BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305I03.T7 (MSMg01no305_i03.b1) | MSMg01-305I03.TJ (MSMg01no305_i03.g1) |
ACC | AG430452 | AG430453 |
length | 1,255 | 1,323 |
length of high quality (start - end) | 436 (30 - 465) | 379 (74 - 452) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_i03.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_i03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_i03.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_i03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCCGTCATTTCGGCCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAA
TTCTCAATAAAGGAAACTCACATGGCCCACAAACACTTAAATATTCAACA
TGCTTAGCCATCAAAGAAATGCAAATTAAAACTACTTTGATATTCCATCT
TACACTTGTCAGAATGTCTAAGATCAACAACCCAAGTGACAGCTTATGTT
GGTGACAATGTAGAGTGAGAAGATTACTCCTCCACTGTTGGGAATGAAAA
CTTGTGAAGTCACTAAAAAAAATCAATATGGTGGTTCTTCAGAAAATTTG
GAATCAATTTCACTCTTGGGCATATGCCCAAAGGACCTCTCTATCCTACC
ATAAGAATACTTACTCAACTATGTTCATTATAGCTTTATTCATAATAGCC
AGTTTCTGGAAACAATTAGGTATCTCTCAACAGATGAATGTATAAAGAAA
ATGTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCGTATTAGTCAGCTATTAAAAAAAAACA
GGGGGAAAATTTCAGGCAAATGGATGGAACTAGAAAAAAAAGTCCCAAGT
GAGATAACTCAGATTCAGAAAGATAAATATGGTGTGCATTTGCTTTTAAA
TGGATATTAGCTGTTAAGTAAATGATGTCCAGCTTCAATTCAAAGACCCA
GAGTAGTTATGCAAAGGGGGAGGATCTAGGGGCATGCATGGATCTCCCTG
GAGGGTTAAATGAAATAGATTTTATGGGCAGACTGGGGGCAAATAGGGAA
AGGAATGGGGAGATCAGGTTGNGAGAGTGGGGCTAGAGGGGGAGAATGCA
TAGAGAGATGGTTGGAATTGAGGGCTATTTGGGAGNTAGTATGGAGTCTT
ATTGCATGGATACTCTGCAATGTTTGAAGTAATCTCCACAAGACTCTTAT
TAATCAGAAATATTAATTCTCATTGCTCTTCTTTTGAACTGTATAATGCT
TCCTATGTCTGACTGGCCTACTTGTATTTCTGGTTGTCCTAATTTTTCAA
GGAATTCCCCTTAACTCATGCTTCATTTATACAATAAAATTTCCCCTCAC
CAATACCAGTTTCCTTTTTCTAAATAAACCCCACCCCCCCCTACTAATAT
GTATTTACCTCTTTGACCCTTCCCTCCTCTTTATCTCTTCTTTTGCTACT
TTCTCCCGTTTTATTATTTAATCTTCTGCTATATTTTATTTTTATTTCAT
TTCTATTGTTCTCCTTTGTCTCCATTCATTTCTTTATACTCTAATGTTCT
GCAAT
| NNNTTCCGAGACGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATAATTTTCAGACTAAGAGGACTCTT
ACCTTACTTCCCATGCTGGGACAAAAAGTCAGGTCTGGGAGCAGAATCCA
ACATCCAGCATTTCTCACATTCTGTGTTCGCCTCGGAGGGCCTTGATGCA
AACATGGATAATGCTAAATGAGTTCATCTCATGTGTTTGAATGAATTGAT
CCAAACACCATCTTTCTAGTTAGCTTTCAATTGCTGTGATAAACACCATA
AACTCTGTTGGGGGAAGGGAGGATTCATTCCATCTTATCCTTCCAGCTAA
CAAATCTATCAGTGAGGAAAGTCAAGGCAGGAACTGAAGCAGGACAGGAA
TTTTTTGGCAGGAACTGCAGCACAGACCAGAGGAACACTGCTTACAGGAT
TGTTTTTTGTTTCCCCCCCCCCCNGNTNNCTTTTACTCTTCAAAAAAAGA
GGGGGGGGNGATGGTACTTAACTACAATGGTTTGGGCACTCTGACACTGG
TCATGAATTAAGAAAATGTCCCACAGGCTGGATTTCAAGAAATCTTATGA
AGGCATTTTCCCAACTAGAGTTCCTCTTTCCAGATAACTCCAACTTGTGT
CAAGTTTGTCAAAAACCAGCCATGACAACTATGGCTTATAAGACAAAGGG
AAGACAGTGAGTAAACTATAGAATTCAAAATTATTATATGAACTTANGGT
AATTATTTCAATTCTAATATTAGTATCTGAAATGTTGCAGATTTAAAAAG
ATCATTTCATCTTCCTATAAGTTAGTAACCATCAGGAGCCATGGAATAAT
TAAACATTTGATACATTAAAAGCAGTAAAAAGAATGAAGTCTTAGGAAGG
ACCCTGAATATTCTAGCTTAAGTACCATCCCTATGACAACCATAACTTTT
GCATTTTCCCTTTTTTTTAGGTTAAATTTGCATCTTAAAGGGCATATTAA
CATAGGCTTTGAAGTGGTGGGGTTTAGCGAAATTACAACAATAATCTAAT
CTCCCAAACTTATATTTGCAAATATTTTATGCTTATTTTCATTATATTAA
TCGTCCGTATTATATGTTCTTTTTTTTTCTATCTTTTTCTTAAAACTATA
CAAAGATAGACACCATATATTCTATTCGATACTTAAATATACTACTTAAT
TTATTTTTTTCCCTTAATGGTTATATACTCNCTAATTATCATTATTCATA
TATAGAATTTAGACTTTGTATAACTTTTCTTATACCCATTTGCACGTATC
ACAATCACGTATATTAATACTCG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 7 9 9 7 6 9 12 10 8 8 10 10 8 8 8 12 17 8 10 10 17 17 24 24 24 42 37 30 33 30 33 37 42 42 42 50 53 50 48 48 50 53
68 68 42 42 41 41 41 42 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 47 50 57 57 57 57 68 68 68 51 51 51 51 51 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 68 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 24 16
12 9 9 11 12 12 12 21 21 39 39 50 50 50 50 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 57 50 50 50 50 57 57 59 59 59 53 50 50 50 50 41
36 23 23 18 13 20 20 26 28 28 24 14 14 14 14 19 20 37 22 12 9 9 9 9 9 23 33 59 59 59 34 32 24 25 18 28 28 35 35 35 31 35 39 25 27 16 16 11 11 11
12 10 9 9 9 13 11 24 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 59 59 68 68
68 68 68 57 57 57 59 59 47 44 37 44 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 54 54 48 48 44 43 37
44 43 54 54 54 54 57 57 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 39 39 42 47 39 39 43 39 48 48 48 47 47 47 47 44 44 34 24 19 22 27 30 37 41 41 34 34 27
27 30 33 32 34 34 37 44 44 44 44 44 39 41 44 44 30 30 22 32 32 37 43 43 40 43 32 37 41 37 37 36 43 39 32 31 41 37 37 37 29 29 32 37 36 37 37 39 30 32
37 37 37 37 41 44 37 37 32 32 20 28 28 34 34 35 31 34 27 27 3 0 3 12 12 15 25 24 28 24 30 30 28 34 28 30 28 31 24 30 19 16 9 9 9 12 15 17 16 14
14 15 19 30 25 22 15 13 12 8 8 13 17 11 17 14 16 13 14 14 12 8 8 8 8 10 11 27 23 19 15 11 13 11 3 0 3 11 16 10 11 11 10 9 9 9 9 9 8 8
8 8 6 6 13 10 16 10 7 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 11 8 8 8 10 10 13 10 6 8 6 7 10 10 10 10 11 10 12 9 10 12 19 15 12 8 8
8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 10 6 8 8 10 12 10 10 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8
8 10 8 8 10 10 10 10 11 11 11 10 13 13 10 11 9 9 8 10 11 9 7 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 10 8 8 8 10 9 8 8 6 6 8 6 8 8 9 12 11
14 14 12 12 12 12 12 10 9 9 9 10 9 9 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 7 6 13 8 8 8 6 7 8 10 10 8 9 8 8 8 11 10 10 8 8 8 10 8 8 8
8 8 10 10 6 8 6 6 8 10 9 7 8 10 12 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 9 9 12 15 23 23 11 10 10 10 10 10 14 16 15 10 8 8 8 8 10 8 11 11 11
11 9 9 9 15 13 12 8 8 8 11 10 10 6 6 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 8 8 8 6 6 6 7 6 6 13 15 12 8 6 6 8 6 6 8
8 8 10 13 10 10 7 8 8 8 8 8 6 7 11 8 8 8 8 12 12 10 19 24 16 21 10 10 9 9 10 8 8 8 13 10 8 7 7 8 8 10 12 12 12 10 11 11 11 8
10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 15 13 10 8 8 8 10 13 19 15 15 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 12 10 9 9 10 9 9 10 7 7 8 8 10 8
11 9 9 10 10 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 12 15 10 8 8 8 3 0 3 3 0 3 10 10 10 21 21 33 33 33 33 47 30 35 36 36
35 35 42 42 42 47 37 57 57 57 57 57 57 57 68 68 53 48 42 46 46 47 48 48 48 48 54 54 57 57 50 48 51 50 50 50 50 50 50 36 29 21 24 18 30 37 37 41 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 46 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 50 50 37 37 37 57 57 57 57 57 50 50 37 38 38 43 44 57 57 57 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 57
59 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 68 44 44 37 37 32 37 37 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 53 50 50 53 57 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 50 42 41 25 24 12 12
11 12 14 11 10 9 9 9 11 22 25 41 42 50 50 59 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 43 43 43 43 48 48 48 57 48 48 48 59 59 59 59 59 50 47 47 27 27
11 11 12 27 25 15 15 7 7 7 9 12 14 16 20 14 14 14 12 11 8 8 3 0 3 0 3 0 0 3 18 12 12 9 9 9 12 12 11 11 11 12 8 9 9 8 8 6 8 6
8 8 9 10 9 12 10 3 0 3 23 25 39 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 54 57 57 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 54 57 57 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 54 54 59 59 57 59 48 48 48 59 59 59 48 48 59 59
59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 47 47 44 59 44 41 41 44 43 41 47 42 42 50 50 50 50 50 57 59 57 57 57 48 57 39 39 39 39 37 39 47 41 41 41 41 39 39 39 36
43 34 34 23 28 28 37 37 33 35 30 35 35 35 47 50 59 59 59 41 59 59 31 26 32 19 18 18 25 34 37 23 19 16 12 12 12 27 32 39 37 41 39 25 25 3 0 3 18 23
18 17 21 25 22 18 18 21 14 12 16 25 28 39 37 27 26 27 28 30 30 33 21 21 11 17 17 22 24 24 24 22 27 27 25 29 27 34 18 18 12 8 8 8 8 8 8 11 11 11
14 21 21 19 11 10 10 10 10 11 19 15 19 27 27 28 23 12 10 10 10 12 17 13 11 9 9 9 10 12 10 10 10 10 9 9 9 12 15 15 15 14 15 12 17 14 15 9 9 9
8 8 8 8 8 10 13 28 24 22 18 14 18 13 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 12 13 19 19 12 9 10 8 8 10 8 8 8 8 8 9 8 10 8 11 15 11 12 11 11
13 8 8 9 10 10 9 12 12 16 10 9 9 9 15 9 11 13 19 15 10 8 10 13 7 7 8 8 8 12 12 19 18 20 19 19 18 10 11 8 8 8 10 11 11 14 12 20 14 10
8 12 13 17 19 9 9 8 10 12 13 18 19 37 29 22 10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 10 9 9 10 10 10 9 8
8 8 9 9 10 10 15 10 12 9 9 9 10 9 6 6 6 6 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 9 9 9 9 8 8 10 8 6 8 9 7 8 7 7
8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 11 8 8 7 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 10 15 10 10 11 10
13 10 10 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 10 8 18 12 12 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 11 12 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9
9 10 13 17 8 8 7 6 8 6 9 8 8 6 6 8 8 8 6 7 11 15 12 11 11 9 8 7 7 11 8 6 6 8 8 8 6 6 10 8 8 8 6 8 8 8 8 6 6 6
8 6 7 8 8 9 12 9 9 9 8 8 10 8 8 10 17 9 9 9 9 16 10 8 6 6 8 8 11 3 0 3 6 8 6 6 8 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 12 14
10 12 9 9 8 8 7 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 8 6 6 7 6 8 9 9 8 8 6 8 8 8 8 8 7 11 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8
6 6 6 8 10 13 8 6 6 6 8 11 12 10 8 8 9 8 8 8 8 6 6 |