BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332B07.T7 (MSMg01no332_b07.b1) | MSMg01-332B07.TJ (MSMg01no332_b07.g1) |
ACC | AG448208 | AG448209 |
length | 1,609 | 1,269 |
length of high quality (start - end) | --- | 664 (139 - 802) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_b07.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_b07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_b07.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_b07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCGCGCTTAGGGGGNNNCCATATTGGCGGGATAAGAATCTCTATATAGGG
AGAGGGAAACGCGCGGGAACTCTATAGGANANGANGNNGATTCCTAATCA
GGACTCCCCCTGNNNNNGNNNNNNNNGNGNGNGNNNNGNGNGCCCCCTTT
TAAAGTAGTCTCCANNNNGGNGAGGGNGGNGANAGGGAGNGAGAGTATGA
GTGAAGAGGTACTTGGGGTTGAGATGCATTATTAGAGAGATATGCAGNAA
TAGGGAGTGNGTGAAAGGAGAGAGTTTAGAAAGGAGTGAAGATTAAGATG
TGGAGAGATGGGNAGAGAGTGTGACAGGATAATGTGATGATGATTGAGAG
GAAGAATAGGTGTAGATGAGGGTATGTTGGATGTAGAGGAGAGTTGAGTA
TGGATTGTTTGATGTAGGAAGATGTAGAGGGAGAATGGTATAGATGGGTG
ATGGGGTGGAGAAGTAGAGTTAGAGTGGGAGGAGATTGGGAAACGGTGAG
GTGGGTAGGTGAGGTATGTAAAGAATAGATGTATTGTGTTTATGTAGGTA
AGAAAGGAATGTTGATTTGTAGAGGAGATTTATAGGTGATAGTAAGTGTG
GTCTTGAGTGATGAGAGAATTTATAGTGTGGTGATGTGAAAGAATGGATG
TTGGAGATGTGAGATGGGATTGGTAGAGAGTAAGAATGAGATGGGAGATA
TAAAAATGTGTGAATTTTANGGGTGTGGAATTGATAGTAGAATTTTGATG
GGGTTGAATTATGGTTGTAAGGTATTGTTAAGTAGTAAGGATTGGGATTT
GGTGATAAGATATTAGTAGGGATGTTGAGGGAAGATGTTGAAAGGGTATN
TAATGAAGGTGGAATAAGGGTTTATGTGTGGGAAATTGGAAAAGTGGGGA
AATAGTTTTTAATGTGAGGATGAATTAGGTGGAAAGTTTTTGATGTAAGT
GGAGGAAGATTTTTATGGGAAAAAAAAGGAGGATTTTTGGGTGTAAAAGG
GTTTATTGTANAAGGTAGTTTATAGAGGGGGAGGGTGGGGAAGAATAAAT
TAAAGGGGAAGAAAAGAAATTTGGTAGGAGGGGTTTTAAAAGAGGAGGGG
GAAAAAGGGGAATAAGTNTTGGGAAGGTATTAATTGTTTGAATGGTGAAA
GTTGAGAAAAAGAAAGGAAAGATGTTATTTGTTATTGTTTTTGGGTAATA
TAAGGAAAAGGAGAGGGTTTTATTATGATGGGAAGGAGAGAGGGGTGGTT
AGGTTTTATTATNTATAGGAGTGGAATGTTATATATGAGATATAAAAGGA
TGAATTGGTGTAATTTTATATTTGTAATTAATTTGGATGGGAGAGAGTAG
ATATAAAGTAAGATATATTAGAAGGGGTAGTAAATATATGATAATATATT
GGATGAGAATGAATTAGTGAATATTTTGATAGTTAGATAGATAATATAGT
TGTGTTTATAATATTATGTGATAATAGTGAGATTATTAGATAATTATAGT
GTGAAGATATATGTATTGTAAAGATGTATAGATGGTGTATTTGTATAGGG
GAGTGATGAAGGAGGATGTATTAAGTTGATGGTGTTGATGGTAGAAGCGG
TGACGTGGG
| CCGCCCTCTTTTNAAACCAAGCGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCATAAGGCCCCCCCTCTCAG
GAGATCCAGGGATGCCCAACCTTTTATCTCCTCCCACGCCATTTGTCACA
TTGTACAGATTGTGATGTGACAAGTGTTTGCCCTTCCCTAGCTGGAAGGC
TTTGTAGTAAATGCTCAATAAACGTTAGCAGCTGCTGCACAGCTCTAAGC
GAGGTGATCCGCCCCAAGGTACTGAGCGCATGCAGTCAGGAGGGGTCTCA
CCTGGCATGTTTTCAGTGAACCTTGGTGTCACAGGCTCCTCACTCCTCCC
TGACTGGTGATCAAAGCTCACCACAACATGAGGAACTGTGTTGAGGGCTC
ACAGCATAAGGATTTTTGAGAACCGCTGCTCTAAGCTGTTGCAGTCCCCT
TACCTGCTCACAGCTAAGAAGCATAGCCACCATGGCTCTGGGGTGGGAGG
GGACAGTGTCACCTTTCATGAGCTTTGTTAGAGTGCTGACCCATGTGGTA
ATTTCTTCTCCCACCTCCCTGTTTTAGGGTTTTTGCCAAACTCTTTGCTA
CCTCCTTATGAGGAAGTGGTGAACCGACCTCCAACTCCTCCCCCACCGTA
CAGTGCCTTCCAGCTCCAGCAGCAGCAGCAGCTGCTGCCACCTCCTCCTC
AGGGTGGCCCTCCAGGTGGCAGTCCCCCAGGCGCTGACCCGCCGCCCCAG
GGCTCCCAGGGAGCGCAGAGCAGTCCTTTGTCCGGACCGAGCCGAAGCAG
CACAAGACCTCCCAGTGTCGCAGATCCTCAGTCCCCTGAAGTGCCCACTG
ACCGGGAAGCCACCAAAGCCTCTGGGACGGAATCTGGTAGCCCCATGGCC
GGCCTCGGGGAGCTGGACCCGGGCGCCTTCCTGGACCAGGATTTCCAAGT
GCAGGAGGATCTACTGAAAATTCCGGTTCTGAGCGGGCGGCGTGGCCCCT
GAAATGGAATACAGACCCCCGGCAGGCATCGCCCTTTCAAGGTGAATCAG
GCTTTGAGGTGTGGGGGTGCAACGGGGGCCCCCTTGAACATAACCCCAAG
AGATTACCCCCTCCTATAATAATCTCTGACACGGCCCCTTTAATTTCTTT
ACAATTTCTTGTCAACCCCCCTTTGTATAAAAAAAAGTCTCTCGCTCCTC
CCCCAAGTTTTCACCTGAAATATTTAAAACCCCTCTTTCATACATCATGT
TTGTTTTGTTAACAACAAA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 21 3 0 0 0 3 7 7 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 10 11 12 9 9 8 10 8 8 9 8 10 8 8 8 8 6 6 7 6
7 7 10 10 10 8 8 8 8 11 12 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 7 7 8 6 6 6 8 3 0 3 0 3 3 0 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 0 3 0 3 0 0 0 0 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8
8 8 8 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 0 0 0 3 3 0 3 11 8 10 3 0 3 3 0 3 3 0 3 8 8 8 9 3 0 3 10 8 6 8 8 10 10 15 12
8 8 12 10 10 6 6 6 8 8 8 8 11 11 11 7 6 6 8 8 6 7 6 10 10 10 8 8 9 9 9 7 8 8 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 6 8 3 0 3 8
9 10 11 14 13 11 6 6 3 0 3 6 7 7 9 9 11 11 11 12 9 9 10 9 9 10 10 9 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 11 11 13 11 9 9 9 11 16 10
10 11 9 9 10 8 6 6 6 8 8 3 0 3 8 6 6 8 8 8 6 6 7 11 7 7 7 15 12 12 9 9 9 9 12 10 11 6 6 8 8 10 8 8 6 6 7 7 10 8
8 9 15 16 14 8 8 8 8 6 6 8 10 9 9 9 9 15 11 11 10 11 10 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 16 19 19 8 8 8 8 8
10 9 9 8 6 6 6 8 8 9 12 10 8 6 6 8 10 6 6 8 8 6 6 6 7 11 8 11 8 10 8 8 6 8 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6
6 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 10 7 6 6 6 8 9 13 8 8 6 6 6 7 8 8 10 11 12 15 15 15 9 10 15 15 15 10 10 8 8 8 8 6 6 8 9 10 7
7 6 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 6 6 13 10 6 6 8 8 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 15 7 8 8 8 8 10 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 9 9 11 15 23 15 10 10 10 8 8 8 10 10 10 7 7 8 7 8 13 13 16 12 10 13 9 9 7 6 6 6 10 12 13 10 8 8 6 6 6 8 8
8 6 6 6 6 6 6 8 8 12 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 6 8 8 11 11 11 11 8 9 9 9 9 8 8 8 6 8 8 8 8 10
8 10 8 6 6 6 8 9 7 6 6 6 8 8 16 7 6 6 6 8 6 8 10 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 10 14 9
9 9 12 9 9 9 6 6 6 6 10 8 10 8 7 7 7 11 3 0 3 7 6 6 8 8 6 6 6 8 7 12 11 11 16 17 9 9 9 23 18 8 8 8 8 10 8 6 6 8
6 9 10 10 10 10 10 8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 14 13 11 11 11 17 18 17 18 11 11 9 9 9 11 9 9 10 9 9 9 13 10 9 9 9 11 12 8 8 8
8 8 6 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 8 11 8 9 10 13 9 10 10 7 8 3 0
3 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 24 18 16 15 10 9 9 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 9 9 9 10 9 9 10 12 15 11 11 11 9 11 10 9 9 9
9 9 9 9 9 9 10 6 8 7 6 7 6 8 6 9 9 8 8 8 8 10 8 8 11 11 10 8 14 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 9 7 8 6 6 8 8 11 10 10 16 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 10 12 13 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6
6 8 10 6 6 8 6 6 6 3 0 3 8 8 6 6 8 10 8 11 9 9 6 6 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 11 9 9 9 10 13 11
13 9 9 7 7 7 8 9 9 8 8 8 9 8 8 9 10 9 9 9 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 9 9 9 11 11 21 19 17 9 9 9 10 10 12 10 10 8 7
8 10 8 9 14 14 13 13 14 11 10 10 13 10 10 10 3 0 3 10 9 10 10 9 10 8 8 8 8 10 11 14 15 12 9 9 9 10 9 10 10 13 9 10 8 8 8 8 10 8
11 11 11 13 9 9 9 9 9 13 13 23 21 19 8 8 8 8 8 8 9 6 8 8 8 10 11 11 13 8 8 13 8 9 9 9 9 10 10 10 10 11 13 8 8 8 10 8 8 8
8 10 9 11 11 11 11 16 11 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 12 13 11 10 10 9 9 9 10 9 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10
8 8 8 8 10 10 11 11 11 13 10 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 10 15 10 8 8 6 6 8 8 9 9 10 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 11 11 9 11 6 8
6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 6 6 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
9 8 8 8 7 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 8 11 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 8
8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 10 18 23 11 10 10 10 8 10 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 10 8 8 6 6
8 8 6 6 10 8 8 8 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 11 12 16 14 8 6 6 6
6 6 6 8 8 8 6 10 6 6 6 6 6 8 8 13 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 6 6 8 10 10 6 6 6 6 8 6 7 7 12 10 12 11 13 7 6 8 8 7
8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 9 9 6 6 6 6 8 7 6 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 11 12 15 9 9 10 10 9 8 8 8 8 6 6 6 8 9 8
8 8 8 8 8 9 9 9 9 | Open.Hide.15 15 7 7 8 9 9 9 9 9 12 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 8 6 6 6 6 9 11 13 9 9 9 9 12 9 10 15 15 20 22 20 19 21 22 20
20 12 15 21 26 26 28 29 24 29 29 26 26 35 36 36 36 36 44 44 39 37 47 47 27 23 9 9 7 7 7 9 7 9 7 8 8 10 10 10 11 11 12 23 25 37 37 37 39 37
37 37 37 36 39 39 43 43 36 36 31 31 30 28 37 37 41 27 25 10 12 11 11 10 9 11 13 12 19 11 11 11 11 11 12 11 11 12 16 25 34 37 37 39 41 44 47 53 47 47
42 36 36 37 36 37 47 48 48 57 57 57 57 50 50 53 68 53 43 43 54 43 43 43 48 50 50 50 57 59 57 54 48 48 50 48 47 42 42 37 37 39 39 42 43 43 57 46 54 54
57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 48 48 48 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 44 50 50 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 57 54 57 57 57 57 57 54
59 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 52 52 59 59 57 54 54 59 52 57 57 57 57
57 57 59 52 43 43 38 43 43 59 59 57 57 57 57 57 43 43 50 59 59 68 57 57 57 57 57 57 50 48 54 57 57 57 57 59 43 43 43 47 47 47 57 57 57 59 59 59 57 54
47 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 54 57 59 59 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 68 59 57 57 57 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 48 48 57 59 59 59 59 48 57 57
53 53 50 50 46 43 32 24 15 8 8 8 8 8 9 24 23 23 28 28 34 37 48 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 48 43 43 43 43 48 59 59 43 43 43 43 43 47 47 59 59
59 59 54 48 48 48 47 47 39 41 39 39 39 43 34 34 37 37 39 44 57 57 57 59 47 43 43 47 57 54 57 57 59 59 35 35 35 47 44 40 36 59 46 54 57 57 57 57 57 57
54 54 57 57 57 48 48 48 50 44 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 54 59 50 50 38 38 43 50 59 57 57 57 57 57 57 54 52 52 52 52 52 57 57 57
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 59 48 57 57 47 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 26 40 40 57 57 57 57 57 54 54 46 43 42 39 39 37 39 33 33 39 43 42 47 39 39 35 43 43 48 57 57 43 43 39 47 34 48 48 40 40
41 41 44 59 41 32 29 34 34 32 28 34 28 35 39 39 39 43 43 43 57 47 57 48 48 48 48 43 43 43 43 37 37 39 39 40 59 37 37 37 37 37 37 37 37 41 37 36 34 28
23 34 24 26 24 18 18 18 18 25 37 47 39 39 37 33 33 19 26 20 20 20 20 28 32 39 32 31 21 22 16 16 16 22 29 33 33 33 33 36 36 36 37 35 31 29 30 34 30 33
33 20 20 16 14 13 15 16 22 29 33 30 30 37 25 23 11 11 11 25 25 25 30 17 19 21 22 22 28 30 30 30 33 30 29 30 27 20 22 14 12 12 12 19 20 25 32 32 22 22
12 15 15 18 14 14 15 24 15 22 11 8 8 8 9 8 8 14 10 12 10 15 11 11 16 12 12 11 8 13 12 8 8 17 21 20 18 18 16 13 13 8 8 13 17 8 9 9 10 19
15 22 18 15 12 12 16 22 16 18 13 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 9 13 8 10 10 10 10 8 13 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 16 11 18 17 19
16 12 15 11 11 11 20 15 10 10 10 10 10 11 12 12 11 19 19 18 13 21 13 13 10 10 10 15 12 14 15 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 14 12 7 6 6 8
8 15 17 13 13 12 12 12 12 12 8 8 10 11 11 14 14 13 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 15 10 10 10 8 8 8 8 11 8 9 8
10 8 11 10 13 11 10 11 8 8 7 8 9 10 10 13 18 22 24 10 10 10 14 15 12 8 6 6 8 8 8 8 8 10 9 9 10 11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9
10 9 10 10 10 12 10 10 11 12 11 12 11 13 13 11 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11 15 15 18 12 16 13 10 12 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 6 6
6 6 6 7 7 12 12 14 15 19 12 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 10 10 12 12 10 13 8 8 8 8 12 13 16 12 9 9 9 8 8
6 6 8 8 12 12 18 19 15 13 8 8 6 6 8 8 15 15 13 10 13 10 10 8 10 10 10 9 8 11 11 15 13 17 17 10 10 11 16 12 12 11 9 9 9 10 10 10 11 11
12 12 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 7 8 8 8 8 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 10 10 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
10 8 9 12 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |