATAAA
GTATTTTTTCATCTTTTTCCATTTGTTCCTCTCATATAATTTTTATTAAA
TGTGTGTATTTCC
| CGTTCTTTTTNNNATAGATGTGAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAATAAGGTTTTACTAGTTAT
AAAAATGAAAAAATTACCCCAAGAATTTAATATGCCCACTTCAAAACACT
TGATAAAGTTATGAATTAATTTAAACCTACTTTATAGAGTATAAATCTTT
AGATTTTTAGCACAAAAAGTGGGCTTCTCAGCCAGATGTGATGGTGCACA
TGCACTCCCAGCACTCAGGAGAAGCAGGCAGGAGAATCAGGAGTGCAAGC
TCATTCTTCTTTAAACAAAAAAACAAAACTAAAACTAAAATTAGGAAATG
GAAAAGAATGTTTGTCTAAAACATTCAGAAGGCACTCTGAATTTTAGATT
TGACTAAAGTCTAATACACTGATGGCGTGTGTTTCTTCTATAGACCCTAC
CGTGGTGTTTCCTCACATTTTCAATGGGTCCAGGAATAGAAAACATCTAC
AATAAAGAAAACACATCATATAAAGCTTTTTATTATTATCATTATTATTT
CTTTTTTCATTATTATTTCTTAAAGAAATTTTTAAAAATTATGTTATCTT
CATTATTTAACATTAATAACATACCTATTAAAGTATTAATTTGCCAGTCT
TTGTTCTAAAGTTTGATATATTGATAAATTTTACCCTCCCAGGCAATTTG
TGAAATTATTTTCTCATTTTATATAGAAAGCCTGCATGATTAGGTCCAAA
ATTTGCTGGTGGGAATTTAAGGTCCCAGGCCTGCAGCTGTCCACCTGTCT
GTCCCACTCATGTATGCTACGCAACTGTTTCCTCCTTCATGTCATGAGTT
AGCACAGAGCTTCAAACCCCAGATTACTACCTGCCCACAGGGTCCACAAC
TGATGTCATACATCTGAGGGGGCCCCTAAAGACCTTGTTTCATGCAAGTA
TGGAGCCTTTTTTTCAGAATTTAAAATTATCACTTCCGCCCTCCTTTCAT
GTAAAAACCATGAAGCCTTAAAAAATGATTAAAATGGTAAAAATGTTAGT
TTATAAAGAATCCATTTTTTGCTTTTTTTGTTTTAAATTTAGGAAAAATA
TATTCCTCTTTTTTCTCATTTGGGGTTCCTCTTAAATTTTTAGGTGTAAA
TTTTTTCTAATAATAAATTTTCATTCGTGCGAATGTTCTCTTTTATGGTG
GTCTTCTCA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 11 11 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 8 7 7 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 6 6 8 10 15 8 8 8 10 13 13 17 19 35 32 28 34 34 34 34 37
48 53 50 50 47 47 47 26 26 16 17 8 8 10 8 8 8 8 16 15 9 9 10 13 10 13 9 9 12 12 12 12 21 17 15 19 16 19 21 15 15 10 10 10 12 15 15 15 19 16
17 21 12 12 12 20 18 15 15 10 21 13 13 11 11 12 10 7 7 8 8 8 9 15 12 15 17 20 29 28 31 31 32 20 19 15 16 13 13 12 10 10 9 10 13 13 12 18 21 30
30 28 19 12 12 9 10 10 10 12 15 12 16 18 11 15 15 24 18 24 15 15 15 18 16 13 11 15 12 12 10 10 11 11 18 17 24 29 29 28 25 22 20 36 36 29 26 19 13 8
8 9 9 16 28 36 26 15 10 8 8 10 10 8 8 10 15 12 11 12 21 22 9 8 8 8 8 8 10 8 11 12 15 12 21 21 21 17 11 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 9
9 9 10 10 12 15 15 15 21 15 18 22 18 18 16 15 15 12 12 12 12 11 12 12 13 13 41 30 28 31 24 21 13 15 15 10 10 12 12 12 12 16 19 15 15 12 22 12 12 10
12 10 10 8 8 9 13 19 16 13 13 12 19 11 9 9 9 12 12 11 12 12 15 15 9 9 10 15 13 8 8 8 8 13 15 18 15 13 11 15 13 8 8 10 12 10 12 10 12 12
9 9 11 11 12 11 9 9 9 10 10 11 10 13 13 11 10 10 17 17 16 14 21 16 16 12 12 11 12 12 15 13 10 8 8 12 10 14 20 23 19 12 11 11 10 10 12 10 9 9
15 19 10 10 10 10 16 19 22 17 16 16 12 12 8 8 8 8 12 10 8 8 10 28 30 32 22 22 18 24 19 11 9 9 9 19 12 9 10 10 10 10 26 38 22 22 32 38 36 36
18 12 10 8 8 8 20 25 9 9 9 12 12 15 32 16 16 8 8 8 10 14 25 24 21 27 41 32 38 12 9 9 9 12 13 23 19 19 20 41 28 43 42 43 42 19 19 8 8 8
10 12 12 12 13 12 13 13 13 13 14 30 24 26 14 11 8 8 8 8 8 9 12 12 10 13 20 21 27 24 16 13 10 12 19 24 22 11 10 9 9 12 12 17 19 15 15 12 11 11
11 11 10 10 10 10 10 12 15 20 20 28 26 31 25 30 30 28 28 13 10 8 12 12 12 15 10 19 19 23 12 19 16 16 16 16 23 23 24 26 15 10 6 6 8 8 8 10 10 19
9 9 12 23 23 23 17 8 8 8 8 8 10 18 13 15 14 15 15 12 15 12 12 10 19 9 9 10 15 20 20 18 18 18 29 31 31 28 15 11 11 11 18 17 13 10 10 9 10 11
10 10 10 8 8 6 7 10 10 21 21 28 23 28 19 21 15 12 12 12 11 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 12 22 24 12 13 17 24 20 19 8 8 8 8 8 9 12 12 11 12
11 12 11 16 12 12 12 18 25 24 28 21 22 15 15 12 10 10 10 9 10 10 10 10 11 11 15 15 12 11 10 15 15 21 21 13 18 11 16 11 10 12 10 13 12 10 10 8 8 8
8 8 10 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 9 9 12 12 22 14 11 9 9 9 16 19 12 12 11 11 11 11 11 9 9 11 11 12 11 12 12 12 15 11 11 11 11 13 15 19 15
14 10 10 10 11 8 10 12 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 13 16 10 10 10 10 10 13 10 10 11 11 9 11 8 8 8 8 10 15 18 18 17 13 10 10 10
8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 10 9 7 7 7 8 10 10 9 9 9 10 9 12 11 11 11 12 10 10 10 12 12 10 8 10 10 10 10 8 8 9 9 10 10 11 10 11 8 8
8 11 10 10 10 10 10 16 12 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8
8 8 8 8 9 10 10 17 10 10 10 10 10 13 14 15 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 10 10 9 9 10 12 18 19 10 8 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 12 9 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 21 20 23 18 12 14 10 13 11 11 6 6
6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 13 8 9 9 10 9 9 11 8 8 8 6 6 10 8 11 12 9 9 11 11 11 9 13 12 10 10 15 15 13 12 10 10 12 6 8 6 7 8 8
8 6 6 8 8 12 15 13 9 9 9 11 15 15 16 8 8 6 6 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 16 16 24 22 12 10 8 8 8 10 8 8 8
8 8 7 7 8 8 8 8 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 11 11 9 11 12 18 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 7 9 8 12 11 8 7 9 9 10 12 19 21 19 11 11 11 22 22 29 22 22
28 28 28 32 35 37 37 28 30 28 35 35 36 36 33 44 39 37 37 41 34 23 15 9 9 11 8 8 8 6 6 8 10 10 13 19 29 34 28 31 31 35 35 35 35 35 36 35 42 53
53 57 57 59 57 50 50 50 50 59 59 41 30 24 20 23 11 10 10 14 14 25 32 46 59 41 50 50 50 50 50 42 41 39 27 27 11 11 11 16 15 16 29 30 59 59 50 50 50 50
57 38 53 53 53 53 50 50 50 53 53 57 53 59 53 53 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 54 54 54 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 43 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 48 48 57 57 50 59 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 43
43 39 25 24 15 12 12 12 12 18 30 30 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 68 68 57 57 54 57 59 59 57
48 43 43 43 43 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 50 57 57 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 59 59 59 54 54 59 59 59 57 57 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 59 59 48 48 44 59 47 54 54 59 59 59 59 59 59
57 57 48 48 54 57 57 57 57 57 57 54 68 68 68 68 68 68 68 50 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 57 57 57 57 50 36 31 31 31 31 31 37 41 41 41 34 34 35
37 41 36 34 35 31 37 37 41 39 32 32 37 31 31 39 41 47 39 30 28 28 28 28 28 25 30 30 25 20 20 34 30 33 32 37 37 26 30 15 18 18 18 20 31 30 32 14 14 12
18 21 23 29 29 22 18 18 14 13 15 15 20 29 33 33 36 37 37 39 36 36 37 30 16 11 12 16 23 23 23 23 20 18 11 13 17 17 15 13 10 10 10 15 25 22 19 10 10 10
15 17 18 11 11 11 12 13 9 9 9 9 10 10 16 13 19 15 15 11 13 10 10 8 8 8 8 10 26 21 24 24 22 17 17 19 17 17 15 22 6 6 8 6 6 8 8 8 11 11
11 17 18 18 22 24 24 24 19 14 12 10 9 10 10 14 14 9 10 12 9 9 12 20 12 9 9 8 8 8 8 8 10 10 12 9 9 9 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10
13 18 18 10 7 7 7 10 19 17 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 12 13 11 8 11 8 8 8 8 11 11 11 11 11 10 12 12 10 10 10 11 6 6 6 6 9 9 8
6 6 6 8 13 23 19 17 10 8 8 8 8 8 10 10 10 12 18 10 10 10 10 14 14 15 14 14 19 15 15 15 20 15 19 12 12 12 10 10 12 12 15 13 10 10 6 6 6 7
8 8 10 10 10 10 11 6 6 6 6 8 6 9 9 9 10 13 8 8 8 8 8 10 18 15 10 10 6 6 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 11 15 10 14 8 8 8
8 9 9 9 8 9 9 12 10 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 7 7 8 10 7 7 7 6 8 8 13 12 13 13 19 10 8 8 8 8 8 12 11 10 8 8 9
10 15 15 10 13 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 11 11 9 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 6
6 6 8 8 10 10 10 10 10 |