BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-090I09.T7 (MSMg01no090_i09.b1) | MSMg01-090I09.TJ (MSMg01no090_i09.g1) |
ACC | AG308731 | AG308732 |
length | 668 | 702 |
length of high quality (start - end) | 287 (19 - 305) | 286 (56 - 341) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no090_i09.b1 PHD_FILE: MSMg01no090_i09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:43:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no090_i09.g1 PHD_FILE: MSMg01no090_i09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:43:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTTGTTACCTCTGAGCCCATTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCTGGAG
TCTACTTTCTTGAGCTCTTTATATATATTGGATATTAGACCCTTATCTGA
TTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCT
TATTGACGTTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAGTTTTATGAGGTCC
CATTTGTCGATTCTCGATCGTACAGCACAAGCCATTGCTGATATGTTCAG
GAATTTCCCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCAATTTCTCCT
CTATTTTTTTCACCGCCTCCCCCTTTATGTGGAGTTCCTTGATCCACTTC
GATTTGCCCCCACTACAAGAAAATAGGAATGGATCAACTCGCATTCTTCT
ACATGACAACTGCCAATTGTGCCAGCACCATTTGTTGAAATGCTGTCTTC
TTTCTCACTGGCTGGTTTTACGCCCCTTGTTAAGCACTACCGCACTAAAT
TGTCGTCGTTCATTCCTTGTCTCTTCCCATTTATTCTATCTGCTCTACTT
TCCTTGTCCTCGATTGTCTTTTCTACTTAACCCTCTTTTTATTGTTTTCC
ATCTTGTATGTCCTCCTTTTCCCACTGCTCATCCATAAATTATTTCTCTG
TATGCCATTACATTCCCA
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXACATGCAAAGCTGTTCAGTTTCTATGCTTTTTTTCATAATTTCCG
TCCAACGTGCTCCCTCCCTCACGAATGGATAGACTATACCCACAAATGAA
TGAGCCAGATAGAATCACTAGAAAATTAAAATGATAAATGTTATGTTATA
TATAGTTTAATCACAGTTTTAAACACAGAATTTTACTGAAAGCTGTTTGA
ACATACTGAGACCTGATGGGTCTTGTGGTCAGGTCTGGTTACATATACTG
TGGAAAAGCTATCTAGTGGTATTGATGAATACTCCCCTGTTTTGTTAACT
GCCTCACGCTGTTCATTAGCAGTTAACTATGAAATGTCTTCTATGGTAAT
TTGTCCTTGCCTTGTATTTAATTTGAACAATTAATAATTAACTGTCATTG
AAAACATGTATTGACTGCCTACTACGTGTCAAGTGCAGTGCTAAATACTG
ATACATTCTAGGAAGGGAAACGTAAATAGATTCAATATTTATTGGTGACG
AAGGGCATGAAAAGGAGCCGATTGTACGCAGGCCCAGGGTTACTTTATAT
GATGTCATGTCAACCTCCTCTGTGCTGCTTATTCAGAAACCTTTAAGTGG
TTGAGCGCTACATGGTAAAACCTTTTTAAAGAGATATTACCGATGTATAT
CT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 11 17 11 9 9 30 19 20 22 13 12 8 8 8 22 22 36 57 57 57 36 34 34 34 33 33 36 37 43 42 43 36 36 37 33 33 40 57 43 43 41 41 41 41 50
50 50 50 50 68 68 68 68 57 50 50 24 20 9 9 9 21 21 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47 50 50 57 57 50 50 47 47 47 50 57 68 57 68 57 57 50 50 50 50
50 50 57 57 50 50 50 50 38 38 32 32 35 50 50 50 51 50 50 50 68 68 68 48 48 50 46 46 46 50 50 50 47 41 52 52 52 52 52 52 52 57 59 57 57 57 41 41 41 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 43 43 38 35 35 43 43 57 57 57 46 41 37 37 52 57 57 57 43 43 30 30 30 37 42 50
52 52 52 43 43 27 20 20 24 24 43 43 43 57 54 54 50 50 43 35 35 35 27 27 23 23 23 32 32 37 35 42 42 48 54 57 47 47 41 47 47 47 37 37 28 28 28 40 37 43
41 41 41 41 47 47 47 47 59 43 41 41 32 27 27 17 17 27 29 47 43 57 57 57 48 48 43 43 43 43 43 48 48 43 43 42 42 43 43 43 48 48 48 48 47 47 41 28 28 12
18 12 12 12 21 14 18 25 18 18 11 11 11 10 10 10 9 9 9 10 10 10 10 10 14 25 23 34 28 32 28 30 32 28 32 20 28 28 39 39 43 34 31 23 23 23 31 37 43 40
40 40 39 19 15 8 8 8 15 16 12 10 8 8 8 10 14 10 10 11 11 16 16 21 14 12 15 12 13 13 15 15 12 16 12 15 12 14 12 19 13 14 14 28 23 30 28 32 28 12
12 10 10 12 15 10 10 10 10 13 15 10 10 13 9 9 12 16 20 23 21 21 12 12 12 12 15 12 14 13 19 19 26 13 13 11 19 15 15 15 11 11 11 11 11 11 8 12 8 8
8 12 17 14 14 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 11 15 8 8 6 6 8 8 8 10 10 12 15 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8
8 8 8 10 7 6 8 8 9 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 13 13 13 10 10 8 8 6 7 8 10 10 10 11 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 19 14 16 11 10 8 8 9 11 12 12 10 10 9 10 10 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 9 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 16 16 16 13 10 10 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 11 8 8 7 6 8 7 11 10 10 9 7 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 12 15 14 | Open.Hide. 9 9 19 19 30 25 27 39 39 39 39 36 28 24 24 25 25 34 25 30 30 30 31 23 28 22 24 23 19 19 10 12 14 26 21 37 37 32 23 16 15 16 24 24 30 40 28 48 42 46
46 48 48 51 50 50 50 50 50 50 47 50 48 43 42 36 42 42 42 42 42 40 40 47 50 50 57 50 47 47 47 57 57 59 59 59 59 36 36 36 30 28 31 41 41 41 37 37 23 23
11 11 12 11 16 23 26 37 41 41 47 48 48 53 48 57 57 36 36 36 37 42 50 57 57 57 47 48 48 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 53 48 48 50 54 50 48 48
48 50 50 54 54 57 57 57 50 48 47 41 41 48 48 48 50 57 57 57 43 43 38 41 46 41 41 42 57 50 47 42 42 42 42 50 42 42 42 42 46 46 50 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 52 52 52 52 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 52 54 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 57 57 57 48 43 44 43 43 57 57 57 57 57 47 57 44 43 44 57 57 57 59 59 57 57 57 57 47 57 57 57 57 48 47 47 57 57 48 48 43 43 39 40 40 43 43 41 26
21 13 13 18 28 32 43 43 43 48 48 48 43 39 39 37 37 35 40 40 57 57 57 57 57 48 47 47 50 48 50 50 59 59 46 32 29 12 12 12 9 9 11 21 23 31 21 21 13 11
11 11 11 11 11 12 11 12 12 23 16 31 41 41 50 48 48 48 48 48 41 36 39 39 39 43 47 48 48 48 48 48 43 39 39 35 35 42 43 48 54 54 43 42 32 28 28 28 37 28
40 30 23 23 20 23 21 26 14 17 24 24 36 36 36 44 36 36 37 35 35 39 39 47 47 43 43 43 41 41 42 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 44 43 43 43 43 43 43 48
42 42 34 35 35 32 33 33 34 34 32 32 36 36 32 32 30 19 20 26 28 35 30 22 12 11 9 12 17 19 28 25 31 35 30 22 8 8 8 8 13 10 15 13 26 17 15 9 9 9
13 11 12 11 11 11 23 24 28 24 24 31 32 28 34 28 28 20 31 26 31 19 19 18 16 13 21 16 20 20 26 26 16 15 15 18 22 20 30 22 28 19 14 9 10 14 15 17 24 19
17 19 14 14 14 13 13 9 11 11 19 19 32 28 23 14 12 18 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 12 18 18 12 14 12 12 12 14 14 26 23 15 10 10 10
13 22 24 15 13 9 9 9 9 10 9 11 10 8 8 6 7 10 6 9 13 9 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 15 18 19 11 15 15 12 14
11 12 12 9 9 11 16 18 19 19 12 12 10 10 8 8 8 8 8 10 11 14 20 18 12 8 6 6 7 6 10 9 9 8 11 13 10 10 10 12 12 10 10 10 8 8 8 8 9 10
10 9 |