| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-289I06.T7 (MSMg01no289_i06.b1) | MSMg01-289I06.TJ (MSMg01no289_i06.g1) |
| ACC | AG419046 | AG419047 |
| length | 747 | 855 |
length of high quality (start - end) | 318 (45 - 362) | 127 (75 - 201) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no289_i06.b1 PHD_FILE: MSMg01no289_i06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:23:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no289_i06.g1 PHD_FILE: MSMg01no289_i06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:23:50 2005 |
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAGACTCTAGCATATTGTGAAACAGTATCTCCAGAACATGGCGTAGC
TATTTCACACACATCCTCACATCAGTGGTAGTTACAGGCATAAGACCTGC
ACAAGGCCACTCCTACCAATGTTCCATTATGGATGGGGGAGAGACGGTGA
TGACAGGATAATGGTGGTGGAGCATATGATCAAAATATATTGTATATGTA
CATGGAGTTATGAATATAGAGCAACAGTAAAAATTGAGCCTAGCTCAAGG
CTCCTTGTTTGTCTTCCTTGTAAGGTTGCTTTTTCTGGCATAGTTCATTC
CACACGCTGCCAATTTTTTGAACACCCGCCCCGCGGCACGCGTGGGTCAC
CATGGACCTCAGAACCCACCCACCTTCAAACTAAAACATCTTCCATGTCT
GAACTGCCCCCACGCTTCTAGCACTCATACAGTGTTAGCATTCATACAGC
TCTCCTGCTCCTCTGCAGTTTGGAACCCAAGGTGCTAGCAATGCAGATAC
AAGGGTGTCTCTGAGCTTTCCCTAATGAGTGATCCTAATGGAAACTCAGT
GTTCATTCCTTCCACAATTTACTGAATATCTGTCTTGCTCTGAGGGTTCT
AACCAGGGCTAAATTAGGGCGAAATTCGACTCTGTTATATAGCAGATATC
CCAATATGTCACCTGATATGTGTGTGCGTTTGCGTTCGATCGTGTCT
| GTGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAACCTAAGATTTCGGAGCAAGTTCC
AGTTTGAGTTTGACATAATGTCACCTACTTCGATAAGTAGGAAAATTTAT
ATATACATATATATGCATTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGN
NNNNNNNNNNNNCCNNNCCNCCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCTCCCNCNCCNCCCCCCCCCTCCCTTTTTCCCTCCGCCTCCCCNN
CCCTTTCCCCCCCCNCCTTCTTTTTTTCCTTTTTTCCCCCCCCCNCCCCC
CCCCCCCCCTTTTTTTTCTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNTNTCGT
TTCCTCCTTTCTCTTNTTTGTTTGCCTCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAA
ATTNTTTGGGGGGCGGGGCGGCTTTCTCCCAACTAATATTTATCTTTCCC
GCCTATTTTATTTCTTTATTCTCCCCCTCCCCTCTTTTTCCTCTCCTTTT
CCTCGCACCTTCTTTTTGGTTATTCCGTATTTATACCCTTTATTTATTAT
ACCCATCGTTTAACATATACTTAACGCCCTCCTCTCCCATTTTGCGTGTC
AGAGTTCTTTAACATAATATTTGTCCTCCTATCTATCCGTCCTCGAAACC
TCTCTGCTTTCTCCTTATAACGGATAACGCCCTCAAATACCCCCATTTAT
TATTGTCTCAATATACCCTCCCCCTTCACCACGCTCTCTTTCCTCTCTAT
CTCACATTAAATCTTCCCCCCTTTTTATATTTTCTCCCTTTCTCCCCTCT
TTTCT
|
| quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 11 18 37 59 41 33 32 32 28 28 37 37 37 37 37 41 37 44 44 59 31 33 32 34 34 36 44 57 50 57 57 57 57 57 57 42 42 26 36 36 42 43 68 68 47 47
42 42 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 51 51 51 51 68 68 50 50 50 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68
68 68 59 59 59 59 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 47 46 43 44 44 39 39 48 48 48 48 54 54 59 59 68 68 59 59 59 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 53 53 50 50 50 50 43 30 24 8 8 8 8 8 8 16 24 19 12 11 12 11 10 11 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 12 25 36 59 50 50 50 50 50 46 43 43 43 43 48
48 43 37 36 36 37 37 37 34 32 16 14 9 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 10 10 18 28 25 27 12 12 12 15 30 28 41 46 46 41 48 48 48 48 57 43 43 36 37 37 43
47 39 43 43 43 59 59 39 43 43 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 54 54 46 46 46 48 48 48 46 43 43 59 44 48 48 57 57 57 57 44 59 42 37 37 42 44 44 32 22 22
25 44 44 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 40 40 28 26 26 31 34 37 30 24 25 20 20 20 23 24 29 30 37 32 32 23 22 19 25 30 39 37 37 28 28 28 24 30 29 17
17 17 21 21 27 32 30 31 40 59 59 59 48 39 39 35 32 32 35 35 35 32 32 39 36 36 39 29 30 18 19 22 32 34 40 33 33 25 28 19 21 13 13 11 22 15 13 10 11 11
11 18 21 18 18 15 30 15 18 18 19 15 13 24 15 13 13 18 28 24 20 20 23 24 28 23 21 11 13 11 13 13 10 10 10 10 11 11 12 20 17 13 10 10 10 10 11 16 20 21
12 8 9 9 9 10 10 16 16 21 21 22 22 19 20 11 12 11 11 11 9 11 9 10 12 13 8 8 8 10 10 10 12 9 9 10 20 15 15 10 10 8 8 8 8 10 12 10 9 9
9 8 9 12 14 15 10 6 6 8 8 8 15 8 8 8 10 9 10 10 12 11 9 9 10 10 10 10 13 13 10 8 8 10 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 8 8 10 9 9 23 17 32 32 37 41 37 37 47 39 44 50 53 53 57 57 57 57 57 57 48 44 40 37 30 30 33 37 43 42 36 36 36 40 42 54 68 68 68 68 51 50 50
50 50 50 54 54 68 68 50 57 36 41 41 41 41 41 57 57 57 48 50 50 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 50 50 50
50 51 51 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 41 41 41 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68
68 68 68 54 54 54 54 54 68 68 68 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 48 59 47 59 34 36 23 23 3 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0 0 0 3 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 6 3 0 3 6 8 8 9 9 7 10 12 9 9 9 9 10
10 8 8 8 7 9 9 7 7 3 0 3 0 3 3 0 3 9 9 7 7 7 7 8 8 6 6 8 8 8 7 7 7 7 10 12 14 8 8 6 8 8 8 10 15 15 11 3 0 0
3 18 10 10 11 22 11 13 11 13 11 10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 15 15 21 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 15 17 18 3 0 3 11 11 15 9
9 9 9 7 7 8 8 8 8 8 9 12 14 16 10 10 6 7 7 8 9 10 14 18 25 20 21 22 24 22 21 22 22 15 14 13 8 8 7 3 0 0 0 0 3 0 3 8 6 6
6 8 9 9 12 16 12 10 9 8 8 8 6 8 3 0 3 6 6 6 6 11 6 6 6 6 6 6 19 16 26 25 22 16 12 12 16 16 21 32 39 19 11 11 12 11 11 21 9 10
8 6 3 0 3 8 8 10 12 22 22 19 10 10 10 10 7 7 6 7 6 11 11 12 11 15 13 16 10 10 10 10 10 10 11 11 12 12 9 12 9 9 8 8 8 8 9 8 8 8
10 10 8 8 6 7 13 7 8 9 9 22 19 10 10 10 12 13 13 10 10 10 13 13 12 12 9 9 9 10 9 13 8 8 8 10 10 9 10 6 6 8 8 8 8 9 9 11 12 12
15 11 10 8 6 8 7 6 6 8 8 10 11 16 15 10 9 9 9 10 10 11 10 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 16 14 10
9 9 10 15 10 10 12 7 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 12 13 11 11 11 10 10 14 9 9 9 7 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 8 8 8 8
6 6 6 8 8 10 13 9 15 6 6 6 6 8 8 9 10 10 9 9 10 8 9 9 14 13 13 9 8 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 6 6 8 8 10 11 12
18 15 12 11 8 8 8 10 8 8 8 8 13 8 11 8 8 8 10 10 8 8 6 6 7 10 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 8 8 8 8 8 8
8 6 8 6 6 7 11 11 8 8 11 12 10 10 7 6 8 8 10 10 10 9 10 10 13 13 11 13 11 11 11 9 11 9 9 9 9 9 12 10 11 11 10 10 10 8 8 8 9 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 10 16 14 28 22 18 16 21 11 8 8 10 8 8 8 10 10 10 15 21 15 10 10 11 8 9 10 15 16 16 16
19 10 10 7 7 |