BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146N22.T7 (MSMg01no146_n22.b1) | MSMg01-146N22.TJ (MSMg01no146_n22.g1) |
ACC | AG350292 | AG350293 |
length | 1,205 | 1,187 |
length of high quality (start - end) | 566 (138 - 703) | 575 (124 - 698) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_n22.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_n22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_n22.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_n22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:09 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CACCCTAGTNNTTAATCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCACTTTGTAGAACAGGCCTATAAAAGCCCTCAGAAATCCG
CCTGCCTCTGCCTCTCACCTTTTGGGATTAAAGGCCCGCACCACCACCGC
CCAGCTCTACTAGCCCCTGTTAATAGTCAGCCATCCCTATCTACGCCAGG
GTTTCAGGGCAGTTGGGAGTGGGTAAGTAGGTGGGATATCAATCAAAGAG
TACAAGTTAATAGAAGAAGGAACATTCCTTTCAGTGAGTGTTGGGAATCT
CCTGGTCTCAGGATGTTCACCAACCTCTATAACTCAAACTCCCAGGGACC
TGGCATCTTCTGTAGCCTCTCCTATGCATCTGCTCACATGTGTGCACATG
GACTCTTTTGCAAAGACACAAACACACATAAGCAATACAATAAGTGCTAT
TAACAATCATGGGAAGTCCTTAGTAAAGGACTCTGGTCACAGTAGGGGCG
CTGGATTGTGGATGCCAGCCAGAAGACACCTCATTTAAAACTGTGAGTGC
TTTTGAGGAGGGCAGAGTAAATGAGAGAGAAGTACAGAGCGCCCAGTAGC
CTGAACACACTGCCACTGTCACCTGTCCCCCCTTCTATGGACACCTCATC
TTTCCCATGGCTGTCTATTTGTGTTTCTGCATTCCACCTGTGATTATTCA
CACCGTGTGTGGTTGCTTTAATAATATCCCTTCCTAGTGTTTATTATCAA
CAATCCCACTTGTGCACAGCTACCCTAACGGAGCCTTGCTGGCAAGACTT
TGTCAGTCATTTACCCACTGCCCTCTGGTGTTTCTGGTTGATAAAAGGTT
GTCTGTCTCCTGCACCTGCCCCCCAGTCCCCTTTGGACACTCTCTTAATG
GTTTTCATGCCAGGACCTGTAGAATCAACTTGTTTCACCGTCCCTTCGGA
ACCGGCTCTTCGGTCACCTGAAGAAAATTTGATGGGTCTTCAACTCTTCC
TTCCCTTGGGGTCTTATTTTAAAAGGACCCCTCTTTATTCTCCTGCATTT
GGATATCTTCTTTTGTTCTGTTTTCCGCCTTTTTAAACACCTTATCCCTC
CTTGTAATTCTTATAATCAGTTTACTCATTTCCTTTTATGTATTCTAGTC
CACTTCTGTGGGCTTTCTTCCTTGTTTATCTTTCATATACTTCTTCTTGT
TCTTA
| GCCTCTTTTNNAAAACAAGGNAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCAATAAAGTTCCGCTTCCCAGAGCCCT
GGGATTCCAGGCCCTTTACATCATACCTGACTGGTTTTTCTTTCTAGACT
CGTCAGATTCACTGGTGGTTGCCAGGGTCAGGACAGAGGAAAAAAAGTGT
TAATATTTAATGGGTGCAGGTGTATCAGTGCGGTGTCATGAAAAGTTCTG
GAGACAGATGGACTGGTACCAATGGTTGTACAACAAAGTAAATGTATCTA
AATGTCAAAAACCATACTTCAAAATGGCTAAAACGGGGATGGAAAATGGC
TTAGTGCGGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGCGTGCGACCTTTAATAC
TCTTACTCGTGTTGTGGTGACTCTTACCGTAGAACTATCATTTTGGTACT
GTTATGAATTGTAATGTAAATATCTGTTAAAGGGGTTTTTACCCACAGGC
TGAGAACCACTGGCTTCCTGGGTACTGGCATCTGCCTCCAAGCCTGGAGA
CCTGACTTTACTGCCCAGGATCTACTTGTTGGAAGGAGAGACCGGACTCC
TGCAAGTTGTCCTCTGATCTTCACACACATACTGTGGCACTGTGCACCCA
CATACATTCACACATTATTAATGAATATAAAAAAATAAAAATGACTAAAA
TGATAGGTTTTATAAATATTACAGTTAAAGAGTAAAACTTATGGCATGGC
TTTAAAATTTTATAGAGCTTTAATATTGAAGGTGGATTTCTTACAGGCAG
TACACAGAAGGGTGTTGCTTTTTTATTTTTTTTAATAAGTCTTATAATTA
TTGTCTTTAATTTTTTTTTAAATTTTATTTTATGTGCATAGGTATTTTTG
CCTGCAGGTATATTCTATATATTGCTTGTTAGGCCCAAAGCCAATGTTTC
CCTTTATATTCCCTTGGTAATTATAGTTTTACAAATGGTTTGTTGAACTT
TCTCTGGGCGTTATTTTGTCAAACTGTATCCCTGTTTTCCCTTTGGCTAA
AAACCTTTTTTATTTCCTTTTTAAATCTTCTGTGATCTTCTGTTTTTTTT
CTTCCCCTCCTAGGGTGATCTCCTTTTTTGTTATTTGCCTTGTCTTTCAC
TCTCATTTCTCTCTGTTAAAATAACTTTACTCTTTCC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 10 11 9 9 9 3 0 0 3 9 9 9 10 6 6 8 6 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 13 21 21 8 8 8 10 12 14 24 25 35 36 36 37 37 36 47 47 47
47 50 57 50 50 50 50 36 36 53 33 33 33 31 28 25 23 23 19 9 9 9 9 19 14 8 6 7 6 6 6 6 8 11 13 15 14 13 13 13 9 17 19 34 39 41 50 48 48 50
36 36 36 36 36 36 36 31 31 31 31 31 30 21 23 10 10 11 13 12 10 10 15 15 14 15 15 19 19 12 12 21 15 18 10 10 10 10 15 26 36 59 59 59 59 59 48 48 48 48
57 57 50 43 43 43 43 43 50 48 50 53 50 50 57 47 47 47 42 42 42 42 51 47 68 68 68 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 43 43 48 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 59 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 52 54 59 57 57 52 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 42 42 31 31 31 44 44 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57
57 59 57 57 57 47 48 54 59 59 59 59 59 54 54 48 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 54 48 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 41 46
46 28 28 15 18 13 14 13 23 12 11 11 12 25 30 44 48 48 48 48 59 59 59 59 57 59 57 48 48 48 59 59 39 43 43 59 47 41 35 35 47 47 54 54 57 59 57 42 44 36
24 10 8 8 8 14 19 43 44 44 57 43 43 43 43 43 57 57 57 47 44 37 42 44 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 47 43 43 33 33 43 43 43 43 43 43 46
57 57 54 54 54 57 57 57 59 57 57 57 59 57 59 57 52 52 52 52 52 44 52 36 36 28 32 32 43 43 52 52 57 59 59 59 59 59 57 57 57 43 39 39 44 43 43 43 35 42
42 57 57 57 57 52 39 39 39 39 35 31 31 31 35 33 38 38 33 32 32 34 38 17 23 23 32 32 39 35 29 43 43 32 23 27 27 38 33 35 35 43 43 35 32 24 38 24 28 15
27 38 43 38 43 43 27 27 23 43 44 52 52 52 52 50 57 57 57 37 37 37 44 57 57 57 59 50 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57
68 68 59 59 59 48 39 37 40 40 48 57 59 48 48 44 44 43 36 37 28 28 40 43 43 59 35 35 35 42 42 42 43 39 36 36 43 43 59 48 48 48 48 48 48 47 32 28 20 20
20 28 20 22 11 11 11 23 21 12 9 6 8 8 8 9 10 17 25 26 25 23 26 19 17 14 19 16 15 21 28 28 28 28 26 28 28 28 28 30 37 37 26 31 20 16 16 19 21 17
17 15 28 18 23 21 15 10 10 10 16 21 34 28 24 24 28 28 25 32 37 22 22 10 9 9 10 13 9 10 12 10 10 10 15 16 16 27 31 31 12 12 13 14 12 14 9 11 10 16
19 19 12 10 10 10 10 12 16 21 26 24 20 16 18 18 18 21 21 15 15 14 21 19 15 15 12 11 15 11 13 13 23 17 18 10 10 10 10 15 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8
13 12 11 9 9 9 9 9 12 13 13 13 10 10 10 13 15 11 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 14 11 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10
11 11 10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 12 12 11 12 8 8 8 8 7 8 7 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 8 12 9 10 10 11 11 15 12 18 15 12 6 6 8 10 10
11 10 10 11 11 16 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 10 13 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 9 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8
8 6 6 8 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 13 12 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 8 8
9 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 14 13 17 9 9 9 10 10 9 13 17 15 10 10 10 10 10 10 16 15 19 11 11 11 10 9 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 8 10
10 10 8 8 10 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 14 9 8 8 8 8 8 8 10 10 17 8 10 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8
9 9 10 11 20 10 9 8 8 6 6 6 6 10 15 19 12 12 9 9 8 8 10 10 9 9 6 8 8 8 8 6 8 6 6 6 7 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8
7 7 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 11 9 9 11 11 23 3 0 0 3 9 8 6 6 8 8 6 3 0 3 6 8 8 6 6 6 6 8 10 13 8 7 9 3 0 3 17 19 22 9 10 12 19 19 24 14 12 15
19 10 12 12 26 26 35 30 35 38 36 53 44 50 50 50 47 47 21 19 8 6 7 6 6 6 6 8 9 11 14 10 10 8 8 8 10 22 25 28 37 31 33 33 36 36 50 50 53 53
36 36 33 31 31 31 37 37 37 25 21 11 10 10 10 10 9 9 11 11 19 13 17 19 24 24 30 31 19 24 14 16 16 26 26 57 42 43 47 47 47 47 47 50 50 48 48 48 57 57
57 54 54 57 57 57 57 54 54 50 50 50 50 48 47 50 50 50 53 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 44 42 33 33 33 42 44 57 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57
54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 68 59 57 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68
68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52
43 52 52 57 57 57 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 57 57 68 57 57 59 59 47 35 35 35 42 35 35 47 59 59 57 57 57 57 57 57 68 59 57 54 54 57 57 47 54
44 44 30 30 30 44 44 43 43 43 46 46 57 54 59 59 57 54 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 43 43 43 43 43 59 59 41 30 15 18 18
11 11 11 21 12 17 19 27 28 50 50 50 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 59 59 59 48 48 40 36 25 25 43 43 57 68 68 68 68 68 59 59 48 44 39 30 30 30 39 39
39 37 48 48 68 57 57 48 46 47 42 42 37 36 32 31 31 42 44 57 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 59 59 57 57 54 50 50 57 43 43 43 57 52 52
43 44 32 35 35 43 44 52 54 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 59 43 43 35 43 43 57 57 59 59 57 59 57 57 39 39 43 44 43 57 35 42 42 43 44 39 35 35 39 43
57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 43 43 43 32 37 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 43 43 32 32 32 43 37 43 43 43 43 32 32 24 29 23
38 30 37 37 50 59 59 57 43 43 27 33 33 44 44 57 57 57 57 48 43 37 37 41 41 42 42 37 37 23 28 28 40 32 42 44 35 35 35 26 26 12 11 11 24 24 25 29 30 28
28 28 36 30 32 32 44 42 28 28 28 37 25 28 28 36 36 37 40 33 43 43 42 42 47 42 47 39 43 39 37 39 43 43 43 43 43 43 46 39 43 39 41 30 22 18 12 10 10 10
16 16 17 25 23 24 24 22 24 34 34 37 31 19 19 10 8 11 8 10 9 18 18 32 39 33 32 28 28 28 20 20 23 28 23 28 28 25 28 24 14 12 17 10 13 13 15 12 10 11
10 21 23 31 31 37 37 28 35 35 30 28 28 31 31 23 18 18 31 31 31 30 30 30 39 37 40 32 39 42 42 48 33 39 32 28 23 23 25 25 20 25 24 15 24 12 12 12 22 19
17 10 13 10 10 9 9 10 16 15 16 11 10 8 8 8 12 15 13 8 8 8 8 10 10 10 11 14 22 23 19 10 8 8 8 8 8 8 10 16 28 19 18 9 9 9 8 10 15 8
8 8 8 10 12 13 15 8 8 7 7 7 11 23 28 30 30 20 12 12 16 15 8 10 10 13 13 22 21 15 15 10 10 8 13 10 11 11 11 13 11 11 11 15 15 37 34 24 22 21
21 18 15 13 8 8 8 9 9 9 13 8 8 8 8 8 10 11 12 9 9 9 13 12 12 14 10 8 8 6 6 6 6 10 8 9 9 9 9 10 12 11 15 10 8 8 8 8 8 8
10 11 12 11 11 10 10 10 13 13 11 12 13 14 12 8 8 10 8 10 11 12 9 9 9 11 14 13 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 13
10 10 11 9 9 10 9 10 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 14 18 13 9 8 8 7 8 6 8 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 12 8 8 8 10 10 21 12 12 8 8 8 8 8 8 17 10 10 10 11 11 16 12 10 10 8 8 6 6 7 14 28 23 10 10 9
9 12 10 10 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 16 16 20 10 15 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 11 14 8 8 8
8 7 8 6 6 8 8 9 9 12 9 8 10 8 10 10 10 11 11 9 9 8 8 7 6 8 8 8 6 6 8 8 8 11 8 8 8 |