BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161E01.T7 (MSMg01no161_e01.b1) | MSMg01-161E01.TJ (MSMg01no161_e01.g1) |
ACC | AG360705 | AG360706 |
length | 1,132 | 1,205 |
length of high quality (start - end) | 285 (506 - 790) | 339 (508 - 846) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_e01.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_e01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_e01.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_e01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:39 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGTCAGTGGGCGCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCAGTCACCAACTCAGATGACGCATTGACTTCCAAAAGTTGTTACGCCTA
GCCCCAGAAAACCTCCATACCTTTGCCAAAATGGTTCTTCCGCCCATGAG
GGATTCGGTGAATACTCAGAATATAGCCATCTCCTCCCAGGACCGAGTGT
TCCTCACCAGGATATCCCCAGCGCATGATTATCTCGGTCTGGGGAGAAAA
AGAACAATGGGTATTCTATGGTGGACTCTGAGTCTTCCATCTCCAAAAAT
ATCAGGCAGAAAACAAAGCTTTATTCTGCTCCATCTAGTAACCAAAATTC
CATCTCAAGACCCAGTCAGTTATACTCGCAGGCATCTCATCATTCCGCCA
GCTCTGTTTCTGAGTGTATCAAATTTGGGCTCTTGTCGTTTTCTTTCCTG
CCGACCATTTTTTTCCCCCCCCTTCTTTTCTAAATATGTCAGCTAACATT
ATTCATGTTCCAAAGTTCCTGACCTAGGCAATAAGGCTAAACAAAATGTC
ATTTGAAAGGCATGAAACTGATAGAAGAAAAGCCGAAAAATGAGAAACTG
CCATTAATTTTACCTCCCCACAGGGAAAGAGTCATGAGTGGCAGGTGGGA
AGGCATCCACCAATTACATGGAAGATCAAAGTGTTCGTTATCCTCTCTGC
CATAAATACCTGAAAGACTTGAATTCCATCATTCCCTTAGGAAGGATGCC
ATGGCCTGTGTCAGTCCATCCTGTCCTATCTAGGAATTTGTCACTCTCTG
CAGTCACCTGTTTCTTTAGCTGGTCAATCCATCTTCTGTCTTAAAGCTAC
TGTGTCTTTAATAAACTATATTTTCTATTCAATTCTTCCACCTTGTTTTA
TCTAAAAATTCCCTGTTTTCTTTAAAATCTATAAATTTTTGAAAGGTTTT
AATTAATTTTTATGGGGATTTTTTTTTTTTTGTTTTGGCATCTATATTTT
ATTCTAACTATTTTTCTTTTTATCTCATCCTTTTTCTTACTTATTTTTTT
TTTTTTTTCTTATTTTTTATTATTTTCGTAATTATTTCATTTATTTATTT
ATCTTCTTTTTCTTTTTCCATTAGTACCTTAT
| NNAAAACAAGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATGAAAATGCATGCACAACTTACCCAAACT
TATGGGACATAATGCAAGTAGTGCTAAGAGCAAAGTTCATAGCACTAAGT
GCCTTCATAAAGAAATTACTAAGATCCTATATTACTGACTTAACAACATG
TCTGAAAGCTCTAGAACAAAAAGAAGCAAACACATTCAAGAGGAGTTGAT
GGCAGGAAATAATGAAACTCAGGGCTGAAATTGATAAGATAGGAGCAAAG
AAAACAATACAAAAAATCAAGGAAACAAAAAGCTGGTTCTTTGAAAAAAA
TCAACAAATAGACAAACCCTTAACCAAGCTAAAAGGCAAAGAAAGAATAT
TCATATTATCAAAGTCAGAACTAAAAAGACACCGAGGAAATCCAAAGAGT
CATTATTTTTTTTTCCCCCCCCCCTGTACTTCACAAATTGTAAAATAAAA
AAGAAATAGATAATTTTCTTGATAGATCATGATCAGATAAACAGCCCAAT
AGGCCTATAATCCCTAAGAAAATAGAAGCAGACATTAAAAGTCTCAACCA
AAAAAGGCGAAGGGCCAGATGGTTTTGTCACAGAATTCTACCAGATTTTC
AAAGAAGAGATAATACAAATACTCCTCAAATTATTCCAAAAAAATAGAAA
TAGAAGGAACATTGCCAAATGCATTTTATTAGGCCATAATCACTTTAATA
CCAAAGACTCAAGAAAGAAAGAAAAAAAAAGTTTCAGACCAATTTCCCTC
AAGAACATGAATGCAAAAATACTCAGTAAAATACTCCCAAACTGAATCCA
AGAACACACTAAAAAGATTGTCCATCATGATCAAGTAGGATTCATCCTAG
TGATGCAGGGATGGTTCAACATGAAAACCCTTCCATGCAATCCCTTGTAT
GAATAAACTTGGAAGAAACCAAACCCCTAATCCCCCTATTTAGAGGTTGG
AAAAAGCCTTTCAAAAAAATCCCACCACCCTTGGGGGAATAAAATCTTGG
AAAAAAAAAAGGGTTTTATAACCCCTATCCCACACAAATATAGGGCATTA
TATTCGCCAGGCTGAAATTCATGCATCCTTGTTATATGTGAGGAAAAACC
CACATCTCCCCTTTATGGGCCCTGGGGCTCTCTCCAATATGAATTTTCAG
GCGCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 7 9 9 12 9 15 16 13 9 9 9 9 10 11 19 23 24 24 15 15 10 12 12 22 21 35 36 33 36 33 36 33 33 39 37 37 37 33 32 29 23 23 22
37 29 30 31 31 33 31 44 36 36 36 36 36 36 33 33 27 27 22 32 17 13 10 8 8 8 15 22 41 42 37 37 44 50 53 36 57 53 53 53 42 43 43 43 47 43 47 47 48 50
50 50 53 54 68 68 48 44 43 21 19 8 8 8 12 12 37 40 48 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 44 43 37 39 46 46 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 57 53 53 53 53 57 57 57 50 53 53 53 53 53 53 50 50 50 50 41 27 25 12 11 11 12 9 16 20 32 37 47 47 50 50 50 50 57 57
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 53 53 53 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
30 30 12 19 14 15 12 15 12 14 11 23 27 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47
36 30 23 15 12 11 11 11 21 18 20 14 13 10 11 10 12 21 25 16 16 11 11 11 12 28 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 28 15 14 12 22 9 9 9 12 12
12 12 12 18 19 21 18 31 29 39 43 59 59 59 59 59 57 59 57 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 68 68 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 48 48 48 48 43 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 41 41 37 36 36 41 43 59 59 46 46 46 48 48 48 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 50 48 50 57 57 57 59 59 59 57 54 54 54 57 54 54 54 57 54 54 54 57 57 57 59 54 57 57
57 57 48 47 43 43 43 40 43 43 48 57 57 57 57 57 48 59 59 59 59 59 31 31 22 27 25 19 26 30 30 44 59 59 59 59 59 59 50 50 57 39 39 35 36 36 34 34 48 48
48 48 48 50 59 59 59 59 59 44 44 44 41 41 41 44 47 47 44 44 37 32 29 29 29 32 41 47 47 59 59 59 59 59 59 59 34 34 25 22 19 26 19 25 27 30 39 40 39 37
32 29 28 32 32 24 39 37 37 36 41 43 46 48 48 59 43 39 41 41 30 31 17 15 11 19 22 20 24 29 30 30 30 30 30 24 20 18 16 15 15 24 26 17 18 25 28 21 17 10
10 10 15 15 10 11 11 25 24 37 32 34 23 23 20 17 14 13 13 21 23 17 10 10 10 11 10 15 16 19 19 11 15 10 10 10 13 17 18 13 8 8 8 14 9 12 12 11 19 19
24 13 11 10 10 10 15 19 10 10 10 10 12 10 10 10 12 10 10 10 10 10 10 10 10 12 16 11 10 10 10 10 16 10 9 8 8 8 7 7 8 8 10 10 9 9 9 12 14 14
10 10 20 16 14 14 15 8 8 9 9 11 11 13 8 8 8 8 9 9 11 11 12 10 13 12 8 8 6 6 6 6 8 16 14 17 14 6 8 6 7 15 10 10 8 8 8 10 10 9
9 8 8 8 8 8 8 11 17 17 8 6 8 6 8 8 8 9 11 10 11 10 8 8 8 10 8 13 19 15 10 10 12 10 10 9 10 10 8 8 8 8 10 15 8 8 9 9 10 10
10 8 10 6 6 8 8 8 8 11 10 10 15 10 8 8 8 10 10 15 8 8 8 8 8 8 6 7 8 10 13 15 15 10 8 8 8 8 10 8 8 8 7 6 8 8 13 15 16 20
15 11 12 11 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 12 10 15 11 9 9 8 8 6 7 7 7 8 8 8 9 8 8 10 8 9 8 13 10 10 8 11 6
8 8 10 10 6 6 8 10 11 10 8 8 8 10 8 8 10 7 6 6 6 8 8 9 9 6 8 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 9 15 9 9 9 9 16 14 21 19 21 10 10 11 21 21 28 28 28 35 39 36 36 36 37 37 42 43 47
47 47 53 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 48 32 32 25 29 25 33 33 47 57 47 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 37 37 44 57 57 57 54 47 47 47
47 47 57 57 57 57 57 48 42 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 38 38 19 19 20 27 27 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 41 41
47 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 41 38 15 13 11 11 13 28 38 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52
57 62 62 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 54 52 52 62 62 62 62 62 62 62 57 52 52 52 57 57 59 52 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 57 59 57 57 59 59 68 57 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 57 57 59 59 59 57 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 48 47 50 47 34
25 12 10 10 10 10 17 12 12 12 24 28 59 59 59 47 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 59 50 50 50 50 50 50
59 27 27 16 16 18 18 20 21 18 21 15 13 12 12 13 12 11 12 18 18 13 27 18 21 14 28 33 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 43 39 39 47 27 27 11 11 11 14 17 30
30 15 15 12 12 12 12 15 19 32 34 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 54 54 57 59 59 59 59 68
68 59 59 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 48 48 54 57 57 54 54 54 48 59 59 59 59 42 44 43 43 42 44 44 57 57 57 57
59 59 57 57 57 57 54 54 54 47 47 48 48 50 46 46 36 36 36 42 41 48 48 57 59 59 57 57 48 43 43 43 39 39 43 43 47 47 57 48 48 48 48 50 50 48 44 59 37 30
30 37 37 37 37 37 44 44 44 47 47 50 50 48 48 48 48 48 59 41 47 43 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 43 43 43 44 44 57 57 59 59 48 48 48 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 41 41 59 39 35 31 31 31 41 41 41 39 40 40 41 41 42 47 41 41 41 37 37 41 39 39 41 42 41 40 48 48 48 48 48 40 40 40 47 30
30 12 12 12 27 27 30 28 26 13 13 24 24 29 30 37 37 37 41 44 44 47 47 47 59 59 39 32 30 19 19 17 17 17 18 35 35 36 39 39 29 29 25 27 27 32 37 34 27 13
11 11 11 14 21 13 14 14 30 24 31 28 31 25 27 29 35 37 37 39 40 41 40 43 40 43 43 32 32 28 31 31 23 23 23 28 28 32 27 27 24 25 21 23 16 19 21 17 14 16
16 19 18 26 24 24 24 25 25 25 20 10 10 10 15 15 13 12 12 10 10 10 11 15 12 14 13 19 23 27 27 28 24 28 31 35 25 13 13 16 16 16 19 19 13 15 14 17 15 16
16 16 23 23 20 25 27 24 22 20 24 17 13 11 11 11 13 11 11 8 8 8 11 9 8 9 9 11 11 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 10 8 8 8 8 9 9 10 8
13 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 8 13 13 14 11 9 9 9 9 13 12 10 22 10 10 15 10 8 8 10 10 11 16 11 9 12 12 9 11 10 10 10 9 9 9 10 9 9 9
9 9 19 21 11 10 10 10 10 9 10 10 10 11 14 19 17 9 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 11 12 12 14 11 11 11 7 12 9 9 7 8 6 6 6 8 8 8 10 10
10 10 11 16 14 14 15 18 10 10 10 10 10 10 13 8 8 8 8 10 8 9 10 12 14 9 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 6 6 6
6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 12 10 11 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6
6 6 6 8 8 6 6 6 9 15 13 9 8 8 8 8 8 8 9 12 10 8 8 7 8 8 8 8 11 8 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 11 10 11
9 9 9 9 9 |