BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392B01.T7 (MSMg01no392_b01.b1) | MSMg01-392B01.TJ (MSMg01no392_b01.g1) |
ACC | AG493689 | AG493690 |
length | 753 | 743 |
length of high quality (start - end) | 578 (49 - 626) | 420 (76 - 495) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_b01.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_b01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_b01.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_b01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:28 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCAGGACCTGGCTTTTAATATTTATGTTTATACCTATCGATTAT
TGCTACATTTGGCCTTTGTTGTTAAAATTACATTTTTGAGGTGGGTTGAG
TTACAAGTTGTCAAAGAGCTTACAGTAAGTGACTGTGAAGCACTGTACAG
TAGAGAAATCTTAATCCAGCAACATGGCTGCCCTGTCAAAGGATCCCATC
CAAATAACTTCTAGGTCTTTGTGATCCAACTGGAATGGTCCACCTTTAAT
CCCTCTGGCTGAAATACAGACACACCCTGCCCGTAATACATTGCTTTGAT
CCCAGGCAATGAAGGTAAATTTAGCTTGTACAAGGAAGCAACCATGTTTG
AAAGTGACTTTTAATTGAGGGACAAAGTGAGGGCTCAGAGAATGAGTCAG
AGATACACTCAACTCTCATAGGAACAGACAGAAAGGAAAGGCTACTTAAG
ACGAGCATGCATGAGTCAGGGTCAGAGGTCAGTTCAGTGAGTGCAATTCA
TTTCATTTCTGGGCTGTTCCACTCAGTTCAGTCAGCTTGGGGGGAAGTTT
TGAGTTAGAACAGCCGAGTTGAACTAGCACCCACCCACACTACCCCCAAG
TTCAGCCAGAACTAAACCAGTTGAGCTTTTTCAGCACAAAGTCTCCGAGG
CTGAAACATTCTACACCTATGTTTGCCCATGGACGCTGGACGCTGACACC
CCN
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCATGTGTCAGAATGTTTTCAGT
ACAACAAAGCTGTGTTTTAAGGTAAGATTTAATGAAGACATTTTCATAAT
CAATAAGACATTTTGCTGGGTTTTTGTTTGTTGGTTTTTTTTTTTGCTGT
TGTTCTCATTTTACCCATTATTGTATCCATGTAAAATTAATAAAAATGTT
ATTAATATAACAGAATGGAAAAGCCTCAGAAAATTCAAAAATTAGCACTA
TAGATTTAAGAAAATATTTATGATGTAAGTAAAAAAACATAATTGGAAAA
TGAAAAAAATACCTGTTATATTTAGTGCAATTTATTTAATACTGTGCAAC
ATAAATATCATGTATGTGACAGACATTAACATTAAAGCTATATAACTGTT
AATAAGTATTACAAAAAATGAATTACCTAAAGACAAAATGTTCAGTATTT
TTAATTGGCTTTATATAATGTATCCATAGTTTCATAATTCTGTGGTTACA
CTGTATCATACTACCCGCAATATACTTCCTAATGGCTTTTAATCTGCGAA
TATAACCTATCATAATTACTTTGCACTTGCAACCTTTATTCCACTTTTAC
TGCCTTTATGAGACTTACCCTCCCACTTCTGATGATTCTCCCTATTCCTA
TTTACCCGCCCCTAAGCCTGTCTTTAATGTTCTTTTTTCCTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 13 8 8 8 8 8 10 12 9 20 30 34 23 23 19 19 15 21 21 28 28 33 30 30 20 23 23 27 27 15 15 14 15 22 12 12 13 21 21 32 42 43 34 34 34 30 26 26 30
30 30 21 28 29 29 33 22 25 25 33 36 28 32 42 32 32 35 42 43 27 27 10 10 10 27 32 57 50 50 48 47 47 47 48 57 59 59 47 43 43 43 57 44 47 47 57 57 68 57
57 57 43 32 32 32 32 37 42 43 42 35 42 43 59 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 43 43 37 37 37 37 35 35 42 47 57 57
57 57 57 39 39 35 43 43 57 43 43 39 39 39 43 43 52 57 57 38 38 14 14 14 32 32 43 39 39 43 57 57 57 57 47 52 52 52 52 52 52 62 62 62 52 52 62 62 52 43
43 43 43 35 43 43 62 62 52 62 62 62 62 62 39 62 43 52 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 43 43 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62
43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 52 43 43 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 45 43 43 43 35 35 39 35 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 57 57 59
57 59 52 57 52 52 52 52 52 59 59 59 43 39 41 41 43 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 38 38 14 14 14 32 32 52 57 57 43 43 38 43 35 41 41 39 57 50 59 52 57
52 52 52 52 52 52 57 59 59 57 57 68 68 44 44 43 43 31 43 43 43 42 37 37 43 43 50 50 50 43 43 35 35 42 43 43 23 23 28 37 42 57 44 44 32 33 33 33 28 31
35 44 59 59 46 43 42 42 47 35 35 35 59 44 47 47 43 37 41 44 46 48 48 46 47 47 30 32 18 18 18 28 41 59 48 48 48 48 48 48 57 57 59 59 59 43 40 30 30 30
32 37 39 43 43 39 39 37 37 34 35 35 43 31 31 30 31 31 36 28 25 28 23 23 23 28 32 31 35 32 32 28 28 37 36 39 35 39 39 39 37 43 43 43 48 43 28 25 13 13
13 28 28 28 28 28 34 36 47 43 43 36 41 37 37 31 35 30 39 39 48 37 34 28 23 23 34 28 39 39 28 33 24 24 24 34 34 34 22 20 23 23 28 34 34 31 25 25 25 34
34 47 40 41 36 37 37 22 18 18 21 23 21 18 14 14 12 19 21 28 34 31 32 30 23 14 14 13 21 15 26 18 18 14 16 13 13 13 23 26 34 34 41 41 25 19 11 11 11 19
20 14 17 14 14 15 15 16 24 18 18 23 21 28 24 26 15 21 18 20 12 12 14 14 21 20 20 27 30 19 14 6 6 6 6 8 8 10 10 11 14 8 8 10 8 7 8 9 10 13
27 25 30 20 8 8 8 8 8 11 16 15 11 10 10 11 11 14 18 28 18 11 8 8 8 12 15 13 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 6 6 6 8 8
11 3 0 | Open.Hide. 7 7 7 10 10 10 9 8 7 7 9 6 8 9 14 30 39 39 41 39 39 39 35 30 29 32 27 29 25 23 12 9 9 12 14 9 10 10 13 13 22 23 28 37 43 48 47 36 36 33
33 33 36 41 59 59 59 59 41 27 18 19 8 8 8 8 8 8 18 15 27 32 33 33 33 59 36 38 36 36 36 36 57 48 43 43 43 36 43 44 53 53 53 57 42 42 37 37 37 42
46 41 41 41 47 47 47 50 59 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 46 57 43 46 46 57 57 57 57 47 47 57 50 57 50
47 47 50 50 57 57 57 37 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 35 35
35 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 62 62 62 62 45 45 45 62 62 52 52 52
62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 43 62 43 43 43 43 52 38 38 26 31 44 44 43 62 47 43 35 35 43 47 62 62 62 62 62 43 39 62 62 62 62
62 52 52 52 57 57 57 57 43 43 35 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 43 43 24 20 20 20 20 38 38 52 52 52 43 43 41 43 43 38 23 23 33 38 38 38 43 57 57
57 43 43 39 42 42 37 37 37 43 50 57 50 43 39 39 50 59 59 52 52 43 43 27 32 35 37 35 35 35 43 43 50 57 59 59 57 50 43 43 43 43 43 35 35 35 33 33 31 33
41 36 44 59 48 47 59 57 48 44 57 44 48 42 44 30 30 30 36 36 39 44 57 43 43 43 59 43 43 43 57 48 48 47 47 47 44 43 39 46 43 48 48 42 39 36 29 29 20 20
20 23 28 34 59 57 47 32 23 19 8 8 8 13 19 32 34 28 28 32 23 23 28 34 33 31 19 26 13 12 12 12 12 12 13 13 15 28 32 32 22 19 16 16 15 16 17 15 15 19
24 21 21 12 11 12 13 13 21 24 13 13 13 28 30 59 34 34 19 18 19 12 9 11 11 17 17 22 29 22 22 22 20 19 18 18 15 19 14 18 18 19 13 13 13 26 21 28 20 20
24 24 15 8 10 10 10 15 17 15 11 11 11 13 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 17 17 9 9 9 10 13 17 14 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
6 9 10 10 10 11 11 12 13 13 13 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 12 10 10 9 7 12 6 6 8 8 9 9 9 11 15 21 14 10 10
10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 11 10 11 11 10 9 11 11 11 14 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 6 6 6 8 8 9 12 17 11 11
11 11 11 11 8 10 6 6 8 8 10 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 12 12 13 24 23 20 20 15 15 12 12 |