| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-305O12.T7 (MSMg01no305_o12.b1) | MSMg01-305O12.TJ (MSMg01no305_o12.g1) |
|---|
| ACC | AG430722 | AG430723 |
|---|
| length | 1,278 | 1,292 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 423 (28 - 450) | 382 (75 - 456) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o12.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_o12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_o12.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_o12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:25 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NNGGGCGCATTGGGCCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
AATGATGGGGTGAGATCAGAGCTGGGGTTCTATGGCCTTTTACTGAAGTG
GGGACTGGACATGCAGCAGCAAGCATCCTCTGGAAGGATTTTAGGATAGA
AATGGAGGCCCCACCTAAAACCTGTCAAACCAGAATCTGTACTTAACAAG
GTCTTTAGAGGCTCTGCACACATATTAAAATCTGGAAAGCTTTGCCCTTT
GTTACAGCCACTCCAAACAATCTCTGGGCAGGTTTAGAGGCACCTACGGT
ACCTTACAATTCATATAATAAAAACAGAGAATTACTCTTGCACCTGATTA
AGAGCTGGAAAAGAAGCATATAGTGGCACTGATATGACTGCTGCCTCTGA
TTTGTTTCTGCTCCAGATCCAGAGCAGACTCAGAGATAGGAAGTGAGTGT
GTTTTCTGTCCCCCCCCAGATAGAGATACAGAGCCAAAGAAAAAAGTGAG
TCATAATTCATTATTGTTTACATATCAATTACTAAACATGTTTGGAAATC
ATCTTACTCTAGGCACACTACAGAGTATATTTTTTCCCCTTTAGGGTTTT
TTGTGAGTCTTGAGAAAAAAATCTAAATCTACTATATGATATCTAAAGAG
GGTTAGGTTAAACGCTTCTGAGTTTACCTGAAACTTACCAGCCTCTGTCT
ACAACAATGAGCACTAGGTCTTGCATGCACTATGACCACCCTTACCTGTA
GATCTGCATTGCCAATTCTTAAGCATGCAGATCTCAGCTTGTCAAGTCCA
CACCAAAAGCTCTCTTGACCACCTCACTGAAAGTAGCCACTTAACATTTT
CTAAAATCATCCCTATCATATATCATCATATAACATATGAAGGTTTTATT
GTTGCTTTTATTATTTCTCTGCTTCCAAAATTTATAATTCCTGAGAATAT
TGACTGTCTTAAATAATATTGTACCCATATTCACTCCCATATTCAAACAA
GTTGCATTGACTATAGAATATATTGCAGCATAATTTTAGAAGGCGGCCTT
AAGTATTGGAAAAATGTTTACCCACAAAACATTTTGAATGTTTTGACTTG
GAAAATTACAAATCCATCTTTTACTTTAGAAACCCCATATCTCCCGGGGG
AAGAACAAAACTATTTTTCTCCCCATTGGGAGTACCAAAAAACCCTTATA
CCACAAGTGGACACCAATTTAAAAGACGGTGTTAAAACCAAAATGAGGGA
AAAAATTTTTTTTCTCCTTCTCCAAAAG
| NNNNCGCATGACGTGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAGAAGTTGATACAGCATTCATAAG
ACCTGCACAGACTTGAACTAGACTAAATACTATCATAGAGAGGGGATATG
GGCATGAAGTCCAGTTTCTAGCTAAGGAACTATATTTTTGATACCTGTGG
GAAAGAAAGGATCATGTTTTTAAAAGTGTATTTCTTGGTGGTACACCATT
CTTCAGTAAATATTTATGCCCATGAGTATATGGGCAGCCTAAACTATACT
TGATGATTCTTTAGTGGATCTCTGATTTCTCGACTATCCTGATCTACAGA
ATAACAGAAGTGCCATGGTTACACAGAGAAACCCTGTCTCGGAAAACCAA
AATTTATTAATAAAATAAAATATATAATAAGCTCGGCAGTAGCAGTACAC
ACCCTTTTTTTTACGCCTCCCCCGGCACAGGCAGGCAGATCTCTGAAAAA
AGGAGCGGCCTGGTCTACAGAGTAAGTTCCAGGACAGCCAGCACTACACA
GAGAAATGCTGTCTTGAAAAACACCAATCATAATAATTATAATTAATAAT
AATAATAATAAATAGGACACAAAGTTAGATAAGTAAGGTAGAGCAGATGA
ATATGGGAGGATGGAAGGAGGTGTGAATATGATTTTTTTAATGACAATTG
CTGTAATCACTAGGAATTGGTTGTTATAGAAGCAGCTATAAAAAAGAATA
GAATTCCTTCCCCTTCAAAGTAAATGAATTGAATGCAAATCTTCACATAC
TGTTGGACTTGTAAAGTTGGGGACATATGGTGTCTGTTTGTTCAGAAATA
GGAAGTAGTGACATTGGGATGCTATTTATTGTTTTCTTGGTATAAAGATA
GCAAGGTAAACTGTTGGATTGTAAATTTAAATTTATATTACATTTTTAAT
GAAAGGGATCAGAACTTAAGTTTTTCTACAGAGAGAAATCATCATGTTTT
ATTTGACAGTACTGATTCAAAATGCCTCAGATTCAGNAAAGGAATTGAAC
TGACCCTGTGGCCGTGGCTTCCGTCCCAGATTGAATGTTCTTCTGTTGAA
CCTCCCATTTGAAAACAGTTCCCCCACCAGGCCGGTCCTTGAAAAGTCCC
CTTCTAATTTAAAAAACAAAATTTTGAACCCCTCTAAAACAAAAAAAGGA
ACTTTTTTTTTTAAAAAACAGTGGAAAATTTAAGGGCTCATTAAGGGAAA
AAAAGAGACACTCGTTCTTCAAGCCAAAAACTTTTTATTTTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 9 7 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 12 9 8 8 14 15 18 29 29 36 30 24 28 28 28 33 33 33 33 33 37 37 37 32 19 19 10 9
9 21 21 46 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 54 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 50 50 50 43 50 50 50 50 47 47 47 47
47 57 57 57 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57
68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 68 57 57 57 68 68 59
59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 28 28 21 15 12
12 12 12 26 28 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 57 57 57 48 57 48 53 53 53 53 53 57 57 57 53 53 50 41 41 23 23 12
12 14 13 8 6 6 6 6 9 10 10 9 8 8 8 8 11 9 11 22 27 43 47 48 43 39 30 28 12 12 12 12 12 14 18 12 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 11 9 12 9
12 12 22 30 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 44 44 40 40 40 41 41 47 47 39 39 44 41 41 44 44 44 47 47 50 59 59 59 46 46 57 59 59 59 59 59 57
48 48 48 48 48 48 50 41 44 37 37 37 41 39 37 30 26 26 32 39 59 59 59 59 59 59 50 50 50 47 47 41 39 39 39 37 34 37 34 37 39 37 37 41 42 41 41 43 48 39
39 30 37 37 59 59 59 59 59 43 41 37 41 41 36 36 31 41 32 28 27 25 30 30 39 39 34 30 20 20 20 31 32 37 37 28 28 34 39 39 37 37 32 29 29 30 34 28 31 32
37 33 31 31 31 34 39 39 34 34 25 34 34 37 31 35 39 37 30 25 30 24 25 21 19 19 21 25 28 36 36 35 33 33 32 26 19 15 19 19 28 19 14 13 22 14 13 12 12 12
15 17 12 14 14 12 15 16 9 11 11 21 20 35 37 37 36 33 33 30 30 30 37 37 34 28 23 23 32 28 16 14 18 21 19 20 30 31 12 9 8 8 11 12 17 12 12 13 11 11
9 11 9 11 15 21 9 9 9 9 10 12 11 12 12 13 12 12 12 18 18 25 14 10 11 11 14 19 21 36 31 22 18 12 10 10 10 10 19 19 14 10 10 9 9 9 10 10 10 12
15 23 25 26 17 14 14 12 12 10 9 6 8 8 6 8 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 13 17 17 10 9 8 8 8 8
10 8 9 8 9 9 12 15 28 28 23 12 10 8 8 7 7 10 10 8 8 9 9 8 8 10 8 13 15 16 19 18 18 20 23 11 11 7 7 7 8 8 7 7 7 8 9 9 9 10
10 10 10 9 9 11 8 8 10 10 10 12 7 6 6 6 10 8 10 16 12 12 9 9 9 9 9 9 9 9 10 11 13 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 10
8 8 9 6 6 6 11 11 13 11 17 9 9 9 11 8 8 6 6 6 7 8 9 14 15 23 11 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 8 10 10
10 7 7 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 13 10 10 10 10 10 10 9 11 19 9 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 13 10 11 11 8 8 6
6 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 11 11 12 12 12 12 11 11 8 6 6 6 10 15 11 8 6 6 6 6 6 10 11 8
8 6 6 6 6 11 24 25 37 24 19 10 12 12 13 11 8 9 8 8 10 8 8 8 10 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 7 7 10 9 9 6 6 6 7 6 6 6 10 8 6 6 6 10 10 12 14 7 8 8 6 8 7 14 19 23 19 22 12 16 16 32 32 35 30 30 30 47 36 36 37
37 37 40 37 37 42 43 48 50 50 50 68 54 68 68 54 54 54 51 48 48 48 57 54 48 47 47 47 47 57 48 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 57 44 44 37 37 37 42 39 42
42 42 42 42 42 42 44 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57
57 57 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 57 57 57 57 43 43 43 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59
59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 57 54 54 54 54 54 54 54 57 59 48 47 47 46 59 57 57 57 57 57 54 54 54 48 48 48 50 48 47 47 47 48 48 57 57 59 59 57 57 57 53 48 50 50 47 41 34
28 18 11 8 8 8 8 12 23 30 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
41 34 23 24 14 15 14 22 16 11 10 9 9 9 9 9 8 7 8 8 9 12 11 13 11 22 29 59 59 59 59 59 59 39 34 28 22 19 18 30 23 25 15 10 10 10 10 10 13 12
14 12 12 12 11 11 11 12 23 28 41 40 46 46 48 59 59 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 48 48 48 59 47 54 57 57
57 57 57 54 54 48 54 57 57 57 59 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 50 59 59 59 46 46 41 41 43 39 37
37 39 44 41 59 59 59 59 48 48 50 50 57 57 53 53 53 53 50 50 47 53 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 48 57 57 48
59 59 48 59 59 47 47 39 39 33 34 34 39 32 32 30 37 37 30 36 32 32 38 39 39 41 40 41 59 59 59 59 59 48 47 47 43 43 39 59 59 59 59 44 44 37 31 31 37 37
37 59 41 41 46 39 39 37 37 31 31 39 39 39 39 32 28 28 31 37 41 39 41 39 39 37 31 31 31 31 37 37 37 37 37 36 32 32 34 32 37 34 34 23 23 23 34 34 47 39
39 36 39 39 35 37 41 39 27 29 30 32 26 24 32 32 29 29 28 28 29 30 22 28 28 34 34 32 25 18 18 18 24 19 14 9 9 9 12 15 29 24 28 23 21 16 20 20 24 24
26 26 29 31 33 34 31 28 30 37 37 31 15 9 8 8 7 9 11 15 19 19 19 20 27 27 15 13 10 10 10 11 9 11 11 17 13 16 16 11 11 11 22 16 31 28 28 15 15 10
15 15 14 11 13 21 28 25 16 16 19 19 15 19 19 28 25 24 21 21 15 15 21 26 17 26 28 31 30 21 21 21 14 10 15 12 11 11 12 17 12 15 21 28 29 28 24 24 9 10
10 21 22 8 10 8 8 8 8 11 9 9 12 12 12 12 16 11 18 22 12 16 9 8 8 13 14 14 9 12 13 10 10 10 10 10 20 22 31 23 23 18 19 13 13 13 15 18 18 16
22 25 29 30 22 16 11 11 9 11 11 13 13 12 10 9 9 10 9 8 10 10 10 11 16 11 12 11 11 11 9 10 10 11 9 3 0 3 8 7 8 8 8 9 11 11 9 9 9 10
12 19 18 18 14 6 10 6 6 6 7 10 9 9 9 9 8 8 8 8 11 12 11 10 10 12 11 9 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 9 6 6 6 6 6 8 9 10
10 10 9 9 9 9 9 6 7 7 9 6 9 11 11 11 9 8 8 9 9 11 9 13 11 11 11 11 10 10 9 10 8 7 7 7 9 6 6 6 6 6 6 12 11 11 11 10 12 17
12 7 6 6 6 6 6 8 12 11 12 11 11 8 8 8 8 8 10 15 16 19 23 14 14 15 15 15 16 19 12 13 10 10 10 15 12 11 8 8 8 8 14 21 19 13 12 10 9 9
9 9 13 14 26 31 35 36 37 27 24 20 18 18 27 18 11 10 8 8 8 8 8 8 9 12 8 8 8 8 8 8 9 11 10 11 9 9 9 9 9 11 11 12 12 20 11 11 8 11
8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 8 6 6 7 8 8 8 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 8 8 |
|---|
