BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-302K08.T7 (MSMg01no302_k08.b1) | MSMg01-302K08.TJ (MSMg01no302_k08.g1) |
ACC | AG428476 | AG428477 |
length | 734 | 756 |
length of high quality (start - end) | 319 (45 - 363) | 290 (74 - 363) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no302_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no302_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:40:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no302_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no302_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:40:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTCCCCAGACATGAGAGTCCTCCCTAGGCATGAGAATTCTCCCCAGA
CATGAGTCCTCCCCAGATATGAGCCCTCCCCAGACATGCAGTCTGTAGGA
ACCTTAGTCTGGGACTTGTAACTTGCAGATGCAGGAGAAAATAACTATGA
TGTCAGCCCACATCAGCCTGTGGTATCTATCAGACAGCCCGAGCAGGTGA
TGAAATGCAGTCTTAAGTGCTCTCGTATGTTAACGTTGCTAGGTAGGAGT
GGCTTTAAATTTGGAGGTACAGAGGACATTAGAGATGAAGTGTTAGGTCG
ATGCAAGTACTAGACTTGAGTGTACTACAGATCACCTCATTCAGATGGAG
GGCACAGAAAGGGCTGTGTTCCTGGCTATAGAACGAGCTAGAAATAGAAA
AGCTATCCTTAGAAGAGAACATTGTTCATGGTGCTGCATGTACCATTAAA
AAGCAGAAGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACTC
ACACACTCAAATTTACCATGAAAATTATCTAGACGCAAAATTTATACATC
CCAATGAACTTCTATATTGTTAGATTAGTCATTCTGAAGTTGTGGAACTT
CATGCCAAATTTTATACTTTCATTATCACTTTTTTCACTTATCTGGTTAA
TTTTACTGTGTGATTTTTTCCCTAATTTTGCAAN
| ATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATATACATTTACAATGACAGTGCACAG
TAGGGACATGGCTAGAGAAAGACTCGATGCCTGACTTGGTGGGGAAAAAT
GCATTACTCCTTAAAAGGTCATTTTATTAATTTAAAGAACAGAGAATCCT
TCCCCTTTATCTATTTTTTCATTAAAATGTTTATACAATAGATTTTGATC
ATATTCTTTCCCCTCTCCCAACATCCCTGATCTTCCCCCACCTCCATTCC
CACCCAACTTCTTGTTCTTTCTCTCATTAAGAAAAAGGAAATGATAAAAA
AAAAGAAAGCCAATTTAATTAATTCCCAANACAANCCCGTGGAGTTCATT
CGCTGTTGGCTAACTACTCCTGTACTCAAAAAAAAAAGACCTGCCCTGGA
GGATGTTTGATATGACTGAAAGGATAAAGGGTGACATAAACCCATTTGTC
TCCATTTCATGACTGGGACTGATTTTTTTTTTGAGATTATAAATTTTTTA
TTAAATATTTTCTTCCTTTGCATTTCAAATGCTTATCCGAAAGTCCCCTA
TACCCCCCCCACCCTGTTCCCCTAACCAACTCACTCCCCACTTTCTTGTT
CCCTGGTGGTTCCCCTTGCTACTGGGTGGTAAATAAAGGTTTGGCAAGAA
ACAAAGGGGGCCTTCTCCTTTCTCCATTGTATGGGCCGAACAAATGCTCA
TTCTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 10 11 19 44 59 41 33 32 32 28 28 30 30 28 24 24 37 41 41 41 59 30 29 31 31 31 35 44 57 37 37 28 32 32 39 43 42 34 28 28 28 23 27 11 11 10 21
21 47 50 51 68 68 68 57 46 42 36 30 25 21 13 24 13 11 25 32 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 50 57 42 42 47 47 47 51 68 68 68 53 53 50 50 50
50 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 53 53 53 44 30 30 19 19 16 19 12 12 12 13 25 30 36 39 36 40 40 48 48 50 50 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 59 59 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 48 44 39 39 39 43 43 43 43 28 41 37 54 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 25 12 10 10 13 13 10 13 11 11 12 25 26 32 24 19 12 12 10 10 13 18 18 19 20 34 37 48 59 57 53 50 50 50 50 48 59 48 48 47
59 59 59 59 59 57 57 59 57 59 59 68 59 59 59 43 41 41 41 41 41 59 59 59 48 59 59 59 59 43 39 39 47 47 48 48 57 47 59 59 59 48 46 46 47 47 34 34 25 20
20 34 34 47 39 46 47 47 43 46 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 47 47 47 47 59 44 43 37 37 41 41 47 47 47 46 47 59 59 46 48 48 57 48 43 43 36 36 39
39 41 41 59 34 34 20 18 22 22 20 19 28 34 47 47 47 47 59 48 48 37 41 28 28 28 28 23 23 18 23 15 20 23 28 26 28 24 16 16 16 10 10 10 10 8 8 10 15 15
30 25 28 19 20 12 15 12 16 15 25 25 22 22 28 32 37 37 37 40 29 22 17 17 19 17 19 37 39 39 40 40 37 37 32 25 25 26 22 25 28 39 36 36 28 34 32 37 37 37
23 17 10 10 10 15 13 15 17 19 30 34 34 34 25 25 18 30 25 39 30 30 15 20 19 25 19 28 32 32 32 33 37 37 37 23 20 16 18 16 16 12 12 15 18 15 14 16 13 16
19 15 15 12 11 9 9 8 8 9 11 18 14 15 15 14 21 14 12 11 10 12 12 20 25 28 22 22 22 22 23 25 31 31 35 30 16 12 8 8 8 11 13 23 16 14 12 12 14 27
30 37 25 24 23 16 12 9 9 9 9 10 15 12 20 24 20 19 12 11 10 14 9 9 9 10 10 11 10 9 10 9 3 0 | Open.Hide. 6 8 8 6 6 8 11 23 30 33 33 37 39 33 48 53 53 57 57 57 57 57 57 57 59 57 53 53 53 44 44 43 43 43 43 33 29 32 32 33 39 43 42 30 30 37 42 42 50 50
50 50 54 54 54 54 54 57 32 40 30 30 38 40 44 59 59 50 51 50 50 50 50 50 48 50 48 50 47 47 47 50 50 47 47 47 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57
57 59 59 57 57 57 57 57 50 50 57 57 68 68 50 50 43 37 43 43 43 50 42 37 32 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 31 44 44 68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 52 57 52 57 57 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 54 54 59 59 59 68 68 59 34 26 13 13 13 13 13 13 18 28 32 47 48 59 59 59 48 43 43 43 43 43 43 57 48 48 48 59
59 59 59 59 59 59 37 37 37 23 18 11 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 13 11 11 18 28 36 41 41 41 48 48 48 48 43
43 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 32 23 23 11 11 11 12 12 18 9 9 9 9 8 8 10 11 12 9 11 9 9 9 10 10 15 20 25 24 24 21 22 14 14
12 14 12 12 11 15 15 30 30 30 22 22 22 29 28 36 33 37 37 39 37 37 37 25 18 18 16 16 17 15 20 23 28 28 34 34 39 35 35 35 37 37 48 57 57 57 57 48 48 43
34 33 33 33 33 29 32 24 24 22 30 30 39 34 32 25 25 30 37 28 34 23 20 15 27 26 33 32 27 24 22 20 24 25 33 43 37 37 30 32 32 39 39 48 48 42 42 40 37 37
28 21 11 8 8 8 8 17 22 23 25 37 37 39 27 26 24 20 27 13 19 13 10 9 11 13 8 8 9 15 15 10 8 6 6 8 8 11 17 16 12 11 10 10 12 18 9 9 10 13
15 10 10 10 10 21 21 37 16 16 13 10 10 10 11 10 10 11 15 16 11 8 8 8 9 10 9 10 8 10 8 8 10 10 19 21 19 21 21 21 21 22 31 24 19 14 11 11 10 17
19 16 15 12 9 9 9 9 10 10 11 14 16 15 16 10 10 9 9 9 10 13 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 11 14 12 11 11 12 12 13 22 12 10 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 10 11 12 12 10 10 10 11 11 11 12 12 12 15 19 12 15 14 9 9 9 9 11 12 13 10 10 8 8 8 8 9 12 10 10 10 11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 11
8 9 9 9 9 9 |